MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 81527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013161	GTC	2	6	135780	135785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058048
2502	NC_013161	TCC	2	6	135853	135858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058048
2503	NC_013161	TAA	2	6	135867	135872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058048
2504	NC_013161	ACT	2	6	135898	135903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058048
2505	NC_013161	AAC	2	6	135907	135912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058048
2506	NC_013161	ATT	2	6	135934	135939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
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2508	NC_013161	TTA	2	6	135977	135982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
2509	NC_013161	TTG	2	6	135997	136002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058048
2510	NC_013161	TAA	2	6	136054	136059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058048
2511	NC_013161	TTGGTA	2	12	136073	136084	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257058048
2512	NC_013161	TCC	2	6	136108	136113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058048
2513	NC_013161	GTC	2	6	136137	136142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058048
2514	NC_013161	ACT	4	12	136249	136260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058048
2515	NC_013161	ATT	2	6	136291	136296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
2516	NC_013161	TTA	2	6	136334	136339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
2517	NC_013161	TTG	2	6	136354	136359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058048
2518	NC_013161	TAA	2	6	136411	136416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058048
2519	NC_013161	TTGGTA	2	12	136430	136441	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257058048
2520	NC_013161	TCC	2	6	136465	136470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058048
2521	NC_013161	GTC	2	6	136494	136499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058048
2522	NC_013161	TAT	2	6	136506	136511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
2523	NC_013161	ACT	2	6	136612	136617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058048
2524	NC_013161	ATT	2	6	136648	136653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
2525	NC_013161	TTG	2	6	136711	136716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058048
2526	NC_013161	TTGGTA	2	12	136787	136798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257058048
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2528	NC_013161	GTC	2	6	136851	136856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058048
2529	NC_013161	TAT	2	6	136863	136868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
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2531	NC_013161	TTA	2	6	137048	137053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
2532	NC_013161	TTG	2	6	137068	137073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058048
2533	NC_013161	TTGGTA	2	12	137144	137155	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257058048
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2535	NC_013161	GTC	2	6	137208	137213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058048
2536	NC_013161	TAT	2	6	137220	137225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
2537	NC_013161	ACT	2	6	137326	137331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058048
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2539	NC_013161	TTA	2	6	137405	137410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
2540	NC_013161	TTG	2	6	137425	137430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058048
2541	NC_013161	TAA	2	6	137482	137487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058048
2542	NC_013161	TTGGTA	2	12	137501	137512	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257058048
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2544	NC_013161	GTC	2	6	137565	137570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058048
2545	NC_013161	TAT	2	6	137577	137582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
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2549	NC_013161	TTGGTA	2	12	137858	137869	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257058048
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2551	NC_013161	GTC	2	6	137922	137927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058048
2552	NC_013161	TAT	2	6	137934	137939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
2553	NC_013161	ACT	2	6	138040	138045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058048
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2555	NC_013161	TTA	2	6	138119	138124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
2556	NC_013161	TTG	2	6	138139	138144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058048
2557	NC_013161	TAA	2	6	138196	138201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058048
2558	NC_013161	TTGGTA	2	12	138215	138226	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257058048
2559	NC_013161	TCC	2	6	138250	138255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058048
2560	NC_013161	TCC	2	6	138283	138288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058048
2561	NC_013161	TAT	2	6	138291	138296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
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2565	NC_013161	TAT	2	6	138531	138536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058048
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2567	NC_013161	TTG	2	6	138587	138592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058048
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2591	NC_013161	CCCT	2	8	139842	139849	0 %	25 %	0 %	75 %	257058048
2592	NC_013161	A	6	6	139891	139896	100 %	0 %	0 %	0 %	257058048
2593	NC_013161	A	6	6	139909	139914	100 %	0 %	0 %	0 %	257058048
2594	NC_013161	GTCT	2	8	140023	140030	0 %	50 %	25 %	25 %	257058048
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2601	NC_013161	AACT	2	8	140849	140856	50 %	25 %	0 %	25 %	257058049
2602	NC_013161	ATC	2	6	140919	140924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058049
2603	NC_013161	TCT	2	6	141058	141063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058049
2604	NC_013161	CAT	2	6	141083	141088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058049
2605	NC_013161	CTAACC	2	12	141095	141106	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	257058049
2606	NC_013161	TAA	2	6	141152	141157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058049
2607	NC_013161	TCT	2	6	141160	141165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058049
2608	NC_013161	TAA	2	6	141367	141372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058049
2609	NC_013161	CAGC	2	8	141382	141389	25 %	0 %	25 %	50 %	257058049
2610	NC_013161	GAT	2	6	141425	141430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058049
2611	NC_013161	GAA	2	6	141443	141448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058049
2612	NC_013161	CAA	2	6	141470	141475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058049
2613	NC_013161	GAA	2	6	141662	141667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058049
2614	NC_013161	TAA	2	6	141784	141789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058049
2615	NC_013161	T	6	6	141800	141805	0 %	100 %	0 %	0 %	257058049
2616	NC_013161	TCA	2	6	141826	141831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058049
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2618	NC_013161	TGG	2	6	141964	141969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058049
2619	NC_013161	A	6	6	142018	142023	100 %	0 %	0 %	0 %	257058049
2620	NC_013161	CAT	2	6	142052	142057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058049
2621	NC_013161	GCCA	2	8	142224	142231	25 %	0 %	25 %	50 %	257058050
2622	NC_013161	GTT	2	6	142297	142302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058050
2623	NC_013161	TGA	2	6	142386	142391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058050
2624	NC_013161	AAT	2	6	142423	142428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058050
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2626	NC_013161	TTC	2	6	142481	142486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058050
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2643	NC_013161	TAA	2	6	143682	143687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058052
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2651	NC_013161	T	7	7	144233	144239	0 %	100 %	0 %	0 %	257058053
2652	NC_013161	TAA	2	6	144256	144261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058053
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2742	NC_013161	TCC	2	6	149415	149420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058060
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2745	NC_013161	GAA	2	6	149519	149524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058060
2746	NC_013161	TCA	2	6	149559	149564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058060
2747	NC_013161	ATGAAC	2	12	149653	149664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	257058060
2748	NC_013161	TCTAA	2	10	149796	149805	40 %	40 %	0 %	20 %	257058060
2749	NC_013161	ATGA	2	8	149874	149881	50 %	25 %	25 %	0 %	257058061
2750	NC_013161	ACAA	2	8	149962	149969	75 %	0 %	0 %	25 %	257058061
2751	NC_013161	AGA	2	6	149972	149977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058061
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2758	NC_013161	TGA	2	6	150591	150596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058062
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2763	NC_013161	TCTT	2	8	150942	150949	0 %	75 %	0 %	25 %	257058063
2764	NC_013161	T	6	6	150959	150964	0 %	100 %	0 %	0 %	257058063
2765	NC_013161	ATT	2	6	151012	151017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058063
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2989	NC_013161	ATC	2	6	164412	164417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058077
2990	NC_013161	GTCC	2	8	164430	164437	0 %	25 %	25 %	50 %	257058077
2991	NC_013161	G	6	6	164508	164513	0 %	0 %	100 %	0 %	257058077
2992	NC_013161	TTC	2	6	164522	164527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058077
2993	NC_013161	GTT	2	6	164533	164538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058077
2994	NC_013161	CTA	2	6	164557	164562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058077
2995	NC_013161	TCT	2	6	164592	164597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058077
2996	NC_013161	ATC	2	6	164651	164656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058077
2997	NC_013161	ATC	2	6	164699	164704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058077
2998	NC_013161	TTCAAC	2	12	164720	164731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058077
2999	NC_013161	CAT	2	6	164816	164821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058077
3000	NC_013161	TGT	2	6	165578	165583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058078

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