MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 37778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_012751	AAG	3	9	80375	80383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897326
1503	NC_012751	AT	3	6	80448	80453	50 %	50 %	0 %	0 %	238897326
1504	NC_012751	T	6	6	80482	80487	0 %	100 %	0 %	0 %	238897326
1505	NC_012751	A	9	9	80492	80500	100 %	0 %	0 %	0 %	238897326
1506	NC_012751	A	6	6	80594	80599	100 %	0 %	0 %	0 %	238897326
1507	NC_012751	AAT	2	6	80626	80631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897326
1508	NC_012751	TAT	2	6	80646	80651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897326
1509	NC_012751	CAG	2	6	80693	80698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897326
1510	NC_012751	TTA	2	6	80740	80745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897326
1511	NC_012751	T	6	6	80802	80807	0 %	100 %	0 %	0 %	238897326
1512	NC_012751	CGA	2	6	80810	80815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897326
1513	NC_012751	TGA	3	9	80898	80906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897326
1514	NC_012751	GGT	2	6	81042	81047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238897326
1515	NC_012751	TGA	2	6	81117	81122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897326
1516	NC_012751	TCT	2	6	81165	81170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897326
1517	NC_012751	A	6	6	81232	81237	100 %	0 %	0 %	0 %	238897326
1518	NC_012751	TCA	2	6	81252	81257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897326
1519	NC_012751	A	6	6	81358	81363	100 %	0 %	0 %	0 %	238897326
1520	NC_012751	TCTA	2	8	81384	81391	25 %	50 %	0 %	25 %	238897326
1521	NC_012751	GAT	2	6	81411	81416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897326
1522	NC_012751	TCA	2	6	81447	81452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897326
1523	NC_012751	TCA	2	6	81501	81506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897326
1524	NC_012751	AGA	2	6	81513	81518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897326
1525	NC_012751	TAG	2	6	81569	81574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897326
1526	NC_012751	GAT	2	6	81577	81582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897326
1527	NC_012751	ATG	2	6	81683	81688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897326
1528	NC_012751	GCA	2	6	81713	81718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897326
1529	NC_012751	GATG	2	8	81726	81733	25 %	25 %	50 %	0 %	238897326
1530	NC_012751	GA	3	6	81807	81812	50 %	0 %	50 %	0 %	238897326
1531	NC_012751	AGA	3	9	81810	81818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897326
1532	NC_012751	AGC	2	6	81834	81839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897326
1533	NC_012751	CTGT	2	8	81852	81859	0 %	50 %	25 %	25 %	238897326
1534	NC_012751	A	8	8	81920	81927	100 %	0 %	0 %	0 %	238897326
1535	NC_012751	AAT	2	6	81949	81954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897326
1536	NC_012751	AAG	2	6	81989	81994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897326
1537	NC_012751	TGA	2	6	82019	82024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897326
1538	NC_012751	TGA	2	6	82032	82037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897326
1539	NC_012751	TTA	2	6	82069	82074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897326
1540	NC_012751	ATT	2	6	82135	82140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897326
1541	NC_012751	A	6	6	82190	82195	100 %	0 %	0 %	0 %	238897326
1542	NC_012751	GAA	2	6	82219	82224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897326
1543	NC_012751	AGA	2	6	82251	82256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897326
1544	NC_012751	TAAAA	2	10	82286	82295	80 %	20 %	0 %	0 %	238897326
1545	NC_012751	AAAGA	2	10	82449	82458	80 %	0 %	20 %	0 %	238897327
1546	NC_012751	GCTG	2	8	82460	82467	0 %	25 %	50 %	25 %	238897327
1547	NC_012751	CTTT	2	8	82488	82495	0 %	75 %	0 %	25 %	238897327
1548	NC_012751	AAG	2	6	82594	82599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897327
1549	NC_012751	AGA	2	6	82706	82711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897327
1550	NC_012751	TTG	2	6	82759	82764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897327
1551	NC_012751	AGA	2	6	82775	82780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897327
1552	NC_012751	AATGA	2	10	82833	82842	60 %	20 %	20 %	0 %	238897327
1553	NC_012751	TATGAA	2	12	82884	82895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238897327
1554	NC_012751	A	9	9	82987	82995	100 %	0 %	0 %	0 %	238897327
1555	NC_012751	TTAT	2	8	83042	83049	25 %	75 %	0 %	0 %	238897327
1556	NC_012751	CAT	2	6	83052	83057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897327
1557	NC_012751	ATC	2	6	83091	83096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897327
1558	NC_012751	A	9	9	83114	83122	100 %	0 %	0 %	0 %	238897327
1559	NC_012751	TGA	2	6	83162	83167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897327
1560	NC_012751	TCA	2	6	83210	83215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897327
1561	NC_012751	AC	3	6	83233	83238	50 %	0 %	0 %	50 %	238897327
1562	NC_012751	TTAT	2	8	83271	83278	25 %	75 %	0 %	0 %	238897327
1563	NC_012751	AAG	2	6	83332	83337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897327
1564	NC_012751	AGA	2	6	83354	83359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897327
1565	NC_012751	CGT	2	6	83370	83375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897327
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1573	NC_012751	AGA	2	6	83564	83569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897328
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1599	NC_012751	CAAG	2	8	84844	84851	50 %	0 %	25 %	25 %	238897329
1600	NC_012751	GTA	2	6	84881	84886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897329
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1609	NC_012751	T	6	6	85343	85348	0 %	100 %	0 %	0 %	238897329
1610	NC_012751	CAA	2	6	85357	85362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238897329
1611	NC_012751	T	6	6	85379	85384	0 %	100 %	0 %	0 %	238897329
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