MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-2 chromosome

Total Repeats: 105923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013446	GC	3	6	251230	251235	0 %	0 %	50 %	50 %	264676353
5502	NC_013446	CGG	2	6	251237	251242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676353
5503	NC_013446	TGCC	2	8	251279	251286	0 %	25 %	25 %	50 %	264676353
5504	NC_013446	AGCG	2	8	251311	251318	25 %	0 %	50 %	25 %	264676353
5505	NC_013446	TGC	2	6	251336	251341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676353
5506	NC_013446	CCA	2	6	251388	251393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676353
5507	NC_013446	GC	4	8	251419	251426	0 %	0 %	50 %	50 %	264676353
5508	NC_013446	TGG	2	6	251429	251434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676353
5509	NC_013446	CT	3	6	251506	251511	0 %	50 %	0 %	50 %	264676353
5510	NC_013446	GCG	2	6	251544	251549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676353
5511	NC_013446	GCG	2	6	251554	251559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676353
5512	NC_013446	CGG	2	6	251583	251588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676353
5513	NC_013446	CGT	2	6	251639	251644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676353
5514	NC_013446	CTG	2	6	251739	251744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676354
5515	NC_013446	CG	3	6	251810	251815	0 %	0 %	50 %	50 %	264676354
5516	NC_013446	CAC	2	6	251850	251855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676354
5517	NC_013446	CCACGC	2	12	251858	251869	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	264676354
5518	NC_013446	GTG	2	6	251929	251934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676354
5519	NC_013446	TGC	2	6	251975	251980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676354
5520	NC_013446	GCA	2	6	252008	252013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676354
5521	NC_013446	GCT	2	6	252030	252035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676354
5522	NC_013446	GC	3	6	252048	252053	0 %	0 %	50 %	50 %	264676354
5523	NC_013446	CACCAG	2	12	252066	252077	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	264676354
5524	NC_013446	CGGT	2	8	252079	252086	0 %	25 %	50 %	25 %	264676354
5525	NC_013446	GCA	2	6	252095	252100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676354
5526	NC_013446	CGTG	2	8	252110	252117	0 %	25 %	50 %	25 %	264676354
5527	NC_013446	CGG	2	6	252167	252172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676354
5528	NC_013446	GTG	2	6	252271	252276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676354
5529	NC_013446	TGC	2	6	252340	252345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676354
5530	NC_013446	TGC	2	6	252349	252354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676354
5531	NC_013446	GC	4	8	252361	252368	0 %	0 %	50 %	50 %	264676354
5532	NC_013446	CTC	2	6	252447	252452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676354
5533	NC_013446	TGG	2	6	252473	252478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676354
5534	NC_013446	CTGT	2	8	252524	252531	0 %	50 %	25 %	25 %	264676354
5535	NC_013446	CTCCA	2	10	252733	252742	20 %	20 %	0 %	60 %	264676355
5536	NC_013446	CGC	2	6	252752	252757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676355
5537	NC_013446	CTG	2	6	252776	252781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676355
5538	NC_013446	CCT	2	6	252810	252815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676355
5539	NC_013446	CCCG	2	8	252818	252825	0 %	0 %	25 %	75 %	264676355
5540	NC_013446	TGG	2	6	252837	252842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676355
5541	NC_013446	GCGG	2	8	252854	252861	0 %	0 %	75 %	25 %	264676355
5542	NC_013446	GGT	2	6	252925	252930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676355
5543	NC_013446	GCGG	2	8	252947	252954	0 %	0 %	75 %	25 %	264676355
5544	NC_013446	GCC	2	6	252983	252988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676355
5545	NC_013446	TGA	2	6	253008	253013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676355
5546	NC_013446	CAG	3	9	253018	253026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676355
5547	NC_013446	TGC	2	6	253119	253124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676355
5548	NC_013446	CATC	2	8	253130	253137	25 %	25 %	0 %	50 %	264676355
5549	NC_013446	GCT	2	6	253162	253167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676355
5550	NC_013446	GGCA	2	8	253210	253217	25 %	0 %	50 %	25 %	264676355
5551	NC_013446	ACC	2	6	253230	253235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676355
5552	NC_013446	TGCAGC	2	12	253269	253280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	264676355
5553	NC_013446	GGGC	2	8	253324	253331	0 %	0 %	75 %	25 %	264676355
5554	NC_013446	GCT	2	6	253339	253344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676355
5555	NC_013446	CAG	2	6	253408	253413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676355
5556	NC_013446	GC	3	6	253418	253423	0 %	0 %	50 %	50 %	264676355
5557	NC_013446	TGC	2	6	253431	253436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676355
5558	NC_013446	CGCGC	2	10	253501	253510	0 %	0 %	40 %	60 %	264676355
5559	NC_013446	GCC	2	6	253516	253521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676355
5560	NC_013446	TGA	2	6	253527	253532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676355
5561	NC_013446	GCA	2	6	253552	253557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676355
5562	NC_013446	GC	3	6	253579	253584	0 %	0 %	50 %	50 %	264676355
5563	NC_013446	GCTG	2	8	253648	253655	0 %	25 %	50 %	25 %	264676355
5564	NC_013446	TCCA	2	8	253739	253746	25 %	25 %	0 %	50 %	264676356
5565	NC_013446	CAT	2	6	253829	253834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676356
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5567	NC_013446	CGGCG	2	10	253983	253992	0 %	0 %	60 %	40 %	264676356
5568	NC_013446	GCC	2	6	254000	254005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676356
5569	NC_013446	TGCCGC	2	12	254008	254019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	264676356
5570	NC_013446	GGGC	3	12	254029	254040	0 %	0 %	75 %	25 %	264676356
5571	NC_013446	GACA	2	8	254054	254061	50 %	0 %	25 %	25 %	264676356
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5574	NC_013446	CCA	2	6	254098	254103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676356
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5579	NC_013446	GCA	2	6	254258	254263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676356
5580	NC_013446	GCA	2	6	254296	254301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676356
5581	NC_013446	CTG	2	6	254319	254324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676356
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5583	NC_013446	GCT	3	9	254438	254446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676356
5584	NC_013446	CTG	2	6	254451	254456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676356
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5586	NC_013446	CG	3	6	254551	254556	0 %	0 %	50 %	50 %	264676356
5587	NC_013446	ACG	2	6	254593	254598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676356
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5591	NC_013446	CGA	2	6	254773	254778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676357
5592	NC_013446	CGA	2	6	254794	254799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676357
5593	NC_013446	GGCT	2	8	254846	254853	0 %	25 %	50 %	25 %	264676357
5594	NC_013446	CGG	2	6	254878	254883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676357
5595	NC_013446	GGCCTG	2	12	254888	254899	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	264676357
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5601	NC_013446	CAC	2	6	255082	255087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676357
5602	NC_013446	ACC	2	6	255098	255103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676357
5603	NC_013446	GAA	2	6	255124	255129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676357
5604	NC_013446	GC	3	6	255206	255211	0 %	0 %	50 %	50 %	264676357
5605	NC_013446	GAA	3	9	255232	255240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676357
5606	NC_013446	GAA	2	6	255286	255291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676357
5607	NC_013446	TTC	2	6	255347	255352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676357
5608	NC_013446	GAG	2	6	255371	255376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676357
5609	NC_013446	TCGAGG	2	12	255579	255590	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	264676357
5610	NC_013446	CG	3	6	255631	255636	0 %	0 %	50 %	50 %	264676357
5611	NC_013446	GCC	2	6	255698	255703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676357
5612	NC_013446	ACG	2	6	255750	255755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676357
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5616	NC_013446	C	6	6	255899	255904	0 %	0 %	0 %	100 %	264676358
5617	NC_013446	GAC	2	6	255931	255936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676358
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5619	NC_013446	CGGC	2	8	255957	255964	0 %	0 %	50 %	50 %	264676358
5620	NC_013446	CTTG	2	8	255972	255979	0 %	50 %	25 %	25 %	264676358
5621	NC_013446	GTT	2	6	256004	256009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676358
5622	NC_013446	GC	4	8	256149	256156	0 %	0 %	50 %	50 %	264676359
5623	NC_013446	GCG	2	6	256182	256187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676359
5624	NC_013446	CG	4	8	256192	256199	0 %	0 %	50 %	50 %	264676359
5625	NC_013446	GCA	2	6	256251	256256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676359
5626	NC_013446	CG	3	6	256363	256368	0 %	0 %	50 %	50 %	264676359
5627	NC_013446	AAG	2	6	256463	256468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676359
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5629	NC_013446	CGGC	2	8	256566	256573	0 %	0 %	50 %	50 %	264676359
5630	NC_013446	CTG	3	9	256604	256612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676359
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5641	NC_013446	GGCC	2	8	257017	257024	0 %	0 %	50 %	50 %	264676359
5642	NC_013446	CG	3	6	257047	257052	0 %	0 %	50 %	50 %	264676359
5643	NC_013446	TGC	2	6	257063	257068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676359
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5645	NC_013446	CTG	2	6	257099	257104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676359
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5664	NC_013446	CGG	2	6	257854	257859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676360
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5734	NC_013446	CAG	2	6	260603	260608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676362
5735	NC_013446	GCAT	2	8	260610	260617	25 %	25 %	25 %	25 %	264676362
5736	NC_013446	TG	3	6	260719	260724	0 %	50 %	50 %	0 %	264676363
5737	NC_013446	CGTGG	2	10	260740	260749	0 %	20 %	60 %	20 %	264676363
5738	NC_013446	TGGCGC	2	12	260759	260770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	264676363
5739	NC_013446	AGG	2	6	260816	260821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676363
5740	NC_013446	CGC	2	6	260828	260833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676363
5741	NC_013446	CGG	2	6	260877	260882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676363
5742	NC_013446	GAT	2	6	260914	260919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676363
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5744	NC_013446	TGCGAT	2	12	260988	260999	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	264676363
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5985	NC_013446	CG	3	6	272348	272353	0 %	0 %	50 %	50 %	264676373
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5990	NC_013446	CGG	3	9	272466	272474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676373
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