MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880202

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013163	TAA	2	6	38	43	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062241
2	NC_013163	CCA	2	6	164	169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062241
3	NC_013163	ATA	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062241
4	NC_013163	AAT	2	6	232	237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062241
5	NC_013163	TCA	2	6	239	244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062241
6	NC_013163	ATT	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062241
7	NC_013163	TGA	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062241
8	NC_013163	GAT	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062241
9	NC_013163	GTT	2	6	426	431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062241
10	NC_013163	TGC	2	6	585	590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062242
11	NC_013163	GCA	2	6	682	687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062242
12	NC_013163	GAG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062242
13	NC_013163	AGG	2	6	726	731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062242
14	NC_013163	AGG	2	6	771	776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062242
15	NC_013163	TAC	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062242
16	NC_013163	TCT	2	6	1096	1101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062242
17	NC_013163	AGA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062242
18	NC_013163	GTT	2	6	1356	1361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062242
19	NC_013163	TCT	2	6	1429	1434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062242
20	NC_013163	CTT	2	6	1489	1494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062242
21	NC_013163	GAA	2	6	1496	1501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062242
22	NC_013163	AGA	2	6	1536	1541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062242
23	NC_013163	TAA	2	6	1625	1630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062242
24	NC_013163	GAT	2	6	2563	2568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062243
25	NC_013163	TTA	2	6	2700	2705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062243
26	NC_013163	CTT	2	6	2711	2716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062243
27	NC_013163	TCT	2	6	2827	2832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062243
28	NC_013163	ATT	2	6	3272	3277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062244
29	NC_013163	TCC	2	6	3317	3322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062244
30	NC_013163	TGA	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062244
31	NC_013163	CAG	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062244
32	NC_013163	GCA	2	6	3550	3555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062244
33	NC_013163	ACT	3	9	3591	3599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062244
34	NC_013163	GTA	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062244
35	NC_013163	TAA	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062244
36	NC_013163	GAG	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062244
37	NC_013163	AAT	2	6	3718	3723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062244
38	NC_013163	TTG	2	6	3821	3826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062244
39	NC_013163	ATG	2	6	3887	3892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062244
40	NC_013163	CTT	2	6	3990	3995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
41	NC_013163	TCT	2	6	4028	4033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
42	NC_013163	TGC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062244
43	NC_013163	TGT	2	6	4152	4157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062244
44	NC_013163	TAA	2	6	4211	4216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062244
45	NC_013163	TTC	2	6	4217	4222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
46	NC_013163	CCT	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062244
47	NC_013163	TCT	2	6	4284	4289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062244
48	NC_013163	TCA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062244
49	NC_013163	CGG	2	6	4550	4555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257062244
50	NC_013163	AAC	2	6	5070	5075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062245
51	NC_013163	AGC	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062245
52	NC_013163	GTT	2	6	5141	5146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062245
53	NC_013163	TAA	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062245
54	NC_013163	GTT	2	6	5196	5201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062245
55	NC_013163	GTG	3	9	5224	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062245
56	NC_013163	CAC	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062246
57	NC_013163	ACC	2	6	5600	5605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062246
58	NC_013163	CAT	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062246
59	NC_013163	GCT	2	6	5630	5635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062246
60	NC_013163	CGT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062246
61	NC_013163	TGC	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062246
62	NC_013163	ACA	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062246
63	NC_013163	ATT	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062247
64	NC_013163	ATT	2	6	5929	5934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062247
65	NC_013163	CAA	2	6	5964	5969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062247
66	NC_013163	AAC	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062247
67	NC_013163	TAA	2	6	6253	6258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062247
68	NC_013163	TCA	3	9	6322	6330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062248
69	NC_013163	CTT	2	6	6389	6394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062248
70	NC_013163	CTA	2	6	6401	6406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062248
71	NC_013163	CTT	2	6	6410	6415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062248
72	NC_013163	TAA	2	6	6441	6446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062248
73	NC_013163	ATA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062248
74	NC_013163	CGT	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
75	NC_013163	TCC	2	6	6570	6575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062249
76	NC_013163	CGT	2	6	6596	6601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
77	NC_013163	CAA	2	6	6659	6664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062249
78	NC_013163	GCT	2	6	6772	6777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
79	NC_013163	TCC	2	6	6846	6851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062249
80	NC_013163	CCA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062249
81	NC_013163	CCG	2	6	7193	7198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062249
82	NC_013163	TTA	2	6	7215	7220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062249
83	NC_013163	GTC	2	6	7221	7226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062249
84	NC_013163	AAG	2	6	7333	7338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062249
85	NC_013163	CCG	3	9	7402	7410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062249
86	NC_013163	ATT	2	6	7448	7453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062249
87	NC_013163	CAA	2	6	7894	7899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062250
88	NC_013163	TAA	2	6	8117	8122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062251
89	NC_013163	TCC	2	6	8292	8297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062251
90	NC_013163	TCA	2	6	8350	8355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062251
91	NC_013163	TGT	2	6	8477	8482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062251
92	NC_013163	ATT	2	6	8513	8518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062251
93	NC_013163	CTT	2	6	8535	8540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062251
94	NC_013163	TCA	2	6	8601	8606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062251
95	NC_013163	CCG	2	6	8669	8674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062251
96	NC_013163	TCC	2	6	8724	8729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062251
97	NC_013163	CAC	2	6	8840	8845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062251
98	NC_013163	CTT	2	6	8953	8958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062251
99	NC_013163	GCT	2	6	9074	9079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062252
100	NC_013163	CAG	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062252
101	NC_013163	CAC	2	6	9120	9125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062252
102	NC_013163	CAC	2	6	9180	9185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062252
103	NC_013163	GCA	2	6	9247	9252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062252
104	NC_013163	CCA	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062252
105	NC_013163	GCT	2	6	9368	9373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062252
106	NC_013163	ACG	2	6	9455	9460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062253
107	NC_013163	CTG	2	6	9472	9477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062253
108	NC_013163	ATT	2	6	9642	9647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062253
109	NC_013163	GAC	3	9	9884	9892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062254
110	NC_013163	GAC	2	6	9932	9937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062254
111	NC_013163	TGG	2	6	9958	9963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062254
112	NC_013163	ATC	2	6	10109	10114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062254
113	NC_013163	GCA	2	6	10192	10197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062254
114	NC_013163	AAC	2	6	10199	10204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062254
115	NC_013163	AGC	2	6	10230	10235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062254
116	NC_013163	AAG	2	6	10343	10348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062254
117	NC_013163	TCC	2	6	10590	10595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062256
118	NC_013163	TCA	2	6	10635	10640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062256
119	NC_013163	TTG	2	6	10769	10774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062256
120	NC_013163	CAG	2	6	10874	10879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062256
121	NC_013163	CCT	2	6	11010	11015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062257
122	NC_013163	AAG	2	6	11048	11053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062257
123	NC_013163	CAA	2	6	11212	11217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062257
124	NC_013163	TTC	2	6	11420	11425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062257
125	NC_013163	CAT	2	6	11481	11486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062257
126	NC_013163	GAA	2	6	11561	11566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062257
127	NC_013163	TGG	2	6	11738	11743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062257
128	NC_013163	TTC	2	6	11980	11985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062257
129	NC_013163	GCT	2	6	12053	12058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062257
130	NC_013163	GAC	3	9	12166	12174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062257
131	NC_013163	GGA	2	6	12361	12366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062257
132	NC_013163	CTC	2	6	12394	12399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062257
133	NC_013163	CAA	2	6	13420	13425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062258
134	NC_013163	ATT	2	6	13426	13431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062258
135	NC_013163	AAC	2	6	13514	13519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062258
136	NC_013163	ATT	2	6	13748	13753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062258
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139	NC_013163	ACC	2	6	13966	13971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062258
140	NC_013163	GAC	2	6	14032	14037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062258
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164	NC_013163	TCT	2	6	15811	15816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062260
165	NC_013163	TCA	2	6	15847	15852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062260
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170	NC_013163	GCA	2	6	16340	16345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062260
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239	NC_013163	AAT	2	6	22344	22349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062264
240	NC_013163	ATA	2	6	22418	22423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062264
241	NC_013163	TAG	2	6	22432	22437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062264
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247	NC_013163	AGG	2	6	22857	22862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062264
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250	NC_013163	TAT	2	6	22991	22996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062264
251	NC_013163	ATA	2	6	23044	23049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062264
252	NC_013163	TAG	2	6	23244	23249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062264
253	NC_013163	CAT	2	6	23279	23284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062264
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.