MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 102045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_013716	TGG	2	6	52022	52027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783824
1003	NC_013716	CG	4	8	52065	52072	0 %	0 %	50 %	50 %	283783824
1004	NC_013716	TGC	2	6	52081	52086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783824
1005	NC_013716	TGA	2	6	52106	52111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783824
1006	NC_013716	CAG	2	6	52128	52133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783824
1007	NC_013716	TGC	2	6	52139	52144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783824
1008	NC_013716	CACG	2	8	52208	52215	25 %	0 %	25 %	50 %	283783824
1009	NC_013716	GC	3	6	52233	52238	0 %	0 %	50 %	50 %	283783824
1010	NC_013716	CACC	2	8	52269	52276	25 %	0 %	0 %	75 %	283783824
1011	NC_013716	CAG	2	6	52362	52367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783824
1012	NC_013716	AGT	2	6	52388	52393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783824
1013	NC_013716	CAG	2	6	52528	52533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783824
1014	NC_013716	ATG	3	9	52537	52545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783824
1015	NC_013716	GCG	2	6	52604	52609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783824
1016	NC_013716	AAT	2	6	52668	52673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783824
1017	NC_013716	A	6	6	52758	52763	100 %	0 %	0 %	0 %	283783824
1018	NC_013716	CGG	2	6	52884	52889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783824
1019	NC_013716	GTA	3	9	52899	52907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783824
1020	NC_013716	CGG	3	9	52934	52942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783824
1021	NC_013716	AGG	2	6	52949	52954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283783824
1022	NC_013716	CAT	2	6	52959	52964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783824
1023	NC_013716	CCAG	2	8	53036	53043	25 %	0 %	25 %	50 %	283783824
1024	NC_013716	ACC	2	6	53062	53067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783824
1025	NC_013716	TAA	2	6	53123	53128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783824
1026	NC_013716	AGC	2	6	53136	53141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783824
1027	NC_013716	CAA	2	6	53177	53182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783824
1028	NC_013716	TTA	2	6	53183	53188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783824
1029	NC_013716	GAA	2	6	53196	53201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783824
1030	NC_013716	GAA	2	6	53411	53416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783825
1031	NC_013716	TGA	2	6	53732	53737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783826
1032	NC_013716	CAG	2	6	53847	53852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783826
1033	NC_013716	GAC	2	6	53856	53861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783826
1034	NC_013716	CGG	2	6	53885	53890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783826
1035	NC_013716	CG	3	6	53932	53937	0 %	0 %	50 %	50 %	283783826
1036	NC_013716	TGG	3	9	53950	53958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783826
1037	NC_013716	GCA	2	6	53990	53995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783826
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1039	NC_013716	CGC	2	6	54002	54007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783826
1040	NC_013716	GCC	2	6	54012	54017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783826
1041	NC_013716	CTG	2	6	54042	54047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783826
1042	NC_013716	GCG	2	6	54052	54057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783826
1043	NC_013716	CCG	2	6	54064	54069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783826
1044	NC_013716	GCA	2	6	54080	54085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783826
1045	NC_013716	CTG	3	9	54093	54101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783826
1046	NC_013716	GGA	2	6	54188	54193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283783826
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1051	NC_013716	GCAAC	2	10	54395	54404	40 %	0 %	20 %	40 %	283783826
1052	NC_013716	GAA	2	6	54423	54428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783826
1053	NC_013716	CGC	2	6	54434	54439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783826
1054	NC_013716	TGA	2	6	54543	54548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783827
1055	NC_013716	GCG	2	6	54549	54554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783827
1056	NC_013716	CG	3	6	54553	54558	0 %	0 %	50 %	50 %	283783827
1057	NC_013716	CGC	2	6	54595	54600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783827
1058	NC_013716	TGG	2	6	54672	54677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783827
1059	NC_013716	CAG	2	6	54713	54718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783827
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1061	NC_013716	CTG	2	6	54764	54769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783827
1062	NC_013716	CGG	3	9	54795	54803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783827
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1110	NC_013716	CA	3	6	56798	56803	50 %	0 %	0 %	50 %	283783829
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1123	NC_013716	CAG	2	6	57581	57586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783830
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1125	NC_013716	CAG	2	6	57671	57676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783830
1126	NC_013716	GCA	2	6	57766	57771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783830
1127	NC_013716	GAC	2	6	57832	57837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783830
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1246	NC_013716	CAT	2	6	63391	63396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783834
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1497	NC_013716	CGG	2	6	75488	75493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783846
1498	NC_013716	CCA	2	6	75535	75540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783846
1499	NC_013716	AGC	2	6	75558	75563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783846
1500	NC_013716	TTC	2	6	75585	75590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783846

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