MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 91169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013315	TTA	3	9	201438	201446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681931
4002	NC_013315	CTC	2	6	201469	201474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260681931
4003	NC_013315	ATG	2	6	201496	201501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681931
4004	NC_013315	AGA	2	6	201512	201517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681931
4005	NC_013315	GCT	2	6	201531	201536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260681931
4006	NC_013315	AAC	2	6	201576	201581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681931
4007	NC_013315	AAC	2	6	201590	201595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681931
4008	NC_013315	ATG	2	6	201600	201605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681931
4009	NC_013315	TGA	2	6	201617	201622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681931
4010	NC_013315	GAA	2	6	201636	201641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681931
4011	NC_013315	CTG	2	6	201748	201753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260681931
4012	NC_013315	ATA	2	6	201850	201855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681931
4013	NC_013315	GAA	2	6	201873	201878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681931
4014	NC_013315	ATT	2	6	201898	201903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681931
4015	NC_013315	AT	3	6	201952	201957	50 %	50 %	0 %	0 %	260681931
4016	NC_013315	TAA	2	6	201979	201984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681931
4017	NC_013315	ACT	2	6	201989	201994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681931
4018	NC_013315	GCA	2	6	202104	202109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681931
4019	NC_013315	ATG	2	6	202126	202131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681931
4020	NC_013315	AAT	2	6	202173	202178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681931
4021	NC_013315	ATT	2	6	202210	202215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681931
4022	NC_013315	ATG	2	6	202255	202260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681931
4023	NC_013315	AAT	2	6	202299	202304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681931
4024	NC_013315	ATA	2	6	202318	202323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681931
4025	NC_013315	GAA	2	6	202362	202367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681931
4026	NC_013315	AAG	2	6	202386	202391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681931
4027	NC_013315	GCT	2	6	202437	202442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260681931
4028	NC_013315	AAC	2	6	202475	202480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681931
4029	NC_013315	ATT	2	6	202538	202543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681931
4030	NC_013315	AGT	2	6	202571	202576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681931
4031	NC_013315	ACT	2	6	202611	202616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681931
4032	NC_013315	ACA	2	6	202625	202630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681931
4033	NC_013315	A	6	6	202638	202643	100 %	0 %	0 %	0 %	260681931
4034	NC_013315	TTA	2	6	202644	202649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681931
4035	NC_013315	AAG	2	6	202658	202663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681931
4036	NC_013315	TGT	2	6	202700	202705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681931
4037	NC_013315	A	7	7	202732	202738	100 %	0 %	0 %	0 %	260681931
4038	NC_013315	GAT	2	6	202947	202952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681932
4039	NC_013315	TTG	2	6	203005	203010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681932
4040	NC_013315	ATG	2	6	203017	203022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681932
4041	NC_013315	AGAA	2	8	203050	203057	75 %	0 %	25 %	0 %	260681932
4042	NC_013315	AGT	2	6	203113	203118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681932
4043	NC_013315	ATG	2	6	203168	203173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681933
4044	NC_013315	AAC	2	6	203187	203192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681933
4045	NC_013315	ATG	2	6	203266	203271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681933
4046	NC_013315	ATA	2	6	203357	203362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681933
4047	NC_013315	TTA	2	6	203424	203429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681933
4048	NC_013315	GGA	2	6	203518	203523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260681933
4049	NC_013315	ACT	2	6	203547	203552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681933
4050	NC_013315	TAT	2	6	203576	203581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681933
4051	NC_013315	AC	3	6	203604	203609	50 %	0 %	0 %	50 %	260681933
4052	NC_013315	TAA	2	6	203649	203654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681933
4053	NC_013315	AACA	2	8	203720	203727	75 %	0 %	0 %	25 %	260681933
4054	NC_013315	TA	3	6	203732	203737	50 %	50 %	0 %	0 %	260681933
4055	NC_013315	AT	3	6	203756	203761	50 %	50 %	0 %	0 %	260681933
4056	NC_013315	TGGAA	2	10	203782	203791	40 %	20 %	40 %	0 %	260681933
4057	NC_013315	AAT	2	6	203875	203880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681933
4058	NC_013315	TTA	2	6	203896	203901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681933
4059	NC_013315	GAGTAT	2	12	203947	203958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681933
4060	NC_013315	TGA	2	6	203976	203981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681933
4061	NC_013315	GAA	2	6	203992	203997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681933
4062	NC_013315	AT	3	6	204005	204010	50 %	50 %	0 %	0 %	260681933
4063	NC_013315	ATT	2	6	204404	204409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681934
4064	NC_013315	A	6	6	204422	204427	100 %	0 %	0 %	0 %	260681934
4065	NC_013315	ATT	2	6	204443	204448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681934
4066	NC_013315	TAT	2	6	204482	204487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681934
4067	NC_013315	ATA	2	6	204509	204514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681934
4068	NC_013315	AAAC	2	8	204552	204559	75 %	0 %	0 %	25 %	260681934
4069	NC_013315	ATT	3	9	204638	204646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681934
4070	NC_013315	TAT	2	6	204667	204672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681934
4071	NC_013315	A	6	6	204719	204724	100 %	0 %	0 %	0 %	260681934
4072	NC_013315	TTA	2	6	204743	204748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681934
4073	NC_013315	TAT	2	6	204775	204780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681934
4074	NC_013315	AACAAT	2	12	204781	204792	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	260681934
4075	NC_013315	TGG	3	9	204793	204801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260681934
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4078	NC_013315	ATTT	2	8	204935	204942	25 %	75 %	0 %	0 %	260681934
4079	NC_013315	AT	3	6	204981	204986	50 %	50 %	0 %	0 %	260681934
4080	NC_013315	T	6	6	205003	205008	0 %	100 %	0 %	0 %	260681934
4081	NC_013315	TAAT	2	8	205014	205021	50 %	50 %	0 %	0 %	260681934
4082	NC_013315	ATT	2	6	205028	205033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681934
4083	NC_013315	T	6	6	205041	205046	0 %	100 %	0 %	0 %	260681934
4084	NC_013315	AT	3	6	205048	205053	50 %	50 %	0 %	0 %	260681934
4085	NC_013315	GTC	2	6	205063	205068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260681934
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4087	NC_013315	TA	3	6	205123	205128	50 %	50 %	0 %	0 %	260681934
4088	NC_013315	ACT	2	6	205235	205240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681934
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4090	NC_013315	AAC	2	6	205498	205503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681935
4091	NC_013315	TAT	2	6	205572	205577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681935
4092	NC_013315	TA	3	6	205621	205626	50 %	50 %	0 %	0 %	260681935
4093	NC_013315	TA	3	6	205704	205709	50 %	50 %	0 %	0 %	260681935
4094	NC_013315	T	6	6	205771	205776	0 %	100 %	0 %	0 %	260681935
4095	NC_013315	A	8	8	205789	205796	100 %	0 %	0 %	0 %	260681935
4096	NC_013315	A	6	6	205805	205810	100 %	0 %	0 %	0 %	260681935
4097	NC_013315	TTC	2	6	205825	205830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260681935
4098	NC_013315	A	8	8	205834	205841	100 %	0 %	0 %	0 %	260681935
4099	NC_013315	TAG	2	6	205848	205853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681935
4100	NC_013315	ATG	2	6	205857	205862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681935
4101	NC_013315	GTA	2	6	205917	205922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681935
4102	NC_013315	ATG	2	6	205932	205937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681935
4103	NC_013315	TAAT	2	8	205968	205975	50 %	50 %	0 %	0 %	260681935
4104	NC_013315	T	6	6	205994	205999	0 %	100 %	0 %	0 %	260681935
4105	NC_013315	T	8	8	206012	206019	0 %	100 %	0 %	0 %	260681935
4106	NC_013315	TGA	2	6	206023	206028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681935
4107	NC_013315	AT	3	6	206029	206034	50 %	50 %	0 %	0 %	260681935
4108	NC_013315	ATT	3	9	206089	206097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681935
4109	NC_013315	TAA	2	6	206107	206112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681935
4110	NC_013315	TAA	2	6	206125	206130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681935
4111	NC_013315	AATA	2	8	206133	206140	75 %	25 %	0 %	0 %	260681935
4112	NC_013315	A	6	6	206143	206148	100 %	0 %	0 %	0 %	260681935
4113	NC_013315	CATA	2	8	206172	206179	50 %	25 %	0 %	25 %	260681935
4114	NC_013315	ATT	2	6	206182	206187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681935
4115	NC_013315	ATC	2	6	206237	206242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681935
4116	NC_013315	ATGA	2	8	206243	206250	50 %	25 %	25 %	0 %	260681935
4117	NC_013315	TAT	2	6	206277	206282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681935
4118	NC_013315	ATA	2	6	206336	206341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681935
4119	NC_013315	T	8	8	206349	206356	0 %	100 %	0 %	0 %	260681935
4120	NC_013315	TAA	2	6	206373	206378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681935
4121	NC_013315	TTAAT	2	10	206421	206430	40 %	60 %	0 %	0 %	260681935
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4249	NC_013315	CAT	2	6	213036	213041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681939
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4252	NC_013315	TTG	2	6	213227	213232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681939
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4254	NC_013315	TGA	2	6	213269	213274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681939
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4266	NC_013315	TGA	2	6	213717	213722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681940
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4496	NC_013315	T	6	6	223614	223619	0 %	100 %	0 %	0 %	260681949
4497	NC_013315	CTT	2	6	223629	223634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260681949
4498	NC_013315	CTT	3	9	223659	223667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260681949
4499	NC_013315	TTTCAA	2	12	223689	223700	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	260681949
4500	NC_013315	TTTTC	2	10	223749	223758	0 %	80 %	0 %	20 %	260681949

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