MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 162654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_013132	ACC	2	6	587400	587405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419535
10502	NC_013132	GTC	2	6	587428	587433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419535
10503	NC_013132	T	6	6	587499	587504	0 %	100 %	0 %	0 %	256419535
10504	NC_013132	GTG	2	6	587590	587595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419535
10505	NC_013132	ATGAT	2	10	587686	587695	40 %	40 %	20 %	0 %	256419535
10506	NC_013132	GAA	2	6	587730	587735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419535
10507	NC_013132	CTGT	2	8	587806	587813	0 %	50 %	25 %	25 %	256419535
10508	NC_013132	CTT	2	6	587855	587860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419535
10509	NC_013132	GCT	2	6	587906	587911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419535
10510	NC_013132	CAT	2	6	587927	587932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419535
10511	NC_013132	ACC	2	6	587946	587951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419535
10512	NC_013132	TTG	2	6	587971	587976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419535
10513	NC_013132	ACC	2	6	588051	588056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419535
10514	NC_013132	ATA	2	6	588057	588062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419535
10515	NC_013132	GAGC	2	8	588140	588147	25 %	0 %	50 %	25 %	256419535
10516	NC_013132	GTA	2	6	588241	588246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419535
10517	NC_013132	CTTG	2	8	588287	588294	0 %	50 %	25 %	25 %	256419535
10518	NC_013132	CTG	2	6	588308	588313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419535
10519	NC_013132	TAT	3	9	588314	588322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419535
10520	NC_013132	GCC	2	6	588364	588369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419535
10521	NC_013132	GT	3	6	588602	588607	0 %	50 %	50 %	0 %	256419536
10522	NC_013132	TCT	2	6	588632	588637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419536
10523	NC_013132	AAG	2	6	588668	588673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419536
10524	NC_013132	CAT	2	6	588716	588721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419536
10525	NC_013132	CAT	2	6	588741	588746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419536
10526	NC_013132	GAA	2	6	588795	588800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419536
10527	NC_013132	GCCA	2	8	588841	588848	25 %	0 %	25 %	50 %	256419536
10528	NC_013132	TGA	2	6	588899	588904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419536
10529	NC_013132	AAG	2	6	588908	588913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419536
10530	NC_013132	AAC	2	6	588951	588956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419536
10531	NC_013132	CAG	3	9	588974	588982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419536
10532	NC_013132	GATC	2	8	589004	589011	25 %	25 %	25 %	25 %	256419536
10533	NC_013132	CAG	2	6	589038	589043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419536
10534	NC_013132	ATC	2	6	589086	589091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419536
10535	NC_013132	CGG	2	6	589129	589134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419536
10536	NC_013132	CTT	2	6	589139	589144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419536
10537	NC_013132	TTC	2	6	589200	589205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419536
10538	NC_013132	GT	3	6	589245	589250	0 %	50 %	50 %	0 %	256419536
10539	NC_013132	TCC	2	6	589276	589281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419536
10540	NC_013132	GAT	2	6	589302	589307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419536
10541	NC_013132	GCA	2	6	589429	589434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419536
10542	NC_013132	CCA	2	6	589436	589441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419536
10543	NC_013132	GTG	2	6	589467	589472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419536
10544	NC_013132	TTC	2	6	589637	589642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419537
10545	NC_013132	TTGAT	2	10	589677	589686	20 %	60 %	20 %	0 %	256419537
10546	NC_013132	ACC	2	6	589754	589759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419537
10547	NC_013132	TTG	2	6	589796	589801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419537
10548	NC_013132	CAGC	2	8	589806	589813	25 %	0 %	25 %	50 %	256419537
10549	NC_013132	GCG	2	6	589837	589842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419537
10550	NC_013132	CAG	2	6	589849	589854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419537
10551	NC_013132	CTT	2	6	589860	589865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419537
10552	NC_013132	TGT	2	6	589923	589928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419537
10553	NC_013132	TTC	2	6	589982	589987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419537
10554	NC_013132	CTG	2	6	589994	589999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419537
10555	NC_013132	TGG	2	6	590013	590018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419537
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10557	NC_013132	CAA	2	6	590055	590060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419537
10558	NC_013132	TTGAT	2	10	590130	590139	20 %	60 %	20 %	0 %	256419537
10559	NC_013132	TCTT	2	8	590618	590625	0 %	75 %	0 %	25 %	256419538
10560	NC_013132	CAG	2	6	590709	590714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419538
10561	NC_013132	CGAT	2	8	590734	590741	25 %	25 %	25 %	25 %	256419538
10562	NC_013132	T	6	6	590866	590871	0 %	100 %	0 %	0 %	256419538
10563	NC_013132	TAC	2	6	590935	590940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419538
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10565	NC_013132	TGC	2	6	591247	591252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419539
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10568	NC_013132	GTA	2	6	591366	591371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419539
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10575	NC_013132	TGT	2	6	591680	591685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419539
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10577	NC_013132	GCCT	2	8	591781	591788	0 %	25 %	25 %	50 %	256419539
10578	NC_013132	CGCA	2	8	592402	592409	25 %	0 %	25 %	50 %	256419540
10579	NC_013132	GCT	2	6	592492	592497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419540
10580	NC_013132	CTG	2	6	592516	592521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419540
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10584	NC_013132	CGC	2	6	592725	592730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419540
10585	NC_013132	GCT	3	9	592758	592766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419540
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10587	NC_013132	TCG	2	6	592829	592834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419540
10588	NC_013132	GGT	2	6	592858	592863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419540
10589	NC_013132	AGA	2	6	592899	592904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419540
10590	NC_013132	AAC	2	6	592916	592921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419540
10591	NC_013132	ACGT	2	8	593003	593010	25 %	25 %	25 %	25 %	256419540
10592	NC_013132	ATC	2	6	593102	593107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419540
10593	NC_013132	CAG	2	6	593128	593133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419540
10594	NC_013132	CGG	2	6	593145	593150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419540
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10598	NC_013132	AGA	2	6	593367	593372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419540
10599	NC_013132	AGC	2	6	593849	593854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419541
10600	NC_013132	ACA	2	6	593860	593865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419541
10601	NC_013132	ACC	2	6	593976	593981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419541
10602	NC_013132	ATC	2	6	593982	593987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419541
10603	NC_013132	TCA	2	6	594037	594042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419541
10604	NC_013132	TCC	2	6	594130	594135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419541
10605	NC_013132	TAT	2	6	594141	594146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419541
10606	NC_013132	CAT	2	6	594231	594236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419541
10607	NC_013132	TTC	2	6	594240	594245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419541
10608	NC_013132	AGGA	2	8	594342	594349	50 %	0 %	50 %	0 %	256419541
10609	NC_013132	CCA	2	6	594436	594441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419541
10610	NC_013132	TAA	2	6	594582	594587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419541
10611	NC_013132	ATG	2	6	594598	594603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419542
10612	NC_013132	CAATGG	2	12	594620	594631	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256419542
10613	NC_013132	GAA	2	6	594670	594675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419542
10614	NC_013132	A	6	6	594674	594679	100 %	0 %	0 %	0 %	256419542
10615	NC_013132	CAG	2	6	594718	594723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419542
10616	NC_013132	CAA	2	6	594801	594806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419542
10617	NC_013132	CAGTAT	2	12	594807	594818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	256419542
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10619	NC_013132	CAT	2	6	594966	594971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419542
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10739	NC_013132	TGC	2	6	600728	600733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419548
10740	NC_013132	GGC	2	6	600752	600757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419548
10741	NC_013132	GAT	2	6	600791	600796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419548
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10743	NC_013132	GGA	2	6	601077	601082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419549
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10745	NC_013132	CTGG	2	8	601111	601118	0 %	25 %	50 %	25 %	256419549
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10758	NC_013132	TCA	2	6	601490	601495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419549
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10770	NC_013132	GC	3	6	602241	602246	0 %	0 %	50 %	50 %	256419549
10771	NC_013132	GTG	2	6	602279	602284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419549
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10855	NC_013132	TTCC	2	8	608234	608241	0 %	50 %	0 %	50 %	256419555
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10978	NC_013132	AGT	2	6	614564	614569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419562
10979	NC_013132	ACG	2	6	614614	614619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419562
10980	NC_013132	A	6	6	614658	614663	100 %	0 %	0 %	0 %	256419562
10981	NC_013132	CAG	2	6	614682	614687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419562
10982	NC_013132	TGA	2	6	614694	614699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419562
10983	NC_013132	TAAAG	2	10	614756	614765	60 %	20 %	20 %	0 %	256419562
10984	NC_013132	AGC	2	6	614773	614778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419562
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