MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-2 chromosome

Total Repeats: 105923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013446	CGA	2	6	45057	45062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676172
1002	NC_013446	TTG	2	6	45065	45070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676172
1003	NC_013446	GCAGG	2	10	45147	45156	20 %	0 %	60 %	20 %	264676172
1004	NC_013446	CAG	2	6	45298	45303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676172
1005	NC_013446	TTG	2	6	45319	45324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676172
1006	NC_013446	TGC	2	6	45381	45386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676172
1007	NC_013446	TGCA	2	8	45404	45411	25 %	25 %	25 %	25 %	264676172
1008	NC_013446	GCA	2	6	45418	45423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676172
1009	NC_013446	TGT	2	6	45663	45668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676173
1010	NC_013446	GGC	2	6	45701	45706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1011	NC_013446	GC	3	6	45737	45742	0 %	0 %	50 %	50 %	264676173
1012	NC_013446	GCA	2	6	45747	45752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1013	NC_013446	TGC	2	6	45759	45764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1014	NC_013446	CGG	2	6	45814	45819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1015	NC_013446	AGG	2	6	45843	45848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676173
1016	NC_013446	GCG	2	6	45861	45866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1017	NC_013446	GACA	2	8	45880	45887	50 %	0 %	25 %	25 %	264676173
1018	NC_013446	GGC	2	6	45890	45895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1019	NC_013446	CGTG	2	8	45934	45941	0 %	25 %	50 %	25 %	264676173
1020	NC_013446	CG	3	6	45945	45950	0 %	0 %	50 %	50 %	264676173
1021	NC_013446	CAG	2	6	46025	46030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1022	NC_013446	GAT	2	6	46037	46042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676173
1023	NC_013446	TGG	2	6	46047	46052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676173
1024	NC_013446	GTG	2	6	46112	46117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676173
1025	NC_013446	CGG	2	6	46122	46127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1026	NC_013446	TCC	2	6	46192	46197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676173
1027	NC_013446	C	7	7	46265	46271	0 %	0 %	0 %	100 %	264676173
1028	NC_013446	GCA	2	6	46284	46289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1029	NC_013446	AAC	2	6	46311	46316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676173
1030	NC_013446	GGC	2	6	46334	46339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1031	NC_013446	GC	3	6	46430	46435	0 %	0 %	50 %	50 %	264676173
1032	NC_013446	ATC	2	6	46445	46450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676173
1033	NC_013446	CACG	2	8	46594	46601	25 %	0 %	25 %	50 %	264676173
1034	NC_013446	CCA	2	6	46623	46628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676173
1035	NC_013446	CGCT	2	8	46736	46743	0 %	25 %	25 %	50 %	264676173
1036	NC_013446	GGC	2	6	46822	46827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1037	NC_013446	CGT	2	6	46895	46900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1038	NC_013446	CGA	2	6	46927	46932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1039	NC_013446	GCC	2	6	47040	47045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676173
1040	NC_013446	CGA	2	6	47059	47064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1041	NC_013446	GC	3	6	47066	47071	0 %	0 %	50 %	50 %	264676173
1042	NC_013446	CG	3	6	47145	47150	0 %	0 %	50 %	50 %	264676173
1043	NC_013446	CTG	2	6	47219	47224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1044	NC_013446	GCC	2	6	47348	47353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676173
1045	NC_013446	TGC	2	6	47398	47403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1046	NC_013446	GGC	2	6	47452	47457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1047	NC_013446	GCC	2	6	47543	47548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676173
1048	NC_013446	GCT	2	6	47554	47559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676173
1049	NC_013446	A	6	6	47573	47578	100 %	0 %	0 %	0 %	264676173
1050	NC_013446	GGC	2	6	47579	47584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676173
1051	NC_013446	AGCTGG	2	12	47672	47683	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	264676174
1052	NC_013446	GATC	2	8	47694	47701	25 %	25 %	25 %	25 %	264676174
1053	NC_013446	CTG	2	6	47722	47727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676174
1054	NC_013446	GCC	2	6	47809	47814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676174
1055	NC_013446	TGC	2	6	47825	47830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676174
1056	NC_013446	GCT	2	6	47874	47879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676174
1057	NC_013446	CGG	2	6	47892	47897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676174
1058	NC_013446	GGTGT	2	10	47908	47917	0 %	40 %	60 %	0 %	264676174
1059	NC_013446	CTG	2	6	47925	47930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676174
1060	NC_013446	AAG	2	6	47968	47973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676174
1061	NC_013446	CAG	2	6	47986	47991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676174
1062	NC_013446	TCA	2	6	48068	48073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676174
1063	NC_013446	TGG	2	6	48095	48100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676174
1064	NC_013446	CAC	2	6	48105	48110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676174
1065	NC_013446	TGC	2	6	48183	48188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676174
1066	NC_013446	CTGC	2	8	48190	48197	0 %	25 %	25 %	50 %	264676174
1067	NC_013446	CTT	2	6	48278	48283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676174
1068	NC_013446	GCC	2	6	48462	48467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676175
1069	NC_013446	TCT	2	6	48475	48480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676175
1070	NC_013446	CTG	2	6	48554	48559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676175
1071	NC_013446	TGGC	2	8	48594	48601	0 %	25 %	50 %	25 %	264676175
1072	NC_013446	GCC	2	6	48627	48632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676175
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1077	NC_013446	GCT	2	6	48698	48703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676175
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1080	NC_013446	CCCGG	2	10	48836	48845	0 %	0 %	40 %	60 %	264676175
1081	NC_013446	GCA	2	6	48888	48893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676175
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1083	NC_013446	GTG	2	6	48969	48974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676175
1084	NC_013446	A	6	6	48985	48990	100 %	0 %	0 %	0 %	264676175
1085	NC_013446	GT	3	6	48997	49002	0 %	50 %	50 %	0 %	264676175
1086	NC_013446	GCC	2	6	49029	49034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676175
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1088	NC_013446	GT	3	6	49150	49155	0 %	50 %	50 %	0 %	264676176
1089	NC_013446	CCA	2	6	49186	49191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676176
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1091	NC_013446	TGC	2	6	49240	49245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676176
1092	NC_013446	GACC	2	8	49526	49533	25 %	0 %	25 %	50 %	264676176
1093	NC_013446	ATC	2	6	49584	49589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676176
1094	NC_013446	CTG	2	6	49593	49598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676176
1095	NC_013446	CAC	2	6	49619	49624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676176
1096	NC_013446	GCA	3	9	49628	49636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676176
1097	NC_013446	GTG	2	6	49740	49745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676176
1098	NC_013446	GCA	2	6	49765	49770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676176
1099	NC_013446	GCA	2	6	49899	49904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676177
1100	NC_013446	TGC	2	6	49913	49918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676177
1101	NC_013446	AGC	2	6	49991	49996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676177
1102	NC_013446	GCA	2	6	50004	50009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676177
1103	NC_013446	GCG	2	6	50018	50023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676177
1104	NC_013446	TGG	2	6	50078	50083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676177
1105	NC_013446	CA	3	6	50084	50089	50 %	0 %	0 %	50 %	264676177
1106	NC_013446	TGG	2	6	50105	50110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676177
1107	NC_013446	TGG	2	6	50113	50118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676177
1108	NC_013446	GCG	2	6	50119	50124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676177
1109	NC_013446	CTG	2	6	50129	50134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676177
1110	NC_013446	TGG	2	6	50165	50170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676177
1111	NC_013446	TGC	3	9	50228	50236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676177
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1113	NC_013446	GC	5	10	50296	50305	0 %	0 %	50 %	50 %	264676177
1114	NC_013446	GGACTG	2	12	50377	50388	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	264676177
1115	NC_013446	GCT	3	9	50406	50414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676177
1116	NC_013446	AAAG	2	8	50423	50430	75 %	0 %	25 %	0 %	264676177
1117	NC_013446	CTG	2	6	50485	50490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676178
1118	NC_013446	AGCAG	2	10	50508	50517	40 %	0 %	40 %	20 %	264676178
1119	NC_013446	GCA	2	6	50532	50537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676178
1120	NC_013446	AGC	2	6	50551	50556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676178
1121	NC_013446	TGG	2	6	50573	50578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676178
1122	NC_013446	CAT	2	6	50655	50660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676178
1123	NC_013446	GCG	2	6	50730	50735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676178
1124	NC_013446	CGA	2	6	50796	50801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676178
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1253	NC_013446	TAC	2	6	56694	56699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676183
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1498	NC_013446	CAT	2	6	67282	67287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676195
1499	NC_013446	GGC	2	6	67306	67311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676195
1500	NC_013446	GCT	2	6	67339	67344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676195

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