MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-2 chromosome

Total Repeats: 105923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013446	CGT	2	6	229217	229222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676334
5002	NC_013446	GCC	2	6	229308	229313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676334
5003	NC_013446	TGC	2	6	229378	229383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676334
5004	NC_013446	GGCG	2	8	229388	229395	0 %	0 %	75 %	25 %	264676334
5005	NC_013446	GCCG	2	8	229397	229404	0 %	0 %	50 %	50 %	264676334
5006	NC_013446	TCC	2	6	229455	229460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676334
5007	NC_013446	ATG	2	6	229476	229481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676334
5008	NC_013446	CG	4	8	229498	229505	0 %	0 %	50 %	50 %	264676334
5009	NC_013446	GGC	2	6	229563	229568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676334
5010	NC_013446	TGA	2	6	229639	229644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676334
5011	NC_013446	CG	3	6	229687	229692	0 %	0 %	50 %	50 %	264676334
5012	NC_013446	TGG	2	6	229855	229860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676334
5013	NC_013446	GGC	2	6	229863	229868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676334
5014	NC_013446	GCC	2	6	229873	229878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676334
5015	NC_013446	GC	3	6	229950	229955	0 %	0 %	50 %	50 %	264676334
5016	NC_013446	TGA	2	6	229981	229986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676334
5017	NC_013446	GC	3	6	230079	230084	0 %	0 %	50 %	50 %	264676334
5018	NC_013446	CG	3	6	230093	230098	0 %	0 %	50 %	50 %	264676334
5019	NC_013446	CGG	2	6	230156	230161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676334
5020	NC_013446	T	6	6	230308	230313	0 %	100 %	0 %	0 %	264676335
5021	NC_013446	CTG	2	6	230324	230329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676335
5022	NC_013446	CG	4	8	230337	230344	0 %	0 %	50 %	50 %	264676335
5023	NC_013446	GCT	2	6	230350	230355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676335
5024	NC_013446	GCA	2	6	230434	230439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676335
5025	NC_013446	GGC	2	6	230453	230458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676335
5026	NC_013446	TCGGCC	2	12	230466	230477	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	264676335
5027	NC_013446	CTA	2	6	230485	230490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676335
5028	NC_013446	CG	3	6	230542	230547	0 %	0 %	50 %	50 %	264676335
5029	NC_013446	TGCG	2	8	230610	230617	0 %	25 %	50 %	25 %	264676335
5030	NC_013446	CTG	2	6	230618	230623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676335
5031	NC_013446	GCG	3	9	230624	230632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676335
5032	NC_013446	GTG	2	6	230651	230656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676335
5033	NC_013446	GCT	2	6	230707	230712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676335
5034	NC_013446	GCC	2	6	230727	230732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676335
5035	NC_013446	TGC	3	9	230754	230762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676335
5036	NC_013446	GC	3	6	230764	230769	0 %	0 %	50 %	50 %	264676335
5037	NC_013446	CAG	2	6	230807	230812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676335
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5040	NC_013446	GGC	2	6	230921	230926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676335
5041	NC_013446	GGC	2	6	230950	230955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676335
5042	NC_013446	GCC	2	6	230960	230965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676335
5043	NC_013446	TGC	2	6	231006	231011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676335
5044	NC_013446	AAAAC	2	10	231086	231095	80 %	0 %	0 %	20 %	264676335
5045	NC_013446	CGG	2	6	231146	231151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676336
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5050	NC_013446	GCA	2	6	231354	231359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676336
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5052	NC_013446	CGC	3	9	231422	231430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676336
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5054	NC_013446	GCA	2	6	231527	231532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676336
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5057	NC_013446	GCA	2	6	231611	231616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676336
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5060	NC_013446	CCA	2	6	231689	231694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676336
5061	NC_013446	CCA	2	6	231699	231704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676336
5062	NC_013446	GC	3	6	231718	231723	0 %	0 %	50 %	50 %	264676336
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5069	NC_013446	CCT	2	6	231929	231934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676336
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5107	NC_013446	GCG	2	6	233342	233347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676337
5108	NC_013446	CAC	2	6	233364	233369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676337
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5110	NC_013446	TGC	2	6	233456	233461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676337
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5113	NC_013446	TGAT	2	8	233524	233531	25 %	50 %	25 %	0 %	264676337
5114	NC_013446	TGG	2	6	233537	233542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676337
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5121	NC_013446	GCA	2	6	234155	234160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676338
5122	NC_013446	GGC	2	6	234186	234191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676338
5123	NC_013446	TGA	2	6	234215	234220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676338
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5241	NC_013446	GCG	2	6	240091	240096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676343
5242	NC_013446	GGC	2	6	240235	240240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676344
5243	NC_013446	TGA	2	6	240286	240291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676344
5244	NC_013446	TGG	2	6	240307	240312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676344
5245	NC_013446	GGC	2	6	240327	240332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676344
5246	NC_013446	CTG	2	6	240369	240374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676344
5247	NC_013446	CCA	2	6	240376	240381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676344
5248	NC_013446	TGC	2	6	240475	240480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676344
5249	NC_013446	GCT	2	6	240590	240595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676344
5250	NC_013446	GCG	2	6	240660	240665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676344
5251	NC_013446	GCC	2	6	240703	240708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676344
5252	NC_013446	GGCCG	2	10	240711	240720	0 %	0 %	60 %	40 %	264676344
5253	NC_013446	GAC	2	6	240741	240746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676344
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5255	NC_013446	CTG	2	6	240873	240878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676345
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5261	NC_013446	GGC	2	6	241115	241120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676345
5262	NC_013446	CGG	2	6	241140	241145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676345
5263	NC_013446	TGC	2	6	241261	241266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676345
5264	NC_013446	GCC	2	6	241287	241292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676345
5265	NC_013446	CTG	2	6	241329	241334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676345
5266	NC_013446	ATGGCG	2	12	241381	241392	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	264676345
5267	NC_013446	CTG	2	6	241423	241428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676345
5268	NC_013446	CTT	2	6	241432	241437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676345
5269	NC_013446	GC	4	8	241484	241491	0 %	0 %	50 %	50 %	264676345
5270	NC_013446	TGA	2	6	241525	241530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676345
5271	NC_013446	TGC	2	6	241582	241587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676345
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5274	NC_013446	CGG	3	9	241718	241726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676345
5275	NC_013446	CCCGG	2	10	241735	241744	0 %	0 %	40 %	60 %	264676345
5276	NC_013446	CG	3	6	241799	241804	0 %	0 %	50 %	50 %	264676345
5277	NC_013446	TGG	2	6	241900	241905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676345
5278	NC_013446	GCT	2	6	241960	241965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676345
5279	NC_013446	GGC	2	6	242042	242047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676345
5280	NC_013446	GAG	2	6	242058	242063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676345
5281	NC_013446	AGC	2	6	242088	242093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676345
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5283	NC_013446	ATC	2	6	242158	242163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676345
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5285	NC_013446	GC	3	6	242256	242261	0 %	0 %	50 %	50 %	264676345
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5287	NC_013446	CCG	2	6	242357	242362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676345
5288	NC_013446	CG	3	6	242361	242366	0 %	0 %	50 %	50 %	264676345
5289	NC_013446	GGC	2	6	242398	242403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676346
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5291	NC_013446	GCT	3	9	242580	242588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676346
5292	NC_013446	AGCG	2	8	242600	242607	25 %	0 %	50 %	25 %	264676346
5293	NC_013446	CAG	2	6	242611	242616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676346
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5299	NC_013446	ACCAGC	2	12	242816	242827	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	264676346
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5303	NC_013446	CTGGG	2	10	242933	242942	0 %	20 %	60 %	20 %	264676346
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5326	NC_013446	TGC	2	6	243978	243983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676347
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5328	NC_013446	TGCA	2	8	243998	244005	25 %	25 %	25 %	25 %	264676347
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5345	NC_013446	TCGG	2	8	244772	244779	0 %	25 %	50 %	25 %	264676348
5346	NC_013446	GC	3	6	244805	244810	0 %	0 %	50 %	50 %	264676348
5347	NC_013446	TGC	2	6	245016	245021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676348
5348	NC_013446	GTG	2	6	245039	245044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676348
5349	NC_013446	GC	3	6	245089	245094	0 %	0 %	50 %	50 %	264676348
5350	NC_013446	CAC	2	6	245104	245109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676348
5351	NC_013446	CCA	2	6	245121	245126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676348
5352	NC_013446	CGA	2	6	245131	245136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676348
5353	NC_013446	GC	3	6	245138	245143	0 %	0 %	50 %	50 %	264676348
5354	NC_013446	GGCG	2	8	245191	245198	0 %	0 %	75 %	25 %	264676348
5355	NC_013446	GCT	2	6	245260	245265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676348
5356	NC_013446	GC	3	6	245267	245272	0 %	0 %	50 %	50 %	264676348
5357	NC_013446	CGC	2	6	245293	245298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676348
5358	NC_013446	GGC	2	6	245300	245305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676348
5359	NC_013446	CCG	2	6	245394	245399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676348
5360	NC_013446	CCAG	2	8	245400	245407	25 %	0 %	25 %	50 %	264676348
5361	NC_013446	GC	3	6	245436	245441	0 %	0 %	50 %	50 %	264676348
5362	NC_013446	CCG	2	6	245457	245462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676348
5363	NC_013446	GC	3	6	245480	245485	0 %	0 %	50 %	50 %	264676348
5364	NC_013446	GCC	2	6	245582	245587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676348
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5483	NC_013446	TCC	2	6	250275	250280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676352
5484	NC_013446	TGTGGG	2	12	250309	250320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676352
5485	NC_013446	GCG	2	6	250390	250395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676352
5486	NC_013446	CTC	2	6	250490	250495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676352
5487	NC_013446	GCCC	2	8	250513	250520	0 %	0 %	25 %	75 %	264676352
5488	NC_013446	CCA	2	6	250551	250556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676352
5489	NC_013446	GTT	2	6	250565	250570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676352
5490	NC_013446	CGT	2	6	250645	250650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676352
5491	NC_013446	GCG	2	6	250655	250660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676352
5492	NC_013446	ATGG	2	8	250664	250671	25 %	25 %	50 %	0 %	264676352
5493	NC_013446	AGC	2	6	250696	250701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676352
5494	NC_013446	CAC	2	6	250703	250708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676352
5495	NC_013446	GCC	2	6	250769	250774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676352
5496	NC_013446	CGTG	2	8	251031	251038	0 %	25 %	50 %	25 %	264676353
5497	NC_013446	GCT	2	6	251127	251132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676353
5498	NC_013446	AGC	2	6	251146	251151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676353
5499	NC_013446	GGC	2	6	251176	251181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676353
5500	NC_013446	TGC	2	6	251216	251221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676353

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