MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 55953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013161	TAT	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057920
2	NC_013161	TGC	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057920
3	NC_013161	TCG	2	6	721	726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057920
4	NC_013161	GAT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057920
5	NC_013161	AAG	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057920
6	NC_013161	ATT	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057920
7	NC_013161	TTC	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057920
8	NC_013161	TCC	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057920
9	NC_013161	CGA	2	6	1232	1237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057920
10	NC_013161	GAA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057920
11	NC_013161	ATC	2	6	1916	1921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057921
12	NC_013161	AAT	2	6	2008	2013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
13	NC_013161	CGT	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057921
14	NC_013161	ATT	2	6	2090	2095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
15	NC_013161	TTG	2	6	2261	2266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057921
16	NC_013161	AGC	2	6	2319	2324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057921
17	NC_013161	GTC	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057921
18	NC_013161	AAT	2	6	2362	2367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
19	NC_013161	ATC	2	6	2393	2398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057921
20	NC_013161	GAA	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057921
21	NC_013161	CAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057921
22	NC_013161	AAT	2	6	2536	2541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
23	NC_013161	TTA	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
24	NC_013161	ATT	2	6	2622	2627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057921
25	NC_013161	ATG	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057921
26	NC_013161	TTG	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057921
27	NC_013161	ATA	2	6	2746	2751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057921
28	NC_013161	CTT	2	6	2761	2766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057921
29	NC_013161	ACA	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057921
30	NC_013161	GGC	2	6	3104	3109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057922
31	NC_013161	TTC	2	6	3153	3158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057922
32	NC_013161	GTT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
33	NC_013161	ATA	2	6	3428	3433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
34	NC_013161	ATA	2	6	3500	3505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
35	NC_013161	AAT	2	6	3561	3566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
36	NC_013161	CCA	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057922
37	NC_013161	TAA	2	6	3630	3635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057922
38	NC_013161	TTC	2	6	3788	3793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057922
39	NC_013161	GTT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
40	NC_013161	TTG	2	6	3812	3817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057922
41	NC_013161	GTA	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057923
42	NC_013161	AGC	2	6	3996	4001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057923
43	NC_013161	TAA	2	6	4036	4041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057923
44	NC_013161	AGT	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057923
45	NC_013161	TTA	2	6	4310	4315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
46	NC_013161	ATT	2	6	4369	4374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
47	NC_013161	CCA	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057924
48	NC_013161	CCT	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057924
49	NC_013161	ATT	2	6	4411	4416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
50	NC_013161	TGT	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057924
51	NC_013161	TTA	2	6	4478	4483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
52	NC_013161	TAA	2	6	4536	4541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057924
53	NC_013161	AGG	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057924
54	NC_013161	TTA	2	6	4617	4622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
55	NC_013161	ATT	2	6	4668	4673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
56	NC_013161	TTA	2	6	4775	4780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
57	NC_013161	ATT	2	6	4876	4881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057924
58	NC_013161	TTG	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
59	NC_013161	CAT	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057925
60	NC_013161	TAA	2	6	5259	5264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
61	NC_013161	GTT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
62	NC_013161	CAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057925
63	NC_013161	TTC	2	6	5602	5607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057925
64	NC_013161	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057925
65	NC_013161	TTG	2	6	5959	5964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057925
66	NC_013161	TAA	2	6	5965	5970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
67	NC_013161	CTT	2	6	5979	5984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057925
68	NC_013161	TAA	3	9	6031	6039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057925
69	NC_013161	ATC	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057925
70	NC_013161	TGG	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057925
71	NC_013161	AAT	2	6	6309	6314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
72	NC_013161	ATT	2	6	6348	6353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057926
73	NC_013161	TCT	2	6	6354	6359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
74	NC_013161	TAA	2	6	6434	6439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
75	NC_013161	AAT	2	6	6529	6534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
76	NC_013161	GCA	2	6	6540	6545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
77	NC_013161	TAA	2	6	6578	6583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
78	NC_013161	ATC	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057926
79	NC_013161	AAT	2	6	6797	6802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057926
80	NC_013161	AGG	2	6	6867	6872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
81	NC_013161	GAC	3	9	6931	6939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
82	NC_013161	CGA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
83	NC_013161	CAG	2	6	7201	7206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
84	NC_013161	AGG	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
85	NC_013161	GAG	2	6	7388	7393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
86	NC_013161	GGA	2	6	7423	7428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
87	NC_013161	TTC	4	12	7511	7522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
88	NC_013161	GTT	2	6	7579	7584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057926
89	NC_013161	GGA	2	6	7640	7645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
90	NC_013161	GTT	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057926
91	NC_013161	GCC	2	6	7851	7856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057926
92	NC_013161	GTG	2	6	7889	7894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057926
93	NC_013161	GTT	2	6	7951	7956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057926
94	NC_013161	CTG	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057926
95	NC_013161	GGT	2	6	8027	8032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057926
96	NC_013161	GAG	2	6	8075	8080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057926
97	NC_013161	TCC	2	6	8096	8101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057926
98	NC_013161	CGA	2	6	8122	8127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057926
99	NC_013161	TCG	2	6	8139	8144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057926
100	NC_013161	TTC	2	6	8204	8209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
101	NC_013161	TGA	2	6	8302	8307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057926
102	NC_013161	CGG	2	6	8409	8414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057926
103	NC_013161	TTC	2	6	8417	8422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
104	NC_013161	CTT	2	6	8452	8457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
105	NC_013161	AAC	2	6	8599	8604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057926
106	NC_013161	TCT	2	6	8622	8627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057926
107	NC_013161	TGT	2	6	8784	8789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057926
108	NC_013161	TTG	2	6	9121	9126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057927
109	NC_013161	TCC	2	6	9163	9168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057927
110	NC_013161	GGC	2	6	9181	9186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057927
111	NC_013161	TCT	2	6	9212	9217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057927
112	NC_013161	CTA	2	6	9225	9230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057927
113	NC_013161	TTC	2	6	9232	9237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057927
114	NC_013161	TTG	2	6	9395	9400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057927
115	NC_013161	TTC	2	6	9421	9426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057927
116	NC_013161	TCT	2	6	9431	9436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057927
117	NC_013161	TTG	2	6	9466	9471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057927
118	NC_013161	AGG	2	6	9473	9478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057927
119	NC_013161	TTC	2	6	9496	9501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057927
120	NC_013161	ATA	2	6	9689	9694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057928
121	NC_013161	ACG	3	9	9722	9730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057928
122	NC_013161	ATC	2	6	9794	9799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057928
123	NC_013161	TAA	2	6	9868	9873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057928
124	NC_013161	GGT	2	6	9901	9906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057928
125	NC_013161	CTT	2	6	9970	9975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057928
126	NC_013161	GCT	2	6	10056	10061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057928
127	NC_013161	CAT	2	6	10297	10302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057928
128	NC_013161	CAA	3	9	10303	10311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057928
129	NC_013161	AAC	2	6	10397	10402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057928
130	NC_013161	TAT	2	6	10574	10579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057929
131	NC_013161	TTG	2	6	10678	10683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057929
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257	NC_013161	AAT	2	6	20984	20989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057939
258	NC_013161	AAT	2	6	21028	21033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057939
259	NC_013161	TGT	2	6	21088	21093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057940
260	NC_013161	AGA	2	6	21115	21120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057940
261	NC_013161	TTC	2	6	21144	21149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057940
262	NC_013161	AGA	2	6	21172	21177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057940
263	NC_013161	ACT	2	6	21196	21201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057940
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265	NC_013161	ATC	2	6	21237	21242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057940
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277	NC_013161	ATA	2	6	22278	22283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057941
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282	NC_013161	TTG	2	6	22398	22403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057941
283	NC_013161	GAC	2	6	22427	22432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057941
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285	NC_013161	ATA	2	6	22444	22449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057941
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287	NC_013161	TAT	2	6	22586	22591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057941
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