MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) plasmid pHD5AT

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012752	A	6	6	637	642	100 %	0 %	0 %	0 %	238899347
2	NC_012752	A	6	6	704	709	100 %	0 %	0 %	0 %	238899347
3	NC_012752	T	6	6	2494	2499	0 %	100 %	0 %	0 %	238899348
4	NC_012752	T	6	6	2774	2779	0 %	100 %	0 %	0 %	238899348
5	NC_012752	A	6	6	2870	2875	100 %	0 %	0 %	0 %	238899348
6	NC_012752	T	6	6	3677	3682	0 %	100 %	0 %	0 %	238899349
7	NC_012752	T	7	7	3812	3818	0 %	100 %	0 %	0 %	238899349
8	NC_012752	A	7	7	4247	4253	100 %	0 %	0 %	0 %	238899349
9	NC_012752	A	6	6	5299	5304	100 %	0 %	0 %	0 %	238899350
10	NC_012752	T	7	7	5588	5594	0 %	100 %	0 %	0 %	238899350
11	NC_012752	A	7	7	6017	6023	100 %	0 %	0 %	0 %	238899350
12	NC_012752	T	7	7	6222	6228	0 %	100 %	0 %	0 %	238899350
13	NC_012752	A	6	6	6325	6330	100 %	0 %	0 %	0 %	238899350
14	NC_012752	A	6	6	7158	7163	100 %	0 %	0 %	0 %	238899351
15	NC_012752	A	6	6	7218	7223	100 %	0 %	0 %	0 %	238899351
16	NC_012752	A	6	6	7935	7940	100 %	0 %	0 %	0 %	238899352
17	NC_012752	C	6	6	7944	7949	0 %	0 %	0 %	100 %	238899352
18	NC_012752	A	6	6	7959	7964	100 %	0 %	0 %	0 %	238899352
19	NC_012752	A	6	6	8034	8039	100 %	0 %	0 %	0 %	238899352
20	NC_012752	T	6	6	8132	8137	0 %	100 %	0 %	0 %	238899352
21	NC_012752	A	9	9	11243	11251	100 %	0 %	0 %	0 %	238899353
22	NC_012752	A	6	6	11298	11303	100 %	0 %	0 %	0 %	238899354
23	NC_012752	A	8	8	11367	11374	100 %	0 %	0 %	0 %	238899354
24	NC_012752	A	8	8	12710	12717	100 %	0 %	0 %	0 %	238899355
25	NC_012752	A	6	6	12918	12923	100 %	0 %	0 %	0 %	238899355
26	NC_012752	A	6	6	12975	12980	100 %	0 %	0 %	0 %	238899356
27	NC_012752	T	7	7	13074	13080	0 %	100 %	0 %	0 %	238899356
28	NC_012752	T	7	7	13772	13778	0 %	100 %	0 %	0 %	238899356
29	NC_012752	A	9	9	13798	13806	100 %	0 %	0 %	0 %	238899356
30	NC_012752	A	6	6	14101	14106	100 %	0 %	0 %	0 %	238899356
31	NC_012752	A	6	6	14133	14138	100 %	0 %	0 %	0 %	238899356
32	NC_012752	A	6	6	14651	14656	100 %	0 %	0 %	0 %	238899356
33	NC_012752	T	6	6	15063	15068	0 %	100 %	0 %	0 %	238899357
34	NC_012752	A	6	6	15092	15097	100 %	0 %	0 %	0 %	238899357
35	NC_012752	A	6	6	15180	15185	100 %	0 %	0 %	0 %	238899357
36	NC_012752	T	6	6	15213	15218	0 %	100 %	0 %	0 %	238899357
37	NC_012752	A	6	6	15281	15286	100 %	0 %	0 %	0 %	238899357
38	NC_012752	A	6	6	15830	15835	100 %	0 %	0 %	0 %	238899358
39	NC_012752	T	6	6	15973	15978	0 %	100 %	0 %	0 %	238899358
40	NC_012752	T	6	6	16226	16231	0 %	100 %	0 %	0 %	238899358
41	NC_012752	A	7	7	16436	16442	100 %	0 %	0 %	0 %	238899358
42	NC_012752	T	6	6	16472	16477	0 %	100 %	0 %	0 %	238899358
43	NC_012752	T	8	8	17241	17248	0 %	100 %	0 %	0 %	238899359
44	NC_012752	T	6	6	17307	17312	0 %	100 %	0 %	0 %	238899359
45	NC_012752	T	7	7	17442	17448	0 %	100 %	0 %	0 %	238899359
46	NC_012752	T	6	6	17465	17470	0 %	100 %	0 %	0 %	238899359
47	NC_012752	A	6	6	19059	19064	100 %	0 %	0 %	0 %	238899359
48	NC_012752	A	7	7	19071	19077	100 %	0 %	0 %	0 %	238899359
49	NC_012752	A	6	6	19217	19222	100 %	0 %	0 %	0 %	238899359
50	NC_012752	A	8	8	19317	19324	100 %	0 %	0 %	0 %	238899359
51	NC_012752	A	6	6	19649	19654	100 %	0 %	0 %	0 %	238899359
52	NC_012752	A	6	6	20115	20120	100 %	0 %	0 %	0 %	238899359
53	NC_012752	A	6	6	20371	20376	100 %	0 %	0 %	0 %	238899359
54	NC_012752	C	8	8	21423	21430	0 %	0 %	0 %	100 %	238899359
55	NC_012752	A	6	6	21522	21527	100 %	0 %	0 %	0 %	238899359
56	NC_012752	T	6	6	21716	21721	0 %	100 %	0 %	0 %	238899360
57	NC_012752	G	6	6	21905	21910	0 %	0 %	100 %	0 %	238899360
58	NC_012752	T	7	7	21992	21998	0 %	100 %	0 %	0 %	238899360
59	NC_012752	A	6	6	22344	22349	100 %	0 %	0 %	0 %	238899360
60	NC_012752	T	6	6	22387	22392	0 %	100 %	0 %	0 %	238899360
61	NC_012752	A	7	7	22520	22526	100 %	0 %	0 %	0 %	238899360
62	NC_012752	T	6	6	22718	22723	0 %	100 %	0 %	0 %	238899361
63	NC_012752	T	7	7	23012	23018	0 %	100 %	0 %	0 %	238899361
64	NC_012752	T	6	6	23025	23030	0 %	100 %	0 %	0 %	238899361
65	NC_012752	T	6	6	23051	23056	0 %	100 %	0 %	0 %	238899361
66	NC_012752	A	8	8	23178	23185	100 %	0 %	0 %	0 %	238899361
67	NC_012752	A	6	6	23743	23748	100 %	0 %	0 %	0 %	238899361
68	NC_012752	A	8	8	23957	23964	100 %	0 %	0 %	0 %	238899362
69	NC_012752	A	6	6	24440	24445	100 %	0 %	0 %	0 %	238899363
70	NC_012752	T	6	6	24839	24844	0 %	100 %	0 %	0 %	238899364
71	NC_012752	T	6	6	25202	25207	0 %	100 %	0 %	0 %	238899364
72	NC_012752	A	6	6	25888	25893	100 %	0 %	0 %	0 %	238899365
73	NC_012752	T	6	6	26107	26112	0 %	100 %	0 %	0 %	238899365
74	NC_012752	T	6	6	26583	26588	0 %	100 %	0 %	0 %	238899365
75	NC_012752	T	6	6	26719	26724	0 %	100 %	0 %	0 %	238899365
76	NC_012752	A	8	8	27225	27232	100 %	0 %	0 %	0 %	238899365
77	NC_012752	T	7	7	27556	27562	0 %	100 %	0 %	0 %	238899366
78	NC_012752	A	6	6	27582	27587	100 %	0 %	0 %	0 %	238899366
79	NC_012752	A	6	6	27707	27712	100 %	0 %	0 %	0 %	238899366
80	NC_012752	A	6	6	28029	28034	100 %	0 %	0 %	0 %	238899366
81	NC_012752	A	6	6	28329	28334	100 %	0 %	0 %	0 %	238899367
82	NC_012752	T	6	6	28572	28577	0 %	100 %	0 %	0 %	238899367
83	NC_012752	T	6	6	28736	28741	0 %	100 %	0 %	0 %	238899367
84	NC_012752	T	7	7	29261	29267	0 %	100 %	0 %	0 %	238899367
85	NC_012752	T	6	6	29387	29392	0 %	100 %	0 %	0 %	238899368
86	NC_012752	T	7	7	30430	30436	0 %	100 %	0 %	0 %	238899368
87	NC_012752	A	6	6	30736	30741	100 %	0 %	0 %	0 %	238899368
88	NC_012752	T	6	6	31267	31272	0 %	100 %	0 %	0 %	238899368
89	NC_012752	T	6	6	31880	31885	0 %	100 %	0 %	0 %	238899368
90	NC_012752	G	6	6	31937	31942	0 %	0 %	100 %	0 %	238899368
91	NC_012752	T	6	6	32330	32335	0 %	100 %	0 %	0 %	238899368
92	NC_012752	T	6	6	33130	33135	0 %	100 %	0 %	0 %	238899371
93	NC_012752	G	6	6	33136	33141	0 %	0 %	100 %	0 %	238899371
94	NC_012752	T	6	6	33262	33267	0 %	100 %	0 %	0 %	238899371
95	NC_012752	A	7	7	33337	33343	100 %	0 %	0 %	0 %	238899371
96	NC_012752	T	6	6	33521	33526	0 %	100 %	0 %	0 %	238899371
97	NC_012752	A	6	6	33541	33546	100 %	0 %	0 %	0 %	238899371
98	NC_012752	T	6	6	33579	33584	0 %	100 %	0 %	0 %	238899371
99	NC_012752	G	6	6	33590	33595	0 %	0 %	100 %	0 %	238899371
100	NC_012752	A	6	6	33618	33623	100 %	0 %	0 %	0 %	238899371
101	NC_012752	T	7	7	33788	33794	0 %	100 %	0 %	0 %	238899372
102	NC_012752	A	7	7	33805	33811	100 %	0 %	0 %	0 %	238899372
103	NC_012752	T	6	6	33980	33985	0 %	100 %	0 %	0 %	238899372
104	NC_012752	A	7	7	34022	34028	100 %	0 %	0 %	0 %	238899372
105	NC_012752	A	7	7	34272	34278	100 %	0 %	0 %	0 %	238899373
106	NC_012752	T	6	6	34841	34846	0 %	100 %	0 %	0 %	238899374
107	NC_012752	T	7	7	34865	34871	0 %	100 %	0 %	0 %	238899374
108	NC_012752	T	6	6	35136	35141	0 %	100 %	0 %	0 %	238899374
109	NC_012752	A	7	7	35142	35148	100 %	0 %	0 %	0 %	238899374
110	NC_012752	A	6	6	35219	35224	100 %	0 %	0 %	0 %	238899374
111	NC_012752	A	6	6	35288	35293	100 %	0 %	0 %	0 %	238899374
112	NC_012752	T	6	6	35299	35304	0 %	100 %	0 %	0 %	238899374
113	NC_012752	G	8	8	35317	35324	0 %	0 %	100 %	0 %	238899374
114	NC_012752	T	6	6	35413	35418	0 %	100 %	0 %	0 %	238899374
115	NC_012752	C	6	6	35590	35595	0 %	0 %	0 %	100 %	238899375
116	NC_012752	T	6	6	35796	35801	0 %	100 %	0 %	0 %	238899375
117	NC_012752	C	6	6	36768	36773	0 %	0 %	0 %	100 %	238899376
118	NC_012752	C	6	6	37320	37325	0 %	0 %	0 %	100 %	238899376
119	NC_012752	T	6	6	37436	37441	0 %	100 %	0 %	0 %	238899376
120	NC_012752	A	7	7	37550	37556	100 %	0 %	0 %	0 %	238899376
121	NC_012752	T	7	7	37605	37611	0 %	100 %	0 %	0 %	238899376
122	NC_012752	A	6	6	37694	37699	100 %	0 %	0 %	0 %	238899377
123	NC_012752	T	7	7	37841	37847	0 %	100 %	0 %	0 %	238899377
124	NC_012752	G	6	6	38088	38093	0 %	0 %	100 %	0 %	238899377
125	NC_012752	T	8	8	38272	38279	0 %	100 %	0 %	0 %	238899377
126	NC_012752	T	6	6	38332	38337	0 %	100 %	0 %	0 %	238899378
127	NC_012752	T	7	7	38372	38378	0 %	100 %	0 %	0 %	238899378
128	NC_012752	T	6	6	38447	38452	0 %	100 %	0 %	0 %	238899378
129	NC_012752	T	6	6	38607	38612	0 %	100 %	0 %	0 %	238899378
130	NC_012752	G	6	6	38764	38769	0 %	0 %	100 %	0 %	238899379
131	NC_012752	T	6	6	38866	38871	0 %	100 %	0 %	0 %	238899379
132	NC_012752	C	6	6	39017	39022	0 %	0 %	0 %	100 %	238899379
133	NC_012752	C	6	6	39228	39233	0 %	0 %	0 %	100 %	238899379
134	NC_012752	T	8	8	39475	39482	0 %	100 %	0 %	0 %	238899379
135	NC_012752	T	7	7	39771	39777	0 %	100 %	0 %	0 %	238899379
136	NC_012752	T	6	6	40255	40260	0 %	100 %	0 %	0 %	238899379
137	NC_012752	T	6	6	40577	40582	0 %	100 %	0 %	0 %	238899379
138	NC_012752	A	8	8	40598	40605	100 %	0 %	0 %	0 %	238899379
139	NC_012752	T	6	6	40791	40796	0 %	100 %	0 %	0 %	238899379
140	NC_012752	T	8	8	41056	41063	0 %	100 %	0 %	0 %	238899379
141	NC_012752	T	6	6	41214	41219	0 %	100 %	0 %	0 %	238899379
142	NC_012752	A	6	6	41670	41675	100 %	0 %	0 %	0 %	238899380
143	NC_012752	T	6	6	43046	43051	0 %	100 %	0 %	0 %	238899382
144	NC_012752	T	8	8	43760	43767	0 %	100 %	0 %	0 %	238899382
145	NC_012752	T	6	6	43826	43831	0 %	100 %	0 %	0 %	238899382
146	NC_012752	A	7	7	43860	43866	100 %	0 %	0 %	0 %	238899383
147	NC_012752	T	8	8	44264	44271	0 %	100 %	0 %	0 %	238899383
148	NC_012752	T	7	7	44797	44803	0 %	100 %	0 %	0 %	238899384
149	NC_012752	A	6	6	44875	44880	100 %	0 %	0 %	0 %	238899385
150	NC_012752	T	10	10	45040	45049	0 %	100 %	0 %	0 %	238899385
151	NC_012752	A	7	7	45174	45180	100 %	0 %	0 %	0 %	238899385
152	NC_012752	A	7	7	45237	45243	100 %	0 %	0 %	0 %	238899385
153	NC_012752	C	7	7	45245	45251	0 %	0 %	0 %	100 %	238899385
154	NC_012752	T	7	7	45384	45390	0 %	100 %	0 %	0 %	238899385
155	NC_012752	T	6	6	45673	45678	0 %	100 %	0 %	0 %	238899386
156	NC_012752	T	8	8	45737	45744	0 %	100 %	0 %	0 %	238899386
157	NC_012752	A	7	7	45869	45875	100 %	0 %	0 %	0 %	238899386
158	NC_012752	A	6	6	46205	46210	100 %	0 %	0 %	0 %	238899387
159	NC_012752	A	7	7	46771	46777	100 %	0 %	0 %	0 %	238899387
160	NC_012752	C	6	6	46845	46850	0 %	0 %	0 %	100 %	238899387
161	NC_012752	A	7	7	46953	46959	100 %	0 %	0 %	0 %	238899387
162	NC_012752	A	6	6	47017	47022	100 %	0 %	0 %	0 %	238899387
163	NC_012752	T	7	7	47950	47956	0 %	100 %	0 %	0 %	238899388
164	NC_012752	T	8	8	47967	47974	0 %	100 %	0 %	0 %	238899388
165	NC_012752	T	6	6	48277	48282	0 %	100 %	0 %	0 %	238899389
166	NC_012752	N	9	9	48458	48466	0 %	0 %	0 %	0 %	238899389
167	NC_012752	N	6	6	48482	48487	0 %	0 %	0 %	0 %	238899389
168	NC_012752	N	10	10	48503	48512	0 %	0 %	0 %	0 %	238899389
169	NC_012752	C	6	6	48513	48518	0 %	0 %	0 %	100 %	238899389
170	NC_012752	N	7	7	48529	48535	0 %	0 %	0 %	0 %	238899389
171	NC_012752	A	6	6	48649	48654	100 %	0 %	0 %	0 %	238899389
172	NC_012752	T	6	6	48690	48695	0 %	100 %	0 %	0 %	238899389
173	NC_012752	A	6	6	49096	49101	100 %	0 %	0 %	0 %	238899390
174	NC_012752	T	6	6	49431	49436	0 %	100 %	0 %	0 %	238899390
175	NC_012752	A	6	6	49857	49862	100 %	0 %	0 %	0 %	238899390
176	NC_012752	T	6	6	50216	50221	0 %	100 %	0 %	0 %	238899390
177	NC_012752	T	7	7	50282	50288	0 %	100 %	0 %	0 %	238899390
178	NC_012752	T	6	6	50343	50348	0 %	100 %	0 %	0 %	238899390
179	NC_012752	T	7	7	50681	50687	0 %	100 %	0 %	0 %	238899391
180	NC_012752	A	7	7	50955	50961	100 %	0 %	0 %	0 %	238899391
181	NC_012752	T	8	8	51044	51051	0 %	100 %	0 %	0 %	238899392
182	NC_012752	C	6	6	51472	51477	0 %	0 %	0 %	100 %	238899392
183	NC_012752	G	6	6	51552	51557	0 %	0 %	100 %	0 %	238899392
184	NC_012752	A	7	7	51675	51681	100 %	0 %	0 %	0 %	238899392
185	NC_012752	A	7	7	51705	51711	100 %	0 %	0 %	0 %	238899392
186	NC_012752	T	6	6	51774	51779	0 %	100 %	0 %	0 %	238899392
187	NC_012752	T	8	8	52263	52270	0 %	100 %	0 %	0 %	238899392
188	NC_012752	T	6	6	52284	52289	0 %	100 %	0 %	0 %	238899392
189	NC_012752	A	6	6	52302	52307	100 %	0 %	0 %	0 %	238899392
190	NC_012752	T	6	6	52448	52453	0 %	100 %	0 %	0 %	238899393
191	NC_012752	A	6	6	52507	52512	100 %	0 %	0 %	0 %	238899393
192	NC_012752	A	6	6	52756	52761	100 %	0 %	0 %	0 %	238899394
193	NC_012752	T	6	6	52895	52900	0 %	100 %	0 %	0 %	238899395
194	NC_012752	T	6	6	52938	52943	0 %	100 %	0 %	0 %	238899395
195	NC_012752	A	6	6	52972	52977	100 %	0 %	0 %	0 %	238899395
196	NC_012752	C	6	6	53490	53495	0 %	0 %	0 %	100 %	238899395
197	NC_012752	C	6	6	53754	53759	0 %	0 %	0 %	100 %	238899395
198	NC_012752	T	6	6	53786	53791	0 %	100 %	0 %	0 %	238899395
199	NC_012752	A	6	6	53963	53968	100 %	0 %	0 %	0 %	238899395
200	NC_012752	T	7	7	54771	54777	0 %	100 %	0 %	0 %	238899396
201	NC_012752	T	6	6	54892	54897	0 %	100 %	0 %	0 %	238899396
202	NC_012752	A	8	8	55146	55153	100 %	0 %	0 %	0 %	238899396
203	NC_012752	T	6	6	55213	55218	0 %	100 %	0 %	0 %	238899396
204	NC_012752	A	6	6	55541	55546	100 %	0 %	0 %	0 %	238899397
205	NC_012752	T	7	7	55579	55585	0 %	100 %	0 %	0 %	238899397
206	NC_012752	T	6	6	55849	55854	0 %	100 %	0 %	0 %	238899397
207	NC_012752	T	8	8	55977	55984	0 %	100 %	0 %	0 %	238899397
208	NC_012752	T	7	7	56476	56482	0 %	100 %	0 %	0 %	238899398
209	NC_012752	T	7	7	56570	56576	0 %	100 %	0 %	0 %	238899398
210	NC_012752	A	7	7	56593	56599	100 %	0 %	0 %	0 %	238899398
211	NC_012752	A	6	6	56625	56630	100 %	0 %	0 %	0 %	238899398
212	NC_012752	T	7	7	56672	56678	0 %	100 %	0 %	0 %	238899398
213	NC_012752	T	7	7	56898	56904	0 %	100 %	0 %	0 %	238899399
214	NC_012752	T	7	7	57191	57197	0 %	100 %	0 %	0 %	238899399
215	NC_012752	A	8	8	57217	57224	100 %	0 %	0 %	0 %	238899399
216	NC_012752	A	7	7	57241	57247	100 %	0 %	0 %	0 %	238899399
217	NC_012752	A	7	7	57284	57290	100 %	0 %	0 %	0 %	238899399
218	NC_012752	T	7	7	57310	57316	0 %	100 %	0 %	0 %	238899399
219	NC_012752	T	6	6	57834	57839	0 %	100 %	0 %	0 %	238899400
220	NC_012752	A	6	6	57873	57878	100 %	0 %	0 %	0 %	238899400
221	NC_012752	T	6	6	57915	57920	0 %	100 %	0 %	0 %	238899400
222	NC_012752	T	7	7	58145	58151	0 %	100 %	0 %	0 %	238899400
223	NC_012752	T	6	6	58196	58201	0 %	100 %	0 %	0 %	238899400

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.