MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Methylomirabilis oxyfera

Total Repeats: 35564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013260	AAG	2	6	54	59	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392373141
2	NC_013260	TTC	2	6	173	178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392373141
3	NC_013260	GCC	2	6	314	319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373141
4	NC_013260	GAC	2	6	321	326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373141
5	NC_013260	TGT	2	6	388	393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392373141
6	NC_013260	AGC	2	6	441	446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373141
7	NC_013260	CTG	2	6	656	661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373141
8	NC_013260	CGA	2	6	667	672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373141
9	NC_013260	AGG	2	6	705	710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373141
10	NC_013260	CTC	2	6	742	747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392373141
11	NC_013260	GCC	2	6	850	855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373141
12	NC_013260	GCC	2	6	872	877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373141
13	NC_013260	GAA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392373141
14	NC_013260	TGA	2	6	919	924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373141
15	NC_013260	TTG	2	6	993	998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392373141
16	NC_013260	TCA	2	6	1083	1088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392373141
17	NC_013260	CAG	2	6	1103	1108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373141
18	NC_013260	TCG	2	6	1223	1228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373141
19	NC_013260	ACG	2	6	1268	1273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373141
20	NC_013260	CAC	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392373141
21	NC_013260	TGA	2	6	1315	1320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373141
22	NC_013260	CGG	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373141
23	NC_013260	TCG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373142
24	NC_013260	TGT	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392373142
25	NC_013260	CTG	2	6	1594	1599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373142
26	NC_013260	ACT	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392373142
27	NC_013260	AGG	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373142
28	NC_013260	GGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373142
29	NC_013260	GAG	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373142
30	NC_013260	GAT	2	6	1947	1952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373142
31	NC_013260	GAA	2	6	1984	1989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392373142
32	NC_013260	TCG	2	6	2093	2098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373142
33	NC_013260	GAT	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373142
34	NC_013260	GCC	2	6	2185	2190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373142
35	NC_013260	GCC	2	6	2367	2372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373142
36	NC_013260	GCG	2	6	2406	2411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373142
37	NC_013260	TTC	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392373142
38	NC_013260	GAG	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373142
39	NC_013260	GCG	2	6	2572	2577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373143
40	NC_013260	GAG	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373143
41	NC_013260	AGT	2	6	2611	2616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373143
42	NC_013260	AGG	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373143
43	NC_013260	CCG	2	6	2655	2660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373143
44	NC_013260	AAG	2	6	2736	2741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392373143
45	NC_013260	CAG	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373143
46	NC_013260	CGG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373143
47	NC_013260	CAG	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373143
48	NC_013260	AGG	2	6	3061	3066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373143
49	NC_013260	ACG	2	6	3084	3089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373143
50	NC_013260	TCG	2	6	3604	3609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373144
51	NC_013260	CCT	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392373144
52	NC_013260	TTC	2	6	3653	3658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392373144
53	NC_013260	GCA	2	6	3663	3668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373144
54	NC_013260	CAT	2	6	3717	3722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392373144
55	NC_013260	CCA	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392373144
56	NC_013260	TCA	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392373144
57	NC_013260	TGA	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373144
58	NC_013260	ACA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392373144
59	NC_013260	TCT	2	6	3900	3905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392373144
60	NC_013260	TCC	2	6	3940	3945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392373144
61	NC_013260	AGC	2	6	3968	3973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373144
62	NC_013260	ACG	2	6	4016	4021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373144
63	NC_013260	TGA	2	6	4023	4028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373144
64	NC_013260	CGT	2	6	4101	4106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373144
65	NC_013260	GAT	2	6	4131	4136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373144
66	NC_013260	TCG	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373144
67	NC_013260	TCC	2	6	4163	4168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392373144
68	NC_013260	TCC	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392373144
69	NC_013260	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373144
70	NC_013260	GCA	2	6	4260	4265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373144
71	NC_013260	CTT	2	6	4303	4308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392373144
72	NC_013260	CAA	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392373144
73	NC_013260	GAT	2	6	4349	4354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373144
74	NC_013260	GGC	2	6	4396	4401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373144
75	NC_013260	GTC	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373144
76	NC_013260	CAG	2	6	4426	4431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373144
77	NC_013260	CAG	2	6	4540	4545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373144
78	NC_013260	ACG	2	6	4595	4600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373144
79	NC_013260	GCA	2	6	4605	4610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373144
80	NC_013260	AGC	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373144
81	NC_013260	AGG	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373144
82	NC_013260	CTT	2	6	4786	4791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392373145
83	NC_013260	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373145
84	NC_013260	TTC	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392373145
85	NC_013260	CCG	2	6	5162	5167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373145
86	NC_013260	GCC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373145
87	NC_013260	AGG	2	6	5333	5338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373145
88	NC_013260	GCT	2	6	5355	5360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373145
89	NC_013260	CAG	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373145
90	NC_013260	CGC	2	6	5442	5447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373145
91	NC_013260	ATT	2	6	5479	5484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392373145
92	NC_013260	GTA	2	6	5503	5508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373145
93	NC_013260	TCC	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392373145
94	NC_013260	GAT	2	6	5557	5562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373145
95	NC_013260	TCT	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392373145
96	NC_013260	AGC	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373145
97	NC_013260	CCG	2	6	5813	5818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373145
98	NC_013260	GAT	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373145
99	NC_013260	CAT	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392373145
100	NC_013260	CCA	2	6	5930	5935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392373145
101	NC_013260	GAC	2	6	5959	5964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373145
102	NC_013260	AGG	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373145
103	NC_013260	ACA	2	6	6263	6268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392373146
104	NC_013260	GCG	2	6	6288	6293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373146
105	NC_013260	TGG	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392373146
106	NC_013260	GAT	2	6	6434	6439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373146
107	NC_013260	GAT	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373146
108	NC_013260	AGA	2	6	6581	6586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392373146
109	NC_013260	CAT	3	9	6598	6606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392373146
110	NC_013260	CAT	3	9	6616	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392373146
111	NC_013260	TCC	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392373147
112	NC_013260	GTC	2	6	6738	6743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373147
113	NC_013260	GAT	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373147
114	NC_013260	TCC	2	6	6786	6791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392373147
115	NC_013260	CCA	2	6	6797	6802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392373147
116	NC_013260	ACG	2	6	6883	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373147
117	NC_013260	AGC	2	6	7000	7005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373147
118	NC_013260	CCG	2	6	7051	7056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373147
119	NC_013260	GCC	2	6	7116	7121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373147
120	NC_013260	GAC	2	6	7212	7217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373147
121	NC_013260	CCA	2	6	7439	7444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392373147
122	NC_013260	ATT	2	6	7449	7454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392373147
123	NC_013260	CCA	2	6	7478	7483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392373147
124	NC_013260	GAA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392373147
125	NC_013260	ACG	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373147
126	NC_013260	CTC	2	6	7605	7610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392373147
127	NC_013260	ACA	2	6	8026	8031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392373148
128	NC_013260	CTC	2	6	8076	8081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392373148
129	NC_013260	CGG	2	6	8097	8102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373148
130	NC_013260	TCG	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373149
131	NC_013260	TCG	2	6	8652	8657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373149
132	NC_013260	GCT	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373149
133	NC_013260	CGG	2	6	8691	8696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373149
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135	NC_013260	GCA	2	6	8878	8883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373149
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151	NC_013260	GCG	2	6	10352	10357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373150
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163	NC_013260	GCC	2	6	11052	11057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373152
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255	NC_013260	TGA	2	6	18944	18949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373164
256	NC_013260	CCG	2	6	19019	19024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373164
257	NC_013260	GTC	2	6	19035	19040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373164
258	NC_013260	CCG	2	6	19205	19210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373164
259	NC_013260	ACT	2	6	19240	19245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392373164
260	NC_013260	GAG	2	6	19892	19897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373166
261	NC_013260	CGC	2	6	20042	20047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373166
262	NC_013260	GGC	2	6	20048	20053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373166
263	NC_013260	CGT	2	6	20083	20088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373166
264	NC_013260	TGA	2	6	20095	20100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373166
265	NC_013260	GCG	2	6	20178	20183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373166
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267	NC_013260	GAG	2	6	20270	20275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373166
268	NC_013260	GCT	2	6	20299	20304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373166
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270	NC_013260	TCG	2	6	20373	20378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373166
271	NC_013260	CGT	2	6	20395	20400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392373166
272	NC_013260	GAG	2	6	20429	20434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392373166
273	NC_013260	TCA	2	6	20506	20511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392373166
274	NC_013260	TGA	2	6	20595	20600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373167
275	NC_013260	CTC	2	6	20629	20634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392373167
276	NC_013260	GGC	2	6	20662	20667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373167
277	NC_013260	GGT	3	9	20713	20721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392373167
278	NC_013260	GCG	2	6	20747	20752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373167
279	NC_013260	CGC	2	6	20794	20799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373167
280	NC_013260	ACG	2	6	20907	20912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392373167
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282	NC_013260	CGG	2	6	21074	21079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373167
283	NC_013260	CAT	2	6	21093	21098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392373167
284	NC_013260	CGC	2	6	21151	21156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392373167
285	NC_013260	CCA	2	6	21243	21248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392373167
286	NC_013260	GCG	2	6	21283	21288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392373167
287	NC_013260	GAT	2	6	21343	21348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392373167
288	NC_013260	ATC	2	6	21410	21415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392373167
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