MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013717	A	6	6	2709	2714	100 %	0 %	0 %	0 %	283777751
2	NC_013717	A	6	6	4588	4593	100 %	0 %	0 %	0 %	283777754
3	NC_013717	T	6	6	5045	5050	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
4	NC_013717	T	9	9	5108	5116	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
5	NC_013717	T	7	7	5177	5183	0 %	100 %	0 %	0 %	283777755
6	NC_013717	A	6	6	5198	5203	100 %	0 %	0 %	0 %	283777755
7	NC_013717	A	8	8	5214	5221	100 %	0 %	0 %	0 %	283777756
8	NC_013717	A	6	6	5245	5250	100 %	0 %	0 %	0 %	283777756
9	NC_013717	T	7	7	5275	5281	0 %	100 %	0 %	0 %	283777756
10	NC_013717	T	6	6	5632	5637	0 %	100 %	0 %	0 %	283777757
11	NC_013717	T	6	6	5747	5752	0 %	100 %	0 %	0 %	283777758
12	NC_013717	G	7	7	7918	7924	0 %	0 %	100 %	0 %	283777759
13	NC_013717	G	7	7	12366	12372	0 %	0 %	100 %	0 %	283777761
14	NC_013717	T	7	7	14128	14134	0 %	100 %	0 %	0 %	283777763
15	NC_013717	A	6	6	14829	14834	100 %	0 %	0 %	0 %	283777764
16	NC_013717	A	7	7	14871	14877	100 %	0 %	0 %	0 %	283777764
17	NC_013717	A	7	7	14964	14970	100 %	0 %	0 %	0 %	283777764
18	NC_013717	A	8	8	14987	14994	100 %	0 %	0 %	0 %	283777764
19	NC_013717	A	8	8	17157	17164	100 %	0 %	0 %	0 %	283777765
20	NC_013717	G	6	6	17205	17210	0 %	0 %	100 %	0 %	283777765
21	NC_013717	T	7	7	17270	17276	0 %	100 %	0 %	0 %	283777765
22	NC_013717	G	7	7	17707	17713	0 %	0 %	100 %	0 %	283777765
23	NC_013717	A	6	6	17902	17907	100 %	0 %	0 %	0 %	283777766
24	NC_013717	T	6	6	18655	18660	0 %	100 %	0 %	0 %	283777767
25	NC_013717	T	6	6	19055	19060	0 %	100 %	0 %	0 %	283777768
26	NC_013717	T	7	7	19078	19084	0 %	100 %	0 %	0 %	283777768
27	NC_013717	A	7	7	19135	19141	100 %	0 %	0 %	0 %	283777768
28	NC_013717	G	8	8	19405	19412	0 %	0 %	100 %	0 %	283777768
29	NC_013717	G	6	6	19521	19526	0 %	0 %	100 %	0 %	283777768
30	NC_013717	T	6	6	20137	20142	0 %	100 %	0 %	0 %	283777769
31	NC_013717	A	9	9	20751	20759	100 %	0 %	0 %	0 %	283777769
32	NC_013717	C	7	7	20792	20798	0 %	0 %	0 %	100 %	283777769
33	NC_013717	A	6	6	21298	21303	100 %	0 %	0 %	0 %	283777770
34	NC_013717	T	8	8	21442	21449	0 %	100 %	0 %	0 %	283777770
35	NC_013717	C	6	6	22917	22922	0 %	0 %	0 %	100 %	283777771
36	NC_013717	T	6	6	23021	23026	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
37	NC_013717	T	7	7	24663	24669	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
38	NC_013717	T	6	6	24755	24760	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
39	NC_013717	C	8	8	24845	24852	0 %	0 %	0 %	100 %	283777771
40	NC_013717	C	6	6	25163	25168	0 %	0 %	0 %	100 %	283777771
41	NC_013717	T	6	6	25463	25468	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
42	NC_013717	T	6	6	25992	25997	0 %	100 %	0 %	0 %	283777771
43	NC_013717	A	6	6	28304	28309	100 %	0 %	0 %	0 %	283777773
44	NC_013717	C	6	6	28442	28447	0 %	0 %	0 %	100 %	283777773
45	NC_013717	T	6	6	29372	29377	0 %	100 %	0 %	0 %	283777773
46	NC_013717	G	7	7	29612	29618	0 %	0 %	100 %	0 %	283777773
47	NC_013717	A	6	6	32055	32060	100 %	0 %	0 %	0 %	283777775
48	NC_013717	A	7	7	32130	32136	100 %	0 %	0 %	0 %	283777775
49	NC_013717	A	6	6	33345	33350	100 %	0 %	0 %	0 %	283777776
50	NC_013717	A	6	6	34314	34319	100 %	0 %	0 %	0 %	283777779
51	NC_013717	A	6	6	34496	34501	100 %	0 %	0 %	0 %	283777779
52	NC_013717	G	6	6	35405	35410	0 %	0 %	100 %	0 %	283777782
53	NC_013717	G	6	6	35936	35941	0 %	0 %	100 %	0 %	283777783
54	NC_013717	T	6	6	37320	37325	0 %	100 %	0 %	0 %	283777784
55	NC_013717	C	6	6	38755	38760	0 %	0 %	0 %	100 %	283777784
56	NC_013717	T	8	8	39918	39925	0 %	100 %	0 %	0 %	283777784
57	NC_013717	T	6	6	40309	40314	0 %	100 %	0 %	0 %	283777784
58	NC_013717	T	8	8	40643	40650	0 %	100 %	0 %	0 %	283777784
59	NC_013717	T	6	6	41685	41690	0 %	100 %	0 %	0 %	283777786
60	NC_013717	A	6	6	41960	41965	100 %	0 %	0 %	0 %	283777787
61	NC_013717	T	6	6	42450	42455	0 %	100 %	0 %	0 %	283777787
62	NC_013717	T	6	6	42533	42538	0 %	100 %	0 %	0 %	283777787
63	NC_013717	T	6	6	42794	42799	0 %	100 %	0 %	0 %	283777787
64	NC_013717	C	7	7	43216	43222	0 %	0 %	0 %	100 %	283777787
65	NC_013717	A	6	6	44262	44267	100 %	0 %	0 %	0 %	283777789
66	NC_013717	G	6	6	44356	44361	0 %	0 %	100 %	0 %	283777789
67	NC_013717	G	6	6	45533	45538	0 %	0 %	100 %	0 %	283777790
68	NC_013717	T	6	6	45886	45891	0 %	100 %	0 %	0 %	283777792
69	NC_013717	T	6	6	46443	46448	0 %	100 %	0 %	0 %	283777792
70	NC_013717	T	6	6	46504	46509	0 %	100 %	0 %	0 %	283777792
71	NC_013717	A	9	9	48339	48347	100 %	0 %	0 %	0 %	283777795
72	NC_013717	A	7	7	48471	48477	100 %	0 %	0 %	0 %	283777795
73	NC_013717	T	6	6	52228	52233	0 %	100 %	0 %	0 %	283777799
74	NC_013717	T	7	7	52401	52407	0 %	100 %	0 %	0 %	283777799
75	NC_013717	T	6	6	54301	54306	0 %	100 %	0 %	0 %	283777801

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.