MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome

Total Repeats: 3256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012960	TCA	2	6	21328	21333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795570
502	NC_012960	CTA	2	6	21405	21410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795570
503	NC_012960	CGC	2	6	21417	21422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795570
504	NC_012960	TTGTG	2	10	21423	21432	0 %	60 %	40 %	0 %	253795570
505	NC_012960	GTT	2	6	21442	21447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795571
506	NC_012960	TGGC	2	8	21476	21483	0 %	25 %	50 %	25 %	253795571
507	NC_012960	GC	3	6	21482	21487	0 %	0 %	50 %	50 %	253795571
508	NC_012960	GC	4	8	21503	21510	0 %	0 %	50 %	50 %	253795571
509	NC_012960	TGC	2	6	21569	21574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795571
510	NC_012960	GGC	2	6	21592	21597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795571
511	NC_012960	GT	4	8	21679	21686	0 %	50 %	50 %	0 %	253795571
512	NC_012960	GTA	2	6	21757	21762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795571
513	NC_012960	CG	3	6	21776	21781	0 %	0 %	50 %	50 %	253795571
514	NC_012960	CAC	2	6	21855	21860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253795571
515	NC_012960	CGC	2	6	21893	21898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795571
516	NC_012960	CGT	2	6	22142	22147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795572
517	NC_012960	CGC	2	6	22148	22153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795572
518	NC_012960	TGC	2	6	22183	22188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795572
519	NC_012960	TGG	2	6	22293	22298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795572
520	NC_012960	GTG	2	6	22340	22345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795572
521	NC_012960	GGT	2	6	22353	22358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795572
522	NC_012960	TG	3	6	22392	22397	0 %	50 %	50 %	0 %	253795572
523	NC_012960	GCTG	2	8	22406	22413	0 %	25 %	50 %	25 %	253795572
524	NC_012960	CG	4	8	22527	22534	0 %	0 %	50 %	50 %	253795572
525	NC_012960	GCTG	2	8	22701	22708	0 %	25 %	50 %	25 %	253795572
526	NC_012960	ATT	2	6	22809	22814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253795573
527	NC_012960	TGT	2	6	22841	22846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795573
528	NC_012960	GCG	2	6	22918	22923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795573
529	NC_012960	CGA	2	6	22925	22930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795573
530	NC_012960	CGT	2	6	22954	22959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795573
531	NC_012960	CCA	2	6	22984	22989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253795573
532	NC_012960	ACTG	2	8	23021	23028	25 %	25 %	25 %	25 %	253795573
533	NC_012960	TGG	2	6	23030	23035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795573
534	NC_012960	TGC	2	6	23068	23073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795573
535	NC_012960	GC	3	6	23072	23077	0 %	0 %	50 %	50 %	253795573
536	NC_012960	GTG	3	9	23166	23174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795573
537	NC_012960	TCGA	2	8	23175	23182	25 %	25 %	25 %	25 %	253795573
538	NC_012960	GT	3	6	23211	23216	0 %	50 %	50 %	0 %	253795573
539	NC_012960	CGG	2	6	23222	23227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795573
540	NC_012960	GCT	2	6	23271	23276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795573
541	NC_012960	GCT	2	6	23348	23353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795573
542	NC_012960	TGG	2	6	23396	23401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795573
543	NC_012960	CGG	2	6	23402	23407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795573
544	NC_012960	GCG	2	6	23443	23448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795573
545	NC_012960	GTA	2	6	23535	23540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795573
546	NC_012960	CGA	2	6	23570	23575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795573
547	NC_012960	AGCG	2	8	23578	23585	25 %	0 %	50 %	25 %	253795573
548	NC_012960	GCCTGC	2	12	23604	23615	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253795574
549	NC_012960	GCT	2	6	23620	23625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795574
550	NC_012960	GCC	2	6	23640	23645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795574
551	NC_012960	TGC	2	6	23657	23662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795574
552	NC_012960	GGC	2	6	23731	23736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795574
553	NC_012960	TAA	2	6	23765	23770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253795574
554	NC_012960	TGCT	2	8	23816	23823	0 %	50 %	25 %	25 %	253795574
555	NC_012960	GCTG	2	8	23877	23884	0 %	25 %	50 %	25 %	253795574
556	NC_012960	TG	3	6	23886	23891	0 %	50 %	50 %	0 %	253795574
557	NC_012960	GAC	2	6	23896	23901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795574
558	NC_012960	GGC	2	6	23919	23924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795574
559	NC_012960	TA	3	6	23931	23936	50 %	50 %	0 %	0 %	253795574
560	NC_012960	TGC	4	12	23942	23953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795574
561	NC_012960	GCTTGA	2	12	23966	23977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	253795574
562	NC_012960	GGTGA	2	10	24014	24023	20 %	20 %	60 %	0 %	253795574
563	NC_012960	GC	3	6	24062	24067	0 %	0 %	50 %	50 %	253795574
564	NC_012960	AAG	2	6	24084	24089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253795574
565	NC_012960	GCT	2	6	24114	24119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795574
566	NC_012960	TTG	2	6	24209	24214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795574
567	NC_012960	TAC	2	6	24229	24234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795574
568	NC_012960	GCC	2	6	24235	24240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795574
569	NC_012960	ACG	2	6	24242	24247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795574
570	NC_012960	TGC	2	6	24248	24253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795574
571	NC_012960	GCT	2	6	24267	24272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795574
572	NC_012960	GTGCT	2	10	24310	24319	0 %	40 %	40 %	20 %	253795574
573	NC_012960	GGC	2	6	24336	24341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795574
574	NC_012960	AGC	2	6	24347	24352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795574
575	NC_012960	GC	3	6	24397	24402	0 %	0 %	50 %	50 %	253795575
576	NC_012960	TAA	2	6	24435	24440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253795575
577	NC_012960	TTG	2	6	24459	24464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795575
578	NC_012960	CG	3	6	24473	24478	0 %	0 %	50 %	50 %	253795575
579	NC_012960	GCT	2	6	24574	24579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795576
580	NC_012960	GC	4	8	24639	24646	0 %	0 %	50 %	50 %	253795576
581	NC_012960	TGC	2	6	24669	24674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795576
582	NC_012960	CGG	3	9	24719	24727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795576
583	NC_012960	CGT	2	6	24761	24766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795576
584	NC_012960	GCT	2	6	24788	24793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795576
585	NC_012960	CTG	2	6	24801	24806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795576
586	NC_012960	TTTG	2	8	24824	24831	0 %	75 %	25 %	0 %	253795576
587	NC_012960	CGCT	2	8	24837	24844	0 %	25 %	25 %	50 %	253795576
588	NC_012960	TGC	2	6	24902	24907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795576
589	NC_012960	GCT	2	6	24954	24959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795576
590	NC_012960	GCTA	2	8	24987	24994	25 %	25 %	25 %	25 %	253795576
591	NC_012960	GCTT	2	8	25029	25036	0 %	50 %	25 %	25 %	253795576
592	NC_012960	GCTA	2	8	25046	25053	25 %	25 %	25 %	25 %	253795576
593	NC_012960	GCTG	2	8	25119	25126	0 %	25 %	50 %	25 %	253795576
594	NC_012960	AGCT	2	8	25129	25136	25 %	25 %	25 %	25 %	253795576
595	NC_012960	TGA	2	6	25204	25209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795576
596	NC_012960	CGT	2	6	25247	25252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795576
597	NC_012960	CAG	2	6	25262	25267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795576
598	NC_012960	TTG	2	6	25292	25297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795576
599	NC_012960	GCT	2	6	25382	25387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795576
600	NC_012960	TG	3	6	25551	25556	0 %	50 %	50 %	0 %	253795577
601	NC_012960	ACA	3	9	25573	25581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253795577
602	NC_012960	AAAG	2	8	25584	25591	75 %	0 %	25 %	0 %	253795577
603	NC_012960	CT	3	6	25639	25644	0 %	50 %	0 %	50 %	253795577
604	NC_012960	GCT	2	6	25718	25723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795578
605	NC_012960	GAC	2	6	25751	25756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795578
606	NC_012960	CGCT	2	8	25784	25791	0 %	25 %	25 %	50 %	253795578
607	NC_012960	CG	3	6	25802	25807	0 %	0 %	50 %	50 %	253795578
608	NC_012960	CGC	2	6	25818	25823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795578
609	NC_012960	GAGC	2	8	25851	25858	25 %	0 %	50 %	25 %	253795578
610	NC_012960	GCT	2	6	25866	25871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795578
611	NC_012960	GC	3	6	25872	25877	0 %	0 %	50 %	50 %	253795578
612	NC_012960	TGC	2	6	25878	25883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795578
613	NC_012960	GC	3	6	25882	25887	0 %	0 %	50 %	50 %	253795578
614	NC_012960	CAA	2	6	25902	25907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253795578
615	NC_012960	T	6	6	26121	26126	0 %	100 %	0 %	0 %	253795579
616	NC_012960	AT	4	8	26127	26134	50 %	50 %	0 %	0 %	253795579
617	NC_012960	GC	4	8	26157	26164	0 %	0 %	50 %	50 %	253795579
618	NC_012960	CGC	2	6	26179	26184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795579
619	NC_012960	CGG	2	6	26213	26218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795580
620	NC_012960	GCT	2	6	26241	26246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795580
621	NC_012960	GC	3	6	26301	26306	0 %	0 %	50 %	50 %	253795580
622	NC_012960	GC	3	6	26321	26326	0 %	0 %	50 %	50 %	253795580
623	NC_012960	GC	3	6	26328	26333	0 %	0 %	50 %	50 %	253795580
624	NC_012960	GC	3	6	26335	26340	0 %	0 %	50 %	50 %	253795580
625	NC_012960	CA	3	6	26354	26359	50 %	0 %	0 %	50 %	253795580
626	NC_012960	GCTA	2	8	26463	26470	25 %	25 %	25 %	25 %	253795581
627	NC_012960	AAG	2	6	26567	26572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253795581
628	NC_012960	CAC	2	6	26587	26592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253795581
629	NC_012960	TGG	2	6	26743	26748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795581
630	NC_012960	TCT	2	6	26779	26784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253795581
631	NC_012960	GCA	2	6	26842	26847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795581
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759	NC_012960	GC	3	6	32604	32609	0 %	0 %	50 %	50 %	253795587
760	NC_012960	TA	3	6	32610	32615	50 %	50 %	0 %	0 %	253795587
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