MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 102045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_013716	GGC	2	6	306619	306624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283784039
6003	NC_013716	T	6	6	306654	306659	0 %	100 %	0 %	0 %	283784039
6004	NC_013716	TTC	2	6	306696	306701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283784039
6005	NC_013716	CGG	2	6	306746	306751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283784039
6006	NC_013716	ACGGG	2	10	306789	306798	20 %	0 %	60 %	20 %	283784039
6007	NC_013716	CAA	2	6	306887	306892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283784039
6008	NC_013716	TCC	2	6	306908	306913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283784040
6009	NC_013716	CGCC	2	8	306924	306931	0 %	0 %	25 %	75 %	283784040
6010	NC_013716	TGC	2	6	306946	306951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784040
6011	NC_013716	CAT	2	6	307024	307029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283784040
6012	NC_013716	TG	4	8	307077	307084	0 %	50 %	50 %	0 %	283784040
6013	NC_013716	TCC	2	6	307146	307151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283784040
6014	NC_013716	GCC	2	6	307191	307196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283784040
6015	NC_013716	GGAC	2	8	307237	307244	25 %	0 %	50 %	25 %	283784040
6016	NC_013716	GTTT	2	8	307303	307310	0 %	75 %	25 %	0 %	283784040
6017	NC_013716	CGG	2	6	307320	307325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283784040
6018	NC_013716	C	6	6	307371	307376	0 %	0 %	0 %	100 %	283784040
6019	NC_013716	GTTTTT	2	12	307400	307411	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	283784040
6020	NC_013716	TCA	2	6	307452	307457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283784040
6021	NC_013716	TCA	2	6	307570	307575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283784040
6022	NC_013716	CAG	2	6	307580	307585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784040
6023	NC_013716	CGC	2	6	307592	307597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283784040
6024	NC_013716	ACC	2	6	307605	307610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283784040
6025	NC_013716	CCG	2	6	307654	307659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283784040
6026	NC_013716	TGTT	2	8	307668	307675	0 %	75 %	25 %	0 %	283784040
6027	NC_013716	TTC	2	6	307685	307690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283784040
6028	NC_013716	ATAA	2	8	307814	307821	75 %	25 %	0 %	0 %	283784040
6029	NC_013716	GCT	2	6	307891	307896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784040
6030	NC_013716	TCG	2	6	307914	307919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784040
6031	NC_013716	GTC	2	6	307928	307933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784040
6032	NC_013716	GAT	2	6	307937	307942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283784040
6033	NC_013716	T	6	6	307982	307987	0 %	100 %	0 %	0 %	283784040
6034	NC_013716	TTG	2	6	308016	308021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283784040
6035	NC_013716	T	6	6	308082	308087	0 %	100 %	0 %	0 %	283784040
6036	NC_013716	ATG	2	6	308160	308165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283784040
6037	NC_013716	CAC	2	6	308239	308244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283784040
6038	NC_013716	GCG	2	6	308250	308255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283784040
6039	NC_013716	CGT	2	6	308260	308265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784040
6040	NC_013716	AAT	2	6	308374	308379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283784040
6041	NC_013716	GCC	2	6	308406	308411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283784040
6042	NC_013716	CGG	2	6	308412	308417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283784040
6043	NC_013716	TG	3	6	308421	308426	0 %	50 %	50 %	0 %	283784040
6044	NC_013716	GCT	2	6	308554	308559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784041
6045	NC_013716	CTGC	2	8	308561	308568	0 %	25 %	25 %	50 %	283784041
6046	NC_013716	GGT	2	6	308661	308666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283784041
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6050	NC_013716	CAC	2	6	308942	308947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283784041
6051	NC_013716	CCG	2	6	309010	309015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283784041
6052	NC_013716	TGC	2	6	309143	309148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784041
6053	NC_013716	TG	4	8	309158	309165	0 %	50 %	50 %	0 %	283784041
6054	NC_013716	CCA	2	6	309166	309171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283784041
6055	NC_013716	CTG	2	6	309172	309177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784041
6056	NC_013716	GCA	2	6	309224	309229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784041
6057	NC_013716	AAT	2	6	309267	309272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283784041
6058	NC_013716	TGA	2	6	309414	309419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283784042
6059	NC_013716	CAC	2	6	309436	309441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283784042
6060	NC_013716	CGGT	2	8	309461	309468	0 %	25 %	50 %	25 %	283784042
6061	NC_013716	T	7	7	309480	309486	0 %	100 %	0 %	0 %	283784042
6062	NC_013716	CTG	2	6	309488	309493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784042
6063	NC_013716	CAGA	2	8	309516	309523	50 %	0 %	25 %	25 %	283784042
6064	NC_013716	CAG	2	6	309529	309534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784042
6065	NC_013716	GCG	2	6	309549	309554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283784042
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6068	NC_013716	GTC	2	6	309685	309690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784042
6069	NC_013716	TTC	2	6	309695	309700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283784042
6070	NC_013716	CGA	2	6	309756	309761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784042
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6085	NC_013716	CGTC	2	8	310535	310542	0 %	25 %	25 %	50 %	283784045
6086	NC_013716	CAGC	2	8	310588	310595	25 %	0 %	25 %	50 %	283784045
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6091	NC_013716	CCAG	2	8	310984	310991	25 %	0 %	25 %	50 %	283784046
6092	NC_013716	CAGC	2	8	311015	311022	25 %	0 %	25 %	50 %	283784046
6093	NC_013716	GAT	3	9	311030	311038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283784046
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6095	NC_013716	ATC	2	6	311073	311078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283784046
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6101	NC_013716	CA	3	6	311285	311290	50 %	0 %	0 %	50 %	283784047
6102	NC_013716	CGA	2	6	311378	311383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784047
6103	NC_013716	TTTC	2	8	311414	311421	0 %	75 %	0 %	25 %	283784047
6104	NC_013716	ACA	2	6	311431	311436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283784047
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6106	NC_013716	AC	3	6	311498	311503	50 %	0 %	0 %	50 %	283784047
6107	NC_013716	CAC	2	6	311507	311512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283784047
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6112	NC_013716	CTT	2	6	311872	311877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283784048
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6114	NC_013716	GTT	2	6	311896	311901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283784048
6115	NC_013716	GCTG	2	8	311917	311924	0 %	25 %	50 %	25 %	283784048
6116	NC_013716	AAGCG	2	10	311941	311950	40 %	0 %	40 %	20 %	283784048
6117	NC_013716	GCA	2	6	311958	311963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784048
6118	NC_013716	T	6	6	312030	312035	0 %	100 %	0 %	0 %	283784048
6119	NC_013716	GCC	2	6	312201	312206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283784049
6120	NC_013716	ACA	2	6	312252	312257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283784049
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6122	NC_013716	CGT	2	6	312295	312300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784049
6123	NC_013716	CTT	2	6	312342	312347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283784049
6124	NC_013716	TCG	2	6	312375	312380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784049
6125	NC_013716	CTG	2	6	312418	312423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784049
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6130	NC_013716	CTG	2	6	312739	312744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784049
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6229	NC_013716	ATG	2	6	318101	318106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283784063
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6233	NC_013716	TGAT	2	8	318371	318378	25 %	50 %	25 %	0 %	283784063
6234	NC_013716	CGT	2	6	318442	318447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784063
6235	NC_013716	AC	3	6	318482	318487	50 %	0 %	0 %	50 %	283784063
6236	NC_013716	A	7	7	318637	318643	100 %	0 %	0 %	0 %	283784063
6237	NC_013716	GC	3	6	318647	318652	0 %	0 %	50 %	50 %	283784063
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6240	NC_013716	GCGT	2	8	318923	318930	0 %	25 %	50 %	25 %	283784063
6241	NC_013716	AAATT	2	10	319553	319562	60 %	40 %	0 %	0 %	283784064
6242	NC_013716	CA	3	6	319621	319626	50 %	0 %	0 %	50 %	283784064
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6244	NC_013716	CAC	2	6	319663	319668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283784064
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6488	NC_013716	GGT	2	6	335666	335671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283784084
6489	NC_013716	GCA	2	6	335746	335751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784084
6490	NC_013716	TCAG	2	8	335800	335807	25 %	25 %	25 %	25 %	283784084
6491	NC_013716	CAG	2	6	335840	335845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784084
6492	NC_013716	AAT	2	6	335858	335863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283784084
6493	NC_013716	AAT	2	6	335880	335885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283784085
6494	NC_013716	GCG	2	6	335899	335904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283784085
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