MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Catenulispora acidiphila DSM 44928 chromosome

Total Repeats: 8078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013131	GCGCC	2	10	2022	2031	0 %	0 %	40 %	60 %	256389233
2	NC_013131	GCCGG	2	10	3043	3052	0 %	0 %	60 %	40 %	256389234
3	NC_013131	CGGCC	2	10	7731	7740	0 %	0 %	40 %	60 %	256389238
4	NC_013131	CCGCG	2	10	8145	8154	0 %	0 %	40 %	60 %	256389238
5	NC_013131	ACCGG	2	10	10008	10017	20 %	0 %	40 %	40 %	256389239
6	NC_013131	GGGCC	2	10	11353	11362	0 %	0 %	60 %	40 %	256389239
7	NC_013131	CGGTG	2	10	11824	11833	0 %	20 %	60 %	20 %	256389239
8	NC_013131	CGGCC	2	10	16889	16898	0 %	0 %	40 %	60 %	256389246
9	NC_013131	GCGCC	2	10	19247	19256	0 %	0 %	40 %	60 %	256389249
10	NC_013131	GCCGG	2	10	19442	19451	0 %	0 %	60 %	40 %	256389249
11	NC_013131	CGCAC	2	10	22317	22326	20 %	0 %	20 %	60 %	256389252
12	NC_013131	CGGTG	2	10	23153	23162	0 %	20 %	60 %	20 %	256389253
13	NC_013131	GGCGT	2	10	25933	25942	0 %	20 %	60 %	20 %	256389256
14	NC_013131	CGGCC	2	10	26298	26307	0 %	0 %	40 %	60 %	256389256
15	NC_013131	CCGGT	2	10	27803	27812	0 %	20 %	40 %	40 %	256389258
16	NC_013131	GGACC	2	10	28546	28555	20 %	0 %	40 %	40 %	256389259
17	NC_013131	GGGCG	2	10	36179	36188	0 %	0 %	80 %	20 %	256389267
18	NC_013131	CCGGC	2	10	38273	38282	0 %	0 %	40 %	60 %	256389268
19	NC_013131	ACCGA	2	10	38450	38459	40 %	0 %	20 %	40 %	256389268
20	NC_013131	GCCGG	2	10	38719	38728	0 %	0 %	60 %	40 %	256389268
21	NC_013131	GCTCG	2	10	39615	39624	0 %	20 %	40 %	40 %	256389269
22	NC_013131	CAGGG	2	10	39994	40003	20 %	0 %	60 %	20 %	256389269
23	NC_013131	CGCGC	2	10	41434	41443	0 %	0 %	40 %	60 %	256389270
24	NC_013131	GGGCT	2	10	42179	42188	0 %	20 %	60 %	20 %	256389270
25	NC_013131	CGGAT	2	10	44186	44195	20 %	20 %	40 %	20 %	256389273
26	NC_013131	TGCGC	2	10	47486	47495	0 %	20 %	40 %	40 %	256389278
27	NC_013131	CGCGG	2	10	48616	48625	0 %	0 %	60 %	40 %	256389279
28	NC_013131	CAGCA	2	10	50416	50425	40 %	0 %	20 %	40 %	256389282
29	NC_013131	CCGCG	2	10	51927	51936	0 %	0 %	40 %	60 %	256389284
30	NC_013131	ACGCC	2	10	52802	52811	20 %	0 %	20 %	60 %	256389285
31	NC_013131	GCCGG	2	10	53691	53700	0 %	0 %	60 %	40 %	256389285
32	NC_013131	GGCCA	2	10	53707	53716	20 %	0 %	40 %	40 %	256389285
33	NC_013131	CGGCC	2	10	54433	54442	0 %	0 %	40 %	60 %	256389285
34	NC_013131	GCGCT	2	10	55881	55890	0 %	20 %	40 %	40 %	256389286
35	NC_013131	CCGTC	2	10	57007	57016	0 %	20 %	20 %	60 %	256389287
36	NC_013131	GCCGG	2	10	57264	57273	0 %	0 %	60 %	40 %	256389288
37	NC_013131	CGAGT	2	10	57319	57328	20 %	20 %	40 %	20 %	256389288
38	NC_013131	TGCGG	2	10	58038	58047	0 %	20 %	60 %	20 %	256389288
39	NC_013131	GCCGA	2	10	59243	59252	20 %	0 %	40 %	40 %	256389289
40	NC_013131	CGAGC	2	10	59726	59735	20 %	0 %	40 %	40 %	256389290
41	NC_013131	CGCGC	2	10	63434	63443	0 %	0 %	40 %	60 %	256389295
42	NC_013131	GGAAG	2	10	65705	65714	40 %	0 %	60 %	0 %	256389297
43	NC_013131	GGCGG	2	10	67487	67496	0 %	0 %	80 %	20 %	256389298
44	NC_013131	CGCCC	2	10	68956	68965	0 %	0 %	20 %	80 %	256389299
45	NC_013131	GCACC	2	10	69204	69213	20 %	0 %	20 %	60 %	256389299
46	NC_013131	CCAGT	2	10	69496	69505	20 %	20 %	20 %	40 %	256389299
47	NC_013131	GCCGT	2	10	71093	71102	0 %	20 %	40 %	40 %	256389301
48	NC_013131	GCGGT	2	10	73815	73824	0 %	20 %	60 %	20 %	256389304
49	NC_013131	CAGGT	2	10	74061	74070	20 %	20 %	40 %	20 %	256389304
50	NC_013131	GCGCG	2	10	75058	75067	0 %	0 %	60 %	40 %	256389305
51	NC_013131	CCCGG	2	10	79655	79664	0 %	0 %	40 %	60 %	256389310
52	NC_013131	CGGCG	2	10	79706	79715	0 %	0 %	60 %	40 %	256389310
53	NC_013131	CTGCG	2	10	79992	80001	0 %	20 %	40 %	40 %	256389310
54	NC_013131	GGCGT	2	10	80463	80472	0 %	20 %	60 %	20 %	256389311
55	NC_013131	CCGGG	2	10	80650	80659	0 %	0 %	60 %	40 %	256389311
56	NC_013131	GCCGT	2	10	81721	81730	0 %	20 %	40 %	40 %	256389312
57	NC_013131	AGCCC	2	10	81857	81866	20 %	0 %	20 %	60 %	256389312
58	NC_013131	ACCGG	2	10	85621	85630	20 %	0 %	40 %	40 %	256389315
59	NC_013131	GGCGC	2	10	85673	85682	0 %	0 %	60 %	40 %	256389315
60	NC_013131	GTCGA	2	10	87107	87116	20 %	20 %	40 %	20 %	256389317
61	NC_013131	CCGCG	2	10	87190	87199	0 %	0 %	40 %	60 %	256389317
62	NC_013131	CGGAC	2	10	90759	90768	20 %	0 %	40 %	40 %	256389319
63	NC_013131	CGCGC	2	10	90819	90828	0 %	0 %	40 %	60 %	256389319
64	NC_013131	CGGGC	2	10	93265	93274	0 %	0 %	60 %	40 %	256389321
65	NC_013131	CCAGG	2	10	95956	95965	20 %	0 %	40 %	40 %	256389323
66	NC_013131	GCGTC	2	10	96405	96414	0 %	20 %	40 %	40 %	256389324
67	NC_013131	CGGGT	2	10	97326	97335	0 %	20 %	60 %	20 %	256389325
68	NC_013131	CGGGA	2	10	99708	99717	20 %	0 %	60 %	20 %	256389327
69	NC_013131	TCGCA	2	10	100826	100835	20 %	20 %	20 %	40 %	256389328
70	NC_013131	AGCGC	2	10	101991	102000	20 %	0 %	40 %	40 %	256389330
71	NC_013131	TCGTT	2	10	103993	104002	0 %	60 %	20 %	20 %	256389332
72	NC_013131	GGTGG	2	10	104814	104823	0 %	20 %	80 %	0 %	256389332
73	NC_013131	GGAGT	2	10	105072	105081	20 %	20 %	60 %	0 %	256389332
74	NC_013131	GGAGC	2	10	106219	106228	20 %	0 %	60 %	20 %	256389333
75	NC_013131	GGGTT	2	10	106372	106381	0 %	40 %	60 %	0 %	256389333
76	NC_013131	CGGCG	2	10	107596	107605	0 %	0 %	60 %	40 %	256389336
77	NC_013131	CGAGG	2	10	108280	108289	20 %	0 %	60 %	20 %	256389336
78	NC_013131	TCGGG	2	10	110226	110235	0 %	20 %	60 %	20 %	256389338
79	NC_013131	ACCCG	2	10	111221	111230	20 %	0 %	20 %	60 %	256389340
80	NC_013131	AGCGC	2	10	112563	112572	20 %	0 %	40 %	40 %	256389341
81	NC_013131	GCCCG	2	10	112961	112970	0 %	0 %	40 %	60 %	256389341
82	NC_013131	GTCGG	2	10	113020	113029	0 %	20 %	60 %	20 %	256389341
83	NC_013131	GTCCG	2	10	113192	113201	0 %	20 %	40 %	40 %	256389341
84	NC_013131	CGGCG	2	10	113559	113568	0 %	0 %	60 %	40 %	256389341
85	NC_013131	CCGCG	2	10	115604	115613	0 %	0 %	40 %	60 %	256389344
86	NC_013131	GGTGT	2	10	116169	116178	0 %	40 %	60 %	0 %	256389344
87	NC_013131	GTGGA	2	10	116707	116716	20 %	20 %	60 %	0 %	256389345
88	NC_013131	TGCAG	2	10	120938	120947	20 %	20 %	40 %	20 %	256389348
89	NC_013131	GCCGG	2	10	122279	122288	0 %	0 %	60 %	40 %	256389349
90	NC_013131	CGGGG	2	10	123156	123165	0 %	0 %	80 %	20 %	256389350
91	NC_013131	GACCA	2	10	124527	124536	40 %	0 %	20 %	40 %	256389352
92	NC_013131	TGGGC	2	10	125199	125208	0 %	20 %	60 %	20 %	256389354
93	NC_013131	CGGAC	2	10	127061	127070	20 %	0 %	40 %	40 %	256389355
94	NC_013131	GCCAT	2	10	128105	128114	20 %	20 %	20 %	40 %	256389356
95	NC_013131	CACGA	2	10	129100	129109	40 %	0 %	20 %	40 %	256389357
96	NC_013131	TCGGC	2	10	130092	130101	0 %	20 %	40 %	40 %	256389358
97	NC_013131	TGGCC	2	10	133535	133544	0 %	20 %	40 %	40 %	256389362
98	NC_013131	GCACG	2	10	134226	134235	20 %	0 %	40 %	40 %	256389362
99	NC_013131	CCGCT	2	10	134765	134774	0 %	20 %	20 %	60 %	256389362
100	NC_013131	CGGCA	2	10	136503	136512	20 %	0 %	40 %	40 %	256389363
101	NC_013131	GTGCG	2	10	139058	139067	0 %	20 %	60 %	20 %	256389365
102	NC_013131	CGGCT	2	10	140488	140497	0 %	20 %	40 %	40 %	256389366
103	NC_013131	CCCTG	2	10	140797	140806	0 %	20 %	20 %	60 %	256389367
104	NC_013131	CCGCG	2	10	141545	141554	0 %	0 %	40 %	60 %	256389367
105	NC_013131	TGCCG	2	10	143336	143345	0 %	20 %	40 %	40 %	256389367
106	NC_013131	GCGCC	2	10	144401	144410	0 %	0 %	40 %	60 %	256389368
107	NC_013131	GCCGC	2	10	147956	147965	0 %	0 %	40 %	60 %	256389371
108	NC_013131	GCGTC	2	10	148080	148089	0 %	20 %	40 %	40 %	256389371
109	NC_013131	CGGTC	2	10	148205	148214	0 %	20 %	40 %	40 %	256389372
110	NC_013131	CCGCG	2	10	149484	149493	0 %	0 %	40 %	60 %	256389373
111	NC_013131	CGCGG	2	10	151164	151173	0 %	0 %	60 %	40 %	256389374
112	NC_013131	CGGCG	2	10	151351	151360	0 %	0 %	60 %	40 %	256389374
113	NC_013131	GGGCC	2	10	152259	152268	0 %	0 %	60 %	40 %	256389376
114	NC_013131	GTCCG	2	10	152839	152848	0 %	20 %	40 %	40 %	256389376
115	NC_013131	AGCCC	2	10	153975	153984	20 %	0 %	20 %	60 %	256389376
116	NC_013131	TGGCC	2	10	154806	154815	0 %	20 %	40 %	40 %	256389376
117	NC_013131	CCCCG	2	10	156718	156727	0 %	0 %	20 %	80 %	256389377
118	NC_013131	CCCGA	2	10	156841	156850	20 %	0 %	20 %	60 %	256389377
119	NC_013131	GCGCC	2	10	158680	158689	0 %	0 %	40 %	60 %	256389379
120	NC_013131	GTTCG	2	10	160249	160258	0 %	40 %	40 %	20 %	256389381
121	NC_013131	TCGCG	2	10	161203	161212	0 %	20 %	40 %	40 %	256389382
122	NC_013131	GGTGC	2	10	161822	161831	0 %	20 %	60 %	20 %	256389384
123	NC_013131	CAGGT	2	10	164637	164646	20 %	20 %	40 %	20 %	256389386
124	NC_013131	CGCGG	2	10	164682	164691	0 %	0 %	60 %	40 %	256389386
125	NC_013131	GCCGC	2	10	166472	166481	0 %	0 %	40 %	60 %	256389388
126	NC_013131	GCGGT	2	10	166955	166964	0 %	20 %	60 %	20 %	256389388
127	NC_013131	CCGGT	2	10	167388	167397	0 %	20 %	40 %	40 %	256389389
128	NC_013131	CCGGG	2	10	167718	167727	0 %	0 %	60 %	40 %	256389389
129	NC_013131	ACGGC	2	10	168885	168894	20 %	0 %	40 %	40 %	256389390
130	NC_013131	GGCCG	2	10	170035	170044	0 %	0 %	60 %	40 %	256389391
131	NC_013131	GGCCG	2	10	170245	170254	0 %	0 %	60 %	40 %	256389391
132	NC_013131	GCACC	2	10	171882	171891	20 %	0 %	20 %	60 %	256389392
133	NC_013131	GCGGG	2	10	173341	173350	0 %	0 %	80 %	20 %	256389394
134	NC_013131	GCTCC	2	10	173885	173894	0 %	20 %	20 %	60 %	256389395
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251	NC_013131	AGCTG	2	10	321686	321695	20 %	20 %	40 %	20 %	256389513
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254	NC_013131	CGGCC	2	10	328483	328492	0 %	0 %	40 %	60 %	256389521
255	NC_013131	GGCGG	2	10	330337	330346	0 %	0 %	80 %	20 %	256389522
256	NC_013131	CGTCG	2	10	331565	331574	0 %	20 %	40 %	40 %	256389523
257	NC_013131	CCAGC	2	10	334433	334442	20 %	0 %	20 %	60 %	256389526
258	NC_013131	CGGCG	2	10	336008	336017	0 %	0 %	60 %	40 %	256389527
259	NC_013131	GGCGC	2	10	336968	336977	0 %	0 %	60 %	40 %	256389529
260	NC_013131	GGACG	2	10	340993	341002	20 %	0 %	60 %	20 %	256389532
261	NC_013131	GCGCC	2	10	342286	342295	0 %	0 %	40 %	60 %	256389533
262	NC_013131	AGGAC	2	10	343956	343965	40 %	0 %	40 %	20 %	256389534
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