MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridiales genomosp. BVAB3 str. UPII9-5 chromosome

Total Repeats: 562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013895	ATCATA	2	12	7672	7683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289450601
2	NC_013895	ATTGCC	2	12	15752	15763	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289450478
3	NC_013895	CTTATG	2	12	20334	20345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289450540
4	NC_013895	TAAATA	2	12	25504	25515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449839
5	NC_013895	GATGCC	2	12	25594	25605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289449839
6	NC_013895	GTTGGT	2	12	26818	26829	0 %	50 %	50 %	0 %	289450795
7	NC_013895	GCAAAA	2	12	36103	36114	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289450398
8	NC_013895	GTGGCT	2	12	37082	37093	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	289450662
9	NC_013895	CTTTTG	2	12	38234	38245	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	289450662
10	NC_013895	AGCTAT	2	12	38458	38469	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289450662
11	NC_013895	TGAACA	2	12	46072	46083	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289450051
12	NC_013895	TTGCGG	2	12	46087	46098	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	289450051
13	NC_013895	CGATTT	2	12	46192	46203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289450051
14	NC_013895	AATGAC	2	12	46283	46294	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289450051
15	NC_013895	TGATCG	2	12	51413	51424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289450312
16	NC_013895	GTGTTG	2	12	53089	53100	0 %	50 %	50 %	0 %	289449745
17	NC_013895	CGCTGG	2	12	53188	53199	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289449745
18	NC_013895	TGCTTG	2	12	57941	57952	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289450856
19	NC_013895	TTAAAT	2	12	59330	59341	50 %	50 %	0 %	0 %	289450856
20	NC_013895	CCGGCT	3	18	59791	59808	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289450856
21	NC_013895	ATCGGC	2	12	61212	61223	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289450011
22	NC_013895	AATTAA	2	12	61628	61639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450011
23	NC_013895	CGAACC	2	12	63941	63952	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289449357
24	NC_013895	GTTGCT	2	12	66227	66238	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289450422
25	NC_013895	TGCGAC	2	12	67114	67125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289450705
26	NC_013895	GCTTAG	2	12	67718	67729	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289450705
27	NC_013895	ATTTCA	2	12	69090	69101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289450050
28	NC_013895	CGGCAT	2	12	72724	72735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289450383
29	NC_013895	TGCGAT	2	12	76345	76356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289449847
30	NC_013895	CCGATC	2	12	79954	79965	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289449869
31	NC_013895	TTGAGT	2	12	85524	85535	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289449376
32	NC_013895	CAAGTC	2	12	91962	91973	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289449888
33	NC_013895	CCAAAA	2	12	93375	93386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289450169
34	NC_013895	TTGCCT	2	12	94709	94720	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289450169
35	NC_013895	AGGCAA	2	12	99258	99269	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289450124
36	NC_013895	AGGCAG	2	12	99270	99281	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	289450124
37	NC_013895	CTTGGT	2	12	101348	101359	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289450804
38	NC_013895	TAAAGG	2	12	104744	104755	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289450001
39	NC_013895	GCGCGT	2	12	108745	108756	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289449834
40	NC_013895	ATGACT	2	12	108816	108827	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289449834
41	NC_013895	TGACCG	2	12	113730	113741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289450659
42	NC_013895	TCAATC	2	12	119915	119926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289449659
43	NC_013895	TGTGGC	2	12	122114	122125	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	289449769
44	NC_013895	GCAAGG	2	12	123751	123762	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	289450776
45	NC_013895	TAAAGC	2	12	124413	124424	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289450776
46	NC_013895	ACCGCA	2	12	124729	124740	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289450776
47	NC_013895	TCTAGA	2	12	125844	125855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289449582
48	NC_013895	TTGGGC	2	12	138947	138958	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	289450116
49	NC_013895	GTTTTT	2	12	139039	139050	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	289450116
50	NC_013895	GGCGGT	2	12	139303	139314	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	289450116
51	NC_013895	CTTTGG	2	12	141452	141463	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289449770
52	NC_013895	AGGTAA	2	12	141817	141828	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289449770
53	NC_013895	CGGCAG	2	12	141845	141856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289449770
54	NC_013895	TTTGCA	2	12	144167	144178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289449544
55	NC_013895	GGTTTT	2	12	147167	147178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308513216
56	NC_013895	ATGACT	2	12	163290	163301	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289450648
57	NC_013895	GTAAGC	2	12	165549	165560	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289449406
58	NC_013895	GCAGCG	2	12	165663	165674	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289449406
59	NC_013895	AAAGGA	2	12	174485	174496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289450796
60	NC_013895	CTATGA	2	12	177728	177739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289450796
61	NC_013895	ATAACA	2	12	196410	196421	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	289449959
62	NC_013895	TGCGGT	2	12	196592	196603	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	289450642
63	NC_013895	CAACTA	2	12	204393	204404	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289450168
64	NC_013895	TAGGCG	2	12	208177	208188	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289449426
65	NC_013895	CGGCTA	3	18	208385	208402	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289449426
66	NC_013895	CAAAAG	2	12	211115	211126	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289449362
67	NC_013895	ATTGAA	2	12	212801	212812	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289450090
68	NC_013895	GGCATG	2	12	222456	222467	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289450236
69	NC_013895	TACTGG	2	12	223459	223470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289449938
70	NC_013895	TTGCCG	2	12	226594	226605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450520
71	NC_013895	TCCAAA	2	12	230865	230876	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289450466
72	NC_013895	GGTTGC	2	12	237472	237483	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	289449648
73	NC_013895	GGTATT	2	12	237917	237928	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289449648
74	NC_013895	TTTATC	2	12	243797	243808	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289449377
75	NC_013895	CTTGAT	2	12	245875	245886	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289449512
76	NC_013895	AAGAGA	2	12	249159	249170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289450135
77	NC_013895	GTCATA	2	12	252097	252108	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289449852
78	NC_013895	TATTTA	2	12	260854	260865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450167
79	NC_013895	TCAAGC	2	12	265245	265256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289450511
80	NC_013895	ACCGAT	2	12	266114	266125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289449593
81	NC_013895	GCCTTG	2	12	266480	266491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289449593
82	NC_013895	ATATAA	2	12	276109	276120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308513221
83	NC_013895	GCCTTG	2	12	278494	278505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450142
84	NC_013895	GGTGGC	2	12	285234	285245	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	289449910
85	NC_013895	GCCGGT	2	12	288141	288152	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289450777
86	NC_013895	TTATGA	2	12	303449	303460	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289449382
87	NC_013895	AGGCTC	2	12	303829	303840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289450262
88	NC_013895	CATTTG	2	12	312268	312279	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289449429
89	NC_013895	ACATCA	2	12	314272	314283	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289450552
90	NC_013895	GCTGCC	2	12	317083	317094	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289449598
91	NC_013895	TTCCGG	2	12	328491	328502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450165
92	NC_013895	AATAAA	2	12	329968	329979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289449756
93	NC_013895	CTGCTT	2	12	332121	332132	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289450495
94	NC_013895	GACCGT	2	12	343757	343768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289450407
95	NC_013895	TGATTA	2	12	348911	348922	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289449708
96	NC_013895	CAACGG	2	12	353667	353678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289450384
97	NC_013895	TATGAC	2	12	356705	356716	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289449418
98	NC_013895	CTGTCG	2	12	358413	358424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450604
99	NC_013895	CATGGC	2	12	359897	359908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289449407
100	NC_013895	GAAAGT	2	12	361148	361159	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289450114
101	NC_013895	TAGGCG	2	12	362462	362473	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289449624
102	NC_013895	TTTTGG	2	12	363070	363081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289449624
103	NC_013895	TTTATT	2	12	363158	363169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	289449624
104	NC_013895	ATCCGC	2	12	365699	365710	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289449624
105	NC_013895	GGGTGA	2	12	365807	365818	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	289449624
106	NC_013895	GGTTTT	2	12	370290	370301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450630
107	NC_013895	AGAAAT	2	12	371175	371186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289450630
108	NC_013895	CACATC	2	12	379370	379381	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	289450867
109	NC_013895	GCCAAA	2	12	387830	387841	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	289449526
110	NC_013895	TGCTGG	2	12	392887	392898	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	289450480
111	NC_013895	CAAGCC	2	12	398253	398264	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289450530
112	NC_013895	CAAGGT	2	12	402356	402367	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289450286
113	NC_013895	CCGGCA	2	12	404438	404449	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289450113
114	NC_013895	AATCAA	2	12	404680	404691	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	289450113
115	NC_013895	TCTGGC	2	12	404808	404819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450113
116	NC_013895	CAAAAG	2	12	408990	409001	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	308513227
117	NC_013895	GGATAA	2	12	410640	410651	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289450146
118	NC_013895	CGTTAC	2	12	413121	413132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289449971
119	NC_013895	AAATTT	2	12	413809	413820	50 %	50 %	0 %	0 %	289449971
120	NC_013895	AAATGG	2	12	414557	414568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289450409
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122	NC_013895	AAAGCC	2	12	422470	422481	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	289449381
123	NC_013895	CTATAG	2	12	425233	425244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289449570
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140	NC_013895	CTATGA	2	12	499205	499216	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289449931
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230	NC_013895	AAGTGA	2	12	812699	812710	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289449488
231	NC_013895	AAGCAA	2	12	812956	812967	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289449488
232	NC_013895	TATCTG	2	12	815683	815694	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289449640
233	NC_013895	TGAAGG	2	12	816305	816316	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	289449640
234	NC_013895	GCTGGA	2	12	816436	816447	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289449640
235	NC_013895	TGGAAA	2	12	819560	819571	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289450066
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342	NC_013895	CCGATG	2	12	1090718	1090729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289449470
343	NC_013895	TATACG	2	12	1090835	1090846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289449470
344	NC_013895	AAGAGC	2	12	1091905	1091916	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289450416
345	NC_013895	GCAAAT	2	12	1095308	1095319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289450245
346	NC_013895	TTGCCT	2	12	1099181	1099192	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289449894
347	NC_013895	AGCCCC	2	12	1101263	1101274	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	289450473
348	NC_013895	TTCGGT	2	12	1103786	1103797	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289450745
349	NC_013895	TCTTTT	2	12	1105620	1105631	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	289449739
350	NC_013895	CGATTT	2	12	1105941	1105952	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289449739
351	NC_013895	ATCATA	2	12	1115973	1115984	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289449896
352	NC_013895	AAGAAT	2	12	1117561	1117572	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289450597
353	NC_013895	CGCTGC	2	12	1118344	1118355	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289450597
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355	NC_013895	GTGCTT	2	12	1124915	1124926	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289450450
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357	NC_013895	GGCTCG	2	12	1129497	1129508	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289450399
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362	NC_013895	TGGCGG	2	12	1141661	1141672	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	289449387
363	NC_013895	ATTCAT	2	12	1141722	1141733	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289449387
364	NC_013895	CCGACA	2	12	1144900	1144911	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289450739
365	NC_013895	ACGTTG	2	12	1151953	1151964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289450123
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369	NC_013895	CACTGT	2	12	1173997	1174008	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289449960
370	NC_013895	CGAACT	2	12	1179540	1179551	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289450822
371	NC_013895	TATGCA	2	12	1180344	1180355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289450822
372	NC_013895	CATGTC	2	12	1183536	1183547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289449747
373	NC_013895	CCCTTC	2	12	1186547	1186558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289449913
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401	NC_013895	GGTTTC	2	12	1287214	1287225	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289449636
402	NC_013895	TCTGTT	2	12	1292572	1292583	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	289450710
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439	NC_013895	GTTAGT	2	12	1401100	1401111	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289449874
440	NC_013895	TTTCTT	2	12	1403910	1403921	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	289449511
441	NC_013895	TCAGCA	2	12	1405615	1405626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289450854
442	NC_013895	TCAACT	2	12	1410541	1410552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289450268
443	NC_013895	CGGCAT	2	12	1411886	1411897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289450268
444	NC_013895	CGGATG	2	12	1415390	1415401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289450750
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446	NC_013895	TCTTAA	2	12	1422491	1422502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289449760
447	NC_013895	AAATTA	2	12	1436975	1436986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450082
448	NC_013895	GGAAGC	2	12	1438212	1438223	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	289450082
449	NC_013895	TCTGTA	2	12	1439723	1439734	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289449898
450	NC_013895	GTGCCG	2	12	1444401	1444412	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289449846
451	NC_013895	TACAAA	2	12	1451619	1451630	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	289449923
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453	NC_013895	AAAATA	2	12	1454270	1454281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289450211
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