MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 1181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013160	CGG	2	6	62149	62154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818732
1002	NC_013160	GAG	2	6	62219	62224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818732
1003	NC_013160	C	6	6	62269	62274	0 %	0 %	0 %	100 %	256818732
1004	NC_013160	GCG	2	6	62280	62285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818732
1005	NC_013160	G	7	7	62321	62327	0 %	0 %	100 %	0 %	256818732
1006	NC_013160	TC	3	6	62339	62344	0 %	50 %	0 %	50 %	256818732
1007	NC_013160	CTG	2	6	62384	62389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818732
1008	NC_013160	CCTGAC	2	12	62566	62577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256818732
1009	NC_013160	A	6	6	62591	62596	100 %	0 %	0 %	0 %	256818732
1010	NC_013160	GAT	2	6	62608	62613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818732
1011	NC_013160	CAT	2	6	62662	62667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818732
1012	NC_013160	AGC	2	6	62673	62678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818732
1013	NC_013160	TCT	2	6	62813	62818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818733
1014	NC_013160	G	6	6	62823	62828	0 %	0 %	100 %	0 %	256818733
1015	NC_013160	TAG	2	6	62854	62859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818733
1016	NC_013160	CT	3	6	62868	62873	0 %	50 %	0 %	50 %	256818733
1017	NC_013160	GAC	2	6	62916	62921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818733
1018	NC_013160	TCC	3	9	62948	62956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818733
1019	NC_013160	AAGG	2	8	62998	63005	50 %	0 %	50 %	0 %	256818733
1020	NC_013160	CAC	2	6	63109	63114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818733
1021	NC_013160	CAC	2	6	63163	63168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818733
1022	NC_013160	CCT	2	6	63243	63248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818733
1023	NC_013160	C	6	6	63281	63286	0 %	0 %	0 %	100 %	256818733
1024	NC_013160	GA	3	6	63338	63343	50 %	0 %	50 %	0 %	256818733
1025	NC_013160	TGC	2	6	63521	63526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818733
1026	NC_013160	TGC	2	6	63915	63920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818734
1027	NC_013160	GAG	2	6	63974	63979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818734
1028	NC_013160	CGG	2	6	64027	64032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818734
1029	NC_013160	GGGA	2	8	64102	64109	25 %	0 %	75 %	0 %	256818734
1030	NC_013160	G	6	6	64155	64160	0 %	0 %	100 %	0 %	256818734
1031	NC_013160	GGAT	2	8	64207	64214	25 %	25 %	50 %	0 %	256818734
1032	NC_013160	GGT	2	6	64238	64243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818734
1033	NC_013160	GCGA	2	8	64244	64251	25 %	0 %	50 %	25 %	256818734
1034	NC_013160	AGC	2	6	64304	64309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818734
1035	NC_013160	ACC	2	6	64353	64358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818734
1036	NC_013160	TGC	2	6	64363	64368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818734
1037	NC_013160	GTC	2	6	64511	64516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818734
1038	NC_013160	TAA	2	6	64529	64534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818734
1039	NC_013160	G	6	6	64595	64600	0 %	0 %	100 %	0 %	256818734
1040	NC_013160	GAG	2	6	64643	64648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818734
1041	NC_013160	TTG	2	6	64697	64702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818734
1042	NC_013160	GGC	2	6	64835	64840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818734
1043	NC_013160	GAA	2	6	64877	64882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818734
1044	NC_013160	GA	3	6	64884	64889	50 %	0 %	50 %	0 %	256818734
1045	NC_013160	TGGGTT	2	12	64912	64923	0 %	50 %	50 %	0 %	256818734
1046	NC_013160	AGG	2	6	64957	64962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818734
1047	NC_013160	G	7	7	64961	64967	0 %	0 %	100 %	0 %	256818734
1048	NC_013160	CA	3	6	64990	64995	50 %	0 %	0 %	50 %	256818734
1049	NC_013160	TTA	2	6	65158	65163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818735
1050	NC_013160	T	6	6	65182	65187	0 %	100 %	0 %	0 %	256818735
1051	NC_013160	GAG	2	6	65242	65247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818735
1052	NC_013160	TGT	2	6	65366	65371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818735
1053	NC_013160	ACA	2	6	65408	65413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818735
1054	NC_013160	G	6	6	65416	65421	0 %	0 %	100 %	0 %	256818735
1055	NC_013160	TG	3	6	65454	65459	0 %	50 %	50 %	0 %	256818735
1056	NC_013160	TAC	2	6	65469	65474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818735
1057	NC_013160	ACAA	2	8	65539	65546	75 %	0 %	0 %	25 %	256818735
1058	NC_013160	AAG	2	6	65589	65594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818735
1059	NC_013160	AAG	2	6	65600	65605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818735
1060	NC_013160	CCA	2	6	65627	65632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818735
1061	NC_013160	TCA	2	6	65822	65827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818735
1062	NC_013160	CAG	2	6	65862	65867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818735
1063	NC_013160	CAG	2	6	65916	65921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818735
1064	NC_013160	GTC	2	6	65927	65932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818735
1065	NC_013160	T	7	7	65937	65943	0 %	100 %	0 %	0 %	256818735
1066	NC_013160	TCAT	2	8	65954	65961	25 %	50 %	0 %	25 %	256818735
1067	NC_013160	ACA	2	6	66282	66287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818736
1068	NC_013160	ACT	2	6	66380	66385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818736
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1070	NC_013160	T	6	6	66957	66962	0 %	100 %	0 %	0 %	256818737
1071	NC_013160	T	6	6	66980	66985	0 %	100 %	0 %	0 %	256818737
1072	NC_013160	T	6	6	66992	66997	0 %	100 %	0 %	0 %	256818737
1073	NC_013160	TCAA	2	8	67059	67066	50 %	25 %	0 %	25 %	256818737
1074	NC_013160	GTTG	2	8	67113	67120	0 %	50 %	50 %	0 %	256818737
1075	NC_013160	TCT	2	6	67146	67151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818737
1076	NC_013160	ATA	2	6	67185	67190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818737
1077	NC_013160	TTC	3	9	67334	67342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818737
1078	NC_013160	T	7	7	67388	67394	0 %	100 %	0 %	0 %	256818737
1079	NC_013160	AAATGA	2	12	67446	67457	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256818737
1080	NC_013160	CTA	2	6	67474	67479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818737
1081	NC_013160	TCA	2	6	67494	67499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818737
1082	NC_013160	AAT	2	6	67505	67510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818737
1083	NC_013160	CGAATA	2	12	67626	67637	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256818737
1084	NC_013160	CTG	2	6	67657	67662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818737
1085	NC_013160	AAG	2	6	67675	67680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818737
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1087	NC_013160	TC	3	6	67790	67795	0 %	50 %	0 %	50 %	256818737
1088	NC_013160	TTA	2	6	68020	68025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818737
1089	NC_013160	ATC	2	6	68048	68053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818737
1090	NC_013160	TCC	2	6	68080	68085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818737
1091	NC_013160	CT	3	6	68201	68206	0 %	50 %	0 %	50 %	256818737
1092	NC_013160	TGAT	2	8	68228	68235	25 %	50 %	25 %	0 %	256818737
1093	NC_013160	GT	3	6	69734	69739	0 %	50 %	50 %	0 %	256818738
1094	NC_013160	AAAC	2	8	69774	69781	75 %	0 %	0 %	25 %	256818738
1095	NC_013160	GAA	2	6	69905	69910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818738
1096	NC_013160	GGGAAA	2	12	69912	69923	50 %	0 %	50 %	0 %	256818738
1097	NC_013160	AAG	2	6	69924	69929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818738
1098	NC_013160	GAA	2	6	69931	69936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818738
1099	NC_013160	GCT	2	6	69976	69981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818738
1100	NC_013160	CA	3	6	70193	70198	50 %	0 %	0 %	50 %	256818738
1101	NC_013160	TA	3	6	70236	70241	50 %	50 %	0 %	0 %	256818738
1102	NC_013160	TGACC	2	10	70258	70267	20 %	20 %	20 %	40 %	256818738
1103	NC_013160	ACC	2	6	70323	70328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818738
1104	NC_013160	TTA	2	6	70357	70362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818738
1105	NC_013160	CGG	2	6	70585	70590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818738
1106	NC_013160	CAG	2	6	70600	70605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818738
1107	NC_013160	AAG	2	6	70608	70613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818738
1108	NC_013160	CTA	2	6	70632	70637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818738
1109	NC_013160	GTTC	2	8	70669	70676	0 %	50 %	25 %	25 %	256818738
1110	NC_013160	AAT	2	6	70718	70723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818738
1111	NC_013160	TTC	2	6	70743	70748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818738
1112	NC_013160	TGA	2	6	70804	70809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818738
1113	NC_013160	GGA	2	6	70849	70854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818738
1114	NC_013160	CAAG	2	8	70870	70877	50 %	0 %	25 %	25 %	256818738
1115	NC_013160	A	6	6	70890	70895	100 %	0 %	0 %	0 %	256818738
1116	NC_013160	AAG	2	6	70919	70924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818738
1117	NC_013160	TATT	2	8	70987	70994	25 %	75 %	0 %	0 %	256818738
1118	NC_013160	TCA	2	6	70995	71000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818738
1119	NC_013160	AAC	2	6	71023	71028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818738
1120	NC_013160	A	6	6	71047	71052	100 %	0 %	0 %	0 %	256818738
1121	NC_013160	AGC	2	6	71188	71193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818738
1122	NC_013160	GAG	2	6	71234	71239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818738
1123	NC_013160	GTT	2	6	71261	71266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818738
1124	NC_013160	GTT	2	6	71360	71365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818738
1125	NC_013160	CCA	2	6	71421	71426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818738
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1127	NC_013160	TCC	2	6	71598	71603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818738
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1132	NC_013160	CCT	2	6	71796	71801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818738
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