MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-2 chromosome

Total Repeats: 105923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013446	GGCG	2	8	137377	137384	0 %	0 %	75 %	25 %	264676258
3002	NC_013446	GGC	2	6	137422	137427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676258
3003	NC_013446	TGG	2	6	137475	137480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676258
3004	NC_013446	GC	3	6	137518	137523	0 %	0 %	50 %	50 %	264676258
3005	NC_013446	TGGC	2	8	137524	137531	0 %	25 %	50 %	25 %	264676258
3006	NC_013446	GGC	2	6	137569	137574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676258
3007	NC_013446	GCA	2	6	137733	137738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676259
3008	NC_013446	GCC	2	6	137756	137761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676259
3009	NC_013446	CCA	2	6	137871	137876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676259
3010	NC_013446	CAGC	2	8	137887	137894	25 %	0 %	25 %	50 %	264676259
3011	NC_013446	TGG	2	6	137933	137938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676259
3012	NC_013446	GC	3	6	137959	137964	0 %	0 %	50 %	50 %	264676259
3013	NC_013446	GTCT	2	8	137980	137987	0 %	50 %	25 %	25 %	264676259
3014	NC_013446	CCA	2	6	138006	138011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676259
3015	NC_013446	GTG	2	6	138059	138064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676259
3016	NC_013446	CTG	2	6	138091	138096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676259
3017	NC_013446	GCG	2	6	138111	138116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676259
3018	NC_013446	CCA	2	6	138126	138131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676259
3019	NC_013446	CGGC	2	8	138209	138216	0 %	0 %	50 %	50 %	264676259
3020	NC_013446	GCTC	2	8	138303	138310	0 %	25 %	25 %	50 %	264676259
3021	NC_013446	CAG	2	6	138322	138327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676259
3022	NC_013446	TCC	2	6	138356	138361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676259
3023	NC_013446	GCAACT	2	12	138396	138407	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	264676259
3024	NC_013446	CAG	2	6	138415	138420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676259
3025	NC_013446	GC	3	6	138421	138426	0 %	0 %	50 %	50 %	264676259
3026	NC_013446	GC	3	6	138438	138443	0 %	0 %	50 %	50 %	264676259
3027	NC_013446	GCG	3	9	138446	138454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676259
3028	NC_013446	GCT	2	6	138566	138571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676259
3029	NC_013446	CTT	2	6	138737	138742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676260
3030	NC_013446	TC	3	6	138754	138759	0 %	50 %	0 %	50 %	264676260
3031	NC_013446	CCG	2	6	138767	138772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676260
3032	NC_013446	GCCAAG	2	12	138787	138798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676260
3033	NC_013446	CAT	2	6	138855	138860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676260
3034	NC_013446	CTG	2	6	138945	138950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676260
3035	NC_013446	ACC	2	6	138965	138970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676260
3036	NC_013446	GTG	2	6	139027	139032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676260
3037	NC_013446	GGC	2	6	139051	139056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676260
3038	NC_013446	CGC	2	6	139059	139064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676260
3039	NC_013446	TGG	2	6	139087	139092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676260
3040	NC_013446	CTG	2	6	139135	139140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676260
3041	NC_013446	TTC	2	6	139144	139149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676260
3042	NC_013446	GAA	2	6	139345	139350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676261
3043	NC_013446	GCA	2	6	139366	139371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676261
3044	NC_013446	TGA	2	6	139381	139386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676261
3045	NC_013446	GAA	2	6	139394	139399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676261
3046	NC_013446	TGGT	2	8	139449	139456	0 %	50 %	50 %	0 %	264676261
3047	NC_013446	CGG	2	6	139516	139521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676261
3048	NC_013446	CGG	2	6	139528	139533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676261
3049	NC_013446	ATG	2	6	139551	139556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676261
3050	NC_013446	GGTC	2	8	139633	139640	0 %	25 %	50 %	25 %	264676261
3051	NC_013446	CAG	2	6	139661	139666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676261
3052	NC_013446	GAT	2	6	139763	139768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676261
3053	NC_013446	C	6	6	139776	139781	0 %	0 %	0 %	100 %	264676261
3054	NC_013446	CAGC	2	8	139857	139864	25 %	0 %	25 %	50 %	264676261
3055	NC_013446	GCA	2	6	139887	139892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676261
3056	NC_013446	TTG	2	6	139917	139922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676261
3057	NC_013446	GC	3	6	139974	139979	0 %	0 %	50 %	50 %	264676261
3058	NC_013446	GCT	2	6	139981	139986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676261
3059	NC_013446	GCC	2	6	140045	140050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676261
3060	NC_013446	GCC	2	6	140057	140062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676261
3061	NC_013446	GAT	2	6	140063	140068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676261
3062	NC_013446	GTG	2	6	140100	140105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676261
3063	NC_013446	CCA	2	6	140170	140175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676261
3064	NC_013446	ATG	3	9	140256	140264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676261
3065	NC_013446	GCC	2	6	140303	140308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676261
3066	NC_013446	GAA	2	6	140351	140356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676261
3067	NC_013446	GCA	2	6	140419	140424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676261
3068	NC_013446	GAT	2	6	140429	140434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676261
3069	NC_013446	GCC	2	6	140436	140441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676261
3070	NC_013446	GCC	2	6	140450	140455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676261
3071	NC_013446	ATG	2	6	140541	140546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676261
3072	NC_013446	GTA	2	6	140552	140557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676261
3073	NC_013446	GC	3	6	141274	141279	0 %	0 %	50 %	50 %	264676262
3074	NC_013446	GC	3	6	141319	141324	0 %	0 %	50 %	50 %	264676262
3075	NC_013446	CAG	2	6	141325	141330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676262
3076	NC_013446	GCC	2	6	141391	141396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676262
3077	NC_013446	TGG	2	6	141455	141460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676262
3078	NC_013446	GGCC	2	8	141486	141493	0 %	0 %	50 %	50 %	264676262
3079	NC_013446	CTGC	2	8	141498	141505	0 %	25 %	25 %	50 %	264676262
3080	NC_013446	AGGGCA	2	12	141506	141517	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	264676262
3081	NC_013446	AGG	2	6	141539	141544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676262
3082	NC_013446	GAG	2	6	141550	141555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676262
3083	NC_013446	AAG	2	6	141559	141564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676262
3084	NC_013446	GCC	2	6	141595	141600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676262
3085	NC_013446	GTG	2	6	141601	141606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676262
3086	NC_013446	AGGCC	2	10	141624	141633	20 %	0 %	40 %	40 %	264676262
3087	NC_013446	GC	3	6	141643	141648	0 %	0 %	50 %	50 %	264676262
3088	NC_013446	CGA	2	6	141687	141692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676262
3089	NC_013446	CCCG	2	8	141702	141709	0 %	0 %	25 %	75 %	264676262
3090	NC_013446	CAT	2	6	141714	141719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676262
3091	NC_013446	CAA	2	6	141765	141770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676262
3092	NC_013446	GGC	2	6	141838	141843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676262
3093	NC_013446	TCTCGT	2	12	141854	141865	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	264676262
3094	NC_013446	CGGC	2	8	141926	141933	0 %	0 %	50 %	50 %	264676262
3095	NC_013446	GT	3	6	141968	141973	0 %	50 %	50 %	0 %	264676262
3096	NC_013446	GGA	2	6	142008	142013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676262
3097	NC_013446	GTG	2	6	142015	142020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676262
3098	NC_013446	CCG	2	6	142026	142031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676262
3099	NC_013446	GAC	2	6	142090	142095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676262
3100	NC_013446	AAG	2	6	142099	142104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676262
3101	NC_013446	TCA	2	6	142187	142192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676262
3102	NC_013446	CAG	2	6	142216	142221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676262
3103	NC_013446	GTG	2	6	142225	142230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676262
3104	NC_013446	GCG	2	6	142235	142240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676262
3105	NC_013446	GATG	2	8	142272	142279	25 %	25 %	50 %	0 %	264676262
3106	NC_013446	TCG	2	6	142289	142294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676262
3107	NC_013446	GGT	2	6	142332	142337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676262
3108	NC_013446	CG	4	8	142344	142351	0 %	0 %	50 %	50 %	264676262
3109	NC_013446	TGA	2	6	142352	142357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676262
3110	NC_013446	CAG	2	6	142405	142410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676262
3111	NC_013446	GCG	2	6	142414	142419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676262
3112	NC_013446	CAA	2	6	142518	142523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676262
3113	NC_013446	TCA	2	6	142532	142537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676262
3114	NC_013446	CAT	2	6	142599	142604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676262
3115	NC_013446	GAC	2	6	142672	142677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676262
3116	NC_013446	AAG	2	6	142690	142695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676262
3117	NC_013446	GCT	2	6	142701	142706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676262
3118	NC_013446	CGG	2	6	142710	142715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676262
3119	NC_013446	ACG	2	6	142763	142768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676262
3120	NC_013446	CAA	2	6	142896	142901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676262
3121	NC_013446	GAA	2	6	142902	142907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676262
3122	NC_013446	CGC	2	6	142910	142915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676262
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3361	NC_013446	GCA	2	6	154076	154081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676271
3362	NC_013446	GCA	2	6	154151	154156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676271
3363	NC_013446	GCTGG	2	10	154166	154175	0 %	20 %	60 %	20 %	264676271
3364	NC_013446	GC	3	6	154245	154250	0 %	0 %	50 %	50 %	264676271
3365	NC_013446	GCAGA	2	10	154395	154404	40 %	0 %	40 %	20 %	264676271
3366	NC_013446	GCG	2	6	154418	154423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676271
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3370	NC_013446	TGG	2	6	154497	154502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676271
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3389	NC_013446	CTG	2	6	155175	155180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676271
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3481	NC_013446	GC	3	6	159591	159596	0 %	0 %	50 %	50 %	264676275
3482	NC_013446	CAAG	2	8	159599	159606	50 %	0 %	25 %	25 %	264676275
3483	NC_013446	AGTC	2	8	159639	159646	25 %	25 %	25 %	25 %	264676275
3484	NC_013446	CAG	3	9	159647	159655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676275
3485	NC_013446	CGG	2	6	159679	159684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676275
3486	NC_013446	GC	3	6	159693	159698	0 %	0 %	50 %	50 %	264676275
3487	NC_013446	TGG	2	6	159772	159777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676275
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3489	NC_013446	GGT	2	6	159809	159814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676275
3490	NC_013446	CCGC	2	8	159823	159830	0 %	0 %	25 %	75 %	264676275
3491	NC_013446	GTG	2	6	159882	159887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676275
3492	NC_013446	CTG	2	6	159899	159904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676275
3493	NC_013446	GGC	2	6	159909	159914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676275
3494	NC_013446	GGC	2	6	159929	159934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676275
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