MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 102045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
102001	NC_013716	CTG	2	6	5344116	5344121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283788576
102002	NC_013716	CTG	4	12	5344149	5344160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283788576
102003	NC_013716	TGA	2	6	5344222	5344227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283788576
102004	NC_013716	TGC	3	9	5344291	5344299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283788576
102005	NC_013716	CTG	2	6	5344320	5344325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283788576
102006	NC_013716	CCG	2	6	5344330	5344335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283788576
102007	NC_013716	GC	3	6	5344339	5344344	0 %	0 %	50 %	50 %	283788576
102008	NC_013716	CTG	2	6	5344347	5344352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283788576
102009	NC_013716	ACG	2	6	5344356	5344361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283788576
102010	NC_013716	TGC	2	6	5344363	5344368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283788576
102011	NC_013716	GCC	2	6	5344442	5344447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283788576
102012	NC_013716	ACG	3	9	5344449	5344457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283788576
102013	NC_013716	CAA	2	6	5344465	5344470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283788576
102014	NC_013716	CGC	2	6	5344489	5344494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283788576
102015	NC_013716	CGTTT	2	10	5344504	5344513	0 %	60 %	20 %	20 %	283788576
102016	NC_013716	CGC	2	6	5344602	5344607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283788577
102017	NC_013716	TGG	2	6	5344632	5344637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283788577
102018	NC_013716	GAT	2	6	5344639	5344644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283788577
102019	NC_013716	CGG	2	6	5344685	5344690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283788577
102020	NC_013716	CAG	2	6	5344747	5344752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283788577
102021	NC_013716	ACG	2	6	5344909	5344914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283788577
102022	NC_013716	TTC	2	6	5344915	5344920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283788577
102023	NC_013716	CAG	2	6	5344951	5344956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283788577
102024	NC_013716	ATC	2	6	5345008	5345013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283788577
102025	NC_013716	CG	3	6	5345103	5345108	0 %	0 %	50 %	50 %	283788577
102026	NC_013716	CAG	2	6	5345110	5345115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283788577
102027	NC_013716	AG	3	6	5345173	5345178	50 %	0 %	50 %	0 %	283788577
102028	NC_013716	CAT	2	6	5345217	5345222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283788577
102029	NC_013716	CAA	2	6	5345447	5345452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283788578
102030	NC_013716	CAT	2	6	5345453	5345458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283788578
102031	NC_013716	ATT	2	6	5346085	5346090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283788579
102032	NC_013716	ATA	2	6	5346092	5346097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283788579
102033	NC_013716	CCA	2	6	5346152	5346157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283788579
102034	NC_013716	GC	3	6	5346160	5346165	0 %	0 %	50 %	50 %	283788579
102035	NC_013716	ATT	2	6	5346182	5346187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283788579
102036	NC_013716	ACGCC	2	10	5346188	5346197	20 %	0 %	20 %	60 %	283788579
102037	NC_013716	CTG	2	6	5346214	5346219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283788579
102038	NC_013716	GAA	2	6	5346220	5346225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283788579
102039	NC_013716	CTGGCG	2	12	5346295	5346306	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283788579
102040	NC_013716	CAA	2	6	5346403	5346408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283788579
102041	NC_013716	AT	3	6	5346425	5346430	50 %	50 %	0 %	0 %	283788579
102042	NC_013716	TGA	2	6	5346432	5346437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283788579
102043	NC_013716	TTA	2	6	5346475	5346480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283788579
102044	NC_013716	CTG	2	6	5346541	5346546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283788579
102045	NC_013716	AAT	2	6	5346608	5346613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283788579

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.