MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 91169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_013315	AAC	2	6	180101	180106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681912
3503	NC_013315	ATT	2	6	180110	180115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681912
3504	NC_013315	TGA	2	6	180119	180124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681912
3505	NC_013315	ACAA	2	8	180150	180157	75 %	0 %	0 %	25 %	260681912
3506	NC_013315	AAAAGA	2	12	180161	180172	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	260681912
3507	NC_013315	ATG	2	6	180201	180206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681912
3508	NC_013315	ATT	2	6	180211	180216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681912
3509	NC_013315	TAA	2	6	180217	180222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681912
3510	NC_013315	ATG	2	6	180235	180240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681912
3511	NC_013315	TTA	2	6	180273	180278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681912
3512	NC_013315	TAT	2	6	180317	180322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681912
3513	NC_013315	CCAA	2	8	180342	180349	50 %	0 %	0 %	50 %	260681912
3514	NC_013315	ATT	2	6	180365	180370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681912
3515	NC_013315	AT	3	6	180389	180394	50 %	50 %	0 %	0 %	260681912
3516	NC_013315	TTA	2	6	180474	180479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681912
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3518	NC_013315	GAT	3	9	180492	180500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681912
3519	NC_013315	ATT	2	6	180518	180523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681912
3520	NC_013315	TA	3	6	180608	180613	50 %	50 %	0 %	0 %	260681912
3521	NC_013315	A	6	6	180750	180755	100 %	0 %	0 %	0 %	260681913
3522	NC_013315	GAA	2	6	180758	180763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681913
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3524	NC_013315	AATT	2	8	180861	180868	50 %	50 %	0 %	0 %	260681913
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3530	NC_013315	A	7	7	181062	181068	100 %	0 %	0 %	0 %	260681913
3531	NC_013315	GAAAA	2	10	181090	181099	80 %	0 %	20 %	0 %	260681914
3532	NC_013315	TATT	2	8	181103	181110	25 %	75 %	0 %	0 %	260681914
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3535	NC_013315	A	7	7	181233	181239	100 %	0 %	0 %	0 %	260681914
3536	NC_013315	TAT	2	6	181251	181256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681914
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3539	NC_013315	ATT	2	6	181509	181514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681915
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3541	NC_013315	ATC	2	6	181542	181547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260681915
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3545	NC_013315	TAG	2	6	181580	181585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681915
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3547	NC_013315	CAA	2	6	181657	181662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681915
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3550	NC_013315	ATT	2	6	181920	181925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681915
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3553	NC_013315	TCC	2	6	181974	181979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260681915
3554	NC_013315	GCA	2	6	181999	182004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260681915
3555	NC_013315	ATT	2	6	182115	182120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681915
3556	NC_013315	TA	3	6	182158	182163	50 %	50 %	0 %	0 %	260681915
3557	NC_013315	AGT	2	6	182200	182205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681915
3558	NC_013315	GTT	2	6	182206	182211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260681915
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3561	NC_013315	TGG	2	6	182331	182336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260681915
3562	NC_013315	GTA	2	6	182342	182347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260681915
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3565	NC_013315	CAA	2	6	182513	182518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260681915
3566	NC_013315	ATA	3	9	182524	182532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681915
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3571	NC_013315	TA	3	6	182683	182688	50 %	50 %	0 %	0 %	260681915
3572	NC_013315	GA	3	6	182721	182726	50 %	0 %	50 %	0 %	260681915
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3602	NC_013315	A	7	7	183810	183816	100 %	0 %	0 %	0 %	260681917
3603	NC_013315	TG	3	6	183896	183901	0 %	50 %	50 %	0 %	260681917
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3609	NC_013315	AAG	2	6	184073	184078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260681917
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3617	NC_013315	TGGA	2	8	184318	184325	25 %	25 %	50 %	0 %	260681917
3618	NC_013315	AAGT	2	8	184358	184365	50 %	25 %	25 %	0 %	260681917
3619	NC_013315	TAA	2	6	184433	184438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260681918
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3621	NC_013315	TTA	2	6	184461	184466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260681918
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