MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Capnocytophaga ochracea DSM 7271 chromosome

Total Repeats: 45493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013162	ATG	2	6	27777	27782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818872
502	NC_013162	AAG	2	6	27813	27818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818872
503	NC_013162	A	6	6	27881	27886	100 %	0 %	0 %	0 %	256818872
504	NC_013162	TGA	2	6	27890	27895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818872
505	NC_013162	AGT	2	6	27920	27925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818872
506	NC_013162	TTTG	2	8	28022	28029	0 %	75 %	25 %	0 %	256818872
507	NC_013162	TAT	2	6	28037	28042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818872
508	NC_013162	CTG	2	6	28093	28098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818872
509	NC_013162	AGG	2	6	28190	28195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818872
510	NC_013162	T	6	6	28389	28394	0 %	100 %	0 %	0 %	256818873
511	NC_013162	TC	3	6	28405	28410	0 %	50 %	0 %	50 %	256818873
512	NC_013162	TGAT	2	8	28439	28446	25 %	50 %	25 %	0 %	256818873
513	NC_013162	AGA	2	6	28538	28543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818873
514	NC_013162	CTT	2	6	28555	28560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818873
515	NC_013162	GAA	2	6	28584	28589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818873
516	NC_013162	CTT	2	6	28615	28620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818873
517	NC_013162	TCT	2	6	28653	28658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818873
518	NC_013162	TCT	2	6	28710	28715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818873
519	NC_013162	ACA	2	6	28746	28751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818873
520	NC_013162	GGA	2	6	28752	28757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818873
521	NC_013162	TTC	2	6	28758	28763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818873
522	NC_013162	CTCA	2	8	28799	28806	25 %	25 %	0 %	50 %	256818873
523	NC_013162	AAT	2	6	28814	28819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818873
524	NC_013162	CTT	2	6	28825	28830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818873
525	NC_013162	T	8	8	28883	28890	0 %	100 %	0 %	0 %	256818873
526	NC_013162	CTA	2	6	28930	28935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818873
527	NC_013162	TCA	2	6	28944	28949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818873
528	NC_013162	CAG	2	6	28954	28959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818873
529	NC_013162	TAAA	2	8	28987	28994	75 %	25 %	0 %	0 %	256818873
530	NC_013162	CTTT	2	8	29011	29018	0 %	75 %	0 %	25 %	256818873
531	NC_013162	GAA	2	6	29031	29036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818873
532	NC_013162	TTG	3	9	29159	29167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818873
533	NC_013162	TGCT	2	8	29267	29274	0 %	50 %	25 %	25 %	256818873
534	NC_013162	ACT	2	6	29285	29290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818873
535	NC_013162	CTT	2	6	29317	29322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818873
536	NC_013162	T	6	6	29321	29326	0 %	100 %	0 %	0 %	256818873
537	NC_013162	AGA	2	6	29343	29348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818873
538	NC_013162	TTA	2	6	29370	29375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818873
539	NC_013162	GCT	2	6	29400	29405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818873
540	NC_013162	GCTGAG	2	12	29439	29450	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256818873
541	NC_013162	ATA	2	6	29454	29459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818873
542	NC_013162	GTACG	2	10	29479	29488	20 %	20 %	40 %	20 %	256818873
543	NC_013162	TAA	2	6	29558	29563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818873
544	NC_013162	CT	3	6	29586	29591	0 %	50 %	0 %	50 %	256818873
545	NC_013162	TAT	3	9	29626	29634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818873
546	NC_013162	T	7	7	29669	29675	0 %	100 %	0 %	0 %	256818873
547	NC_013162	TGCTTG	2	12	29681	29692	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	256818873
548	NC_013162	AGT	2	6	29726	29731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818873
549	NC_013162	CCA	2	6	29805	29810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818873
550	NC_013162	GCTCCT	2	12	29913	29924	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256818873
551	NC_013162	TTA	2	6	29958	29963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818873
552	NC_013162	CCT	2	6	30069	30074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818873
553	NC_013162	CAAAT	2	10	30113	30122	60 %	20 %	0 %	20 %	256818873
554	NC_013162	AAG	2	6	30185	30190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818874
555	NC_013162	ATTTA	2	10	30205	30214	40 %	60 %	0 %	0 %	256818874
556	NC_013162	CCA	2	6	30217	30222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818874
557	NC_013162	CTA	2	6	30227	30232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818874
558	NC_013162	TCA	2	6	30251	30256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818874
559	NC_013162	ATTT	2	8	30280	30287	25 %	75 %	0 %	0 %	256818874
560	NC_013162	CTA	2	6	30297	30302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818874
561	NC_013162	GTT	2	6	30312	30317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818874
562	NC_013162	TGA	2	6	30325	30330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818874
563	NC_013162	CTG	2	6	30342	30347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818874
564	NC_013162	T	6	6	30415	30420	0 %	100 %	0 %	0 %	256818874
565	NC_013162	AAGT	2	8	30489	30496	50 %	25 %	25 %	0 %	256818874
566	NC_013162	AT	3	6	30560	30565	50 %	50 %	0 %	0 %	256818874
567	NC_013162	CTA	2	6	30567	30572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818874
568	NC_013162	CCT	2	6	30602	30607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818874
569	NC_013162	TAC	2	6	30613	30618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818874
570	NC_013162	TTC	2	6	30643	30648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818874
571	NC_013162	AAT	2	6	30709	30714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818874
572	NC_013162	TTCC	2	8	30748	30755	0 %	50 %	0 %	50 %	256818874
573	NC_013162	TC	3	6	30795	30800	0 %	50 %	0 %	50 %	256818874
574	NC_013162	CTT	2	6	30864	30869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818874
575	NC_013162	ATC	2	6	30874	30879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818874
576	NC_013162	TAA	2	6	30882	30887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818874
577	NC_013162	CCT	2	6	30893	30898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818874
578	NC_013162	ATA	2	6	30923	30928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818874
579	NC_013162	ACC	2	6	30958	30963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818874
580	NC_013162	ACC	2	6	30980	30985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818874
581	NC_013162	CA	3	6	31075	31080	50 %	0 %	0 %	50 %	256818874
582	NC_013162	CAT	2	6	31150	31155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818874
583	NC_013162	GTT	2	6	31293	31298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818874
584	NC_013162	TCTTT	2	10	31392	31401	0 %	80 %	0 %	20 %	256818874
585	NC_013162	ATA	2	6	31421	31426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818874
586	NC_013162	AGT	2	6	31432	31437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818874
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589	NC_013162	TAG	2	6	31910	31915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818875
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592	NC_013162	TGT	2	6	32020	32025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818875
593	NC_013162	CTT	2	6	32030	32035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818875
594	NC_013162	TAA	2	6	32065	32070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818875
595	NC_013162	ACT	2	6	32146	32151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818875
596	NC_013162	ATC	2	6	32178	32183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818875
597	NC_013162	ATA	2	6	32191	32196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818875
598	NC_013162	AAT	2	6	32310	32315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818875
599	NC_013162	T	6	6	32373	32378	0 %	100 %	0 %	0 %	256818875
600	NC_013162	CCT	2	6	32395	32400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818875
601	NC_013162	TCA	3	9	32428	32436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818875
602	NC_013162	TAA	2	6	32609	32614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818876
603	NC_013162	TTG	2	6	32661	32666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818876
604	NC_013162	CAA	2	6	32699	32704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818876
605	NC_013162	GCT	2	6	32706	32711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818876
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607	NC_013162	TA	3	6	32947	32952	50 %	50 %	0 %	0 %	256818876
608	NC_013162	ACA	2	6	32985	32990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818876
609	NC_013162	CAAC	2	8	32996	33003	50 %	0 %	0 %	50 %	256818876
610	NC_013162	AAATA	2	10	33004	33013	80 %	20 %	0 %	0 %	256818876
611	NC_013162	ACA	2	6	33015	33020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818876
612	NC_013162	AT	3	6	33023	33028	50 %	50 %	0 %	0 %	256818876
613	NC_013162	ATT	2	6	33110	33115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818877
614	NC_013162	TCC	2	6	33142	33147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818877
615	NC_013162	TAG	2	6	33155	33160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818877
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617	NC_013162	CTA	2	6	33233	33238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818877
618	NC_013162	TGA	2	6	33299	33304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818877
619	NC_013162	ATC	2	6	33313	33318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818877
620	NC_013162	CCT	2	6	33382	33387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818877
621	NC_013162	GGT	2	6	33399	33404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818877
622	NC_013162	GACG	2	8	33418	33425	25 %	0 %	50 %	25 %	256818877
623	NC_013162	CAG	2	6	33674	33679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818877
624	NC_013162	GTC	2	6	33714	33719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818877
625	NC_013162	TTC	2	6	33741	33746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818877
626	NC_013162	TGG	2	6	33757	33762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818877
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