MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU1

Total Repeats: 287

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013283	GCAG	2	8	73	80	25 %	0 %	50 %	25 %	260424376
2	NC_013283	ATTC	2	8	602	609	25 %	50 %	0 %	25 %	260424377
3	NC_013283	GATG	2	8	881	888	25 %	25 %	50 %	0 %	260424377
4	NC_013283	TGCG	2	8	920	927	0 %	25 %	50 %	25 %	260424377
5	NC_013283	CTGG	2	8	1800	1807	0 %	25 %	50 %	25 %	260424378
6	NC_013283	CTGG	2	8	2190	2197	0 %	25 %	50 %	25 %	260424379
7	NC_013283	TCGC	2	8	2655	2662	0 %	25 %	25 %	50 %	260424379
8	NC_013283	TTAA	2	8	3028	3035	50 %	50 %	0 %	0 %	260424379
9	NC_013283	GGCG	2	8	3385	3392	0 %	0 %	75 %	25 %	260424381
10	NC_013283	CAGC	2	8	3567	3574	25 %	0 %	25 %	50 %	260424381
11	NC_013283	GTTC	2	8	4327	4334	0 %	50 %	25 %	25 %	260424382
12	NC_013283	ATCA	2	8	5446	5453	50 %	25 %	0 %	25 %	260424383
13	NC_013283	CCCT	2	8	6276	6283	0 %	25 %	0 %	75 %	260424384
14	NC_013283	GCGT	2	8	6549	6556	0 %	25 %	50 %	25 %	260424385
15	NC_013283	AAAT	2	8	7846	7853	75 %	25 %	0 %	0 %	260424387
16	NC_013283	ACAT	2	8	8020	8027	50 %	25 %	0 %	25 %	260424387
17	NC_013283	TCGC	2	8	8255	8262	0 %	25 %	25 %	50 %	260424387
18	NC_013283	GCTG	2	8	8472	8479	0 %	25 %	50 %	25 %	260424387
19	NC_013283	AGCG	2	8	9425	9432	25 %	0 %	50 %	25 %	260424389
20	NC_013283	CGCT	2	8	9616	9623	0 %	25 %	25 %	50 %	260424389
21	NC_013283	TGAT	2	8	10071	10078	25 %	50 %	25 %	0 %	260424390
22	NC_013283	GTCA	2	8	10917	10924	25 %	25 %	25 %	25 %	260424392
23	NC_013283	GGCT	2	8	11263	11270	0 %	25 %	50 %	25 %	260424392
24	NC_013283	CGCC	2	8	11846	11853	0 %	0 %	25 %	75 %	260424393
25	NC_013283	AGAA	2	8	12178	12185	75 %	0 %	25 %	0 %	260424393
26	NC_013283	ACTG	2	8	12567	12574	25 %	25 %	25 %	25 %	260424394
27	NC_013283	CCCG	2	8	12601	12608	0 %	0 %	25 %	75 %	260424394
28	NC_013283	GCGG	2	8	14212	14219	0 %	0 %	75 %	25 %	260424396
29	NC_013283	AATG	2	8	14581	14588	50 %	25 %	25 %	0 %	260424396
30	NC_013283	GATG	2	8	15799	15806	25 %	25 %	50 %	0 %	260424397
31	NC_013283	GGCG	2	8	15877	15884	0 %	0 %	75 %	25 %	260424397
32	NC_013283	GCTG	2	8	16096	16103	0 %	25 %	50 %	25 %	260424397
33	NC_013283	TGAC	2	8	16446	16453	25 %	25 %	25 %	25 %	260424399
34	NC_013283	CGAA	2	8	17271	17278	50 %	0 %	25 %	25 %	260424402
35	NC_013283	GTGA	2	8	19760	19767	25 %	25 %	50 %	0 %	260424405
36	NC_013283	CGCC	2	8	20299	20306	0 %	0 %	25 %	75 %	260424405
37	NC_013283	TCTT	2	8	20725	20732	0 %	75 %	0 %	25 %	260424406
38	NC_013283	GGGC	2	8	21663	21670	0 %	0 %	75 %	25 %	260424407
39	NC_013283	GCTC	2	8	22417	22424	0 %	25 %	25 %	50 %	260424408
40	NC_013283	TGCG	2	8	23752	23759	0 %	25 %	50 %	25 %	260424408
41	NC_013283	GTCT	2	8	24730	24737	0 %	50 %	25 %	25 %	260424410
42	NC_013283	CGTG	2	8	25892	25899	0 %	25 %	50 %	25 %	260424412
43	NC_013283	TCGC	2	8	26099	26106	0 %	25 %	25 %	50 %	260424412
44	NC_013283	GGGC	2	8	26546	26553	0 %	0 %	75 %	25 %	260424413
45	NC_013283	GATG	2	8	27124	27131	25 %	25 %	50 %	0 %	260424415
46	NC_013283	GGCG	2	8	27391	27398	0 %	0 %	75 %	25 %	260424415
47	NC_013283	AGGC	2	8	28790	28797	25 %	0 %	50 %	25 %	260424417
48	NC_013283	AAAG	2	8	28842	28849	75 %	0 %	25 %	0 %	260424417
49	NC_013283	CGCT	2	8	29083	29090	0 %	25 %	25 %	50 %	260424417
50	NC_013283	TGGC	2	8	29711	29718	0 %	25 %	50 %	25 %	260424417
51	NC_013283	CCCG	2	8	30376	30383	0 %	0 %	25 %	75 %	260424418
52	NC_013283	GACA	2	8	30384	30391	50 %	0 %	25 %	25 %	260424418
53	NC_013283	CGAC	2	8	30415	30422	25 %	0 %	25 %	50 %	260424418
54	NC_013283	CTGG	2	8	31055	31062	0 %	25 %	50 %	25 %	260424418
55	NC_013283	TATC	2	8	31403	31410	25 %	50 %	0 %	25 %	260424418
56	NC_013283	CGCC	2	8	31626	31633	0 %	0 %	25 %	75 %	260424419
57	NC_013283	TGCG	2	8	33258	33265	0 %	25 %	50 %	25 %	260424420
58	NC_013283	GCCT	2	8	33804	33811	0 %	25 %	25 %	50 %	260424420
59	NC_013283	GCGG	2	8	33941	33948	0 %	0 %	75 %	25 %	260424420
60	NC_013283	CTTT	2	8	34905	34912	0 %	75 %	0 %	25 %	260424421
61	NC_013283	TCTG	2	8	35076	35083	0 %	50 %	25 %	25 %	260424421
62	NC_013283	GCTG	2	8	35271	35278	0 %	25 %	50 %	25 %	260424421
63	NC_013283	ATAC	2	8	35391	35398	50 %	25 %	0 %	25 %	260424422
64	NC_013283	TGAA	2	8	35413	35420	50 %	25 %	25 %	0 %	260424422
65	NC_013283	GGGC	2	8	35630	35637	0 %	0 %	75 %	25 %	260424422
66	NC_013283	GACA	2	8	35874	35881	50 %	0 %	25 %	25 %	260424422
67	NC_013283	CATC	2	8	36592	36599	25 %	25 %	0 %	50 %	260424423
68	NC_013283	CTTT	2	8	36708	36715	0 %	75 %	0 %	25 %	260424423
69	NC_013283	ATGA	2	8	36923	36930	50 %	25 %	25 %	0 %	260424423
70	NC_013283	TTTC	2	8	37771	37778	0 %	75 %	0 %	25 %	260424423
71	NC_013283	CCAG	2	8	39134	39141	25 %	0 %	25 %	50 %	260424425
72	NC_013283	CGAG	2	8	39311	39318	25 %	0 %	50 %	25 %	260424425
73	NC_013283	AGCA	2	8	40204	40211	50 %	0 %	25 %	25 %	260424426
74	NC_013283	GGCA	2	8	40411	40418	25 %	0 %	50 %	25 %	260424427
75	NC_013283	GGCG	2	8	41051	41058	0 %	0 %	75 %	25 %	260424427
76	NC_013283	TTCA	2	8	41325	41332	25 %	50 %	0 %	25 %	260424428
77	NC_013283	CAGC	2	8	42084	42091	25 %	0 %	25 %	50 %	260424428
78	NC_013283	TCGC	2	8	42334	42341	0 %	25 %	25 %	50 %	260424429
79	NC_013283	CGGG	2	8	42597	42604	0 %	0 %	75 %	25 %	260424429
80	NC_013283	GGCG	2	8	42636	42643	0 %	0 %	75 %	25 %	260424429
81	NC_013283	GCGG	2	8	42879	42886	0 %	0 %	75 %	25 %	260424429
82	NC_013283	CTGG	2	8	43008	43015	0 %	25 %	50 %	25 %	260424429
83	NC_013283	TTAC	2	8	43612	43619	25 %	50 %	0 %	25 %	260424430
84	NC_013283	CCTT	2	8	44030	44037	0 %	50 %	0 %	50 %	260424430
85	NC_013283	CATA	2	8	44139	44146	50 %	25 %	0 %	25 %	260424430
86	NC_013283	ATCT	2	8	44863	44870	25 %	50 %	0 %	25 %	260424432
87	NC_013283	TAAA	2	8	44876	44883	75 %	25 %	0 %	0 %	260424432
88	NC_013283	AGAA	2	8	44969	44976	75 %	0 %	25 %	0 %	260424433
89	NC_013283	GCGA	2	8	45460	45467	25 %	0 %	50 %	25 %	260424434
90	NC_013283	TGGT	2	8	45864	45871	0 %	50 %	50 %	0 %	260424435
91	NC_013283	CGTC	2	8	46102	46109	0 %	25 %	25 %	50 %	260424435
92	NC_013283	AACG	2	8	46124	46131	50 %	0 %	25 %	25 %	260424435
93	NC_013283	TGCC	2	8	46327	46334	0 %	25 %	25 %	50 %	260424435
94	NC_013283	ACCG	2	8	46663	46670	25 %	0 %	25 %	50 %	260424436
95	NC_013283	CGAG	2	8	46677	46684	25 %	0 %	50 %	25 %	260424436
96	NC_013283	GCCA	2	8	47348	47355	25 %	0 %	25 %	50 %	260424436
97	NC_013283	CTGA	2	8	47526	47533	25 %	25 %	25 %	25 %	260424437
98	NC_013283	CACC	2	8	48014	48021	25 %	0 %	0 %	75 %	260424437
99	NC_013283	GCCA	2	8	48705	48712	25 %	0 %	25 %	50 %	260424438
100	NC_013283	CTAT	2	8	48757	48764	25 %	50 %	0 %	25 %	260424438
101	NC_013283	GGCG	2	8	49178	49185	0 %	0 %	75 %	25 %	260424438
102	NC_013283	GGCT	2	8	49572	49579	0 %	25 %	50 %	25 %	260424438
103	NC_013283	TGCC	2	8	49588	49595	0 %	25 %	25 %	50 %	260424438
104	NC_013283	GACC	2	8	50353	50360	25 %	0 %	25 %	50 %	260424439
105	NC_013283	CTGG	2	8	51251	51258	0 %	25 %	50 %	25 %	260424440
106	NC_013283	GGCT	2	8	51435	51442	0 %	25 %	50 %	25 %	260424440
107	NC_013283	TGGC	2	8	51900	51907	0 %	25 %	50 %	25 %	260424440
108	NC_013283	CGTC	2	8	52114	52121	0 %	25 %	25 %	50 %	260424440
109	NC_013283	GCCG	2	8	52180	52187	0 %	0 %	50 %	50 %	260424440
110	NC_013283	GGCG	2	8	52205	52212	0 %	0 %	75 %	25 %	260424440
111	NC_013283	CGAT	2	8	53083	53090	25 %	25 %	25 %	25 %	260424441
112	NC_013283	CTGC	2	8	53144	53151	0 %	25 %	25 %	50 %	260424441
113	NC_013283	AGGC	2	8	55338	55345	25 %	0 %	50 %	25 %	260424444
114	NC_013283	CCGC	2	8	55617	55624	0 %	0 %	25 %	75 %	260424444
115	NC_013283	AAAG	2	8	56274	56281	75 %	0 %	25 %	0 %	260424444
116	NC_013283	ACGC	2	8	56410	56417	25 %	0 %	25 %	50 %	260424445
117	NC_013283	AATC	2	8	57262	57269	50 %	25 %	0 %	25 %	260424445
118	NC_013283	TGCA	2	8	58487	58494	25 %	25 %	25 %	25 %	260424446
119	NC_013283	TTCC	2	8	58938	58945	0 %	50 %	0 %	50 %	260424446
120	NC_013283	TGGC	2	8	59194	59201	0 %	25 %	50 %	25 %	260424446
121	NC_013283	GCTG	2	8	59422	59429	0 %	25 %	50 %	25 %	260424447
122	NC_013283	TCTG	3	12	60143	60154	0 %	50 %	25 %	25 %	260424447
123	NC_013283	AGAA	2	8	60508	60515	75 %	0 %	25 %	0 %	260424447
124	NC_013283	GGTG	2	8	63040	63047	0 %	25 %	75 %	0 %	260424448
125	NC_013283	GGTC	2	8	63058	63065	0 %	25 %	50 %	25 %	260424448
126	NC_013283	GTCT	2	8	63682	63689	0 %	50 %	25 %	25 %	260424449
127	NC_013283	CTGC	2	8	63697	63704	0 %	25 %	25 %	50 %	260424449
128	NC_013283	CCAC	2	8	63786	63793	25 %	0 %	0 %	75 %	260424449
129	NC_013283	GCCT	2	8	63845	63852	0 %	25 %	25 %	50 %	260424449
130	NC_013283	GCCA	2	8	63957	63964	25 %	0 %	25 %	50 %	260424449
131	NC_013283	CTGA	2	8	64665	64672	25 %	25 %	25 %	25 %	260424450
132	NC_013283	AGCG	2	8	65652	65659	25 %	0 %	50 %	25 %	260424450
133	NC_013283	GGTT	2	8	65881	65888	0 %	50 %	50 %	0 %	260424450
134	NC_013283	CTAT	2	8	65893	65900	25 %	50 %	0 %	25 %	260424450
135	NC_013283	GCCC	2	8	66332	66339	0 %	0 %	25 %	75 %	260424451
136	NC_013283	TAAG	2	8	66798	66805	50 %	25 %	25 %	0 %	260424452
137	NC_013283	TTTC	2	8	66809	66816	0 %	75 %	0 %	25 %	260424452
138	NC_013283	CATT	2	8	67088	67095	25 %	50 %	0 %	25 %	260424454
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.