MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 81527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013161	AAG	2	6	303237	303242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058219
5502	NC_013161	TGC	2	6	303403	303408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058220
5503	NC_013161	ACC	2	6	303419	303424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058220
5504	NC_013161	A	7	7	303433	303439	100 %	0 %	0 %	0 %	257058220
5505	NC_013161	TGA	2	6	303452	303457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058220
5506	NC_013161	C	6	6	303528	303533	0 %	0 %	0 %	100 %	257058220
5507	NC_013161	CTAT	2	8	303556	303563	25 %	50 %	0 %	25 %	257058220
5508	NC_013161	GTC	2	6	303571	303576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058220
5509	NC_013161	GAT	2	6	303681	303686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058220
5510	NC_013161	GGAT	2	8	303766	303773	25 %	25 %	50 %	0 %	257058220
5511	NC_013161	GATGGA	2	12	303873	303884	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257058220
5512	NC_013161	GAA	2	6	303927	303932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058220
5513	NC_013161	CCAA	2	8	303955	303962	50 %	0 %	0 %	50 %	257058220
5514	NC_013161	CGGA	2	8	304004	304011	25 %	0 %	50 %	25 %	257058220
5515	NC_013161	AGA	2	6	304025	304030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058220
5516	NC_013161	AAG	2	6	304054	304059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058220
5517	NC_013161	TGA	2	6	304079	304084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058220
5518	NC_013161	TAT	2	6	304131	304136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058220
5519	NC_013161	AAT	2	6	304239	304244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058220
5520	NC_013161	ATG	2	6	304246	304251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058220
5521	NC_013161	A	6	6	304257	304262	100 %	0 %	0 %	0 %	257058220
5522	NC_013161	CAACC	2	10	304498	304507	40 %	0 %	0 %	60 %	257058221
5523	NC_013161	T	8	8	304518	304525	0 %	100 %	0 %	0 %	257058221
5524	NC_013161	CTT	2	6	304604	304609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058221
5525	NC_013161	CTC	2	6	304610	304615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058221
5526	NC_013161	T	6	6	304659	304664	0 %	100 %	0 %	0 %	257058221
5527	NC_013161	CTT	2	6	304700	304705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058221
5528	NC_013161	TAA	2	6	304752	304757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058222
5529	NC_013161	TCG	2	6	304813	304818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058222
5530	NC_013161	GATA	2	8	304961	304968	50 %	25 %	25 %	0 %	257058222
5531	NC_013161	TTTGT	2	10	304985	304994	0 %	80 %	20 %	0 %	257058222
5532	NC_013161	TAA	2	6	304999	305004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058222
5533	NC_013161	AGTT	2	8	305011	305018	25 %	50 %	25 %	0 %	257058222
5534	NC_013161	ATT	3	9	306235	306243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058223
5535	NC_013161	TTG	2	6	306254	306259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058223
5536	NC_013161	TTTC	2	8	306283	306290	0 %	75 %	0 %	25 %	257058223
5537	NC_013161	GTT	2	6	306373	306378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058223
5538	NC_013161	CTT	2	6	306400	306405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058223
5539	NC_013161	GATA	2	8	306505	306512	50 %	25 %	25 %	0 %	257058223
5540	NC_013161	TGCT	2	8	306536	306543	0 %	50 %	25 %	25 %	257058223
5541	NC_013161	CTT	2	6	306592	306597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058223
5542	NC_013161	TTC	2	6	306626	306631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058223
5543	NC_013161	ACT	2	6	306656	306661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058223
5544	NC_013161	T	8	8	306692	306699	0 %	100 %	0 %	0 %	257058223
5545	NC_013161	GTT	2	6	306700	306705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058223
5546	NC_013161	TTTC	2	8	306726	306733	0 %	75 %	0 %	25 %	257058223
5547	NC_013161	TTC	3	9	306755	306763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058223
5548	NC_013161	GTT	2	6	306769	306774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058223
5549	NC_013161	TCTT	2	8	306797	306804	0 %	75 %	0 %	25 %	257058223
5550	NC_013161	TGA	2	6	306816	306821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058223
5551	NC_013161	T	7	7	306879	306885	0 %	100 %	0 %	0 %	257058223
5552	NC_013161	TTGA	2	8	306887	306894	25 %	50 %	25 %	0 %	257058223
5553	NC_013161	TTC	2	6	306896	306901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058223
5554	NC_013161	ATC	2	6	306953	306958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058223
5555	NC_013161	TTC	2	6	307001	307006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058223
5556	NC_013161	TCT	2	6	307026	307031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058223
5557	NC_013161	AAT	2	6	307115	307120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058223
5558	NC_013161	AAT	2	6	307124	307129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058223
5559	NC_013161	TTA	2	6	307131	307136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058223
5560	NC_013161	GAG	2	6	307201	307206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058223
5561	NC_013161	TTC	2	6	307280	307285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058223
5562	NC_013161	AGTTA	2	10	307370	307379	40 %	40 %	20 %	0 %	257058224
5563	NC_013161	TTA	2	6	307460	307465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058224
5564	NC_013161	ATT	2	6	307482	307487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058224
5565	NC_013161	GCT	2	6	307498	307503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058224
5566	NC_013161	TTAA	2	8	307537	307544	50 %	50 %	0 %	0 %	257058224
5567	NC_013161	TCT	2	6	307664	307669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058224
5568	NC_013161	TTG	2	6	307692	307697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058224
5569	NC_013161	CTTTTT	2	12	307727	307738	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	257058224
5570	NC_013161	TC	3	6	307757	307762	0 %	50 %	0 %	50 %	257058224
5571	NC_013161	TTG	2	6	307767	307772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058224
5572	NC_013161	TTC	2	6	307782	307787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058224
5573	NC_013161	CTT	2	6	307844	307849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058224
5574	NC_013161	T	7	7	307856	307862	0 %	100 %	0 %	0 %	257058224
5575	NC_013161	TAAT	2	8	307865	307872	50 %	50 %	0 %	0 %	257058224
5576	NC_013161	TCT	2	6	307879	307884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058224
5577	NC_013161	TTC	2	6	307902	307907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058224
5578	NC_013161	T	6	6	307934	307939	0 %	100 %	0 %	0 %	257058224
5579	NC_013161	TGC	2	6	307966	307971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058224
5580	NC_013161	TGT	2	6	307978	307983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058224
5581	NC_013161	CTA	2	6	308039	308044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058224
5582	NC_013161	T	6	6	308076	308081	0 %	100 %	0 %	0 %	257058224
5583	NC_013161	TTC	2	6	308103	308108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058224
5584	NC_013161	TGT	2	6	308124	308129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058224
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5586	NC_013161	CTT	2	6	308264	308269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058224
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5588	NC_013161	ATAG	2	8	308873	308880	50 %	25 %	25 %	0 %	257058227
5589	NC_013161	ATT	2	6	308930	308935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058227
5590	NC_013161	ATAG	2	8	308996	309003	50 %	25 %	25 %	0 %	257058228
5591	NC_013161	CAT	2	6	309052	309057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058228
5592	NC_013161	ATAG	2	8	309119	309126	50 %	25 %	25 %	0 %	257058229
5593	NC_013161	CAT	2	6	309175	309180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058229
5594	NC_013161	ATAG	2	8	309242	309249	50 %	25 %	25 %	0 %	257058230
5595	NC_013161	TCT	2	6	309288	309293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058230
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5597	NC_013161	TATC	2	8	309547	309554	25 %	50 %	0 %	25 %	257058231
5598	NC_013161	TTG	2	6	309559	309564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058231
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5601	NC_013161	CAATC	2	10	309720	309729	40 %	20 %	0 %	40 %	257058231
5602	NC_013161	TCT	2	6	309797	309802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058231
5603	NC_013161	GTG	2	6	309803	309808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058231
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5605	NC_013161	CAAA	2	8	309885	309892	75 %	0 %	0 %	25 %	257058231
5606	NC_013161	ATA	2	6	309904	309909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058231
5607	NC_013161	AGC	2	6	309943	309948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058231
5608	NC_013161	TA	3	6	309961	309966	50 %	50 %	0 %	0 %	257058231
5609	NC_013161	GTTG	2	8	309986	309993	0 %	50 %	50 %	0 %	257058231
5610	NC_013161	ACA	2	6	310021	310026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058231
5611	NC_013161	TAA	2	6	310032	310037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058231
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5613	NC_013161	AGCAGT	2	12	310069	310080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257058231
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5617	NC_013161	ATA	2	6	310165	310170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058231
5618	NC_013161	CTT	2	6	310200	310205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058231
5619	NC_013161	TCT	2	6	310322	310327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058231
5620	NC_013161	TTGA	2	8	310342	310349	25 %	50 %	25 %	0 %	257058231
5621	NC_013161	T	7	7	310361	310367	0 %	100 %	0 %	0 %	257058231
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5623	NC_013161	TCC	2	6	310453	310458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058231
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5990	NC_013161	CCCTCG	2	12	332885	332896	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	257058249
5991	NC_013161	GCT	2	6	333051	333056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058250
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5993	NC_013161	ATC	2	6	333184	333189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058250
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5998	NC_013161	TC	3	6	333363	333368	0 %	50 %	0 %	50 %	257058250
5999	NC_013161	C	6	6	333373	333378	0 %	0 %	0 %	100 %	257058250
6000	NC_013161	TGA	2	6	333386	333391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058250

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