MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU2

Total Repeats: 233

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013284	GCC	2	6	188	193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260585139
2	NC_013284	AGC	2	6	322	327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585139
3	NC_013284	GAC	2	6	546	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585140
4	NC_013284	TCT	3	9	922	930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260585141
5	NC_013284	CAC	2	6	949	954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260585141
6	NC_013284	AAC	2	6	996	1001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260585141
7	NC_013284	ACC	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260585141
8	NC_013284	TGC	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585141
9	NC_013284	GAC	2	6	1257	1262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585141
10	NC_013284	TTC	2	6	1354	1359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260585141
11	NC_013284	TTA	2	6	1374	1379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260585141
12	NC_013284	TTG	2	6	1393	1398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260585141
13	NC_013284	GAA	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260585141
14	NC_013284	GCA	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585141
15	NC_013284	GGA	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260585141
16	NC_013284	AGA	2	6	1730	1735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260585141
17	NC_013284	GCT	3	9	1804	1812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585141
18	NC_013284	ATT	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260585141
19	NC_013284	AAT	2	6	1841	1846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260585141
20	NC_013284	TGA	2	6	1940	1945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585141
21	NC_013284	ATC	2	6	1954	1959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585141
22	NC_013284	CAG	2	6	2143	2148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585141
23	NC_013284	TTG	2	6	2179	2184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260585141
24	NC_013284	ATG	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585141
25	NC_013284	GAT	2	6	2246	2251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585141
26	NC_013284	TGC	2	6	2287	2292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585141
27	NC_013284	CCA	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260585141
28	NC_013284	CTT	2	6	2391	2396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260585141
29	NC_013284	AGG	2	6	2551	2556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260585142
30	NC_013284	CTG	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585142
31	NC_013284	GAA	2	6	2858	2863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260585142
32	NC_013284	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260585142
33	NC_013284	TGT	2	6	2954	2959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260585142
34	NC_013284	ATT	2	6	3009	3014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260585142
35	NC_013284	GCC	2	6	3027	3032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260585142
36	NC_013284	GTC	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585142
37	NC_013284	GAA	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260585142
38	NC_013284	TGA	2	6	3630	3635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585143
39	NC_013284	AGG	2	6	3656	3661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260585143
40	NC_013284	GGC	2	6	3905	3910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585144
41	NC_013284	GCC	2	6	3995	4000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260585144
42	NC_013284	ATC	2	6	4029	4034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585144
43	NC_013284	GCT	2	6	4037	4042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585144
44	NC_013284	TGG	2	6	4054	4059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260585144
45	NC_013284	GAA	2	6	4112	4117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260585144
46	NC_013284	GCA	2	6	4245	4250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585145
47	NC_013284	CTG	2	6	4355	4360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585145
48	NC_013284	TCA	2	6	4498	4503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585146
49	NC_013284	ACC	2	6	4678	4683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260585146
50	NC_013284	GTC	2	6	4729	4734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585146
51	NC_013284	ATC	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585146
52	NC_013284	CAG	2	6	4779	4784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585146
53	NC_013284	CAA	2	6	4787	4792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260585146
54	NC_013284	AGT	2	6	4807	4812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585146
55	NC_013284	TGG	2	6	4817	4822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260585146
56	NC_013284	CGG	2	6	4917	4922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585146
57	NC_013284	TGC	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585147
58	NC_013284	AGT	2	6	5259	5264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585147
59	NC_013284	CGG	2	6	5266	5271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585147
60	NC_013284	CGG	2	6	5342	5347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585147
61	NC_013284	GCC	2	6	5361	5366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260585147
62	NC_013284	CCA	2	6	5583	5588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260585147
63	NC_013284	AAT	2	6	5591	5596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260585147
64	NC_013284	CCA	2	6	5793	5798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260585147
65	NC_013284	AAT	2	6	5800	5805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260585147
66	NC_013284	TGA	2	6	6842	6847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585149
67	NC_013284	CCT	2	6	6954	6959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260585149
68	NC_013284	GCT	2	6	7074	7079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585149
69	NC_013284	ACA	2	6	7543	7548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260585150
70	NC_013284	AGT	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585152
71	NC_013284	GGC	2	6	8433	8438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585152
72	NC_013284	GAA	2	6	8530	8535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260585152
73	NC_013284	CAT	2	6	8574	8579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585152
74	NC_013284	ATA	2	6	8606	8611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260585152
75	NC_013284	AGA	2	6	8622	8627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260585152
76	NC_013284	TCG	2	6	8753	8758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585152
77	NC_013284	TCG	2	6	9525	9530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585153
78	NC_013284	GCT	2	6	9532	9537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585153
79	NC_013284	CTT	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260585153
80	NC_013284	TGC	3	9	9594	9602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585153
81	NC_013284	ATA	2	6	9641	9646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260585153
82	NC_013284	CAA	2	6	9757	9762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260585153
83	NC_013284	CGG	2	6	9790	9795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585153
84	NC_013284	CTT	2	6	9805	9810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260585153
85	NC_013284	GGA	2	6	10067	10072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260585154
86	NC_013284	TGT	2	6	10268	10273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260585154
87	NC_013284	GCA	2	6	10329	10334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585154
88	NC_013284	TCT	2	6	10382	10387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260585154
89	NC_013284	TGA	2	6	10400	10405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585154
90	NC_013284	TTG	2	6	10440	10445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260585154
91	NC_013284	GCT	2	6	10508	10513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585154
92	NC_013284	GCT	2	6	10777	10782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585155
93	NC_013284	AGC	2	6	10785	10790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585155
94	NC_013284	CAT	2	6	10945	10950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585156
95	NC_013284	GAT	2	6	11003	11008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585156
96	NC_013284	ACG	2	6	11010	11015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585156
97	NC_013284	GCC	2	6	11099	11104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260585157
98	NC_013284	CAA	2	6	11232	11237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260585157
99	NC_013284	AGG	2	6	11241	11246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260585157
100	NC_013284	GCC	2	6	11283	11288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260585157
101	NC_013284	TCA	2	6	11397	11402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585157
102	NC_013284	GGC	2	6	11420	11425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585157
103	NC_013284	GCT	2	6	11445	11450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585157
104	NC_013284	GCA	2	6	11476	11481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585157
105	NC_013284	TTC	2	6	11581	11586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260585157
106	NC_013284	GCG	2	6	11661	11666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585157
107	NC_013284	TAC	2	6	11705	11710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585157
108	NC_013284	GGC	2	6	11814	11819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585158
109	NC_013284	GGC	2	6	11895	11900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585158
110	NC_013284	CAT	3	9	11979	11987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585158
111	NC_013284	GGC	2	6	11989	11994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585158
112	NC_013284	CGC	2	6	12021	12026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260585158
113	NC_013284	TTA	2	6	12029	12034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260585158
114	NC_013284	CGG	2	6	12086	12091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585159
115	NC_013284	CTG	2	6	12118	12123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585159
116	NC_013284	CAT	2	6	12141	12146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585159
117	NC_013284	CTC	2	6	12172	12177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260585159
118	NC_013284	TGA	2	6	12203	12208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585159
119	NC_013284	CAA	2	6	12302	12307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260585159
120	NC_013284	CTA	2	6	12657	12662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585159
121	NC_013284	CCG	2	6	12687	12692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260585159
122	NC_013284	CTG	2	6	12925	12930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585159
123	NC_013284	GCG	2	6	12991	12996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260585159
124	NC_013284	GAT	2	6	13098	13103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585159
125	NC_013284	GAA	2	6	13168	13173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260585159
126	NC_013284	CCG	2	6	13197	13202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260585159
127	NC_013284	CTG	2	6	13267	13272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585159
128	NC_013284	CAT	2	6	13300	13305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260585159
129	NC_013284	AAC	2	6	13378	13383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260585159
130	NC_013284	AGC	2	6	13483	13488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585159
131	NC_013284	GCT	2	6	13569	13574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260585159
132	NC_013284	TGA	2	6	13703	13708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585159
133	NC_013284	GCA	2	6	13725	13730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260585159
134	NC_013284	TTA	2	6	13845	13850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260585159
135	NC_013284	GTG	2	6	13862	13867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260585159
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138	NC_013284	TGA	2	6	13934	13939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585159
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142	NC_013284	TGT	2	6	14601	14606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260585159
143	NC_013284	GTG	2	6	14627	14632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260585159
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232	NC_013284	ATA	2	6	22184	22189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260585170
233	NC_013284	GAT	2	6	22342	22347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260585170

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.