MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 plasmid pAph03

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013191	GACG	2	8	206	213	25 %	0 %	50 %	25 %	257074492
2	NC_013191	CTGA	2	8	420	427	25 %	25 %	25 %	25 %	257074492
3	NC_013191	CGGG	2	8	448	455	0 %	0 %	75 %	25 %	257074492
4	NC_013191	TGCC	2	8	1051	1058	0 %	25 %	25 %	50 %	257074493
5	NC_013191	GTGC	2	8	1233	1240	0 %	25 %	50 %	25 %	257074493
6	NC_013191	ATCA	2	8	1564	1571	50 %	25 %	0 %	25 %	257074494
7	NC_013191	CAAA	2	8	2476	2483	75 %	0 %	0 %	25 %	257074496
8	NC_013191	GCCA	2	8	3027	3034	25 %	0 %	25 %	50 %	257074497
9	NC_013191	TCAA	2	8	3070	3077	50 %	25 %	0 %	25 %	257074497
10	NC_013191	GCGG	2	8	5374	5381	0 %	0 %	75 %	25 %	257074499
11	NC_013191	CGGC	2	8	6007	6014	0 %	0 %	50 %	50 %	257074500
12	NC_013191	GTAT	2	8	7540	7547	25 %	50 %	25 %	0 %	257074501
13	NC_013191	TTTC	2	8	8195	8202	0 %	75 %	0 %	25 %	257074501
14	NC_013191	ATCC	2	8	8674	8681	25 %	25 %	0 %	50 %	257074501
15	NC_013191	CTGC	2	8	9014	9021	0 %	25 %	25 %	50 %	257074502
16	NC_013191	GGTC	2	8	12224	12231	0 %	25 %	50 %	25 %	257074504
17	NC_013191	GGCG	2	8	13010	13017	0 %	0 %	75 %	25 %	257074506
18	NC_013191	GCTT	2	8	14857	14864	0 %	50 %	25 %	25 %	257074507
19	NC_013191	ACGA	2	8	15914	15921	50 %	0 %	25 %	25 %	257074508
20	NC_013191	TCAT	2	8	16493	16500	25 %	50 %	0 %	25 %	257074508
21	NC_013191	GATA	2	8	16743	16750	50 %	25 %	25 %	0 %	257074509
22	NC_013191	CGGC	2	8	17080	17087	0 %	0 %	50 %	50 %	257074510
23	NC_013191	GCCG	2	8	17567	17574	0 %	0 %	50 %	50 %	257074510
24	NC_013191	GAAA	2	8	18100	18107	75 %	0 %	25 %	0 %	257074510
25	NC_013191	GCCC	2	8	18782	18789	0 %	0 %	25 %	75 %	257074512
26	NC_013191	TCGA	2	8	18872	18879	25 %	25 %	25 %	25 %	257074512
27	NC_013191	CGTC	2	8	20022	20029	0 %	25 %	25 %	50 %	257074514
28	NC_013191	CAGC	2	8	20174	20181	25 %	0 %	25 %	50 %	257074514
29	NC_013191	GTCG	2	8	20835	20842	0 %	25 %	50 %	25 %	257074514
30	NC_013191	TCAA	2	8	21703	21710	50 %	25 %	0 %	25 %	257074514
31	NC_013191	ACCC	2	8	23397	23404	25 %	0 %	0 %	75 %	257074516
32	NC_013191	GGCG	2	8	23616	23623	0 %	0 %	75 %	25 %	257074516
33	NC_013191	AGAA	2	8	23895	23902	75 %	0 %	25 %	0 %	257074516
34	NC_013191	CGTG	2	8	24798	24805	0 %	25 %	50 %	25 %	257074517
35	NC_013191	AGCC	2	8	24826	24833	25 %	0 %	25 %	50 %	257074517
36	NC_013191	GGCG	2	8	24888	24895	0 %	0 %	75 %	25 %	257074517
37	NC_013191	TCGG	2	8	25967	25974	0 %	25 %	50 %	25 %	257074517
38	NC_013191	ACCA	2	8	26137	26144	50 %	0 %	0 %	50 %	257074517
39	NC_013191	ATAA	2	8	26315	26322	75 %	25 %	0 %	0 %	257074517
40	NC_013191	GAAG	2	8	26468	26475	50 %	0 %	50 %	0 %	257074518
41	NC_013191	GTAA	2	8	26837	26844	50 %	25 %	25 %	0 %	257074518
42	NC_013191	CTTC	2	8	27363	27370	0 %	50 %	0 %	50 %	257074519
43	NC_013191	CGAC	2	8	27409	27416	25 %	0 %	25 %	50 %	257074519
44	NC_013191	CGAT	2	8	27491	27498	25 %	25 %	25 %	25 %	257074519
45	NC_013191	CGGC	2	8	29384	29391	0 %	0 %	50 %	50 %	257074522
46	NC_013191	GACC	2	8	29439	29446	25 %	0 %	25 %	50 %	257074522
47	NC_013191	ATTT	2	8	30014	30021	25 %	75 %	0 %	0 %	257074523
48	NC_013191	TCCT	2	8	30199	30206	0 %	50 %	0 %	50 %	257074523
49	NC_013191	CGAA	2	8	30267	30274	50 %	0 %	25 %	25 %	257074523
50	NC_013191	CCAG	2	8	30356	30363	25 %	0 %	25 %	50 %	257074523
51	NC_013191	GGCG	2	8	30515	30522	0 %	0 %	75 %	25 %	257074523
52	NC_013191	GGAC	2	8	31202	31209	25 %	0 %	50 %	25 %	257074523
53	NC_013191	GATT	2	8	31229	31236	25 %	50 %	25 %	0 %	257074523
54	NC_013191	CGTG	2	8	31454	31461	0 %	25 %	50 %	25 %	257074524
55	NC_013191	GGCC	2	8	32783	32790	0 %	0 %	50 %	50 %	257074525
56	NC_013191	CCAT	2	8	33452	33459	25 %	25 %	0 %	50 %	257074526
57	NC_013191	GCCG	2	8	33591	33598	0 %	0 %	50 %	50 %	257074526
58	NC_013191	GGCC	2	8	34474	34481	0 %	0 %	50 %	50 %	257074527
59	NC_013191	GATC	2	8	34593	34600	25 %	25 %	25 %	25 %	257074527
60	NC_013191	CAGC	2	8	34892	34899	25 %	0 %	25 %	50 %	257074528
61	NC_013191	AAGG	2	8	35091	35098	50 %	0 %	50 %	0 %	257074528
62	NC_013191	GGTC	2	8	36860	36867	0 %	25 %	50 %	25 %	257074529
63	NC_013191	CCGC	2	8	37143	37150	0 %	0 %	25 %	75 %	257074530
64	NC_013191	GCCG	2	8	37229	37236	0 %	0 %	50 %	50 %	257074530
65	NC_013191	CAAA	2	8	37275	37282	75 %	0 %	0 %	25 %	257074530
66	NC_013191	GCAC	2	8	37377	37384	25 %	0 %	25 %	50 %	257074530
67	NC_013191	TGCC	2	8	37419	37426	0 %	25 %	25 %	50 %	257074531

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.