MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 chromosome

Total Repeats: 3270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013194	CCGCG	2	10	2702	2711	0 %	0 %	40 %	60 %	257091665
2	NC_013194	GTGCT	2	10	3929	3938	0 %	40 %	40 %	20 %	257091666
3	NC_013194	GCCGC	2	10	5473	5482	0 %	0 %	40 %	60 %	257091666
4	NC_013194	GTTTG	2	10	7000	7009	0 %	60 %	40 %	0 %	257091668
5	NC_013194	CGGCG	2	10	7400	7409	0 %	0 %	60 %	40 %	257091669
6	NC_013194	GGCGC	2	10	10746	10755	0 %	0 %	60 %	40 %	257091673
7	NC_013194	GCGTC	2	10	14784	14793	0 %	20 %	40 %	40 %	257091677
8	NC_013194	TGCGA	2	10	16761	16770	20 %	20 %	40 %	20 %	257091678
9	NC_013194	GAATC	2	10	17237	17246	40 %	20 %	20 %	20 %	257091678
10	NC_013194	GGTCA	2	10	17930	17939	20 %	20 %	40 %	20 %	257091679
11	NC_013194	GATCT	2	10	18602	18611	20 %	40 %	20 %	20 %	257091679
12	NC_013194	CGACT	2	10	18692	18701	20 %	20 %	20 %	40 %	257091679
13	NC_013194	GCACG	2	10	20505	20514	20 %	0 %	40 %	40 %	257091680
14	NC_013194	ATGGC	2	10	22163	22172	20 %	20 %	40 %	20 %	257091680
15	NC_013194	CGGCG	2	10	22191	22200	0 %	0 %	60 %	40 %	257091680
16	NC_013194	CGGCG	2	10	23844	23853	0 %	0 %	60 %	40 %	257091681
17	NC_013194	GTAGC	2	10	24729	24738	20 %	20 %	40 %	20 %	257091681
18	NC_013194	CGGGG	2	10	25377	25386	0 %	0 %	80 %	20 %	257091683
19	NC_013194	TGCGC	2	10	26076	26085	0 %	20 %	40 %	40 %	257091684
20	NC_013194	GATGG	2	10	26573	26582	20 %	20 %	60 %	0 %	257091685
21	NC_013194	CACAA	2	10	28458	28467	60 %	0 %	0 %	40 %	257091689
22	NC_013194	GACGG	2	10	31036	31045	20 %	0 %	60 %	20 %	257091691
23	NC_013194	CGGGT	2	10	32023	32032	0 %	20 %	60 %	20 %	257091691
24	NC_013194	TCGAA	2	10	32810	32819	40 %	20 %	20 %	20 %	257091692
25	NC_013194	GGAGT	2	10	35696	35705	20 %	20 %	60 %	0 %	257091694
26	NC_013194	CTGGC	2	10	36118	36127	0 %	20 %	40 %	40 %	257091694
27	NC_013194	TATGC	2	10	37244	37253	20 %	40 %	20 %	20 %	257091694
28	NC_013194	CGCGA	2	10	38451	38460	20 %	0 %	40 %	40 %	257091694
29	NC_013194	CACGC	2	10	40722	40731	20 %	0 %	20 %	60 %	257091697
30	NC_013194	AGCGG	2	10	42031	42040	20 %	0 %	60 %	20 %	257091699
31	NC_013194	TTCGC	2	10	44521	44530	0 %	40 %	20 %	40 %	257091700
32	NC_013194	TTGAA	2	10	44873	44882	40 %	40 %	20 %	0 %	257091700
33	NC_013194	CTGCG	2	10	46134	46143	0 %	20 %	40 %	40 %	257091702
34	NC_013194	GTGGC	2	10	46498	46507	0 %	20 %	60 %	20 %	257091702
35	NC_013194	TGTGG	2	10	46740	46749	0 %	40 %	60 %	0 %	257091702
36	NC_013194	CGGGT	2	10	46826	46835	0 %	20 %	60 %	20 %	257091702
37	NC_013194	TTGCG	2	10	47043	47052	0 %	40 %	40 %	20 %	257091702
38	NC_013194	GCCAC	2	10	47634	47643	20 %	0 %	20 %	60 %	257091703
39	NC_013194	GATGC	2	10	47920	47929	20 %	20 %	40 %	20 %	257091703
40	NC_013194	TGGCG	2	10	49158	49167	0 %	20 %	60 %	20 %	257091705
41	NC_013194	CCAGG	2	10	51585	51594	20 %	0 %	40 %	40 %	257091707
42	NC_013194	CGAAG	2	10	51629	51638	40 %	0 %	40 %	20 %	257091707
43	NC_013194	GCGAG	2	10	52194	52203	20 %	0 %	60 %	20 %	257091708
44	NC_013194	CGGGC	2	10	52825	52834	0 %	0 %	60 %	40 %	257091709
45	NC_013194	GCGCC	2	10	53220	53229	0 %	0 %	40 %	60 %	257091709
46	NC_013194	GCGCC	2	10	53516	53525	0 %	0 %	40 %	60 %	257091709
47	NC_013194	GGCCA	2	10	55870	55879	20 %	0 %	40 %	40 %	257091711
48	NC_013194	GCACG	2	10	57014	57023	20 %	0 %	40 %	40 %	257091712
49	NC_013194	GACCA	2	10	58288	58297	40 %	0 %	20 %	40 %	257091713
50	NC_013194	TCGCG	2	10	58797	58806	0 %	20 %	40 %	40 %	257091713
51	NC_013194	ACGCG	2	10	59669	59678	20 %	0 %	40 %	40 %	257091714
52	NC_013194	GCGCT	2	10	60409	60418	0 %	20 %	40 %	40 %	257091714
53	NC_013194	TGTCG	2	10	60432	60441	0 %	40 %	40 %	20 %	257091714
54	NC_013194	CTTCG	2	10	64334	64343	0 %	40 %	20 %	40 %	257091716
55	NC_013194	CCCTG	2	10	66000	66009	0 %	20 %	20 %	60 %	257091720
56	NC_013194	CGATG	2	10	66090	66099	20 %	20 %	40 %	20 %	257091720
57	NC_013194	CGGCG	2	10	76950	76959	0 %	0 %	60 %	40 %	257091728
58	NC_013194	ATCGG	2	10	77220	77229	20 %	20 %	40 %	20 %	257091728
59	NC_013194	CTTGA	2	10	77547	77556	20 %	40 %	20 %	20 %	257091728
60	NC_013194	CGGAC	2	10	79627	79636	20 %	0 %	40 %	40 %	257091729
61	NC_013194	CTTGG	2	10	82656	82665	0 %	40 %	40 %	20 %	257091732
62	NC_013194	TGTGC	2	10	83078	83087	0 %	40 %	40 %	20 %	257091732
63	NC_013194	TACTT	2	10	83208	83217	20 %	60 %	0 %	20 %	257091732
64	NC_013194	CGCGG	2	10	88249	88258	0 %	0 %	60 %	40 %	257091735
65	NC_013194	TTGCC	2	10	90194	90203	0 %	40 %	20 %	40 %	257091735
66	NC_013194	GTGGC	2	10	91091	91100	0 %	20 %	60 %	20 %	257091735
67	NC_013194	TGCGT	2	10	96022	96031	0 %	40 %	40 %	20 %	257091739
68	NC_013194	GCTGG	2	10	96307	96316	0 %	20 %	60 %	20 %	257091740
69	NC_013194	TTTTG	2	10	96941	96950	0 %	80 %	20 %	0 %	257091740
70	NC_013194	CGAAG	2	10	97397	97406	40 %	0 %	40 %	20 %	257091740
71	NC_013194	CGGCC	2	10	99259	99268	0 %	0 %	40 %	60 %	257091741
72	NC_013194	TGGGC	2	10	99691	99700	0 %	20 %	60 %	20 %	257091741
73	NC_013194	GCAGC	2	10	100161	100170	20 %	0 %	40 %	40 %	257091742
74	NC_013194	GTGGC	2	10	100480	100489	0 %	20 %	60 %	20 %	257091742
75	NC_013194	CGCGC	2	10	101411	101420	0 %	0 %	40 %	60 %	257091743
76	NC_013194	GCGCC	2	10	102480	102489	0 %	0 %	40 %	60 %	257091745
77	NC_013194	CCGAA	2	10	105295	105304	40 %	0 %	20 %	40 %	257091747
78	NC_013194	CGGGG	2	10	105356	105365	0 %	0 %	80 %	20 %	257091747
79	NC_013194	CCGCC	2	10	105532	105541	0 %	0 %	20 %	80 %	257091747
80	NC_013194	CCGGG	2	10	106623	106632	0 %	0 %	60 %	40 %	257091748
81	NC_013194	TTGCC	2	10	109920	109929	0 %	40 %	20 %	40 %	257091749
82	NC_013194	AAACC	2	10	113583	113592	60 %	0 %	0 %	40 %	257091750
83	NC_013194	TGGGC	2	10	118322	118331	0 %	20 %	60 %	20 %	257091752
84	NC_013194	CAGCG	2	10	122493	122502	20 %	0 %	40 %	40 %	257091753
85	NC_013194	GGTTT	2	10	123613	123622	0 %	60 %	40 %	0 %	257091754
86	NC_013194	GCTGG	2	10	124937	124946	0 %	20 %	60 %	20 %	257091755
87	NC_013194	GCATT	2	10	127933	127942	20 %	40 %	20 %	20 %	257091757
88	NC_013194	AAGGA	2	10	128139	128148	60 %	0 %	40 %	0 %	257091757
89	NC_013194	CGACA	2	10	128465	128474	40 %	0 %	20 %	40 %	257091757
90	NC_013194	ATGCC	2	10	132541	132550	20 %	20 %	20 %	40 %	257091761
91	NC_013194	GCTGG	2	10	132669	132678	0 %	20 %	60 %	20 %	257091761
92	NC_013194	GGGCT	2	10	136883	136892	0 %	20 %	60 %	20 %	257091765
93	NC_013194	TGGCG	2	10	140582	140591	0 %	20 %	60 %	20 %	257091769
94	NC_013194	GAAGA	2	10	141285	141294	60 %	0 %	40 %	0 %	257091769
95	NC_013194	GCGCG	2	10	143297	143306	0 %	0 %	60 %	40 %	257091770
96	NC_013194	TGGCC	2	10	143531	143540	0 %	20 %	40 %	40 %	257091770
97	NC_013194	GCGCC	2	10	145052	145061	0 %	0 %	40 %	60 %	257091773
98	NC_013194	TGCTC	2	10	147104	147113	0 %	40 %	20 %	40 %	257091774
99	NC_013194	GCGCA	2	10	147631	147640	20 %	0 %	40 %	40 %	257091774
100	NC_013194	CACGG	2	10	153210	153219	20 %	0 %	40 %	40 %	257091778
101	NC_013194	CGCGG	2	10	154918	154927	0 %	0 %	60 %	40 %	257091780
102	NC_013194	CAACG	2	10	156372	156381	40 %	0 %	20 %	40 %	257091780
103	NC_013194	CGCTG	2	10	156914	156923	0 %	20 %	40 %	40 %	257091780
104	NC_013194	GCTCG	2	10	158288	158297	0 %	20 %	40 %	40 %	257091783
105	NC_013194	CGGCT	2	10	158306	158315	0 %	20 %	40 %	40 %	257091783
106	NC_013194	CGCGC	2	10	159049	159058	0 %	0 %	40 %	60 %	257091784
107	NC_013194	GCATC	2	10	159537	159546	20 %	20 %	20 %	40 %	257091784
108	NC_013194	CGTGC	2	10	160383	160392	0 %	20 %	40 %	40 %	257091785
109	NC_013194	GTGAC	2	10	161817	161826	20 %	20 %	40 %	20 %	257091786
110	NC_013194	CCAGT	2	10	163394	163403	20 %	20 %	20 %	40 %	257091786
111	NC_013194	AAGCG	2	10	168689	168698	40 %	0 %	40 %	20 %	257091789
112	NC_013194	GCGAC	2	10	172034	172043	20 %	0 %	40 %	40 %	257091791
113	NC_013194	GTACG	2	10	176012	176021	20 %	20 %	40 %	20 %	257091795
114	NC_013194	AGCGA	2	10	178841	178850	40 %	0 %	40 %	20 %	257091797
115	NC_013194	CGCGC	2	10	179290	179299	0 %	0 %	40 %	60 %	257091797
116	NC_013194	CGAAG	2	10	181044	181053	40 %	0 %	40 %	20 %	257091798
117	NC_013194	GGGGA	2	10	182998	183007	20 %	0 %	80 %	0 %	257091799
118	NC_013194	GCGCA	2	10	184352	184361	20 %	0 %	40 %	40 %	257091801
119	NC_013194	CCGGT	2	10	185728	185737	0 %	20 %	40 %	40 %	257091802
120	NC_013194	GCTCC	2	10	187223	187232	0 %	20 %	20 %	60 %	257091804
121	NC_013194	CTGCC	2	10	187632	187641	0 %	20 %	20 %	60 %	257091804
122	NC_013194	TCGCT	2	10	188211	188220	0 %	40 %	20 %	40 %	257091804
123	NC_013194	CTGGT	2	10	191808	191817	0 %	40 %	40 %	20 %	257091805
124	NC_013194	GCCGC	2	10	191848	191857	0 %	0 %	40 %	60 %	257091805
125	NC_013194	CGACG	2	10	193655	193664	20 %	0 %	40 %	40 %	257091805
126	NC_013194	GCTGT	2	10	194667	194676	0 %	40 %	40 %	20 %	257091806
127	NC_013194	GCGAC	2	10	195065	195074	20 %	0 %	40 %	40 %	257091806
128	NC_013194	GTAGC	2	10	195112	195121	20 %	20 %	40 %	20 %	257091806
129	NC_013194	TTCCG	2	10	195751	195760	0 %	40 %	20 %	40 %	257091807
130	NC_013194	GTGCT	2	10	199937	199946	0 %	40 %	40 %	20 %	257091810
131	NC_013194	AACAG	2	10	201981	201990	60 %	0 %	20 %	20 %	257091811
132	NC_013194	GGGCG	2	10	203576	203585	0 %	0 %	80 %	20 %	257091813
133	NC_013194	CTTGC	2	10	203849	203858	0 %	40 %	20 %	40 %	257091813
134	NC_013194	CGAAC	2	10	204455	204464	40 %	0 %	20 %	40 %	257091813
135	NC_013194	AAACC	2	10	211810	211819	60 %	0 %	0 %	40 %	257091818
136	NC_013194	GGCCG	2	10	212601	212610	0 %	0 %	60 %	40 %	257091819
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139	NC_013194	CCGAC	2	10	214063	214072	20 %	0 %	20 %	60 %	257091820
140	NC_013194	CCCAG	2	10	216655	216664	20 %	0 %	20 %	60 %	257091823
141	NC_013194	GCACG	2	10	219692	219701	20 %	0 %	40 %	40 %	257091826
142	NC_013194	CAGGT	2	10	220577	220586	20 %	20 %	40 %	20 %	257091827
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144	NC_013194	AGGCC	2	10	221806	221815	20 %	0 %	40 %	40 %	257091827
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146	NC_013194	TTGGC	2	10	225157	225166	0 %	40 %	40 %	20 %	257091830
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149	NC_013194	CTGGG	2	10	236459	236468	0 %	20 %	60 %	20 %	257091837
150	NC_013194	TCTGC	2	10	236747	236756	0 %	40 %	20 %	40 %	257091838
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157	NC_013194	GCCGC	2	10	250113	250122	0 %	0 %	40 %	60 %	257091852
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248	NC_013194	CGGCG	2	10	386575	386584	0 %	0 %	60 %	40 %	257091969
249	NC_013194	TCGCC	2	10	390913	390922	0 %	20 %	20 %	60 %	257091974
250	NC_013194	GCCTT	2	10	391896	391905	0 %	40 %	20 %	40 %	257091974
251	NC_013194	AACGC	2	10	392118	392127	40 %	0 %	20 %	40 %	257091974
252	NC_013194	AGCGG	2	10	395181	395190	20 %	0 %	60 %	20 %	257091976
253	NC_013194	GCCGG	2	10	397332	397341	0 %	0 %	60 %	40 %	257091978
254	NC_013194	TCGAC	2	10	400536	400545	20 %	20 %	20 %	40 %	257091979
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256	NC_013194	CGGCG	2	10	401287	401296	0 %	0 %	60 %	40 %	257091979
257	NC_013194	CCGGC	2	10	403101	403110	0 %	0 %	40 %	60 %	257091979
258	NC_013194	CTTAC	2	10	408055	408064	20 %	40 %	0 %	40 %	257091984
259	NC_013194	GGCAT	2	10	408625	408634	20 %	20 %	40 %	20 %	257091985
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379	NC_013194	TGGCC	2	10	617245	617254	0 %	20 %	40 %	40 %	257092149
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382	NC_013194	AGCCG	2	10	625453	625462	20 %	0 %	40 %	40 %	257092157
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384	NC_013194	TGGCT	2	10	627044	627053	0 %	40 %	40 %	20 %	257092158
385	NC_013194	CGAAG	2	10	628951	628960	40 %	0 %	40 %	20 %	257092160
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388	NC_013194	TCGGT	2	10	631425	631434	0 %	40 %	40 %	20 %	257092161
389	NC_013194	TCGGC	2	10	631837	631846	0 %	20 %	40 %	40 %	257092161
390	NC_013194	TCGAC	2	10	632345	632354	20 %	20 %	20 %	40 %	257092162
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