MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 81527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013161	TCG	2	6	221134	221139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058144
4002	NC_013161	CA	3	6	221157	221162	50 %	0 %	0 %	50 %	257058144
4003	NC_013161	T	7	7	221163	221169	0 %	100 %	0 %	0 %	257058144
4004	NC_013161	CTT	2	6	221311	221316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058145
4005	NC_013161	TTC	2	6	221337	221342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058145
4006	NC_013161	ACG	2	6	221410	221415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058145
4007	NC_013161	TTCC	2	8	221502	221509	0 %	50 %	0 %	50 %	257058145
4008	NC_013161	GAC	2	6	221745	221750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058146
4009	NC_013161	TAA	2	6	221800	221805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058146
4010	NC_013161	TCA	2	6	221911	221916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058146
4011	NC_013161	A	6	6	221977	221982	100 %	0 %	0 %	0 %	257058146
4012	NC_013161	GACC	2	8	222040	222047	25 %	0 %	25 %	50 %	257058146
4013	NC_013161	TCA	2	6	222079	222084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058146
4014	NC_013161	TC	3	6	222164	222169	0 %	50 %	0 %	50 %	257058146
4015	NC_013161	A	7	7	222247	222253	100 %	0 %	0 %	0 %	257058146
4016	NC_013161	TTTG	2	8	222406	222413	0 %	75 %	25 %	0 %	257058147
4017	NC_013161	CTA	2	6	222433	222438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058147
4018	NC_013161	AGA	2	6	222444	222449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058147
4019	NC_013161	ACA	2	6	222519	222524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058147
4020	NC_013161	A	7	7	222528	222534	100 %	0 %	0 %	0 %	257058147
4021	NC_013161	AAG	2	6	222543	222548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058147
4022	NC_013161	T	6	6	222586	222591	0 %	100 %	0 %	0 %	257058147
4023	NC_013161	A	6	6	222686	222691	100 %	0 %	0 %	0 %	257058147
4024	NC_013161	A	6	6	222791	222796	100 %	0 %	0 %	0 %	257058147
4025	NC_013161	GA	3	6	222803	222808	50 %	0 %	50 %	0 %	257058147
4026	NC_013161	AAT	2	6	222839	222844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058147
4027	NC_013161	GAC	2	6	222919	222924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058147
4028	NC_013161	AAT	2	6	222932	222937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058147
4029	NC_013161	AAG	2	6	222990	222995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058147
4030	NC_013161	AGG	2	6	223002	223007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058147
4031	NC_013161	ACC	2	6	223011	223016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058147
4032	NC_013161	GAC	2	6	223030	223035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058147
4033	NC_013161	TGA	2	6	223141	223146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058147
4034	NC_013161	CCG	2	6	223177	223182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058147
4035	NC_013161	ACG	2	6	223203	223208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058147
4036	NC_013161	TAT	2	6	223219	223224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058147
4037	NC_013161	TAA	2	6	223241	223246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058147
4038	NC_013161	CCCAA	2	10	223279	223288	40 %	0 %	0 %	60 %	257058147
4039	NC_013161	TCG	2	6	223319	223324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058147
4040	NC_013161	T	7	7	223341	223347	0 %	100 %	0 %	0 %	257058147
4041	NC_013161	AGC	2	6	223370	223375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058147
4042	NC_013161	AAGG	2	8	223411	223418	50 %	0 %	50 %	0 %	257058147
4043	NC_013161	C	6	6	223451	223456	0 %	0 %	0 %	100 %	257058147
4044	NC_013161	CTG	3	9	223491	223499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058147
4045	NC_013161	GCA	3	9	223503	223511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058147
4046	NC_013161	TAA	2	6	223568	223573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058147
4047	NC_013161	GCT	2	6	223608	223613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058147
4048	NC_013161	ATT	2	6	223716	223721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058148
4049	NC_013161	GGC	2	6	223780	223785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058148
4050	NC_013161	T	6	6	223788	223793	0 %	100 %	0 %	0 %	257058148
4051	NC_013161	AGC	2	6	223813	223818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058148
4052	NC_013161	TGG	2	6	223881	223886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058148
4053	NC_013161	TAA	2	6	223887	223892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058148
4054	NC_013161	TGA	2	6	223962	223967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058148
4055	NC_013161	CAG	2	6	224121	224126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058148
4056	NC_013161	CGA	2	6	224144	224149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058148
4057	NC_013161	CTT	2	6	224166	224171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058148
4058	NC_013161	GTT	2	6	224347	224352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058149
4059	NC_013161	GTT	2	6	224373	224378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058149
4060	NC_013161	GCTT	2	8	224518	224525	0 %	50 %	25 %	25 %	257058149
4061	NC_013161	GTT	2	6	224547	224552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058149
4062	NC_013161	T	6	6	224551	224556	0 %	100 %	0 %	0 %	257058149
4063	NC_013161	ACGG	2	8	224575	224582	25 %	0 %	50 %	25 %	257058149
4064	NC_013161	ACCC	2	8	224611	224618	25 %	0 %	0 %	75 %	257058149
4065	NC_013161	ACA	2	6	224645	224650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058149
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4067	NC_013161	CGA	2	6	224699	224704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058149
4068	NC_013161	TTCG	2	8	224744	224751	0 %	50 %	25 %	25 %	257058149
4069	NC_013161	ACG	2	6	224761	224766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058149
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4071	NC_013161	CGG	3	9	224959	224967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058150
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4073	NC_013161	TGT	2	6	225042	225047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058150
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4075	NC_013161	TCA	2	6	225230	225235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058151
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4077	NC_013161	CGG	2	6	225291	225296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058151
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4082	NC_013161	GAC	2	6	225598	225603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058151
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4084	NC_013161	CGC	2	6	225833	225838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058152
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4087	NC_013161	ATG	2	6	225988	225993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058152
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4092	NC_013161	AATT	2	8	226244	226251	50 %	50 %	0 %	0 %	257058153
4093	NC_013161	GAG	2	6	226280	226285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058153
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4098	NC_013161	T	6	6	226574	226579	0 %	100 %	0 %	0 %	257058153
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4100	NC_013161	AG	3	6	226616	226621	50 %	0 %	50 %	0 %	257058153
4101	NC_013161	AGTT	2	8	226739	226746	25 %	50 %	25 %	0 %	257058153
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4104	NC_013161	CTT	2	6	226917	226922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058154
4105	NC_013161	TGG	2	6	226962	226967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058154
4106	NC_013161	CTT	2	6	227031	227036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058154
4107	NC_013161	TGG	3	9	227091	227099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058154
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4109	NC_013161	TTG	2	6	227326	227331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058155
4110	NC_013161	ATG	2	6	227332	227337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058155
4111	NC_013161	CGG	2	6	227339	227344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058155
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4116	NC_013161	GAC	2	6	227740	227745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058156
4117	NC_013161	GTGAG	2	10	227764	227773	20 %	20 %	60 %	0 %	257058156
4118	NC_013161	CAA	2	6	227820	227825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058156
4119	NC_013161	CTTT	2	8	227834	227841	0 %	75 %	0 %	25 %	257058156
4120	NC_013161	CGTTCC	2	12	227907	227918	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257058157
4121	NC_013161	T	6	6	227968	227973	0 %	100 %	0 %	0 %	257058157
4122	NC_013161	TGG	2	6	227983	227988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058157
4123	NC_013161	GGC	2	6	228023	228028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058157
4124	NC_013161	TCC	2	6	228036	228041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058157
4125	NC_013161	TCT	2	6	228072	228077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058157
4126	NC_013161	TCC	2	6	228109	228114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058158
4127	NC_013161	TAA	2	6	228122	228127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058158
4128	NC_013161	ACC	2	6	228333	228338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058158
4129	NC_013161	GGC	2	6	228369	228374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058158
4130	NC_013161	TGC	2	6	228443	228448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058158
4131	NC_013161	TCCG	2	8	228470	228477	0 %	25 %	25 %	50 %	257058158
4132	NC_013161	TGT	2	6	228481	228486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058158
4133	NC_013161	TTC	2	6	228500	228505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058158
4134	NC_013161	TTC	2	6	228616	228621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058159
4135	NC_013161	GATC	2	8	228626	228633	25 %	25 %	25 %	25 %	257058159
4136	NC_013161	CGA	2	6	228647	228652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058159
4137	NC_013161	TCT	2	6	228695	228700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058159
4138	NC_013161	AAT	2	6	228709	228714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058159
4139	NC_013161	GAC	2	6	228864	228869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058159
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4142	NC_013161	GTT	2	6	228963	228968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058159
4143	NC_013161	GGCATC	2	12	228994	229005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257058159
4144	NC_013161	CTG	2	6	229060	229065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058159
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4146	NC_013161	ATGG	2	8	229132	229139	25 %	25 %	50 %	0 %	257058159
4147	NC_013161	TCT	2	6	229232	229237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058159
4148	NC_013161	TGAC	2	8	229491	229498	25 %	25 %	25 %	25 %	257058160
4149	NC_013161	GCG	2	6	229542	229547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058160
4150	NC_013161	AAT	2	6	229604	229609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058160
4151	NC_013161	TCG	2	6	229652	229657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058160
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4153	NC_013161	CTG	2	6	229705	229710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058160
4154	NC_013161	T	6	6	229841	229846	0 %	100 %	0 %	0 %	257058161
4155	NC_013161	TCG	2	6	229990	229995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058161
4156	NC_013161	T	7	7	230087	230093	0 %	100 %	0 %	0 %	257058161
4157	NC_013161	CTA	2	6	230139	230144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058162
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4160	NC_013161	TCA	2	6	230297	230302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058162
4161	NC_013161	CTT	2	6	230432	230437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058162
4162	NC_013161	ACC	2	6	230493	230498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058162
4163	NC_013161	AAC	2	6	230622	230627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058162
4164	NC_013161	CGG	2	6	230648	230653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058162
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4171	NC_013161	T	8	8	231161	231168	0 %	100 %	0 %	0 %	257058163
4172	NC_013161	GACG	2	8	231177	231184	25 %	0 %	50 %	25 %	257058163
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4190	NC_013161	AGG	2	6	232113	232118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058165
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4203	NC_013161	TCA	2	6	234344	234349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058166
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4212	NC_013161	TAT	2	6	234670	234675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058166
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4225	NC_013161	A	6	6	235401	235406	100 %	0 %	0 %	0 %	257058167
4226	NC_013161	ATC	2	6	235416	235421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058167
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4228	NC_013161	CAT	2	6	235478	235483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058167
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4230	NC_013161	ATC	2	6	235515	235520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058167
4231	NC_013161	GAG	3	9	235540	235548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058167
4232	NC_013161	ATG	2	6	235560	235565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058167
4233	NC_013161	GCC	2	6	235608	235613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058167
4234	NC_013161	AGG	2	6	235625	235630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058167
4235	NC_013161	GCC	2	6	235641	235646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058167
4236	NC_013161	CCA	2	6	235647	235652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058167
4237	NC_013161	GAG	2	6	235682	235687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058167
4238	NC_013161	TAA	2	6	235730	235735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058167
4239	NC_013161	GAG	2	6	235742	235747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058167
4240	NC_013161	AACA	2	8	235751	235758	75 %	0 %	0 %	25 %	257058167
4241	NC_013161	TCA	2	6	235897	235902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058167
4242	NC_013161	GCGGCC	2	12	235908	235919	0 %	0 %	50 %	50 %	257058167
4243	NC_013161	AAT	2	6	236021	236026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058167
4244	NC_013161	ATA	2	6	236045	236050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058167
4245	NC_013161	G	6	6	236083	236088	0 %	0 %	100 %	0 %	257058167
4246	NC_013161	TTC	2	6	236195	236200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058168
4247	NC_013161	CGT	2	6	236231	236236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058168
4248	NC_013161	ATG	2	6	236276	236281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058168
4249	NC_013161	C	6	6	236365	236370	0 %	0 %	0 %	100 %	257058168
4250	NC_013161	TCG	2	6	236443	236448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058168
4251	NC_013161	TCA	2	6	236476	236481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058168
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4253	NC_013161	CGG	2	6	236605	236610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058168
4254	NC_013161	CAAA	2	8	236633	236640	75 %	0 %	0 %	25 %	257058168
4255	NC_013161	ACT	2	6	236649	236654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058168
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4259	NC_013161	ACC	2	6	236815	236820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058168
4260	NC_013161	TGGCAA	2	12	237013	237024	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257058168
4261	NC_013161	CCAGA	2	10	237029	237038	40 %	0 %	20 %	40 %	257058168
4262	NC_013161	ATG	2	6	237509	237514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058169
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4265	NC_013161	AGG	2	6	237633	237638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058169
4266	NC_013161	AT	3	6	237639	237644	50 %	50 %	0 %	0 %	257058169
4267	NC_013161	TGA	2	6	237645	237650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058169
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4277	NC_013161	GTT	2	6	238040	238045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058169
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4284	NC_013161	G	6	6	238443	238448	0 %	0 %	100 %	0 %	257058170
4285	NC_013161	CGG	2	6	238474	238479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058170
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4292	NC_013161	TGAT	2	8	238639	238646	25 %	50 %	25 %	0 %	257058170
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4302	NC_013161	ATC	2	6	238959	238964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058170
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4314	NC_013161	AAACC	2	10	239563	239572	60 %	0 %	0 %	40 %	257058170
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4319	NC_013161	TCT	2	6	239694	239699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058170
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4344	NC_013161	A	7	7	241482	241488	100 %	0 %	0 %	0 %	257058172
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4354	NC_013161	AATATT	2	12	241886	241897	50 %	50 %	0 %	0 %	257058172
4355	NC_013161	TGC	2	6	241932	241937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058172
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4359	NC_013161	GCA	2	6	242211	242216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058172
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4364	NC_013161	CAA	2	6	242931	242936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058173
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4366	NC_013161	GCG	2	6	243003	243008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058173
4367	NC_013161	CGG	2	6	243079	243084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058173
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4402	NC_013161	ATTGA	2	10	245947	245956	40 %	40 %	20 %	0 %	257058175
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4487	NC_013161	TCA	2	6	250725	250730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058179
4488	NC_013161	CTA	2	6	250861	250866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058179
4489	NC_013161	GGT	2	6	250881	250886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058179
4490	NC_013161	T	7	7	250888	250894	0 %	100 %	0 %	0 %	257058179
4491	NC_013161	GTT	2	6	250900	250905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058179
4492	NC_013161	GGA	2	6	250959	250964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058179
4493	NC_013161	GCA	2	6	251016	251021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058179
4494	NC_013161	AGC	2	6	251027	251032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058179
4495	NC_013161	ATT	2	6	251051	251056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058179
4496	NC_013161	TTGAG	2	10	251079	251088	20 %	40 %	40 %	0 %	257058179
4497	NC_013161	TCA	2	6	251101	251106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058179
4498	NC_013161	AAACAA	2	12	251130	251141	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	257058180
4499	NC_013161	T	8	8	251221	251228	0 %	100 %	0 %	0 %	257058180
4500	NC_013161	TAA	2	6	251254	251259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058180

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