MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 162654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013132	CAA	2	6	141266	141271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419167
2502	NC_013132	AT	5	10	141280	141289	50 %	50 %	0 %	0 %	256419167
2503	NC_013132	CTG	2	6	141302	141307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419167
2504	NC_013132	TGA	2	6	141331	141336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419167
2505	NC_013132	CTGA	2	8	141389	141396	25 %	25 %	25 %	25 %	256419167
2506	NC_013132	CCA	2	6	141497	141502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419167
2507	NC_013132	TGC	2	6	141541	141546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419167
2508	NC_013132	GTT	2	6	141560	141565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419167
2509	NC_013132	GTT	2	6	141590	141595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419167
2510	NC_013132	CCG	2	6	141649	141654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419167
2511	NC_013132	CTG	2	6	141696	141701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419167
2512	NC_013132	CCCTT	2	10	141708	141717	0 %	40 %	0 %	60 %	256419167
2513	NC_013132	CAG	2	6	141720	141725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419167
2514	NC_013132	T	6	6	141734	141739	0 %	100 %	0 %	0 %	256419167
2515	NC_013132	T	6	6	141809	141814	0 %	100 %	0 %	0 %	256419167
2516	NC_013132	AG	3	6	141824	141829	50 %	0 %	50 %	0 %	256419167
2517	NC_013132	TTC	2	6	141960	141965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419167
2518	NC_013132	GC	4	8	141970	141977	0 %	0 %	50 %	50 %	256419167
2519	NC_013132	ATA	2	6	141978	141983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419167
2520	NC_013132	ATA	2	6	142014	142019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419167
2521	NC_013132	ACG	2	6	142039	142044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419167
2522	NC_013132	TA	3	6	142050	142055	50 %	50 %	0 %	0 %	256419167
2523	NC_013132	CAG	2	6	142086	142091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419167
2524	NC_013132	T	6	6	142092	142097	0 %	100 %	0 %	0 %	256419167
2525	NC_013132	ATCGT	2	10	142116	142125	20 %	40 %	20 %	20 %	256419167
2526	NC_013132	TCA	2	6	142177	142182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419167
2527	NC_013132	TAAG	2	8	142183	142190	50 %	25 %	25 %	0 %	256419167
2528	NC_013132	GCC	2	6	142247	142252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419167
2529	NC_013132	AT	3	6	142338	142343	50 %	50 %	0 %	0 %	256419167
2530	NC_013132	GGT	2	6	142367	142372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419167
2531	NC_013132	TGT	2	6	142391	142396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419167
2532	NC_013132	TGT	2	6	142426	142431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419167
2533	NC_013132	CTG	2	6	142436	142441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419167
2534	NC_013132	GATA	2	8	142553	142560	50 %	25 %	25 %	0 %	256419167
2535	NC_013132	GCT	2	6	142567	142572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419167
2536	NC_013132	CTTC	2	8	142646	142653	0 %	50 %	0 %	50 %	256419167
2537	NC_013132	CGG	2	6	142654	142659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419167
2538	NC_013132	TTCT	2	8	142719	142726	0 %	75 %	0 %	25 %	256419167
2539	NC_013132	TGT	2	6	142834	142839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419167
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2541	NC_013132	ATT	2	6	143012	143017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419168
2542	NC_013132	CT	3	6	143030	143035	0 %	50 %	0 %	50 %	256419168
2543	NC_013132	ACA	2	6	143120	143125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419168
2544	NC_013132	AATA	2	8	143132	143139	75 %	25 %	0 %	0 %	256419168
2545	NC_013132	AGG	2	6	143360	143365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419169
2546	NC_013132	TCT	2	6	143389	143394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419169
2547	NC_013132	TTA	2	6	143429	143434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419169
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2549	NC_013132	GCATCA	2	12	143492	143503	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	256419169
2550	NC_013132	TTCA	2	8	143661	143668	25 %	50 %	0 %	25 %	256419169
2551	NC_013132	CTG	2	6	143740	143745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419169
2552	NC_013132	CTGA	2	8	143822	143829	25 %	25 %	25 %	25 %	256419169
2553	NC_013132	GCC	2	6	143917	143922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419169
2554	NC_013132	TGA	2	6	143971	143976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419169
2555	NC_013132	CAG	2	6	144006	144011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419169
2556	NC_013132	TGT	2	6	144016	144021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419169
2557	NC_013132	GAG	2	6	144022	144027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419169
2558	NC_013132	GA	3	6	144043	144048	50 %	0 %	50 %	0 %	256419169
2559	NC_013132	CTG	2	6	144051	144056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419169
2560	NC_013132	CTG	2	6	144069	144074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419169
2561	NC_013132	TAC	2	6	144092	144097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419169
2562	NC_013132	GAT	2	6	144138	144143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419169
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2564	NC_013132	TCTT	2	8	144268	144275	0 %	75 %	0 %	25 %	256419169
2565	NC_013132	AAC	2	6	144331	144336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419169
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2567	NC_013132	CTT	2	6	144476	144481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419169
2568	NC_013132	ATA	2	6	144519	144524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419169
2569	NC_013132	CAG	2	6	144543	144548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419169
2570	NC_013132	TGC	2	6	144618	144623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419169
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2573	NC_013132	GACT	2	8	144852	144859	25 %	25 %	25 %	25 %	256419169
2574	NC_013132	CAT	2	6	144885	144890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419169
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2578	NC_013132	GTAAG	2	10	145136	145145	40 %	20 %	40 %	0 %	256419169
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2580	NC_013132	ATTC	2	8	145334	145341	25 %	50 %	0 %	25 %	256419169
2581	NC_013132	TTA	2	6	145444	145449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419169
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2590	NC_013132	TGT	2	6	146206	146211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419170
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2592	NC_013132	CAGA	2	8	146288	146295	50 %	0 %	25 %	25 %	256419170
2593	NC_013132	TG	3	6	146389	146394	0 %	50 %	50 %	0 %	256419170
2594	NC_013132	GTT	2	6	146421	146426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419170
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2605	NC_013132	TA	3	6	146985	146990	50 %	50 %	0 %	0 %	256419170
2606	NC_013132	ATA	2	6	147024	147029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419170
2607	NC_013132	AGC	3	9	147078	147086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419170
2608	NC_013132	TA	3	6	147167	147172	50 %	50 %	0 %	0 %	256419170
2609	NC_013132	TC	3	6	147220	147225	0 %	50 %	0 %	50 %	256419170
2610	NC_013132	TAA	2	6	147236	147241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419170
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2619	NC_013132	TTC	2	6	148275	148280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419171
2620	NC_013132	CAGG	2	8	148348	148355	25 %	0 %	50 %	25 %	256419171
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2745	NC_013132	TTA	2	6	155932	155937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419179
2746	NC_013132	GT	3	6	156044	156049	0 %	50 %	50 %	0 %	256419179
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2748	NC_013132	TA	3	6	156176	156181	50 %	50 %	0 %	0 %	256419180
2749	NC_013132	GGT	2	6	156330	156335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419180
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2774	NC_013132	TCCT	2	8	157985	157992	0 %	50 %	0 %	50 %	256419182
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2851	NC_013132	ATT	2	6	161778	161783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419184
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2856	NC_013132	ATTA	2	8	161931	161938	50 %	50 %	0 %	0 %	256419184
2857	NC_013132	ACT	2	6	161953	161958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419184
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2861	NC_013132	T	6	6	162135	162140	0 %	100 %	0 %	0 %	256419185
2862	NC_013132	AT	3	6	162162	162167	50 %	50 %	0 %	0 %	256419185
2863	NC_013132	AGA	2	6	162242	162247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419185
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2865	NC_013132	AAC	2	6	162289	162294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419185
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2868	NC_013132	TAT	2	6	162414	162419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419185
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2871	NC_013132	T	6	6	162532	162537	0 %	100 %	0 %	0 %	256419185
2872	NC_013132	TA	3	6	162571	162576	50 %	50 %	0 %	0 %	256419185
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2990	NC_013132	CAT	2	6	167722	167727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419187
2991	NC_013132	CTC	2	6	167756	167761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419187
2992	NC_013132	ACC	2	6	167783	167788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419187
2993	NC_013132	T	7	7	167809	167815	0 %	100 %	0 %	0 %	256419187
2994	NC_013132	GAAT	2	8	167942	167949	50 %	25 %	25 %	0 %	256419187
2995	NC_013132	AAT	2	6	168063	168068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419187
2996	NC_013132	GTT	2	6	168324	168329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419187
2997	NC_013132	CTT	2	6	168483	168488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419187
2998	NC_013132	AT	3	6	168505	168510	50 %	50 %	0 %	0 %	256419187
2999	NC_013132	TTC	2	6	168577	168582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419187
3000	NC_013132	CCAT	2	8	168596	168603	25 %	25 %	0 %	50 %	256419187

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