MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 81527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013161	CGA	2	6	333434	333439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058250
6002	NC_013161	GAA	2	6	333549	333554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058250
6003	NC_013161	GAGCTA	2	12	333607	333618	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257058250
6004	NC_013161	ACA	2	6	333635	333640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058250
6005	NC_013161	TCA	2	6	333899	333904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058251
6006	NC_013161	AAT	2	6	333961	333966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058251
6007	NC_013161	GTT	2	6	333984	333989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058251
6008	NC_013161	GAA	2	6	334021	334026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058251
6009	NC_013161	TCA	2	6	334068	334073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058251
6010	NC_013161	TCA	2	6	334141	334146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058251
6011	NC_013161	GACT	2	8	334202	334209	25 %	25 %	25 %	25 %	257058251
6012	NC_013161	TG	3	6	334211	334216	0 %	50 %	50 %	0 %	257058251
6013	NC_013161	AAG	2	6	334325	334330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058251
6014	NC_013161	TGG	2	6	334364	334369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058251
6015	NC_013161	CCA	2	6	334418	334423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058252
6016	NC_013161	TTG	2	6	334451	334456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058252
6017	NC_013161	GAT	2	6	334570	334575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058252
6018	NC_013161	GAT	2	6	334684	334689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058252
6019	NC_013161	TCT	2	6	334719	334724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058252
6020	NC_013161	ATAG	2	8	334742	334749	50 %	25 %	25 %	0 %	257058252
6021	NC_013161	GTA	2	6	334982	334987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058253
6022	NC_013161	AGC	2	6	335034	335039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058253
6023	NC_013161	ACC	2	6	335050	335055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058253
6024	NC_013161	GGA	2	6	335074	335079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058253
6025	NC_013161	TCA	2	6	335188	335193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058253
6026	NC_013161	TTG	2	6	335213	335218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058253
6027	NC_013161	GAG	2	6	335219	335224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058253
6028	NC_013161	TGG	2	6	335238	335243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058253
6029	NC_013161	ATG	2	6	335315	335320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058253
6030	NC_013161	ACTT	2	8	335352	335359	25 %	50 %	0 %	25 %	257058253
6031	NC_013161	TTC	2	6	335410	335415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058253
6032	NC_013161	AAGT	2	8	335432	335439	50 %	25 %	25 %	0 %	257058253
6033	NC_013161	TGA	2	6	335442	335447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058253
6034	NC_013161	GAC	2	6	335466	335471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058253
6035	NC_013161	TTG	2	6	335500	335505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058253
6036	NC_013161	ATT	2	6	335508	335513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058253
6037	NC_013161	CAA	2	6	335853	335858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058254
6038	NC_013161	TTA	2	6	336200	336205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058255
6039	NC_013161	ATA	2	6	336273	336278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058255
6040	NC_013161	GCT	2	6	336336	336341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058255
6041	NC_013161	CAT	2	6	336368	336373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058255
6042	NC_013161	CGCTG	2	10	336374	336383	0 %	20 %	40 %	40 %	257058255
6043	NC_013161	AAT	2	6	336453	336458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058255
6044	NC_013161	T	6	6	336725	336730	0 %	100 %	0 %	0 %	257058255
6045	NC_013161	AAAT	2	8	336858	336865	75 %	25 %	0 %	0 %	257058255
6046	NC_013161	ATA	2	6	336891	336896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058255
6047	NC_013161	CGA	2	6	336907	336912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058255
6048	NC_013161	GAG	2	6	336927	336932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058255
6049	NC_013161	TGG	2	6	336955	336960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058255
6050	NC_013161	TGA	2	6	337026	337031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058255
6051	NC_013161	GGC	2	6	337064	337069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058255
6052	NC_013161	TTC	2	6	337109	337114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058255
6053	NC_013161	CTT	2	6	337162	337167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058255
6054	NC_013161	AAT	2	6	337199	337204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058255
6055	NC_013161	GAA	2	6	337258	337263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058255
6056	NC_013161	TGG	2	6	337288	337293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058255
6057	NC_013161	CCG	2	6	337433	337438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058256
6058	NC_013161	GTT	2	6	337452	337457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058256
6059	NC_013161	TCT	2	6	337532	337537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058256
6060	NC_013161	GAT	2	6	337713	337718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058257
6061	NC_013161	GA	3	6	337745	337750	50 %	0 %	50 %	0 %	257058257
6062	NC_013161	TAA	2	6	337788	337793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058257
6063	NC_013161	ACAAA	2	10	338076	338085	80 %	0 %	0 %	20 %	257058258
6064	NC_013161	ATT	2	6	338199	338204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058258
6065	NC_013161	TTA	2	6	338301	338306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058258
6066	NC_013161	AATT	2	8	338435	338442	50 %	50 %	0 %	0 %	257058258
6067	NC_013161	TAA	2	6	338472	338477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058258
6068	NC_013161	CTG	2	6	338654	338659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058259
6069	NC_013161	ACA	2	6	338797	338802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058259
6070	NC_013161	ACA	2	6	339066	339071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058260
6071	NC_013161	GT	3	6	339075	339080	0 %	50 %	50 %	0 %	257058260
6072	NC_013161	TGGT	2	8	339147	339154	0 %	50 %	50 %	0 %	257058260
6073	NC_013161	TTG	2	6	339158	339163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058260
6074	NC_013161	ACAATT	2	12	339174	339185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	257058260
6075	NC_013161	A	6	6	339188	339193	100 %	0 %	0 %	0 %	257058260
6076	NC_013161	CAA	2	6	339214	339219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058260
6077	NC_013161	TGG	2	6	339313	339318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058260
6078	NC_013161	CGA	2	6	339372	339377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058260
6079	NC_013161	TAA	2	6	339470	339475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058261
6080	NC_013161	GTT	2	6	339495	339500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058261
6081	NC_013161	G	6	6	339556	339561	0 %	0 %	100 %	0 %	257058261
6082	NC_013161	TAA	2	6	339593	339598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058261
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6085	NC_013161	GAT	2	6	339727	339732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058261
6086	NC_013161	A	6	6	339800	339805	100 %	0 %	0 %	0 %	257058261
6087	NC_013161	TCT	2	6	339837	339842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058261
6088	NC_013161	G	6	6	339847	339852	0 %	0 %	100 %	0 %	257058261
6089	NC_013161	CGC	2	6	339922	339927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058261
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6091	NC_013161	AAT	2	6	340304	340309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058262
6092	NC_013161	GCA	2	6	340335	340340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058262
6093	NC_013161	TGA	2	6	340380	340385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058262
6094	NC_013161	GAG	2	6	340412	340417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058262
6095	NC_013161	TGT	2	6	340463	340468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058262
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6100	NC_013161	GGA	2	6	340725	340730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058262
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6102	NC_013161	AAT	2	6	340886	340891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058262
6103	NC_013161	T	7	7	340895	340901	0 %	100 %	0 %	0 %	257058262
6104	NC_013161	CAA	2	6	340927	340932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058262
6105	NC_013161	TCC	2	6	340973	340978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058262
6106	NC_013161	CAC	2	6	340985	340990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058262
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6108	NC_013161	GTT	2	6	341099	341104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058262
6109	NC_013161	ACG	2	6	341291	341296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058263
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6112	NC_013161	T	6	6	341411	341416	0 %	100 %	0 %	0 %	257058263
6113	NC_013161	TA	3	6	341428	341433	50 %	50 %	0 %	0 %	257058263
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6119	NC_013161	AAT	2	6	341602	341607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058263
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6121	NC_013161	ATA	2	6	341666	341671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058263
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6124	NC_013161	GGTA	2	8	341726	341733	25 %	25 %	50 %	0 %	257058263
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6232	NC_013161	A	6	6	347747	347752	100 %	0 %	0 %	0 %	257058270
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6241	NC_013161	CAT	2	6	348304	348309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058270
6242	NC_013161	GAC	2	6	348319	348324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058270
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6490	NC_013161	AAC	2	6	361542	361547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058279
6491	NC_013161	TTG	2	6	361617	361622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058279
6492	NC_013161	TAA	2	6	361646	361651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058279
6493	NC_013161	TC	3	6	361655	361660	0 %	50 %	0 %	50 %	257058279
6494	NC_013161	C	6	6	361686	361691	0 %	0 %	0 %	100 %	257058279
6495	NC_013161	ATC	2	6	361749	361754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058279
6496	NC_013161	ATA	2	6	361816	361821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058279
6497	NC_013161	GTTA	2	8	361990	361997	25 %	50 %	25 %	0 %	257058280
6498	NC_013161	CAC	2	6	362064	362069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058280
6499	NC_013161	CTG	2	6	362076	362081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058280
6500	NC_013161	CGT	2	6	362153	362158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058280

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