MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 102045

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013716	ACC	2	6	216940	216945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783963
4502	NC_013716	GC	3	6	216956	216961	0 %	0 %	50 %	50 %	283783963
4503	NC_013716	GAT	2	6	216964	216969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783963
4504	NC_013716	CGT	2	6	217023	217028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783963
4505	NC_013716	CGG	2	6	217043	217048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783963
4506	NC_013716	TGA	2	6	217262	217267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783963
4507	NC_013716	TGA	2	6	217272	217277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783963
4508	NC_013716	CAA	2	6	217318	217323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783963
4509	NC_013716	ACT	2	6	217436	217441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783964
4510	NC_013716	GAA	2	6	217529	217534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783964
4511	NC_013716	GC	3	6	217546	217551	0 %	0 %	50 %	50 %	283783964
4512	NC_013716	TGA	2	6	217720	217725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783964
4513	NC_013716	GC	3	6	217727	217732	0 %	0 %	50 %	50 %	283783964
4514	NC_013716	TGT	2	6	217744	217749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783964
4515	NC_013716	GAT	2	6	217762	217767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783964
4516	NC_013716	AGT	2	6	217840	217845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783964
4517	NC_013716	GAT	2	6	217858	217863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783964
4518	NC_013716	TGAT	2	8	217893	217900	25 %	50 %	25 %	0 %	283783965
4519	NC_013716	GAA	2	6	217934	217939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783965
4520	NC_013716	TTG	2	6	217983	217988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783965
4521	NC_013716	GTGAA	2	10	218097	218106	40 %	20 %	40 %	0 %	283783965
4522	NC_013716	TGA	2	6	218241	218246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783965
4523	NC_013716	TCA	2	6	218343	218348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783965
4524	NC_013716	CGG	2	6	218350	218355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783965
4525	NC_013716	TGG	2	6	218400	218405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783965
4526	NC_013716	CCG	2	6	218435	218440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783965
4527	NC_013716	CCACG	2	10	218461	218470	20 %	0 %	20 %	60 %	283783965
4528	NC_013716	GAA	2	6	218579	218584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783965
4529	NC_013716	AGC	2	6	218613	218618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783965
4530	NC_013716	GC	3	6	218770	218775	0 %	0 %	50 %	50 %	283783966
4531	NC_013716	TTG	2	6	218873	218878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783966
4532	NC_013716	CGT	2	6	218896	218901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
4533	NC_013716	CTG	2	6	218902	218907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
4534	NC_013716	CGC	2	6	218929	218934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783966
4535	NC_013716	CATT	2	8	219030	219037	25 %	50 %	0 %	25 %	283783966
4536	NC_013716	GTCC	2	8	219044	219051	0 %	25 %	25 %	50 %	283783966
4537	NC_013716	CGTGC	2	10	219153	219162	0 %	20 %	40 %	40 %	283783966
4538	NC_013716	GC	3	6	219220	219225	0 %	0 %	50 %	50 %	283783966
4539	NC_013716	TGC	2	6	219266	219271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
4540	NC_013716	CGCGG	2	10	219280	219289	0 %	0 %	60 %	40 %	283783966
4541	NC_013716	GTG	3	9	219361	219369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783966
4542	NC_013716	CTG	2	6	219493	219498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
4543	NC_013716	CCG	2	6	219509	219514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783966
4544	NC_013716	TGG	3	9	219545	219553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783966
4545	NC_013716	CTGG	2	8	219579	219586	0 %	25 %	50 %	25 %	283783966
4546	NC_013716	CTG	2	6	219628	219633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
4547	NC_013716	GGGAA	2	10	219636	219645	40 %	0 %	60 %	0 %	283783966
4548	NC_013716	CTG	2	6	219700	219705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
4549	NC_013716	GCT	2	6	219708	219713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783966
4550	NC_013716	CAG	2	6	219766	219771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783966
4551	NC_013716	GGC	2	6	219795	219800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783966
4552	NC_013716	TGCTG	2	10	219804	219813	0 %	40 %	40 %	20 %	283783966
4553	NC_013716	GGT	2	6	219902	219907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783967
4554	NC_013716	GCC	2	6	219912	219917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783967
4555	NC_013716	A	6	6	219963	219968	100 %	0 %	0 %	0 %	283783967
4556	NC_013716	CCA	2	6	220081	220086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783967
4557	NC_013716	GC	3	6	220100	220105	0 %	0 %	50 %	50 %	283783967
4558	NC_013716	GGC	2	6	220346	220351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783967
4559	NC_013716	TCG	2	6	220373	220378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783967
4560	NC_013716	ACT	2	6	220486	220491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783968
4561	NC_013716	GGCT	2	8	220504	220511	0 %	25 %	50 %	25 %	283783968
4562	NC_013716	A	6	6	220529	220534	100 %	0 %	0 %	0 %	283783968
4563	NC_013716	GGC	2	6	220535	220540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783968
4564	NC_013716	CTCA	2	8	220686	220693	25 %	25 %	0 %	50 %	283783968
4565	NC_013716	GGC	2	6	220706	220711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783968
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4567	NC_013716	ACCTT	2	10	220732	220741	20 %	40 %	0 %	40 %	283783968
4568	NC_013716	CGGCG	2	10	220772	220781	0 %	0 %	60 %	40 %	283783968
4569	NC_013716	ATCG	2	8	220791	220798	25 %	25 %	25 %	25 %	283783968
4570	NC_013716	TGAAC	2	10	220811	220820	40 %	20 %	20 %	20 %	283783968
4571	NC_013716	CT	3	6	220836	220841	0 %	50 %	0 %	50 %	283783968
4572	NC_013716	GGCG	2	8	220842	220849	0 %	0 %	75 %	25 %	283783968
4573	NC_013716	CTG	2	6	220872	220877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783968
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4579	NC_013716	GGT	2	6	221030	221035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783968
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4585	NC_013716	ACC	2	6	221304	221309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783968
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4588	NC_013716	CGC	2	6	221394	221399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783968
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4592	NC_013716	ATT	2	6	221733	221738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783968
4593	NC_013716	GGC	2	6	221753	221758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783968
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4605	NC_013716	CGC	2	6	222203	222208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783968
4606	NC_013716	TGC	2	6	222241	222246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783968
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4622	NC_013716	TGG	2	6	222844	222849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783968
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4986	NC_013716	GCA	2	6	245980	245985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783988
4987	NC_013716	CTGC	2	8	245994	246001	0 %	25 %	25 %	50 %	283783988
4988	NC_013716	GCG	2	6	246082	246087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783988
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4990	NC_013716	CAG	2	6	246200	246205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783988
4991	NC_013716	AGC	2	6	246240	246245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783988
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4994	NC_013716	TCA	2	6	246291	246296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783988
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4996	NC_013716	GCA	2	6	246301	246306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783988
4997	NC_013716	GGCT	3	12	246312	246323	0 %	25 %	50 %	25 %	283783988
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4999	NC_013716	GCC	2	6	246356	246361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783988
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