MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri SMDSEM

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013123	AAATC	2	10	1160	1169	60 %	20 %	0 %	20 %	256370583
2	NC_013123	TAATT	2	10	2093	2102	40 %	60 %	0 %	0 %	256370584
3	NC_013123	TATTC	2	10	3559	3568	20 %	60 %	0 %	20 %	256370584
4	NC_013123	AGAAA	2	10	3646	3655	80 %	0 %	20 %	0 %	256370585
5	NC_013123	TACAA	2	10	3781	3790	60 %	20 %	0 %	20 %	256370585
6	NC_013123	GAAAA	2	10	4024	4033	80 %	0 %	20 %	0 %	256370585
7	NC_013123	ATTAT	2	10	4198	4207	40 %	60 %	0 %	0 %	256370585
8	NC_013123	ATTTT	2	10	4713	4722	20 %	80 %	0 %	0 %	256370585
9	NC_013123	TTGAT	2	10	5247	5256	20 %	60 %	20 %	0 %	256370585
10	NC_013123	AAAAC	2	10	5422	5431	80 %	0 %	0 %	20 %	256370585
11	NC_013123	TTTTA	2	10	5530	5539	20 %	80 %	0 %	0 %	256370585
12	NC_013123	TAAAA	2	10	6318	6327	80 %	20 %	0 %	0 %	256370586
13	NC_013123	ATTTT	2	10	7786	7795	20 %	80 %	0 %	0 %	256370587
14	NC_013123	TATAA	2	10	8064	8073	60 %	40 %	0 %	0 %	256370587
15	NC_013123	TAAAA	2	10	8288	8297	80 %	20 %	0 %	0 %	256370587
16	NC_013123	AAAAT	2	10	9160	9169	80 %	20 %	0 %	0 %	256370587
17	NC_013123	TAATT	2	10	9981	9990	40 %	60 %	0 %	0 %	256370588
18	NC_013123	TTATT	2	10	10098	10107	20 %	80 %	0 %	0 %	256370588
19	NC_013123	AAATT	2	10	10325	10334	60 %	40 %	0 %	0 %	256370588
20	NC_013123	TTAAT	3	15	10424	10438	40 %	60 %	0 %	0 %	256370588
21	NC_013123	ATTTA	2	10	11651	11660	40 %	60 %	0 %	0 %	256370589
22	NC_013123	GAAAA	2	10	13362	13371	80 %	0 %	20 %	0 %	256370590
23	NC_013123	TGGCA	2	10	15153	15162	20 %	20 %	40 %	20 %	256370591
24	NC_013123	TAGAA	3	15	15305	15319	60 %	20 %	20 %	0 %	256370591
25	NC_013123	TAAAT	2	10	15452	15461	60 %	40 %	0 %	0 %	256370592
26	NC_013123	TTTGG	2	10	15540	15549	0 %	60 %	40 %	0 %	256370592
27	NC_013123	ATTAT	2	10	15665	15674	40 %	60 %	0 %	0 %	256370592
28	NC_013123	CTTTT	2	10	17461	17470	0 %	80 %	0 %	20 %	256370593
29	NC_013123	AAATG	2	10	19036	19045	60 %	20 %	20 %	0 %	256370594
30	NC_013123	TTAGG	10	50	19697	19746	20 %	40 %	40 %	0 %	256370595
31	NC_013123	TTAAA	2	10	20291	20300	60 %	40 %	0 %	0 %	256370597
32	NC_013123	ATTAA	2	10	20338	20347	60 %	40 %	0 %	0 %	256370597
33	NC_013123	GTACA	2	10	21572	21581	40 %	20 %	20 %	20 %	256370597
34	NC_013123	ATAAA	2	10	21733	21742	80 %	20 %	0 %	0 %	256370597
35	NC_013123	TAAAA	2	10	22347	22356	80 %	20 %	0 %	0 %	256370598
36	NC_013123	ATTTT	2	10	22502	22511	20 %	80 %	0 %	0 %	256370598
37	NC_013123	AAAAG	2	10	22939	22948	80 %	0 %	20 %	0 %	256370599
38	NC_013123	ATATT	2	10	24076	24085	40 %	60 %	0 %	0 %	256370599
39	NC_013123	GTTTG	2	10	24505	24514	0 %	60 %	40 %	0 %	256370599
40	NC_013123	AATAT	2	10	25328	25337	60 %	40 %	0 %	0 %	256370599
41	NC_013123	TAACT	2	10	25653	25662	40 %	40 %	0 %	20 %	256370599
42	NC_013123	TTTAT	2	10	26399	26408	20 %	80 %	0 %	0 %	256370600
43	NC_013123	GTTGT	2	10	26515	26524	0 %	60 %	40 %	0 %	256370600
44	NC_013123	TATAT	2	10	27518	27527	40 %	60 %	0 %	0 %	256370601
45	NC_013123	TATTT	2	10	28202	28211	20 %	80 %	0 %	0 %	256370601
46	NC_013123	ATTTA	2	10	30758	30767	40 %	60 %	0 %	0 %	256370603
47	NC_013123	TTAAT	2	10	31163	31172	40 %	60 %	0 %	0 %	256370604
48	NC_013123	AATGT	2	10	31446	31455	40 %	40 %	20 %	0 %	256370605
49	NC_013123	TAAAT	2	10	33433	33442	60 %	40 %	0 %	0 %	256370606
50	NC_013123	TAAAT	2	10	33906	33915	60 %	40 %	0 %	0 %	256370606
51	NC_013123	TATAT	2	10	34566	34575	40 %	60 %	0 %	0 %	256370606
52	NC_013123	ATTTT	2	10	35228	35237	20 %	80 %	0 %	0 %	256370608
53	NC_013123	ATAAA	2	10	35279	35288	80 %	20 %	0 %	0 %	256370608
54	NC_013123	ATCAT	2	10	35301	35310	40 %	40 %	0 %	20 %	256370608
55	NC_013123	AGAAA	3	15	36231	36245	80 %	0 %	20 %	0 %	256370609
56	NC_013123	CAAAT	2	10	36328	36337	60 %	20 %	0 %	20 %	256370609
57	NC_013123	AATTA	2	10	36752	36761	60 %	40 %	0 %	0 %	256370609
58	NC_013123	TAAAT	2	10	39976	39985	60 %	40 %	0 %	0 %	256370612
59	NC_013123	AAATT	2	10	40554	40563	60 %	40 %	0 %	0 %	256370613
60	NC_013123	AAATT	2	10	40603	40612	60 %	40 %	0 %	0 %	256370613
61	NC_013123	TTTCT	2	10	41166	41175	0 %	80 %	0 %	20 %	256370613
62	NC_013123	TTATT	2	10	41590	41599	20 %	80 %	0 %	0 %	256370614
63	NC_013123	AGTAT	2	10	42156	42165	40 %	40 %	20 %	0 %	256370614
64	NC_013123	TTTTA	2	10	43969	43978	20 %	80 %	0 %	0 %	256370616
65	NC_013123	TAAAA	2	10	46223	46232	80 %	20 %	0 %	0 %	256370619
66	NC_013123	AAAAT	2	10	47671	47680	80 %	20 %	0 %	0 %	256370620
67	NC_013123	GAAAT	2	10	48473	48482	60 %	20 %	20 %	0 %	256370621
68	NC_013123	TTAAT	2	10	51006	51015	40 %	60 %	0 %	0 %	256370624
69	NC_013123	ATTTT	2	10	51114	51123	20 %	80 %	0 %	0 %	256370624
70	NC_013123	TATAA	2	10	51333	51342	60 %	40 %	0 %	0 %	256370624
71	NC_013123	ATATA	2	10	51504	51513	60 %	40 %	0 %	0 %	256370624
72	NC_013123	TAAAT	2	10	52158	52167	60 %	40 %	0 %	0 %	256370625
73	NC_013123	TTCTG	2	10	52784	52793	0 %	60 %	20 %	20 %	256370625
74	NC_013123	AATTT	2	10	55615	55624	40 %	60 %	0 %	0 %	256370628
75	NC_013123	TTAAA	2	10	56509	56518	60 %	40 %	0 %	0 %	256370628
76	NC_013123	AAAAG	2	10	56826	56835	80 %	0 %	20 %	0 %	256370628
77	NC_013123	ATTTA	2	10	56893	56902	40 %	60 %	0 %	0 %	256370628
78	NC_013123	TATTT	2	10	57590	57599	20 %	80 %	0 %	0 %	256370628
79	NC_013123	AATAA	2	10	57870	57879	80 %	20 %	0 %	0 %	256370628
80	NC_013123	GAAAA	2	10	58911	58920	80 %	0 %	20 %	0 %	256370630
81	NC_013123	ATTAA	2	10	60206	60215	60 %	40 %	0 %	0 %	256370631
82	NC_013123	TATAA	2	10	60563	60572	60 %	40 %	0 %	0 %	256370631
83	NC_013123	AAAAT	2	10	60630	60639	80 %	20 %	0 %	0 %	256370631
84	NC_013123	GAAAA	2	10	61153	61162	80 %	0 %	20 %	0 %	256370631
85	NC_013123	AAATA	2	10	61549	61558	80 %	20 %	0 %	0 %	256370633
86	NC_013123	TTTTA	2	10	62345	62354	20 %	80 %	0 %	0 %	256370634
87	NC_013123	TCTAT	2	10	62433	62442	20 %	60 %	0 %	20 %	256370634
88	NC_013123	TAAAA	2	10	62485	62494	80 %	20 %	0 %	0 %	256370634
89	NC_013123	AAATT	2	10	63163	63172	60 %	40 %	0 %	0 %	256370635
90	NC_013123	ATTTT	2	10	63982	63991	20 %	80 %	0 %	0 %	256370636
91	NC_013123	AAAAT	2	10	64415	64424	80 %	20 %	0 %	0 %	256370636
92	NC_013123	ATTTG	2	10	64702	64711	20 %	60 %	20 %	0 %	256370636
93	NC_013123	TTTCA	2	10	64956	64965	20 %	60 %	0 %	20 %	256370636
94	NC_013123	ATTTT	2	10	68847	68856	20 %	80 %	0 %	0 %	256370637
95	NC_013123	AATTT	2	10	69120	69129	40 %	60 %	0 %	0 %	256370637
96	NC_013123	TTTAT	2	10	69149	69158	20 %	80 %	0 %	0 %	256370637
97	NC_013123	ATTTT	2	10	69789	69798	20 %	80 %	0 %	0 %	256370637
98	NC_013123	ATTTA	2	10	70783	70792	40 %	60 %	0 %	0 %	256370637
99	NC_013123	CAATC	2	10	71115	71124	40 %	20 %	0 %	40 %	256370637
100	NC_013123	AAGTA	2	10	71263	71272	60 %	20 %	20 %	0 %	256370637
101	NC_013123	AATTC	3	15	72006	72020	40 %	40 %	0 %	20 %	256370638
102	NC_013123	AGTTT	2	10	72250	72259	20 %	60 %	20 %	0 %	256370638
103	NC_013123	TCAAA	2	10	72825	72834	60 %	20 %	0 %	20 %	256370639
104	NC_013123	ATTTT	2	10	73749	73758	20 %	80 %	0 %	0 %	256370641
105	NC_013123	ATTTT	2	10	74056	74065	20 %	80 %	0 %	0 %	256370641
106	NC_013123	GATAT	2	10	74795	74804	40 %	40 %	20 %	0 %	256370642
107	NC_013123	AAATT	2	10	77925	77934	60 %	40 %	0 %	0 %	256370643
108	NC_013123	TATAT	2	10	78025	78034	40 %	60 %	0 %	0 %	256370643
109	NC_013123	ATATA	2	10	79285	79294	60 %	40 %	0 %	0 %	256370644
110	NC_013123	TAAAA	2	10	80120	80129	80 %	20 %	0 %	0 %	256370644
111	NC_013123	AATTT	2	10	80538	80547	40 %	60 %	0 %	0 %	256370644
112	NC_013123	ACTAA	2	10	80652	80661	60 %	20 %	0 %	20 %	256370644
113	NC_013123	ATGTA	2	10	80966	80975	40 %	40 %	20 %	0 %	256370644
114	NC_013123	TATAA	2	10	81687	81696	60 %	40 %	0 %	0 %	256370644
115	NC_013123	ATATA	2	10	83092	83101	60 %	40 %	0 %	0 %	256370646
116	NC_013123	ATTGG	2	10	83312	83321	20 %	40 %	40 %	0 %	256370646
117	NC_013123	TTATT	2	10	85061	85070	20 %	80 %	0 %	0 %	256370648
118	NC_013123	AAATT	2	10	85764	85773	60 %	40 %	0 %	0 %	256370649
119	NC_013123	GGTAA	2	10	86040	86049	40 %	20 %	40 %	0 %	256370650
120	NC_013123	CATTT	2	10	92480	92489	20 %	60 %	0 %	20 %	256370651
121	NC_013123	GGATT	2	10	92887	92896	20 %	40 %	40 %	0 %	256370651
122	NC_013123	AGTGA	3	15	93145	93159	40 %	20 %	40 %	0 %	256370651
123	NC_013123	GAATT	2	10	93702	93711	40 %	40 %	20 %	0 %	256370652
124	NC_013123	TTAAC	2	10	94182	94191	40 %	40 %	0 %	20 %	256370652
125	NC_013123	GAATG	2	10	96912	96921	40 %	20 %	40 %	0 %	256370654
126	NC_013123	ATTAA	2	10	99181	99190	60 %	40 %	0 %	0 %	256370655
127	NC_013123	AGAAT	2	10	99931	99940	60 %	20 %	20 %	0 %	256370656
128	NC_013123	ATTAA	2	10	99958	99967	60 %	40 %	0 %	0 %	256370656
129	NC_013123	ATTTT	2	10	100004	100013	20 %	80 %	0 %	0 %	256370656
130	NC_013123	ATTTA	2	10	101027	101036	40 %	60 %	0 %	0 %	256370658
131	NC_013123	TTCTA	2	10	102189	102198	20 %	60 %	0 %	20 %	256370659
132	NC_013123	ATTGA	2	10	103264	103273	40 %	40 %	20 %	0 %	256370659
133	NC_013123	AATTT	2	10	104486	104495	40 %	60 %	0 %	0 %	256370662
134	NC_013123	TAAAA	2	10	105836	105845	80 %	20 %	0 %	0 %	256370665
135	NC_013123	AAAAT	2	10	105846	105855	80 %	20 %	0 %	0 %	256370665
136	NC_013123	ATTTT	2	10	109535	109544	20 %	80 %	0 %	0 %	256370668
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.