MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 1181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013160	ATA	2	6	31364	31369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818706
502	NC_013160	TCAC	2	8	31419	31426	25 %	25 %	0 %	50 %	256818706
503	NC_013160	AAT	2	6	31449	31454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818706
504	NC_013160	TTC	2	6	31553	31558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818706
505	NC_013160	TTGA	2	8	31592	31599	25 %	50 %	25 %	0 %	256818706
506	NC_013160	CGA	2	6	31614	31619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818706
507	NC_013160	TGA	2	6	31621	31626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818706
508	NC_013160	GCCA	2	8	31648	31655	25 %	0 %	25 %	50 %	256818706
509	NC_013160	TAGA	2	8	31682	31689	50 %	25 %	25 %	0 %	256818706
510	NC_013160	CAG	2	6	31726	31731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818706
511	NC_013160	TTTAT	2	10	31811	31820	20 %	80 %	0 %	0 %	256818707
512	NC_013160	GA	3	6	31837	31842	50 %	0 %	50 %	0 %	256818707
513	NC_013160	GTT	2	6	31941	31946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818707
514	NC_013160	ATA	2	6	31978	31983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818707
515	NC_013160	TTAA	2	8	32018	32025	50 %	50 %	0 %	0 %	256818707
516	NC_013160	TAA	2	6	32032	32037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818707
517	NC_013160	TCT	4	12	32075	32086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818707
518	NC_013160	AAT	2	6	32092	32097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818707
519	NC_013160	TCCTG	2	10	32156	32165	0 %	40 %	20 %	40 %	256818707
520	NC_013160	ACAG	2	8	32180	32187	50 %	0 %	25 %	25 %	256818707
521	NC_013160	GCT	2	6	32213	32218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818707
522	NC_013160	T	7	7	32238	32244	0 %	100 %	0 %	0 %	256818707
523	NC_013160	CCAGG	2	10	32386	32395	20 %	0 %	40 %	40 %	256818707
524	NC_013160	T	6	6	32452	32457	0 %	100 %	0 %	0 %	256818707
525	NC_013160	CGT	2	6	32507	32512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818707
526	NC_013160	TAA	2	6	32529	32534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818707
527	NC_013160	GA	3	6	32644	32649	50 %	0 %	50 %	0 %	256818707
528	NC_013160	CTG	2	6	32654	32659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818707
529	NC_013160	GGTCAT	2	12	32665	32676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256818707
530	NC_013160	T	7	7	32676	32682	0 %	100 %	0 %	0 %	256818707
531	NC_013160	T	6	6	32742	32747	0 %	100 %	0 %	0 %	256818707
532	NC_013160	AG	3	6	32772	32777	50 %	0 %	50 %	0 %	256818707
533	NC_013160	GACA	2	8	32816	32823	50 %	0 %	25 %	25 %	256818707
534	NC_013160	TGC	2	6	32825	32830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818707
535	NC_013160	A	6	6	32891	32896	100 %	0 %	0 %	0 %	256818707
536	NC_013160	A	6	6	32901	32906	100 %	0 %	0 %	0 %	256818707
537	NC_013160	A	7	7	33009	33015	100 %	0 %	0 %	0 %	256818708
538	NC_013160	TCAA	2	8	33071	33078	50 %	25 %	0 %	25 %	256818708
539	NC_013160	TTCGG	2	10	33079	33088	0 %	40 %	40 %	20 %	256818708
540	NC_013160	GGT	2	6	33112	33117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818708
541	NC_013160	ATA	2	6	33122	33127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818708
542	NC_013160	C	6	6	33196	33201	0 %	0 %	0 %	100 %	256818708
543	NC_013160	GTT	2	6	33259	33264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818708
544	NC_013160	TGT	2	6	33284	33289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818708
545	NC_013160	G	6	6	33349	33354	0 %	0 %	100 %	0 %	256818708
546	NC_013160	GAT	2	6	33403	33408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818708
547	NC_013160	ACTGT	2	10	33433	33442	20 %	40 %	20 %	20 %	256818708
548	NC_013160	G	7	7	33461	33467	0 %	0 %	100 %	0 %	256818708
549	NC_013160	G	7	7	33477	33483	0 %	0 %	100 %	0 %	256818708
550	NC_013160	G	6	6	33486	33491	0 %	0 %	100 %	0 %	256818708
551	NC_013160	G	6	6	33494	33499	0 %	0 %	100 %	0 %	256818708
552	NC_013160	GGAG	2	8	33502	33509	25 %	0 %	75 %	0 %	256818708
553	NC_013160	TCT	2	6	33516	33521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818708
554	NC_013160	TCT	2	6	33524	33529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818708
555	NC_013160	GTT	2	6	33620	33625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818708
556	NC_013160	TCT	2	6	33626	33631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818708
557	NC_013160	CAA	2	6	33643	33648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818708
558	NC_013160	GTAGC	2	10	33765	33774	20 %	20 %	40 %	20 %	256818708
559	NC_013160	AGA	2	6	33775	33780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818708
560	NC_013160	AGG	2	6	33799	33804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818708
561	NC_013160	GTT	2	6	33897	33902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818708
562	NC_013160	T	7	7	33908	33914	0 %	100 %	0 %	0 %	256818708
563	NC_013160	GGC	2	6	33961	33966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818708
564	NC_013160	GAG	2	6	33979	33984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818708
565	NC_013160	CAAA	2	8	33993	34000	75 %	0 %	0 %	25 %	256818708
566	NC_013160	TAA	2	6	34030	34035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818708
567	NC_013160	TTC	2	6	34066	34071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818708
568	NC_013160	ATG	2	6	34112	34117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818708
569	NC_013160	TTG	2	6	34120	34125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818708
570	NC_013160	CTT	2	6	34341	34346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818708
571	NC_013160	CG	3	6	34464	34469	0 %	0 %	50 %	50 %	256818708
572	NC_013160	GTTG	2	8	34587	34594	0 %	50 %	50 %	0 %	256818708
573	NC_013160	GTT	2	6	34605	34610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818708
574	NC_013160	TCA	2	6	34664	34669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818708
575	NC_013160	ATA	2	6	34788	34793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818708
576	NC_013160	GGC	2	6	34816	34821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818708
577	NC_013160	TAA	2	6	34840	34845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818708
578	NC_013160	TGG	2	6	34851	34856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818708
579	NC_013160	ATC	2	6	34858	34863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818708
580	NC_013160	TTC	2	6	34873	34878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818708
581	NC_013160	AGA	2	6	35006	35011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818708
582	NC_013160	ATG	2	6	35182	35187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818708
583	NC_013160	ATA	2	6	35192	35197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818708
584	NC_013160	T	7	7	35198	35204	0 %	100 %	0 %	0 %	256818708
585	NC_013160	TAA	2	6	35584	35589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818709
586	NC_013160	ATT	2	6	35597	35602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818709
587	NC_013160	TTG	2	6	35641	35646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818709
588	NC_013160	GTT	2	6	35794	35799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818709
589	NC_013160	GAAA	2	8	35807	35814	75 %	0 %	25 %	0 %	256818709
590	NC_013160	T	8	8	35818	35825	0 %	100 %	0 %	0 %	256818709
591	NC_013160	TAA	2	6	35844	35849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818709
592	NC_013160	TTGA	2	8	35869	35876	25 %	50 %	25 %	0 %	256818709
593	NC_013160	ATTAT	2	10	35888	35897	40 %	60 %	0 %	0 %	256818709
594	NC_013160	ATC	2	6	35995	36000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818709
595	NC_013160	TAAAA	2	10	36007	36016	80 %	20 %	0 %	0 %	256818709
596	NC_013160	ATCA	2	8	36031	36038	50 %	25 %	0 %	25 %	256818709
597	NC_013160	TTA	2	6	36050	36055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818709
598	NC_013160	CTTG	2	8	36163	36170	0 %	50 %	25 %	25 %	256818709
599	NC_013160	A	6	6	36185	36190	100 %	0 %	0 %	0 %	256818709
600	NC_013160	GGC	2	6	36204	36209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818709
601	NC_013160	TCAA	2	8	36239	36246	50 %	25 %	0 %	25 %	256818709
602	NC_013160	TAA	2	6	36258	36263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818709
603	NC_013160	TAT	2	6	36282	36287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818709
604	NC_013160	TTA	2	6	36380	36385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818709
605	NC_013160	TGAT	2	8	36473	36480	25 %	50 %	25 %	0 %	256818709
606	NC_013160	T	6	6	36480	36485	0 %	100 %	0 %	0 %	256818709
607	NC_013160	GAG	2	6	36537	36542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818709
608	NC_013160	TGT	2	6	36667	36672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818710
609	NC_013160	T	6	6	36715	36720	0 %	100 %	0 %	0 %	256818710
610	NC_013160	ATCC	2	8	36813	36820	25 %	25 %	0 %	50 %	256818710
611	NC_013160	TAT	2	6	36821	36826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818710
612	NC_013160	TTA	2	6	36845	36850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818710
613	NC_013160	AGA	2	6	36897	36902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818710
614	NC_013160	CT	3	6	36925	36930	0 %	50 %	0 %	50 %	256818710
615	NC_013160	GA	3	6	36980	36985	50 %	0 %	50 %	0 %	256818710
616	NC_013160	AAT	2	6	36989	36994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818710
617	NC_013160	T	6	6	37004	37009	0 %	100 %	0 %	0 %	256818710
618	NC_013160	GTT	2	6	37030	37035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818710
619	NC_013160	A	9	9	37055	37063	100 %	0 %	0 %	0 %	256818710
620	NC_013160	TAA	2	6	37390	37395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818711
621	NC_013160	GAG	2	6	37406	37411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256818711
622	NC_013160	ACTG	2	8	37443	37450	25 %	25 %	25 %	25 %	256818711
623	NC_013160	ACC	2	6	37482	37487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818711
624	NC_013160	CTT	2	6	37505	37510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818711
625	NC_013160	CCT	2	6	37531	37536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818711
626	NC_013160	TAT	2	6	37604	37609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818711
627	NC_013160	TG	3	6	37653	37658	0 %	50 %	50 %	0 %	256818711
628	NC_013160	AC	3	6	37666	37671	50 %	0 %	0 %	50 %	256818711
629	NC_013160	AAC	2	6	37692	37697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818711
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