MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-2 chromosome

Total Repeats: 105923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013446	GC	3	6	19195	19200	0 %	0 %	50 %	50 %	264676153
502	NC_013446	CCG	2	6	19222	19227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676153
503	NC_013446	CAC	2	6	19403	19408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676153
504	NC_013446	CGC	2	6	19414	19419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676153
505	NC_013446	GC	3	6	19418	19423	0 %	0 %	50 %	50 %	264676153
506	NC_013446	GCT	2	6	19435	19440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676153
507	NC_013446	GCT	2	6	19456	19461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676153
508	NC_013446	GCAT	2	8	19468	19475	25 %	25 %	25 %	25 %	264676153
509	NC_013446	CCA	2	6	19486	19491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676153
510	NC_013446	TGG	2	6	19513	19518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676153
511	NC_013446	GCG	2	6	19565	19570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676153
512	NC_013446	CACGCC	2	12	19589	19600	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	264676153
513	NC_013446	TGGT	2	8	19623	19630	0 %	50 %	50 %	0 %	264676153
514	NC_013446	GCC	2	6	19650	19655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676153
515	NC_013446	CCG	2	6	19674	19679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676153
516	NC_013446	TGT	2	6	19696	19701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676153
517	NC_013446	CGA	3	9	19702	19710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676153
518	NC_013446	TTG	2	6	19728	19733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676153
519	NC_013446	GCC	2	6	19778	19783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676153
520	NC_013446	GCC	2	6	19811	19816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676153
521	NC_013446	GCT	2	6	19825	19830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676153
522	NC_013446	GCC	3	9	19842	19850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676153
523	NC_013446	GCG	2	6	19854	19859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676153
524	NC_013446	GTG	2	6	19878	19883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676153
525	NC_013446	GGC	2	6	19899	19904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676153
526	NC_013446	CGG	2	6	20021	20026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676153
527	NC_013446	GC	3	6	20027	20032	0 %	0 %	50 %	50 %	264676153
528	NC_013446	GCGCG	2	10	20096	20105	0 %	0 %	60 %	40 %	264676153
529	NC_013446	GGCTGC	2	12	20106	20117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	264676153
530	NC_013446	GC	3	6	20142	20147	0 %	0 %	50 %	50 %	264676153
531	NC_013446	CGG	2	6	20161	20166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676153
532	NC_013446	GTG	2	6	20169	20174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676153
533	NC_013446	CGG	2	6	20185	20190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676153
534	NC_013446	GCA	2	6	20191	20196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676153
535	NC_013446	CGA	2	6	20260	20265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676153
536	NC_013446	CTT	2	6	20278	20283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676153
537	NC_013446	CCA	3	9	20284	20292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676153
538	NC_013446	GC	3	6	20298	20303	0 %	0 %	50 %	50 %	264676153
539	NC_013446	GCA	2	6	20320	20325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676153
540	NC_013446	CCA	2	6	20335	20340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676153
541	NC_013446	TCA	2	6	20356	20361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676153
542	NC_013446	TGC	2	6	20409	20414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676153
543	NC_013446	GC	3	6	20416	20421	0 %	0 %	50 %	50 %	264676153
544	NC_013446	GTC	2	6	20465	20470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676153
545	NC_013446	GAA	2	6	20483	20488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676153
546	NC_013446	CTC	2	6	20504	20509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676153
547	NC_013446	CCG	3	9	20521	20529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676153
548	NC_013446	GCT	2	6	20536	20541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676153
549	NC_013446	CGG	2	6	20573	20578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676153
550	NC_013446	GGCC	2	8	20636	20643	0 %	0 %	50 %	50 %	264676153
551	NC_013446	GGCA	2	8	20680	20687	25 %	0 %	50 %	25 %	264676153
552	NC_013446	GCA	2	6	20701	20706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676153
553	NC_013446	AGC	2	6	20790	20795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676153
554	NC_013446	ATG	2	6	20838	20843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676153
555	NC_013446	CGA	2	6	20869	20874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676153
556	NC_013446	GC	3	6	20881	20886	0 %	0 %	50 %	50 %	264676153
557	NC_013446	CGC	2	6	20896	20901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676153
558	NC_013446	GGC	3	9	21005	21013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676153
559	NC_013446	GC	3	6	21106	21111	0 %	0 %	50 %	50 %	264676153
560	NC_013446	CAG	2	6	21146	21151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676153
561	NC_013446	CTT	2	6	21212	21217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676153
562	NC_013446	ATG	2	6	21795	21800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676154
563	NC_013446	CAA	2	6	21880	21885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676154
564	NC_013446	CAC	2	6	21900	21905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676154
565	NC_013446	AC	3	6	21948	21953	50 %	0 %	0 %	50 %	264676154
566	NC_013446	GAT	2	6	21967	21972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676154
567	NC_013446	T	6	6	21988	21993	0 %	100 %	0 %	0 %	264676154
568	NC_013446	CAGCC	2	10	22247	22256	20 %	0 %	20 %	60 %	264676155
569	NC_013446	CG	3	6	22302	22307	0 %	0 %	50 %	50 %	264676155
570	NC_013446	AGCC	2	8	22340	22347	25 %	0 %	25 %	50 %	264676155
571	NC_013446	TGC	2	6	22421	22426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676155
572	NC_013446	GC	3	6	22469	22474	0 %	0 %	50 %	50 %	264676155
573	NC_013446	GGC	2	6	22477	22482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676155
574	NC_013446	TCG	2	6	22496	22501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676155
575	NC_013446	GC	3	6	22514	22519	0 %	0 %	50 %	50 %	264676155
576	NC_013446	GTGGGC	2	12	22525	22536	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	264676155
577	NC_013446	TCC	2	6	22598	22603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676155
578	NC_013446	GCG	2	6	22605	22610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676155
579	NC_013446	CAG	3	9	22645	22653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676155
580	NC_013446	CGC	2	6	22674	22679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676155
581	NC_013446	GCTGC	2	10	22735	22744	0 %	20 %	40 %	40 %	264676155
582	NC_013446	CAAT	2	8	22803	22810	50 %	25 %	0 %	25 %	264676155
583	NC_013446	GC	3	6	22818	22823	0 %	0 %	50 %	50 %	264676155
584	NC_013446	GTA	2	6	22837	22842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676155
585	NC_013446	GAAAT	2	10	23017	23026	60 %	20 %	20 %	0 %	264676156
586	NC_013446	TTG	2	6	23039	23044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676156
587	NC_013446	TGC	2	6	23110	23115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676156
588	NC_013446	TGG	2	6	23162	23167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676156
589	NC_013446	GCT	2	6	23214	23219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676156
590	NC_013446	CCG	2	6	23274	23279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676156
591	NC_013446	CGC	2	6	23317	23322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676156
592	NC_013446	AAG	2	6	23368	23373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676156
593	NC_013446	CAA	2	6	23403	23408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676156
594	NC_013446	GGCA	2	8	23461	23468	25 %	0 %	50 %	25 %	264676157
595	NC_013446	GC	3	6	23476	23481	0 %	0 %	50 %	50 %	264676157
596	NC_013446	GCC	2	6	23518	23523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676157
597	NC_013446	GGT	2	6	23602	23607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676157
598	NC_013446	C	6	6	23667	23672	0 %	0 %	0 %	100 %	264676157
599	NC_013446	CGCA	2	8	23707	23714	25 %	0 %	25 %	50 %	264676157
600	NC_013446	GCA	3	9	23712	23720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676157
601	NC_013446	GAT	2	6	23744	23749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676157
602	NC_013446	CAA	2	6	23797	23802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676157
603	NC_013446	TGC	2	6	23831	23836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676157
604	NC_013446	GCC	2	6	23854	23859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676157
605	NC_013446	CCA	2	6	23868	23873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676157
606	NC_013446	CCA	2	6	23889	23894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676157
607	NC_013446	GGCT	2	8	23940	23947	0 %	25 %	50 %	25 %	264676157
608	NC_013446	ACACC	2	10	23985	23994	40 %	0 %	0 %	60 %	264676157
609	NC_013446	CTT	2	6	24006	24011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676157
610	NC_013446	CCA	2	6	24015	24020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676157
611	NC_013446	GCGCAG	2	12	24067	24078	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	264676157
612	NC_013446	GCG	2	6	24093	24098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676157
613	NC_013446	AGC	2	6	24191	24196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676157
614	NC_013446	CGC	2	6	24207	24212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676157
615	NC_013446	CGCC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	25 %	75 %	264676157
616	NC_013446	CG	3	6	24255	24260	0 %	0 %	50 %	50 %	264676157
617	NC_013446	CG	3	6	24283	24288	0 %	0 %	50 %	50 %	264676157
618	NC_013446	CCA	2	6	24294	24299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676157
619	NC_013446	ATG	2	6	24332	24337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676157
620	NC_013446	GCC	2	6	24350	24355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676157
621	NC_013446	CTC	2	6	24379	24384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676157
622	NC_013446	GCTGCA	2	12	24393	24404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	264676157
623	NC_013446	CAG	2	6	24421	24426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676157
624	NC_013446	CCA	2	6	24462	24467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676157
625	NC_013446	GCC	2	6	24471	24476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676157
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627	NC_013446	GGA	2	6	24527	24532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676157
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754	NC_013446	CAC	2	6	30122	30127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676161
755	NC_013446	TCT	2	6	30130	30135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676161
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757	NC_013446	CAC	2	6	30194	30199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676161
758	NC_013446	GTT	2	6	30215	30220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676161
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782	NC_013446	CG	3	6	32518	32523	0 %	0 %	50 %	50 %	264676162
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786	NC_013446	CGC	2	6	32943	32948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676162
787	NC_013446	TGG	2	6	32956	32961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676162
788	NC_013446	TGC	2	6	32992	32997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676162
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