MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880204

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013168	CAT	2	6	106	111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823892
2	NC_013168	ACC	2	6	207	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823892
3	NC_013168	TCA	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823892
4	NC_013168	AGA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823892
5	NC_013168	GAA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823892
6	NC_013168	ACT	2	6	443	448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823892
7	NC_013168	ACA	2	6	454	459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823892
8	NC_013168	TTA	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823892
9	NC_013168	GCA	2	6	594	599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823892
10	NC_013168	AGC	2	6	646	651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823892
11	NC_013168	TTA	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823892
12	NC_013168	AGA	2	6	792	797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823893
13	NC_013168	GCT	2	6	806	811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823893
14	NC_013168	AGC	2	6	837	842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823893
15	NC_013168	CTT	2	6	848	853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823893
16	NC_013168	ATT	2	6	1139	1144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823894
17	NC_013168	GTT	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823894
18	NC_013168	ACG	2	6	1237	1242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823894
19	NC_013168	ATC	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823894
20	NC_013168	CCA	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823894
21	NC_013168	TTC	2	6	1539	1544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823895
22	NC_013168	GGA	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256823895
23	NC_013168	CTG	2	6	1622	1627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823895
24	NC_013168	CAG	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823895
25	NC_013168	CCA	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256823896
26	NC_013168	GTA	2	6	2024	2029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823896
27	NC_013168	AAT	2	6	2202	2207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823896
28	NC_013168	TTG	2	6	2218	2223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823896
29	NC_013168	AGA	2	6	2461	2466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823897
30	NC_013168	GCT	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823897
31	NC_013168	GAA	2	6	3105	3110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823897
32	NC_013168	TTG	2	6	3371	3376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823897
33	NC_013168	TCA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823897
34	NC_013168	AGT	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823897
35	NC_013168	ACT	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823898
36	NC_013168	TCT	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823898
37	NC_013168	CAA	3	9	4068	4076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823898
38	NC_013168	AGA	3	9	4094	4102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823898
39	NC_013168	ACA	3	9	4176	4184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823898
40	NC_013168	CAA	2	6	4194	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823898
41	NC_013168	CAA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823898
42	NC_013168	CAA	2	6	4227	4232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823898
43	NC_013168	CAA	2	6	4269	4274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823898
44	NC_013168	CAT	2	6	4317	4322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823898
45	NC_013168	AGA	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823898
46	NC_013168	AAG	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823898
47	NC_013168	TCA	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823898
48	NC_013168	GAT	2	6	4536	4541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823898
49	NC_013168	ATT	2	6	4707	4712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823898
50	NC_013168	TAA	2	6	4735	4740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823898
51	NC_013168	CAA	2	6	4776	4781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823898
52	NC_013168	TAA	2	6	4829	4834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823898
53	NC_013168	GTG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823898
54	NC_013168	AGC	2	6	4943	4948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256823898
55	NC_013168	ATC	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823898
56	NC_013168	ATT	2	6	5009	5014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823898
57	NC_013168	ATT	2	6	5121	5126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823898
58	NC_013168	CAT	2	6	5223	5228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823898
59	NC_013168	ATT	2	6	5922	5927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823899
60	NC_013168	TAT	2	6	6118	6123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823899
61	NC_013168	TAA	2	6	6166	6171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823899
62	NC_013168	ATT	2	6	6231	6236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823899
63	NC_013168	ATT	2	6	6354	6359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823899
64	NC_013168	ATT	2	6	6381	6386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823899
65	NC_013168	ATT	3	9	6437	6445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823899
66	NC_013168	TAG	2	6	6472	6477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823899
67	NC_013168	GAA	2	6	6491	6496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823899
68	NC_013168	CAA	2	6	6518	6523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823899
69	NC_013168	ATA	2	6	6588	6593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823899
70	NC_013168	TAA	2	6	6610	6615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823899
71	NC_013168	TTC	2	6	6649	6654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823899
72	NC_013168	AAT	2	6	6698	6703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823899
73	NC_013168	TAA	2	6	6751	6756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823899
74	NC_013168	ATG	2	6	6792	6797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823899
75	NC_013168	GAA	2	6	6824	6829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823899
76	NC_013168	TTG	2	6	7397	7402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256823900
77	NC_013168	GAA	2	6	7403	7408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823900
78	NC_013168	AAG	2	6	7448	7453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823900
79	NC_013168	TGG	2	6	7518	7523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256823900
80	NC_013168	GAA	2	6	7624	7629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823900
81	NC_013168	ATT	2	6	7636	7641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823900
82	NC_013168	GAT	2	6	7723	7728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823900
83	NC_013168	AGA	2	6	7735	7740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823900
84	NC_013168	GAA	2	6	7750	7755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823900
85	NC_013168	AAG	2	6	7760	7765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823900
86	NC_013168	AGA	2	6	7774	7779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823900
87	NC_013168	GAA	2	6	7783	7788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823900
88	NC_013168	ATT	2	6	7825	7830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823900
89	NC_013168	TGA	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823900
90	NC_013168	CCT	2	6	8139	8144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823901
91	NC_013168	TCC	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823901
92	NC_013168	CAA	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823901
93	NC_013168	TAA	2	6	8341	8346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256823901
94	NC_013168	TAG	2	6	8379	8384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823901
95	NC_013168	ACA	2	6	8502	8507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823901
96	NC_013168	TCT	2	6	9073	9078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823902
97	NC_013168	TCT	2	6	9101	9106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256823902
98	NC_013168	GAA	2	6	9189	9194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823902
99	NC_013168	TCA	2	6	9313	9318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256823902
100	NC_013168	AAG	2	6	9949	9954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823903
101	NC_013168	TGA	2	6	10223	10228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256823903
102	NC_013168	AGA	2	6	10260	10265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823903
103	NC_013168	CTC	2	6	10400	10405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256823904
104	NC_013168	ACA	2	6	10410	10415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256823904
105	NC_013168	TAT	2	6	10542	10547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823904
106	NC_013168	AGA	2	6	10581	10586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823904
107	NC_013168	GCT	2	6	10588	10593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823904
108	NC_013168	TTA	2	6	10660	10665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256823904
109	NC_013168	AAG	2	6	10670	10675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823904
110	NC_013168	CGT	2	6	10687	10692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256823904
111	NC_013168	AGA	2	6	10698	10703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256823904

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.