MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT chromosome

Total Repeats: 20155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012687	CT	3	6	211855	211860	0 %	50 %	0 %	50 %	237804533
4002	NC_012687	AGC	2	6	211877	211882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804533
4003	NC_012687	AG	3	6	211928	211933	50 %	0 %	50 %	0 %	237804534
4004	NC_012687	TGG	2	6	212032	212037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804534
4005	NC_012687	GTA	2	6	212090	212095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804534
4006	NC_012687	TAG	2	6	212225	212230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804534
4007	NC_012687	TGT	2	6	212299	212304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804534
4008	NC_012687	GCT	2	6	212311	212316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804534
4009	NC_012687	ACA	3	9	212321	212329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804534
4010	NC_012687	T	6	6	212348	212353	0 %	100 %	0 %	0 %	237804534
4011	NC_012687	AGA	2	6	212365	212370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804534
4012	NC_012687	AG	3	6	212392	212397	50 %	0 %	50 %	0 %	237804534
4013	NC_012687	CT	3	6	212409	212414	0 %	50 %	0 %	50 %	237804534
4014	NC_012687	CTT	2	6	212435	212440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804534
4015	NC_012687	CTA	2	6	212501	212506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804534
4016	NC_012687	TGC	2	6	212554	212559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804535
4017	NC_012687	TTC	2	6	212566	212571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804535
4018	NC_012687	CAA	2	6	212613	212618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804535
4019	NC_012687	TG	3	6	212657	212662	0 %	50 %	50 %	0 %	237804535
4020	NC_012687	GAAC	2	8	212798	212805	50 %	0 %	25 %	25 %	237804535
4021	NC_012687	CA	4	8	212871	212878	50 %	0 %	0 %	50 %	237804535
4022	NC_012687	T	6	6	212936	212941	0 %	100 %	0 %	0 %	237804535
4023	NC_012687	CTC	2	6	212958	212963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804535
4024	NC_012687	AGC	2	6	212965	212970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804535
4025	NC_012687	ATAAC	2	10	213030	213039	60 %	20 %	0 %	20 %	237804535
4026	NC_012687	AGC	2	6	213067	213072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804535
4027	NC_012687	CAT	2	6	213087	213092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804535
4028	NC_012687	T	6	6	213115	213120	0 %	100 %	0 %	0 %	237804535
4029	NC_012687	ACA	2	6	213158	213163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804535
4030	NC_012687	CTT	2	6	213166	213171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804535
4031	NC_012687	GCA	2	6	213224	213229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804535
4032	NC_012687	TTCC	2	8	213249	213256	0 %	50 %	0 %	50 %	237804535
4033	NC_012687	TAA	2	6	213264	213269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804535
4034	NC_012687	GCC	2	6	213306	213311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	237804535
4035	NC_012687	AGTA	2	8	213353	213360	50 %	25 %	25 %	0 %	237804535
4036	NC_012687	TTC	2	6	213407	213412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804535
4037	NC_012687	ATC	2	6	213487	213492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804535
4038	NC_012687	TGA	2	6	213504	213509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804535
4039	NC_012687	ATA	2	6	213527	213532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804535
4040	NC_012687	TCT	2	6	213533	213538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804535
4041	NC_012687	ACG	2	6	213577	213582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804535
4042	NC_012687	TTC	2	6	213616	213621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804535
4043	NC_012687	TAAC	2	8	213636	213643	50 %	25 %	0 %	25 %	237804535
4044	NC_012687	TCT	2	6	213644	213649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804535
4045	NC_012687	ATA	2	6	213667	213672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804535
4046	NC_012687	TGT	2	6	213803	213808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804535
4047	NC_012687	TAC	2	6	213847	213852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804535
4048	NC_012687	AAG	2	6	213878	213883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804535
4049	NC_012687	TTTA	2	8	213913	213920	25 %	75 %	0 %	0 %	237804535
4050	NC_012687	TTC	2	6	213933	213938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804535
4051	NC_012687	AAC	2	6	214081	214086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804535
4052	NC_012687	T	6	6	214102	214107	0 %	100 %	0 %	0 %	237804535
4053	NC_012687	CACGA	2	10	214117	214126	40 %	0 %	20 %	40 %	237804535
4054	NC_012687	ATTT	2	8	214218	214225	25 %	75 %	0 %	0 %	237804535
4055	NC_012687	AAT	2	6	214249	214254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804535
4056	NC_012687	GC	3	6	214298	214303	0 %	0 %	50 %	50 %	237804535
4057	NC_012687	AAT	2	6	214360	214365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804535
4058	NC_012687	CCT	2	6	214367	214372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804535
4059	NC_012687	AATT	2	8	214456	214463	50 %	50 %	0 %	0 %	237804535
4060	NC_012687	TTG	2	6	214488	214493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804535
4061	NC_012687	GAG	2	6	214514	214519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804535
4062	NC_012687	GCA	2	6	214673	214678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804535
4063	NC_012687	CAA	2	6	214719	214724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804535
4064	NC_012687	AAT	2	6	214939	214944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804535
4065	NC_012687	GAT	2	6	215005	215010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804535
4066	NC_012687	TTC	2	6	215011	215016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804535
4067	NC_012687	TTTA	2	8	215017	215024	25 %	75 %	0 %	0 %	237804535
4068	NC_012687	ATT	2	6	215055	215060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804536
4069	NC_012687	TTG	2	6	215201	215206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804536
4070	NC_012687	TC	3	6	215231	215236	0 %	50 %	0 %	50 %	237804536
4071	NC_012687	TTC	2	6	215270	215275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804536
4072	NC_012687	AGT	2	6	215288	215293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804536
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4074	NC_012687	TCT	2	6	215341	215346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804536
4075	NC_012687	TGGA	2	8	215373	215380	25 %	25 %	50 %	0 %	237804536
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4077	NC_012687	TA	3	6	215447	215452	50 %	50 %	0 %	0 %	237804536
4078	NC_012687	TTC	2	6	215475	215480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804536
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4080	NC_012687	GCT	2	6	215494	215499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804536
4081	NC_012687	GGA	2	6	215551	215556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804536
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4083	NC_012687	AACG	2	8	215667	215674	50 %	0 %	25 %	25 %	237804536
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4086	NC_012687	CCAT	2	8	215758	215765	25 %	25 %	0 %	50 %	237804536
4087	NC_012687	GA	3	6	215776	215781	50 %	0 %	50 %	0 %	237804536
4088	NC_012687	T	6	6	215796	215801	0 %	100 %	0 %	0 %	237804536
4089	NC_012687	AGG	2	6	215820	215825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804536
4090	NC_012687	CATT	2	8	215842	215849	25 %	50 %	0 %	25 %	237804536
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4093	NC_012687	ATA	4	12	215932	215943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804536
4094	NC_012687	GCT	2	6	216001	216006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804536
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4097	NC_012687	AGCG	2	8	216212	216219	25 %	0 %	50 %	25 %	237804536
4098	NC_012687	CT	3	6	216249	216254	0 %	50 %	0 %	50 %	237804536
4099	NC_012687	CT	3	6	216257	216262	0 %	50 %	0 %	50 %	237804536
4100	NC_012687	AGC	2	6	216264	216269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804536
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4103	NC_012687	TGTTT	2	10	216406	216415	0 %	80 %	20 %	0 %	237804536
4104	NC_012687	CTA	2	6	216458	216463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804536
4105	NC_012687	TCT	2	6	216478	216483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804536
4106	NC_012687	TAGA	2	8	216509	216516	50 %	25 %	25 %	0 %	237804536
4107	NC_012687	CTTGT	2	10	216587	216596	0 %	60 %	20 %	20 %	237804536
4108	NC_012687	ATT	2	6	216603	216608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804536
4109	NC_012687	CAT	2	6	216677	216682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804536
4110	NC_012687	AGA	2	6	216779	216784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804536
4111	NC_012687	CG	3	6	216882	216887	0 %	0 %	50 %	50 %	237804536
4112	NC_012687	CTGGAT	2	12	216914	216925	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	237804536
4113	NC_012687	GTA	2	6	217139	217144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804536
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4115	NC_012687	CTTG	2	8	217181	217188	0 %	50 %	25 %	25 %	237804536
4116	NC_012687	GAAATA	2	12	217237	217248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	237804536
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4118	NC_012687	CCA	2	6	217319	217324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237804536
4119	NC_012687	CGT	2	6	217430	217435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804536
4120	NC_012687	TTTCT	2	10	217437	217446	0 %	80 %	0 %	20 %	237804536
4121	NC_012687	TAA	2	6	217466	217471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804537
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4123	NC_012687	CTT	2	6	217634	217639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804537
4124	NC_012687	ACG	2	6	217772	217777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804537
4125	NC_012687	TA	3	6	218755	218760	50 %	50 %	0 %	0 %	237804538
4126	NC_012687	ATG	2	6	218808	218813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804538
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4136	NC_012687	T	6	6	219292	219297	0 %	100 %	0 %	0 %	237804538
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4144	NC_012687	TAA	2	6	219611	219616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804538
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4154	NC_012687	TTC	2	6	220331	220336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804539
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4237	NC_012687	GA	4	8	224493	224500	50 %	0 %	50 %	0 %	237804542
4238	NC_012687	CA	3	6	224515	224520	50 %	0 %	0 %	50 %	237804542
4239	NC_012687	AGG	2	6	224529	224534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804542
4240	NC_012687	TGCT	2	8	224566	224573	0 %	50 %	25 %	25 %	237804542
4241	NC_012687	TCC	2	6	224605	224610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804543
4242	NC_012687	CA	3	6	224641	224646	50 %	0 %	0 %	50 %	237804543
4243	NC_012687	GAT	2	6	224665	224670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804543
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4245	NC_012687	TCA	2	6	224724	224729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804543
4246	NC_012687	TCT	2	6	224795	224800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804543
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4248	NC_012687	A	6	6	224836	224841	100 %	0 %	0 %	0 %	237804543
4249	NC_012687	TTA	2	6	224864	224869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804543
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4253	NC_012687	T	6	6	224974	224979	0 %	100 %	0 %	0 %	237804543
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