MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Capnocytophaga ochracea DSM 7271 chromosome

Total Repeats: 45493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013162	ATTA	2	8	251679	251686	50 %	50 %	0 %	0 %	256819046
4502	NC_013162	TAT	2	6	252902	252907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819047
4503	NC_013162	GCA	2	6	252946	252951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256819047
4504	NC_013162	CA	3	6	252950	252955	50 %	0 %	0 %	50 %	256819047
4505	NC_013162	A	7	7	253061	253067	100 %	0 %	0 %	0 %	256819047
4506	NC_013162	TC	3	6	253152	253157	0 %	50 %	0 %	50 %	256819047
4507	NC_013162	T	6	6	253195	253200	0 %	100 %	0 %	0 %	256819047
4508	NC_013162	A	6	6	253210	253215	100 %	0 %	0 %	0 %	256819047
4509	NC_013162	TCT	2	6	253294	253299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256819047
4510	NC_013162	CTC	2	6	253300	253305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819047
4511	NC_013162	CT	3	6	253320	253325	0 %	50 %	0 %	50 %	256819047
4512	NC_013162	ACCG	2	8	253332	253339	25 %	0 %	25 %	50 %	256819047
4513	NC_013162	GTAT	2	8	253357	253364	25 %	50 %	25 %	0 %	256819047
4514	NC_013162	AAT	2	6	253419	253424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256819047
4515	NC_013162	ATG	2	6	253452	253457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819047
4516	NC_013162	TTA	2	6	253483	253488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819047
4517	NC_013162	CGA	2	6	253568	253573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256819047
4518	NC_013162	A	6	6	253609	253614	100 %	0 %	0 %	0 %	256819047
4519	NC_013162	TTAC	2	8	253737	253744	25 %	50 %	0 %	25 %	256819048
4520	NC_013162	AT	3	6	253769	253774	50 %	50 %	0 %	0 %	256819048
4521	NC_013162	AGT	2	6	253818	253823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4522	NC_013162	CGTC	2	8	253853	253860	0 %	25 %	25 %	50 %	256819048
4523	NC_013162	CAT	3	9	253974	253982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4524	NC_013162	AAG	2	6	253991	253996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256819048
4525	NC_013162	GGT	2	6	254000	254005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256819048
4526	NC_013162	AGT	2	6	254172	254177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4527	NC_013162	GGA	2	6	254186	254191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256819048
4528	NC_013162	CCT	2	6	254195	254200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4529	NC_013162	TA	3	6	254344	254349	50 %	50 %	0 %	0 %	256819048
4530	NC_013162	GTTC	2	8	254353	254360	0 %	50 %	25 %	25 %	256819048
4531	NC_013162	ATAGC	2	10	254441	254450	40 %	20 %	20 %	20 %	256819048
4532	NC_013162	TTG	2	6	254483	254488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256819048
4533	NC_013162	GTC	2	6	254510	254515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256819048
4534	NC_013162	AGT	2	6	254518	254523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4535	NC_013162	TAC	2	6	254668	254673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4536	NC_013162	AT	3	6	254903	254908	50 %	50 %	0 %	0 %	256819048
4537	NC_013162	TTA	2	6	254933	254938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819048
4538	NC_013162	ACC	2	6	254992	254997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256819048
4539	NC_013162	CAT	2	6	255021	255026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4540	NC_013162	AAC	2	6	255036	255041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256819048
4541	NC_013162	TAG	2	6	255054	255059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4542	NC_013162	TTA	2	6	255119	255124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819048
4543	NC_013162	CTC	2	6	255186	255191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4544	NC_013162	CTATA	2	10	255195	255204	40 %	40 %	0 %	20 %	256819048
4545	NC_013162	AGA	2	6	255232	255237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256819048
4546	NC_013162	TAT	2	6	255261	255266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819048
4547	NC_013162	CCTT	2	8	255311	255318	0 %	50 %	0 %	50 %	256819048
4548	NC_013162	GTA	2	6	255338	255343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4549	NC_013162	AAG	2	6	255447	255452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256819048
4550	NC_013162	TCC	2	6	255457	255462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4551	NC_013162	TGATAG	2	12	255465	255476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4552	NC_013162	CAT	2	6	255486	255491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4553	NC_013162	ACC	2	6	255493	255498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256819048
4554	NC_013162	TCA	2	6	255509	255514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4555	NC_013162	TAA	2	6	255538	255543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256819048
4556	NC_013162	GTA	2	6	255566	255571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4557	NC_013162	TTC	2	6	255687	255692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256819048
4558	NC_013162	CCT	2	6	255698	255703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4559	NC_013162	AGA	2	6	255856	255861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256819048
4560	NC_013162	CCT	2	6	255923	255928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4561	NC_013162	CTAT	2	8	256100	256107	25 %	50 %	0 %	25 %	256819048
4562	NC_013162	GTA	2	6	256163	256168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4563	NC_013162	AGTA	2	8	256191	256198	50 %	25 %	25 %	0 %	256819048
4564	NC_013162	ACC	2	6	256210	256215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256819048
4565	NC_013162	TAG	2	6	256233	256238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4566	NC_013162	TTG	2	6	256240	256245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256819048
4567	NC_013162	CAAG	2	8	256246	256253	50 %	0 %	25 %	25 %	256819048
4568	NC_013162	TCA	2	6	256298	256303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4569	NC_013162	AGT	2	6	256384	256389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4570	NC_013162	CCT	2	6	256403	256408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4571	NC_013162	TCC	2	6	256456	256461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4572	NC_013162	CAC	2	6	256471	256476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256819048
4573	NC_013162	TTA	2	6	256479	256484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819048
4574	NC_013162	AGT	2	6	256516	256521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4575	NC_013162	TGG	2	6	256549	256554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256819048
4576	NC_013162	TAC	2	6	256561	256566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4577	NC_013162	TAG	3	9	256569	256577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4578	NC_013162	AAC	2	6	256581	256586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256819048
4579	NC_013162	CTC	2	6	256587	256592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4580	NC_013162	GTG	2	6	256646	256651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256819048
4581	NC_013162	GAG	2	6	256674	256679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256819048
4582	NC_013162	TCC	2	6	256681	256686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4583	NC_013162	CCT	2	6	256718	256723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4584	NC_013162	TAT	2	6	256749	256754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819048
4585	NC_013162	TAG	2	6	256785	256790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4586	NC_013162	AGT	2	6	256834	256839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4587	NC_013162	ACT	2	6	256871	256876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4588	NC_013162	CT	3	6	256915	256920	0 %	50 %	0 %	50 %	256819048
4589	NC_013162	TC	3	6	256921	256926	0 %	50 %	0 %	50 %	256819048
4590	NC_013162	CAT	2	6	257043	257048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4591	NC_013162	CCT	2	6	257051	257056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4592	NC_013162	TGGTT	2	10	257068	257077	0 %	60 %	40 %	0 %	256819048
4593	NC_013162	GCA	2	6	257081	257086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256819048
4594	NC_013162	ATGCG	2	10	257119	257128	20 %	20 %	40 %	20 %	256819048
4595	NC_013162	AAC	2	6	257136	257141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256819048
4596	NC_013162	TTTCA	2	10	257161	257170	20 %	60 %	0 %	20 %	256819048
4597	NC_013162	TTA	2	6	257288	257293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819048
4598	NC_013162	TA	3	6	257440	257445	50 %	50 %	0 %	0 %	256819048
4599	NC_013162	GTA	3	9	257519	257527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4600	NC_013162	TTG	2	6	257602	257607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256819048
4601	NC_013162	ATT	3	9	257611	257619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819048
4602	NC_013162	GT	3	6	257635	257640	0 %	50 %	50 %	0 %	256819048
4603	NC_013162	TAC	2	6	257659	257664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4604	NC_013162	TGA	2	6	257716	257721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4605	NC_013162	TA	3	6	257736	257741	50 %	50 %	0 %	0 %	256819048
4606	NC_013162	CTG	2	6	257745	257750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256819048
4607	NC_013162	TCC	2	6	257809	257814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4608	NC_013162	TGGTA	2	10	257860	257869	20 %	40 %	40 %	0 %	256819048
4609	NC_013162	GTC	2	6	257877	257882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256819048
4610	NC_013162	TTGC	2	8	257885	257892	0 %	50 %	25 %	25 %	256819048
4611	NC_013162	CCG	2	6	257907	257912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256819048
4612	NC_013162	GTA	2	6	257987	257992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
4613	NC_013162	TAT	2	6	258048	258053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819048
4614	NC_013162	ATT	2	6	258076	258081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819048
4615	NC_013162	CCT	2	6	258110	258115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4616	NC_013162	TAC	2	6	258175	258180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4617	NC_013162	TTGT	2	8	258306	258313	0 %	75 %	25 %	0 %	256819048
4618	NC_013162	CAC	2	6	258369	258374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256819048
4619	NC_013162	ATAG	2	8	258431	258438	50 %	25 %	25 %	0 %	256819048
4620	NC_013162	TTA	2	6	258452	258457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819048
4621	NC_013162	CCT	2	6	258500	258505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4622	NC_013162	TTG	2	6	258579	258584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256819048
4623	NC_013162	GGT	2	6	258590	258595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256819048
4624	NC_013162	GTA	2	6	258596	258601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819048
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4626	NC_013162	ACT	2	6	258775	258780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
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4742	NC_013162	TAC	2	6	264304	264309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
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4744	NC_013162	CTA	2	6	264339	264344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256819048
4745	NC_013162	AGTATA	2	12	264370	264381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256819048
4746	NC_013162	CCT	2	6	264392	264397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256819048
4747	NC_013162	TTC	2	6	264414	264419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256819048
4748	NC_013162	TTCATT	2	12	264427	264438	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256819048
4749	NC_013162	GTT	2	6	264497	264502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256819048
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4757	NC_013162	ATT	2	6	265042	265047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256819048
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4845	NC_013162	TC	3	6	269305	269310	0 %	50 %	0 %	50 %	256819048
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4849	NC_013162	GA	3	6	269594	269599	50 %	0 %	50 %	0 %	256819048
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4853	NC_013162	CTCAA	2	10	270206	270215	40 %	20 %	0 %	40 %	256819049
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4856	NC_013162	CT	3	6	270289	270294	0 %	50 %	0 %	50 %	256819049
4857	NC_013162	CGATGA	2	12	270330	270341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256819049
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4859	NC_013162	A	7	7	270379	270385	100 %	0 %	0 %	0 %	256819049
4860	NC_013162	TAG	2	6	270404	270409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256819049
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4862	NC_013162	TAA	2	6	270522	270527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256819049
4863	NC_013162	CT	3	6	270613	270618	0 %	50 %	0 %	50 %	256819049
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4865	NC_013162	AAAGG	2	10	270664	270673	60 %	0 %	40 %	0 %	256819049
4866	NC_013162	CTT	2	6	270873	270878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256819050
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4973	NC_013162	TGGTA	2	10	277474	277483	20 %	40 %	40 %	0 %	256819057
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4988	NC_013162	A	6	6	277918	277923	100 %	0 %	0 %	0 %	256819057
4989	NC_013162	GAA	2	6	277931	277936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256819057
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