MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Capnocytophaga ochracea DSM 7271 chromosome

Total Repeats: 45493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_013162	TCT	2	6	166883	166888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818990
3003	NC_013162	TTG	2	6	166910	166915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818990
3004	NC_013162	TTC	2	6	166973	166978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818990
3005	NC_013162	TTC	2	6	167030	167035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818990
3006	NC_013162	TCG	2	6	167054	167059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818990
3007	NC_013162	GTGATA	2	12	167069	167080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818990
3008	NC_013162	CAT	2	6	167100	167105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818990
3009	NC_013162	TCA	2	6	167108	167113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818990
3010	NC_013162	TTC	2	6	167129	167134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818990
3011	NC_013162	GACT	2	8	167192	167199	25 %	25 %	25 %	25 %	256818990
3012	NC_013162	TTA	2	6	167201	167206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818990
3013	NC_013162	CTT	2	6	167215	167220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818990
3014	NC_013162	AAG	2	6	167228	167233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818990
3015	NC_013162	TCC	2	6	167239	167244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818990
3016	NC_013162	AGATA	2	10	167306	167315	60 %	20 %	20 %	0 %	256818990
3017	NC_013162	CTT	2	6	167332	167337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818990
3018	NC_013162	TTC	2	6	167359	167364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818990
3019	NC_013162	AGA	2	6	167429	167434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818990
3020	NC_013162	AAT	2	6	167439	167444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818990
3021	NC_013162	CTTT	2	8	167451	167458	0 %	75 %	0 %	25 %	256818990
3022	NC_013162	TAC	2	6	167484	167489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818990
3023	NC_013162	ACC	2	6	167521	167526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818990
3024	NC_013162	CAC	2	6	167623	167628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818991
3025	NC_013162	GTA	2	6	167681	167686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818991
3026	NC_013162	TTA	2	6	167705	167710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818991
3027	NC_013162	AC	3	6	167727	167732	50 %	0 %	0 %	50 %	256818991
3028	NC_013162	TTTC	2	8	167870	167877	0 %	75 %	0 %	25 %	256818991
3029	NC_013162	CAAA	2	8	167925	167932	75 %	0 %	0 %	25 %	256818991
3030	NC_013162	TAC	2	6	167986	167991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818991
3031	NC_013162	CCT	2	6	168191	168196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818991
3032	NC_013162	CAC	2	6	168205	168210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818991
3033	NC_013162	TCC	2	6	168319	168324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818991
3034	NC_013162	AGT	2	6	168367	168372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818991
3035	NC_013162	ATC	3	9	168385	168393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818991
3036	NC_013162	CTT	2	6	168523	168528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818991
3037	NC_013162	TATC	2	8	168570	168577	25 %	50 %	0 %	25 %	256818991
3038	NC_013162	ATG	2	6	168647	168652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818991
3039	NC_013162	TTTC	2	8	168660	168667	0 %	75 %	0 %	25 %	256818991
3040	NC_013162	A	6	6	168953	168958	100 %	0 %	0 %	0 %	256818992
3041	NC_013162	AGA	2	6	169011	169016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818992
3042	NC_013162	TAT	2	6	169030	169035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818992
3043	NC_013162	AGA	2	6	169138	169143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818992
3044	NC_013162	GAG	2	6	169202	169207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818992
3045	NC_013162	TGA	2	6	169209	169214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818992
3046	NC_013162	AAG	2	6	169311	169316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818992
3047	NC_013162	TA	3	6	169380	169385	50 %	50 %	0 %	0 %	256818992
3048	NC_013162	TTTC	2	8	169431	169438	0 %	75 %	0 %	25 %	256818992
3049	NC_013162	AGA	2	6	169450	169455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818992
3050	NC_013162	TAA	2	6	169489	169494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818992
3051	NC_013162	CACAA	2	10	169505	169514	60 %	0 %	0 %	40 %	256818992
3052	NC_013162	ATG	2	6	169526	169531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818992
3053	NC_013162	TATC	2	8	169573	169580	25 %	50 %	0 %	25 %	256818992
3054	NC_013162	TA	3	6	169598	169603	50 %	50 %	0 %	0 %	256818992
3055	NC_013162	GGA	2	6	169612	169617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818992
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3057	NC_013162	CTG	2	6	169686	169691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818992
3058	NC_013162	AAC	2	6	169752	169757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818992
3059	NC_013162	AAG	2	6	169762	169767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818992
3060	NC_013162	CAA	2	6	169792	169797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818992
3061	NC_013162	ATT	2	6	169868	169873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818992
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3065	NC_013162	GAT	2	6	170068	170073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818992
3066	NC_013162	TGC	2	6	170149	170154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818992
3067	NC_013162	GATAG	2	10	170176	170185	40 %	20 %	40 %	0 %	256818992
3068	NC_013162	TGG	2	6	171111	171116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818993
3069	NC_013162	TAC	2	6	171187	171192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818993
3070	NC_013162	CAG	2	6	171288	171293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818993
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3072	NC_013162	CATT	2	8	171330	171337	25 %	50 %	0 %	25 %	256818993
3073	NC_013162	TGA	2	6	171342	171347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818993
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3081	NC_013162	TA	3	6	171600	171605	50 %	50 %	0 %	0 %	256818993
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3094	NC_013162	CTGT	2	8	172331	172338	0 %	50 %	25 %	25 %	256818994
3095	NC_013162	CTT	2	6	172427	172432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818994
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3102	NC_013162	GA	3	6	172793	172798	50 %	0 %	50 %	0 %	256818994
3103	NC_013162	TGGTAA	2	12	172850	172861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818994
3104	NC_013162	CTT	2	6	172865	172870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818994
3105	NC_013162	TTG	2	6	172908	172913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818994
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3107	NC_013162	ATCT	2	8	172977	172984	25 %	50 %	0 %	25 %	256818994
3108	NC_013162	ATT	2	6	173031	173036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818994
3109	NC_013162	CTG	2	6	173130	173135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818994
3110	NC_013162	TTG	2	6	173151	173156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818994
3111	NC_013162	AGC	2	6	173190	173195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818994
3112	NC_013162	CTG	2	6	173254	173259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818994
3113	NC_013162	TGC	2	6	173346	173351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818994
3114	NC_013162	CTG	2	6	173409	173414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818994
3115	NC_013162	CTGCTC	2	12	173594	173605	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256818994
3116	NC_013162	GGA	2	6	173624	173629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818994
3117	NC_013162	CCA	2	6	173642	173647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818994
3118	NC_013162	CTT	2	6	173720	173725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818994
3119	NC_013162	T	6	6	173724	173729	0 %	100 %	0 %	0 %	256818994
3120	NC_013162	GAA	2	6	173831	173836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818994
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3122	NC_013162	TCAC	2	8	174064	174071	25 %	25 %	0 %	50 %	256818994
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3246	NC_013162	TTG	2	6	181092	181097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256819000
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3249	NC_013162	CT	3	6	181257	181262	0 %	50 %	0 %	50 %	256819000
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3273	NC_013162	TTATC	2	10	182251	182260	20 %	60 %	0 %	20 %	256819002
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3362	NC_013162	ACAA	2	8	187481	187488	75 %	0 %	0 %	25 %	256819005
3363	NC_013162	CTT	2	6	187604	187609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256819005
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3365	NC_013162	GTT	2	6	187764	187769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256819005
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3489	NC_013162	ACT	3	9	193290	193298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819007
3490	NC_013162	GTA	2	6	193309	193314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819007
3491	NC_013162	TAC	2	6	193325	193330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819007
3492	NC_013162	AAG	2	6	193360	193365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256819007
3493	NC_013162	CGG	2	6	193492	193497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256819007
3494	NC_013162	ACC	2	6	193545	193550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256819007
3495	NC_013162	GTA	2	6	193558	193563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819007
3496	NC_013162	CTCA	2	8	193668	193675	25 %	25 %	0 %	50 %	256819007
3497	NC_013162	TAA	2	6	193700	193705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256819007
3498	NC_013162	TTACAA	2	12	193718	193729	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256819007
3499	NC_013162	ACT	2	6	193866	193871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819007
3500	NC_013162	ACT	2	6	193905	193910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819007

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