MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	GAA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818683
2	NC_013160	GAA	2	6	159	164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818683
3	NC_013160	CGT	2	6	212	217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818683
4	NC_013160	TAT	2	6	245	250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818683
5	NC_013160	TAT	2	6	288	293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818683
6	NC_013160	TTG	2	6	401	406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818684
7	NC_013160	TGA	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818684
8	NC_013160	ACC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818685
9	NC_013160	CCA	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818685
10	NC_013160	TCG	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818685
11	NC_013160	ATA	2	6	1308	1313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818685
12	NC_013160	TAC	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818686
13	NC_013160	GTT	2	6	1503	1508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818686
14	NC_013160	GCA	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818686
15	NC_013160	ACA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818686
16	NC_013160	CAT	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818686
17	NC_013160	TCG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818686
18	NC_013160	TGC	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818686
19	NC_013160	ACT	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818687
20	NC_013160	AAC	2	6	2073	2078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818687
21	NC_013160	TAA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818687
22	NC_013160	GAC	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818687
23	NC_013160	GGT	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818687
24	NC_013160	TCA	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818687
25	NC_013160	AGC	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818687
26	NC_013160	TGG	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818688
27	NC_013160	CCA	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818688
28	NC_013160	GTT	2	6	3322	3327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818688
29	NC_013160	GAC	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818688
30	NC_013160	AAT	2	6	3739	3744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818688
31	NC_013160	TCA	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818688
32	NC_013160	ATT	2	6	4043	4048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818688
33	NC_013160	GTC	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818688
34	NC_013160	CTT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818688
35	NC_013160	CTG	2	6	4302	4307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818689
36	NC_013160	TGT	2	6	4322	4327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818689
37	NC_013160	AAT	2	6	4437	4442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818689
38	NC_013160	AGC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818689
39	NC_013160	CAA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818689
40	NC_013160	AAC	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818689
41	NC_013160	GCG	2	6	4658	4663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818689
42	NC_013160	GCT	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818689
43	NC_013160	CTT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818689
44	NC_013160	CTT	2	6	6373	6378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
45	NC_013160	ACC	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818690
46	NC_013160	TCA	2	6	6462	6467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818690
47	NC_013160	ATC	2	6	6570	6575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818690
48	NC_013160	CTT	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
49	NC_013160	CTT	2	6	6685	6690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
50	NC_013160	CCT	2	6	6726	6731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818691
51	NC_013160	CAT	2	6	6811	6816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818691
52	NC_013160	TTC	2	6	6940	6945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818691
53	NC_013160	GTT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818691
54	NC_013160	AAT	2	6	7037	7042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818691
55	NC_013160	CAG	2	6	7059	7064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818691
56	NC_013160	TGG	3	9	7186	7194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818691
57	NC_013160	AGC	2	6	7300	7305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818691
58	NC_013160	TTC	2	6	7360	7365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818691
59	NC_013160	AAG	2	6	7429	7434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818691
60	NC_013160	TAT	2	6	8938	8943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818692
61	NC_013160	AAC	2	6	9040	9045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818692
62	NC_013160	CAA	2	6	9078	9083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818692
63	NC_013160	GAT	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818692
64	NC_013160	TTC	2	6	9112	9117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
65	NC_013160	CTT	2	6	9142	9147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
66	NC_013160	TTG	2	6	9211	9216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818692
67	NC_013160	GAC	2	6	9240	9245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818692
68	NC_013160	TAC	2	6	9283	9288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818692
69	NC_013160	TGC	2	6	9347	9352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818692
70	NC_013160	AAT	2	6	9360	9365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818692
71	NC_013160	TCT	4	12	9461	9472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
72	NC_013160	AGC	2	6	9578	9583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818692
73	NC_013160	TAT	2	6	9603	9608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818692
74	NC_013160	TTC	3	9	9640	9648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
75	NC_013160	TTG	2	6	9763	9768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818692
76	NC_013160	TAA	2	6	9781	9786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818692
77	NC_013160	TTA	2	6	9963	9968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818693
78	NC_013160	TTG	2	6	10031	10036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818693
79	NC_013160	TAA	2	6	10126	10131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818693
80	NC_013160	TTC	2	6	10178	10183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818693
81	NC_013160	CTT	2	6	10204	10209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818693
82	NC_013160	ATT	2	6	10253	10258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818693
83	NC_013160	GCT	2	6	10312	10317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818693
84	NC_013160	AGT	2	6	11099	11104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818694
85	NC_013160	AGA	2	6	11240	11245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
86	NC_013160	AGA	2	6	11250	11255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
87	NC_013160	GAG	3	9	11260	11268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818694
88	NC_013160	GAA	2	6	11332	11337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
89	NC_013160	GAA	2	6	11340	11345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
90	NC_013160	AGA	2	6	11357	11362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
91	NC_013160	GAA	3	9	11388	11396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
92	NC_013160	AAG	2	6	11414	11419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
93	NC_013160	AGA	2	6	11445	11450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
94	NC_013160	GAA	2	6	11542	11547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
95	NC_013160	AAG	2	6	11576	11581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
96	NC_013160	AGG	2	6	11642	11647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818694
97	NC_013160	TTG	2	6	11669	11674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818694
98	NC_013160	GAA	2	6	11680	11685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
99	NC_013160	TGA	2	6	11691	11696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818694
100	NC_013160	ATC	2	6	11723	11728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818694
101	NC_013160	TGT	3	9	11799	11807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818694
102	NC_013160	TAC	2	6	11983	11988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818694
103	NC_013160	ATC	2	6	12083	12088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818694
104	NC_013160	TTG	2	6	12242	12247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818694
105	NC_013160	AAC	2	6	12248	12253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818694
106	NC_013160	TCA	2	6	12297	12302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818694
107	NC_013160	ATC	9	27	12305	12331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818694
108	NC_013160	TAT	2	6	12346	12351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818694
109	NC_013160	TTG	2	6	12365	12370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818694
110	NC_013160	GAG	2	6	12388	12393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818694
111	NC_013160	AAG	2	6	12394	12399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
112	NC_013160	GTT	2	6	12421	12426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818694
113	NC_013160	GTT	2	6	12454	12459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818694
114	NC_013160	CTT	2	6	12463	12468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818694
115	NC_013160	AGC	2	6	12551	12556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818694
116	NC_013160	TGA	2	6	12730	12735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818695
117	NC_013160	TCA	2	6	12763	12768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818695
118	NC_013160	TCT	2	6	12772	12777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818695
119	NC_013160	CAA	2	6	12785	12790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818695
120	NC_013160	TCC	2	6	12811	12816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818695
121	NC_013160	CTT	2	6	12879	12884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818695
122	NC_013160	CTT	2	6	12912	12917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818695
123	NC_013160	CTT	2	6	13041	13046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818695
124	NC_013160	TTC	3	9	13064	13072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818695
125	NC_013160	TTC	2	6	13097	13102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818695
126	NC_013160	CTT	2	6	13114	13119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818695
127	NC_013160	CTT	2	6	13122	13127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818695
128	NC_013160	TCC	2	6	13193	13198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818695
129	NC_013160	CTT	2	6	13213	13218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818695
130	NC_013160	ACT	2	6	13356	13361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818695
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134	NC_013160	GTT	2	6	14171	14176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818696
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141	NC_013160	ACC	2	6	14786	14791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818696
142	NC_013160	TGA	2	6	14958	14963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818696
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255	NC_013160	TCT	2	6	23757	23762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818700
256	NC_013160	GTT	2	6	23776	23781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818700
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258	NC_013160	ACG	2	6	23876	23881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818700
259	NC_013160	TAT	2	6	23939	23944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818700
260	NC_013160	GCT	2	6	23967	23972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818700
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283	NC_013160	CTT	2	6	27086	27091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818702
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