MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome

Total Repeats: 3256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012960	CGT	3	9	43740	43748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795603
1002	NC_012960	CTGA	2	8	43758	43765	25 %	25 %	25 %	25 %	253795603
1003	NC_012960	GC	5	10	43774	43783	0 %	0 %	50 %	50 %	253795603
1004	NC_012960	GC	3	6	43794	43799	0 %	0 %	50 %	50 %	253795603
1005	NC_012960	GC	3	6	43810	43815	0 %	0 %	50 %	50 %	253795603
1006	NC_012960	GC	3	6	43890	43895	0 %	0 %	50 %	50 %	253795603
1007	NC_012960	GCT	2	6	43940	43945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1008	NC_012960	GCT	2	6	43950	43955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1009	NC_012960	TGG	2	6	43981	43986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795604
1010	NC_012960	CG	3	6	43987	43992	0 %	0 %	50 %	50 %	253795604
1011	NC_012960	TTTGGG	2	12	44013	44024	0 %	50 %	50 %	0 %	253795604
1012	NC_012960	TGC	2	6	44033	44038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1013	NC_012960	GGC	2	6	44080	44085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795604
1014	NC_012960	GCT	2	6	44096	44101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1015	NC_012960	GGT	2	6	44204	44209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795604
1016	NC_012960	GCGCG	2	10	44217	44226	0 %	0 %	60 %	40 %	253795604
1017	NC_012960	GC	4	8	44351	44358	0 %	0 %	50 %	50 %	253795604
1018	NC_012960	TGG	2	6	44363	44368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795604
1019	NC_012960	GGC	2	6	44376	44381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795604
1020	NC_012960	GC	3	6	44389	44394	0 %	0 %	50 %	50 %	253795604
1021	NC_012960	GCGT	2	8	44403	44410	0 %	25 %	50 %	25 %	253795604
1022	NC_012960	GGC	2	6	44436	44441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795604
1023	NC_012960	GTG	2	6	44472	44477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795604
1024	NC_012960	TCG	2	6	44532	44537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1025	NC_012960	GTTT	2	8	44551	44558	0 %	75 %	25 %	0 %	253795604
1026	NC_012960	GGCT	2	8	44584	44591	0 %	25 %	50 %	25 %	253795604
1027	NC_012960	CGT	2	6	44594	44599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1028	NC_012960	GC	4	8	44754	44761	0 %	0 %	50 %	50 %	253795604
1029	NC_012960	GTG	2	6	44802	44807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795604
1030	NC_012960	GCT	2	6	44832	44837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1031	NC_012960	GCT	2	6	45052	45057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1032	NC_012960	GAC	2	6	45059	45064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1033	NC_012960	GCT	2	6	45065	45070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1034	NC_012960	CG	3	6	45125	45130	0 %	0 %	50 %	50 %	253795604
1035	NC_012960	GCT	2	6	45132	45137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1036	NC_012960	GACGTC	2	12	45138	45149	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253795604
1037	NC_012960	GGT	2	6	45251	45256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795604
1038	NC_012960	GT	3	6	45291	45296	0 %	50 %	50 %	0 %	253795604
1039	NC_012960	GCG	2	6	45316	45321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795604
1040	NC_012960	GC	3	6	45347	45352	0 %	0 %	50 %	50 %	253795605
1041	NC_012960	AGT	2	6	45382	45387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795605
1042	NC_012960	AAT	2	6	45640	45645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253795605
1043	NC_012960	G	8	8	45650	45657	0 %	0 %	100 %	0 %	253795605
1044	NC_012960	TG	3	6	45658	45663	0 %	50 %	50 %	0 %	253795605
1045	NC_012960	TCG	2	6	45671	45676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795605
1046	NC_012960	CGC	2	6	45683	45688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795605
1047	NC_012960	TTA	2	6	45705	45710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253795605
1048	NC_012960	GT	3	6	45811	45816	0 %	50 %	50 %	0 %	253795605
1049	NC_012960	GC	3	6	45825	45830	0 %	0 %	50 %	50 %	253795605
1050	NC_012960	TTG	2	6	45840	45845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795605
1051	NC_012960	GCG	2	6	45947	45952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795605
1052	NC_012960	CAGAA	2	10	45961	45970	60 %	0 %	20 %	20 %	253795605
1053	NC_012960	TGG	2	6	46008	46013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795605
1054	NC_012960	CG	3	6	46014	46019	0 %	0 %	50 %	50 %	253795605
1055	NC_012960	CGC	2	6	46046	46051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795605
1056	NC_012960	GCT	2	6	46173	46178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795605
1057	NC_012960	GCG	2	6	46254	46259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795605
1058	NC_012960	TTG	2	6	46286	46291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795605
1059	NC_012960	GC	3	6	46324	46329	0 %	0 %	50 %	50 %	253795605
1060	NC_012960	GCT	2	6	46337	46342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795605
1061	NC_012960	AGT	2	6	46350	46355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795605
1062	NC_012960	GCT	2	6	46569	46574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795606
1063	NC_012960	CGT	2	6	46589	46594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795606
1064	NC_012960	GAC	2	6	46755	46760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795606
1065	NC_012960	CG	3	6	46873	46878	0 %	0 %	50 %	50 %	253795606
1066	NC_012960	A	6	6	46903	46908	100 %	0 %	0 %	0 %	253795606
1067	NC_012960	CGC	2	6	46922	46927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795606
1068	NC_012960	TCAA	2	8	46929	46936	50 %	25 %	0 %	25 %	253795606
1069	NC_012960	GCT	2	6	46938	46943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795606
1070	NC_012960	GCTG	2	8	47039	47046	0 %	25 %	50 %	25 %	253795607
1071	NC_012960	GGC	2	6	47119	47124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795607
1072	NC_012960	GC	3	6	47126	47131	0 %	0 %	50 %	50 %	253795607
1073	NC_012960	GCTA	2	8	47163	47170	25 %	25 %	25 %	25 %	253795607
1074	NC_012960	GC	3	6	47177	47182	0 %	0 %	50 %	50 %	253795607
1075	NC_012960	CAG	2	6	47226	47231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795607
1076	NC_012960	GC	4	8	47283	47290	0 %	0 %	50 %	50 %	253795607
1077	NC_012960	GAC	2	6	47353	47358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795607
1078	NC_012960	GCT	2	6	47543	47548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795608
1079	NC_012960	GC	3	6	47590	47595	0 %	0 %	50 %	50 %	253795608
1080	NC_012960	GCT	2	6	47610	47615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795608
1081	NC_012960	TGC	3	9	47621	47629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795608
1082	NC_012960	TGC	3	9	47633	47641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795608
1083	NC_012960	TGC	4	12	47645	47656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795608
1084	NC_012960	GC	3	6	47659	47664	0 %	0 %	50 %	50 %	253795608
1085	NC_012960	C	6	6	47664	47669	0 %	0 %	0 %	100 %	253795608
1086	NC_012960	AGG	2	6	47773	47778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253795608
1087	NC_012960	GC	3	6	47842	47847	0 %	0 %	50 %	50 %	253795608
1088	NC_012960	AAGCTT	2	12	47850	47861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	253795608
1089	NC_012960	GCG	2	6	47935	47940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795609
1090	NC_012960	GGC	3	9	47945	47953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795609
1091	NC_012960	GTTG	2	8	48002	48009	0 %	50 %	50 %	0 %	253795609
1092	NC_012960	GTG	2	6	48010	48015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795609
1093	NC_012960	GCT	2	6	48044	48049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1094	NC_012960	TGACGA	2	12	48131	48142	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253795609
1095	NC_012960	CAG	2	6	48233	48238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1096	NC_012960	GCTGAC	2	12	48240	48251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1097	NC_012960	TGA	2	6	48259	48264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795609
1098	NC_012960	CTG	2	6	48489	48494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1099	NC_012960	GGT	2	6	48568	48573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795609
1100	NC_012960	CGA	2	6	48602	48607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1101	NC_012960	GC	5	10	48645	48654	0 %	0 %	50 %	50 %	253795609
1102	NC_012960	GC	3	6	48688	48693	0 %	0 %	50 %	50 %	253795609
1103	NC_012960	ACG	2	6	48694	48699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1104	NC_012960	TGG	2	6	48700	48705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795609
1105	NC_012960	GC	3	6	48709	48714	0 %	0 %	50 %	50 %	253795609
1106	NC_012960	CGG	2	6	48790	48795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795609
1107	NC_012960	TGG	2	6	48805	48810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795609
1108	NC_012960	GC	3	6	48845	48850	0 %	0 %	50 %	50 %	253795609
1109	NC_012960	GCT	2	6	48855	48860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1110	NC_012960	GC	3	6	48873	48878	0 %	0 %	50 %	50 %	253795609
1111	NC_012960	GCC	2	6	48909	48914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795609
1112	NC_012960	CGT	2	6	48956	48961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1113	NC_012960	AAGCT	2	10	48978	48987	40 %	20 %	20 %	20 %	253795609
1114	NC_012960	GCT	2	6	48995	49000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1115	NC_012960	CGA	2	6	49043	49048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1116	NC_012960	GC	3	6	49117	49122	0 %	0 %	50 %	50 %	253795609
1117	NC_012960	CG	3	6	49283	49288	0 %	0 %	50 %	50 %	253795609
1118	NC_012960	GT	3	6	49338	49343	0 %	50 %	50 %	0 %	253795609
1119	NC_012960	TGC	2	6	49381	49386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1120	NC_012960	CAGC	2	8	49493	49500	25 %	0 %	25 %	50 %	253795609
1121	NC_012960	GC	3	6	49540	49545	0 %	0 %	50 %	50 %	253795609
1122	NC_012960	CAG	2	6	49636	49641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1123	NC_012960	ACG	2	6	49669	49674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795609
1124	NC_012960	CG	4	8	49678	49685	0 %	0 %	50 %	50 %	253795609
1125	NC_012960	AAGC	2	8	49707	49714	50 %	0 %	25 %	25 %	253795609
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1127	NC_012960	TGGT	2	8	49744	49751	0 %	50 %	50 %	0 %	253795609
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1255	NC_012960	TGAGC	2	10	54969	54978	20 %	20 %	40 %	20 %	253795610
1256	NC_012960	CGTCAG	2	12	55048	55059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253795610
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1495	NC_012960	CG	4	8	65210	65217	0 %	0 %	50 %	50 %	253795627
1496	NC_012960	GCA	2	6	65241	65246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795627
1497	NC_012960	CGC	2	6	65256	65261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795627
1498	NC_012960	CTA	2	6	65343	65348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795627
1499	NC_012960	TGC	2	6	65402	65407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795627
1500	NC_012960	GTC	2	6	65421	65426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795627

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