MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 102045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013716	CTGG	2	8	279736	279743	0 %	25 %	50 %	25 %	283784010
5502	NC_013716	C	6	6	279779	279784	0 %	0 %	0 %	100 %	283784010
5503	NC_013716	CCAGCG	2	12	279825	279836	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	283784010
5504	NC_013716	ACC	3	9	279922	279930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283784011
5505	NC_013716	ATT	2	6	279954	279959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283784011
5506	NC_013716	GTC	2	6	280011	280016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784011
5507	NC_013716	CAG	2	6	280026	280031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784011
5508	NC_013716	CAG	2	6	280092	280097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784011
5509	NC_013716	TCC	2	6	280120	280125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283784011
5510	NC_013716	GGC	2	6	280164	280169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283784011
5511	NC_013716	GGT	2	6	280179	280184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283784011
5512	NC_013716	TCT	2	6	280210	280215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283784011
5513	NC_013716	TCA	2	6	280248	280253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283784012
5514	NC_013716	TCC	2	6	280280	280285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283784012
5515	NC_013716	AAT	2	6	280301	280306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283784012
5516	NC_013716	TGG	2	6	280374	280379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283784012
5517	NC_013716	ATGA	2	8	280441	280448	50 %	25 %	25 %	0 %	283784012
5518	NC_013716	CTT	2	6	280462	280467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283784012
5519	NC_013716	T	7	7	280466	280472	0 %	100 %	0 %	0 %	283784012
5520	NC_013716	CCG	2	6	280494	280499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283784012
5521	NC_013716	CGA	2	6	280526	280531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784012
5522	NC_013716	GCC	2	6	280582	280587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283784012
5523	NC_013716	CTG	2	6	280646	280651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784012
5524	NC_013716	TTA	2	6	280688	280693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283784012
5525	NC_013716	CAG	2	6	280822	280827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784012
5526	NC_013716	CGAT	2	8	280835	280842	25 %	25 %	25 %	25 %	283784012
5527	NC_013716	GA	3	6	280866	280871	50 %	0 %	50 %	0 %	283784012
5528	NC_013716	TCA	2	6	280872	280877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283784012
5529	NC_013716	CATC	2	8	280899	280906	25 %	25 %	0 %	50 %	283784012
5530	NC_013716	T	8	8	280917	280924	0 %	100 %	0 %	0 %	283784012
5531	NC_013716	T	6	6	280945	280950	0 %	100 %	0 %	0 %	283784012
5532	NC_013716	TAAA	2	8	280998	281005	75 %	25 %	0 %	0 %	283784012
5533	NC_013716	GT	3	6	281811	281816	0 %	50 %	50 %	0 %	283784013
5534	NC_013716	AGAATG	2	12	281849	281860	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	283784013
5535	NC_013716	GCG	2	6	281884	281889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283784013
5536	NC_013716	ATT	2	6	281997	282002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283784013
5537	NC_013716	GCA	2	6	282086	282091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784013
5538	NC_013716	AACTT	2	10	282104	282113	40 %	40 %	0 %	20 %	283784013
5539	NC_013716	CGC	2	6	282156	282161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283784013
5540	NC_013716	TTA	2	6	282183	282188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283784013
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5542	NC_013716	C	7	7	282217	282223	0 %	0 %	0 %	100 %	283784013
5543	NC_013716	A	6	6	282271	282276	100 %	0 %	0 %	0 %	283784013
5544	NC_013716	A	6	6	282294	282299	100 %	0 %	0 %	0 %	283784013
5545	NC_013716	CGC	2	6	282322	282327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283784013
5546	NC_013716	GC	3	6	282326	282331	0 %	0 %	50 %	50 %	283784013
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5549	NC_013716	GC	3	6	282536	282541	0 %	0 %	50 %	50 %	283784013
5550	NC_013716	TTA	2	6	282604	282609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283784013
5551	NC_013716	TGC	2	6	282764	282769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784014
5552	NC_013716	GCA	2	6	282777	282782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784014
5553	NC_013716	TC	3	6	282810	282815	0 %	50 %	0 %	50 %	283784014
5554	NC_013716	CAGCG	2	10	282828	282837	20 %	0 %	40 %	40 %	283784014
5555	NC_013716	CAT	2	6	282870	282875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283784014
5556	NC_013716	CAG	2	6	282907	282912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784014
5557	NC_013716	CGAT	2	8	282935	282942	25 %	25 %	25 %	25 %	283784014
5558	NC_013716	CGA	2	6	282954	282959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283784014
5559	NC_013716	GAT	2	6	282972	282977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283784014
5560	NC_013716	GCCA	2	8	282979	282986	25 %	0 %	25 %	50 %	283784014
5561	NC_013716	TGA	2	6	283055	283060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283784014
5562	NC_013716	ATGA	2	8	283079	283086	50 %	25 %	25 %	0 %	283784015
5563	NC_013716	AAG	2	6	283094	283099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283784015
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5565	NC_013716	GGC	3	9	283162	283170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283784015
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5589	NC_013716	GAA	2	6	284230	284235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283784015
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5591	NC_013716	CTGA	2	8	284261	284268	25 %	25 %	25 %	25 %	283784015
5592	NC_013716	CTG	2	6	284270	284275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784015
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5595	NC_013716	CTGTCG	2	12	284315	284326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283784015
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5605	NC_013716	ATC	2	6	285693	285698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283784016
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5608	NC_013716	TTC	2	6	285789	285794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283784016
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5614	NC_013716	AG	3	6	286562	286567	50 %	0 %	50 %	0 %	283784017
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5733	NC_013716	CGG	2	6	292886	292891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283784024
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5735	NC_013716	AC	3	6	292955	292960	50 %	0 %	0 %	50 %	283784024
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