MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 2379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013161	GAGTT	2	10	1292	1301	20 %	40 %	40 %	0 %	257057920
2	NC_013161	AAAAT	2	10	2275	2284	80 %	20 %	0 %	0 %	257057921
3	NC_013161	CTAGA	2	10	3515	3524	40 %	20 %	20 %	20 %	257057922
4	NC_013161	TTATT	2	10	4635	4644	20 %	80 %	0 %	0 %	257057924
5	NC_013161	CTTGA	2	10	5617	5626	20 %	40 %	20 %	20 %	257057925
6	NC_013161	AATCA	2	10	6653	6662	60 %	20 %	0 %	20 %	257057926
7	NC_013161	TTTGC	2	10	9257	9266	0 %	60 %	20 %	20 %	257057927
8	NC_013161	TTAAA	2	10	9381	9390	60 %	40 %	0 %	0 %	257057927
9	NC_013161	GATCA	2	10	10845	10854	40 %	20 %	20 %	20 %	257057929
10	NC_013161	AATAT	2	10	11239	11248	60 %	40 %	0 %	0 %	257057929
11	NC_013161	GAATT	2	10	12853	12862	40 %	40 %	20 %	0 %	257057931
12	NC_013161	AGAAA	2	10	17156	17165	80 %	0 %	20 %	0 %	257057936
13	NC_013161	TATTT	2	10	18339	18348	20 %	80 %	0 %	0 %	257057938
14	NC_013161	ATCAA	2	10	18554	18563	60 %	20 %	0 %	20 %	257057938
15	NC_013161	CAGAT	2	10	20503	20512	40 %	20 %	20 %	20 %	257057939
16	NC_013161	TAAAT	2	10	20998	21007	60 %	40 %	0 %	0 %	257057939
17	NC_013161	CATTA	2	10	28182	28191	40 %	40 %	0 %	20 %	257057945
18	NC_013161	TCTTA	2	10	29252	29261	20 %	60 %	0 %	20 %	257057945
19	NC_013161	TATTT	2	10	29493	29502	20 %	80 %	0 %	0 %	257057945
20	NC_013161	CTTTA	2	10	31218	31227	20 %	60 %	0 %	20 %	257057947
21	NC_013161	TCTTT	2	10	31404	31413	0 %	80 %	0 %	20 %	257057947
22	NC_013161	GCTTA	2	10	32806	32815	20 %	40 %	20 %	20 %	257057948
23	NC_013161	ATTCA	2	10	34325	34334	40 %	40 %	0 %	20 %	257057951
24	NC_013161	TCAGT	2	10	37961	37970	20 %	40 %	20 %	20 %	257057955
25	NC_013161	TTGCG	2	10	38263	38272	0 %	40 %	40 %	20 %	257057955
26	NC_013161	GGTTG	2	10	38590	38599	0 %	40 %	60 %	0 %	257057955
27	NC_013161	GGAAA	2	10	38949	38958	60 %	0 %	40 %	0 %	257057956
28	NC_013161	TAGTT	2	10	40550	40559	20 %	60 %	20 %	0 %	257057957
29	NC_013161	AGACA	2	10	41061	41070	60 %	0 %	20 %	20 %	257057957
30	NC_013161	AATTA	2	10	43422	43431	60 %	40 %	0 %	0 %	257057959
31	NC_013161	CCATT	2	10	44087	44096	20 %	40 %	0 %	40 %	257057960
32	NC_013161	CCTAC	2	10	45545	45554	20 %	20 %	0 %	60 %	257057961
33	NC_013161	TTTGG	2	10	46339	46348	0 %	60 %	40 %	0 %	257057962
34	NC_013161	ATCAA	2	10	46534	46543	60 %	20 %	0 %	20 %	257057962
35	NC_013161	GATTT	2	10	47684	47693	20 %	60 %	20 %	0 %	257057963
36	NC_013161	AATTT	2	10	47926	47935	40 %	60 %	0 %	0 %	257057963
37	NC_013161	TAATT	2	10	48075	48084	40 %	60 %	0 %	0 %	257057963
38	NC_013161	ACTCA	2	10	48992	49001	40 %	20 %	0 %	40 %	257057964
39	NC_013161	TGAGG	2	10	49412	49421	20 %	20 %	60 %	0 %	257057965
40	NC_013161	TAAAG	2	10	50881	50890	60 %	20 %	20 %	0 %	257057966
41	NC_013161	CAACA	2	10	51103	51112	60 %	0 %	0 %	40 %	257057967
42	NC_013161	AACTA	2	10	52298	52307	60 %	20 %	0 %	20 %	257057968
43	NC_013161	TATGA	2	10	52504	52513	40 %	40 %	20 %	0 %	257057968
44	NC_013161	ATTCC	2	10	52643	52652	20 %	40 %	0 %	40 %	257057968
45	NC_013161	ATCTG	2	10	52821	52830	20 %	40 %	20 %	20 %	257057968
46	NC_013161	TAAAG	2	10	55978	55987	60 %	20 %	20 %	0 %	257057972
47	NC_013161	ACCAG	2	10	56473	56482	40 %	0 %	20 %	40 %	257057972
48	NC_013161	CAGTC	2	10	57443	57452	20 %	20 %	20 %	40 %	257057973
49	NC_013161	ATCGC	2	10	58867	58876	20 %	20 %	20 %	40 %	257057974
50	NC_013161	CTAAA	2	10	59699	59708	60 %	20 %	0 %	20 %	257057975
51	NC_013161	TAATT	2	10	60482	60491	40 %	60 %	0 %	0 %	257057976
52	NC_013161	GGGAA	2	10	65224	65233	40 %	0 %	60 %	0 %	257057981
53	NC_013161	TCTTT	2	10	65279	65288	0 %	80 %	0 %	20 %	257057981
54	NC_013161	CTGAA	2	10	67791	67800	40 %	20 %	20 %	20 %	257057983
55	NC_013161	AGTTA	2	10	75450	75459	40 %	40 %	20 %	0 %	257057990
56	NC_013161	ATAAA	2	10	79209	79218	80 %	20 %	0 %	0 %	257057994
57	NC_013161	TTTAG	2	10	80949	80958	20 %	60 %	20 %	0 %	257057994
58	NC_013161	ATATT	2	10	82274	82283	40 %	60 %	0 %	0 %	257057996
59	NC_013161	CCTTT	2	10	82291	82300	0 %	60 %	0 %	40 %	257057996
60	NC_013161	TATTT	2	10	83200	83209	20 %	80 %	0 %	0 %	257057996
61	NC_013161	ATTCA	2	10	83757	83766	40 %	40 %	0 %	20 %	257057996
62	NC_013161	TTATT	2	10	84232	84241	20 %	80 %	0 %	0 %	257057997
63	NC_013161	GGTTT	2	10	85851	85860	0 %	60 %	40 %	0 %	257057999
64	NC_013161	TTATT	2	10	86375	86384	20 %	80 %	0 %	0 %	257057999
65	NC_013161	ATAGT	2	10	87444	87453	40 %	40 %	20 %	0 %	257058000
66	NC_013161	CAATA	2	10	87782	87791	60 %	20 %	0 %	20 %	257058000
67	NC_013161	AGGTG	2	10	91295	91304	20 %	20 %	60 %	0 %	257058003
68	NC_013161	TCAAA	2	10	91970	91979	60 %	20 %	0 %	20 %	257058004
69	NC_013161	TTTGA	2	10	91980	91989	20 %	60 %	20 %	0 %	257058004
70	NC_013161	TAATT	2	10	95112	95121	40 %	60 %	0 %	0 %	257058008
71	NC_013161	CAACG	2	10	95653	95662	40 %	0 %	20 %	40 %	257058008
72	NC_013161	TTATT	2	10	96426	96435	20 %	80 %	0 %	0 %	257058008
73	NC_013161	ATTTT	2	10	96486	96495	20 %	80 %	0 %	0 %	257058008
74	NC_013161	CATAA	2	10	96604	96613	60 %	20 %	0 %	20 %	257058009
75	NC_013161	GTTTA	2	10	97317	97326	20 %	60 %	20 %	0 %	257058009
76	NC_013161	AGGGA	2	10	98369	98378	40 %	0 %	60 %	0 %	257058010
77	NC_013161	TTTCA	2	10	99080	99089	20 %	60 %	0 %	20 %	257058011
78	NC_013161	AATTT	2	10	99582	99591	40 %	60 %	0 %	0 %	257058011
79	NC_013161	GATTT	2	10	103298	103307	20 %	60 %	20 %	0 %	257058015
80	NC_013161	CATCA	2	10	103361	103370	40 %	20 %	0 %	40 %	257058015
81	NC_013161	CGGAA	2	10	104306	104315	40 %	0 %	40 %	20 %	257058016
82	NC_013161	TTTAT	2	10	104321	104330	20 %	80 %	0 %	0 %	257058016
83	NC_013161	CAAAC	2	10	110075	110084	60 %	0 %	0 %	40 %	257058022
84	NC_013161	AAAAT	2	10	112576	112585	80 %	20 %	0 %	0 %	257058025
85	NC_013161	TTAAT	2	10	114477	114486	40 %	60 %	0 %	0 %	257058026
86	NC_013161	TTTGG	2	10	115534	115543	0 %	60 %	40 %	0 %	257058027
87	NC_013161	ACCCC	2	10	118727	118736	20 %	0 %	0 %	80 %	257058032
88	NC_013161	CCCAT	2	10	120415	120424	20 %	20 %	0 %	60 %	257058032
89	NC_013161	CCCAT	2	10	121454	121463	20 %	20 %	0 %	60 %	257058032
90	NC_013161	GTTTT	2	10	121558	121567	0 %	80 %	20 %	0 %	257058032
91	NC_013161	GTTGA	2	10	123209	123218	20 %	40 %	40 %	0 %	257058036
92	NC_013161	ATAAA	2	10	123427	123436	80 %	20 %	0 %	0 %	257058036
93	NC_013161	TGGGA	2	10	143723	143732	20 %	20 %	60 %	0 %	257058052
94	NC_013161	TTCAT	2	10	144290	144299	20 %	60 %	0 %	20 %	257058053
95	NC_013161	AATTT	2	10	145450	145459	40 %	60 %	0 %	0 %	257058055
96	NC_013161	GCCAT	2	10	146353	146362	20 %	20 %	20 %	40 %	257058056
97	NC_013161	TTAAT	2	10	147292	147301	40 %	60 %	0 %	0 %	257058058
98	NC_013161	AGCAT	2	10	148046	148055	40 %	20 %	20 %	20 %	257058059
99	NC_013161	TCTAA	2	10	149796	149805	40 %	40 %	0 %	20 %	257058060
100	NC_013161	AAGAC	2	10	151206	151215	60 %	0 %	20 %	20 %	257058064
101	NC_013161	CAAGC	2	10	156820	156829	40 %	0 %	20 %	40 %	257058069
102	NC_013161	ATCCC	2	10	159457	159466	20 %	20 %	0 %	60 %	257058072
103	NC_013161	ACTCA	2	10	161523	161532	40 %	20 %	0 %	40 %	257058073
104	NC_013161	CAAAA	2	10	163399	163408	80 %	0 %	0 %	20 %	257058076
105	NC_013161	GATAC	2	10	166681	166690	40 %	20 %	20 %	20 %	257058078
106	NC_013161	TTGAA	2	10	170644	170653	40 %	40 %	20 %	0 %	257058084
107	NC_013161	CATAC	2	10	173637	173646	40 %	20 %	0 %	40 %	257058089
108	NC_013161	GGGAT	2	10	173857	173866	20 %	20 %	60 %	0 %	257058089
109	NC_013161	AATTT	2	10	174815	174824	40 %	60 %	0 %	0 %	257058090
110	NC_013161	ATCTT	2	10	175052	175061	20 %	60 %	0 %	20 %	257058090
111	NC_013161	TTGTT	2	10	175839	175848	0 %	80 %	20 %	0 %	257058091
112	NC_013161	GCAAA	2	10	181477	181486	60 %	0 %	20 %	20 %	257058099
113	NC_013161	TCCCG	2	10	181536	181545	0 %	20 %	20 %	60 %	257058099
114	NC_013161	ATCGC	2	10	185093	185102	20 %	20 %	20 %	40 %	257058102
115	NC_013161	TATTT	2	10	186580	186589	20 %	80 %	0 %	0 %	257058103
116	NC_013161	GTCCA	2	10	186684	186693	20 %	20 %	20 %	40 %	257058103
117	NC_013161	AATTA	2	10	187697	187706	60 %	40 %	0 %	0 %	257058105
118	NC_013161	GATAG	2	10	187787	187796	40 %	20 %	40 %	0 %	257058105
119	NC_013161	AAATA	2	10	187938	187947	80 %	20 %	0 %	0 %	257058105
120	NC_013161	CAATA	2	10	188570	188579	60 %	20 %	0 %	20 %	257058106
121	NC_013161	AGATG	2	10	190437	190446	40 %	20 %	40 %	0 %	257058109
122	NC_013161	TTATT	2	10	191403	191412	20 %	80 %	0 %	0 %	257058109
123	NC_013161	TCGGT	2	10	191612	191621	0 %	40 %	40 %	20 %	257058109
124	NC_013161	TTGTT	2	10	193690	193699	0 %	80 %	20 %	0 %	257058112
125	NC_013161	GTTTC	2	10	193974	193983	0 %	60 %	20 %	20 %	257058113
126	NC_013161	TTCGG	2	10	194186	194195	0 %	40 %	40 %	20 %	257058113
127	NC_013161	CGGAA	2	10	196660	196669	40 %	0 %	40 %	20 %	257058116
128	NC_013161	TAATA	2	10	199599	199608	60 %	40 %	0 %	0 %	257058118
129	NC_013161	TGAAA	2	10	203030	203039	60 %	20 %	20 %	0 %	257058121
130	NC_013161	GGTGT	2	10	203646	203655	0 %	40 %	60 %	0 %	257058122
131	NC_013161	TTTGA	2	10	204359	204368	20 %	60 %	20 %	0 %	257058124
132	NC_013161	TATCC	2	10	206080	206089	20 %	40 %	0 %	40 %	257058125
133	NC_013161	ACAGA	2	10	206798	206807	60 %	0 %	20 %	20 %	257058125
134	NC_013161	CTATT	2	10	207823	207832	20 %	60 %	0 %	20 %	257058126
135	NC_013161	AACCC	2	10	210646	210655	40 %	0 %	0 %	60 %	257058130
136	NC_013161	AGCTA	2	10	210775	210784	40 %	20 %	20 %	20 %	257058130
137	NC_013161	GTTTG	2	10	214672	214681	0 %	60 %	40 %	0 %	257058133
138	NC_013161	TTTAG	2	10	215014	215023	20 %	60 %	20 %	0 %	257058134
139	NC_013161	TAGGT	2	10	218179	218188	20 %	40 %	40 %	0 %	257058139
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143	NC_013161	GTGAG	2	10	227764	227773	20 %	20 %	60 %	0 %	257058156
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149	NC_013161	TTGAG	2	10	251079	251088	20 %	40 %	40 %	0 %	257058179
150	NC_013161	TTCTC	2	10	251729	251738	0 %	60 %	0 %	40 %	257058180
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161	NC_013161	TGTAG	2	10	269584	269593	20 %	40 %	40 %	0 %	257058195
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168	NC_013161	TTAAA	2	10	279745	279754	60 %	40 %	0 %	0 %	257058201
169	NC_013161	AAGTA	2	10	284198	284207	60 %	20 %	20 %	0 %	257058205
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262	NC_013161	GATTT	2	10	476240	476249	20 %	60 %	20 %	0 %	257058382
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