MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 91169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53502	NC_013315	TAT	2	6	2448818	2448823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683848
53503	NC_013315	T	6	6	2448823	2448828	0 %	100 %	0 %	0 %	260683848
53504	NC_013315	AT	3	6	2448831	2448836	50 %	50 %	0 %	0 %	260683848
53505	NC_013315	TAC	2	6	2448863	2448868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683848
53506	NC_013315	ATT	2	6	2448888	2448893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683848
53507	NC_013315	AT	3	6	2448914	2448919	50 %	50 %	0 %	0 %	260683848
53508	NC_013315	ATT	2	6	2448942	2448947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683848
53509	NC_013315	ATT	2	6	2448951	2448956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683848
53510	NC_013315	ATTTCC	2	12	2448960	2448971	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	260683848
53511	NC_013315	ATTAC	2	10	2448985	2448994	40 %	40 %	0 %	20 %	260683848
53512	NC_013315	TTATAG	2	12	2449121	2449132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	260683848
53513	NC_013315	AT	4	8	2449176	2449183	50 %	50 %	0 %	0 %	260683848
53514	NC_013315	TAA	3	9	2449223	2449231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260683848
53515	NC_013315	AACC	2	8	2449256	2449263	50 %	0 %	0 %	50 %	260683848
53516	NC_013315	TA	3	6	2449272	2449277	50 %	50 %	0 %	0 %	260683848
53517	NC_013315	ACT	2	6	2449300	2449305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683848
53518	NC_013315	TTA	2	6	2449313	2449318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683848
53519	NC_013315	ACA	2	6	2449375	2449380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260683848
53520	NC_013315	TAC	2	6	2449388	2449393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683848
53521	NC_013315	CTA	2	6	2449430	2449435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683848
53522	NC_013315	ATA	2	6	2449440	2449445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260683848
53523	NC_013315	TGG	2	6	2449452	2449457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260683848
53524	NC_013315	TTA	2	6	2449478	2449483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260683848
53525	NC_013315	ATC	2	6	2449527	2449532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683848
53526	NC_013315	ATTT	2	8	2449536	2449543	25 %	75 %	0 %	0 %	260683848
53527	NC_013315	TC	3	6	2449572	2449577	0 %	50 %	0 %	50 %	260683848
53528	NC_013315	AT	3	6	2449602	2449607	50 %	50 %	0 %	0 %	260683848
53529	NC_013315	CCAACT	2	12	2449618	2449629	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	260683848
53530	NC_013315	ACTT	2	8	2449632	2449639	25 %	50 %	0 %	25 %	260683848
53531	NC_013315	T	6	6	2449698	2449703	0 %	100 %	0 %	0 %	260683848
53532	NC_013315	TAG	2	6	2449739	2449744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260683848
53533	NC_013315	CTA	2	6	2449808	2449813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683848
53534	NC_013315	TAG	2	6	2449820	2449825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260683848
53535	NC_013315	T	6	6	2449828	2449833	0 %	100 %	0 %	0 %	260683848
53536	NC_013315	AGA	2	6	2449863	2449868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260683848
53537	NC_013315	AT	3	6	2449978	2449983	50 %	50 %	0 %	0 %	260683848
53538	NC_013315	TAC	2	6	2450019	2450024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683848
53539	NC_013315	CAATTT	2	12	2450060	2450071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	260683848
53540	NC_013315	GTA	2	6	2450115	2450120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260683848
53541	NC_013315	CAA	2	6	2450126	2450131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260683848
53542	NC_013315	T	6	6	2450179	2450184	0 %	100 %	0 %	0 %	260683848
53543	NC_013315	ATC	2	6	2450191	2450196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260683848
53544	NC_013315	A	7	7	2450485	2450491	100 %	0 %	0 %	0 %	260683849
53545	NC_013315	A	6	6	2450517	2450522	100 %	0 %	0 %	0 %	260683849
53546	NC_013315	T	6	6	2450582	2450587	0 %	100 %	0 %	0 %	260683849
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53550	NC_013315	CTG	2	6	2450876	2450881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260683849
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53552	NC_013315	TAA	2	6	2450990	2450995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260683849
53553	NC_013315	TTG	2	6	2451017	2451022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260683849
53554	NC_013315	AGT	2	6	2451046	2451051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260683849
53555	NC_013315	ATG	2	6	2451064	2451069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260683849
53556	NC_013315	GGT	2	6	2451079	2451084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260683849
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53571	NC_013315	T	8	8	2451585	2451592	0 %	100 %	0 %	0 %	260683850
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53585	NC_013315	AT	3	6	2452169	2452174	50 %	50 %	0 %	0 %	260683850
53586	NC_013315	TA	3	6	2452179	2452184	50 %	50 %	0 %	0 %	260683850
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53601	NC_013315	TGT	2	6	2452791	2452796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260683851
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