MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT chromosome

Total Repeats: 20155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012687	TGTCT	2	10	80455	80464	0 %	60 %	20 %	20 %	237804416
1502	NC_012687	TGAT	2	8	80529	80536	25 %	50 %	25 %	0 %	237804416
1503	NC_012687	TCAT	2	8	80551	80558	25 %	50 %	0 %	25 %	237804416
1504	NC_012687	T	6	6	80607	80612	0 %	100 %	0 %	0 %	237804416
1505	NC_012687	GGTTTA	2	12	80618	80629	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	237804416
1506	NC_012687	TCT	2	6	80719	80724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804416
1507	NC_012687	GAA	2	6	80729	80734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804416
1508	NC_012687	TGC	2	6	80779	80784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804416
1509	NC_012687	CAA	2	6	80813	80818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804416
1510	NC_012687	GAA	2	6	80831	80836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804416
1511	NC_012687	GGA	2	6	80875	80880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804416
1512	NC_012687	TC	4	8	80903	80910	0 %	50 %	0 %	50 %	237804416
1513	NC_012687	A	7	7	80922	80928	100 %	0 %	0 %	0 %	237804416
1514	NC_012687	TTACT	2	10	80962	80971	20 %	60 %	0 %	20 %	237804416
1515	NC_012687	TATC	2	8	80978	80985	25 %	50 %	0 %	25 %	237804416
1516	NC_012687	GA	3	6	80996	81001	50 %	0 %	50 %	0 %	237804416
1517	NC_012687	TAT	2	6	81076	81081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804416
1518	NC_012687	TA	3	6	81216	81221	50 %	50 %	0 %	0 %	237804416
1519	NC_012687	AGA	2	6	81280	81285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804416
1520	NC_012687	GGGA	2	8	81289	81296	25 %	0 %	75 %	0 %	237804416
1521	NC_012687	CTGC	2	8	81393	81400	0 %	25 %	25 %	50 %	237804417
1522	NC_012687	GCT	2	6	81411	81416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804417
1523	NC_012687	ATT	2	6	81417	81422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804417
1524	NC_012687	CTT	2	6	81460	81465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804417
1525	NC_012687	CTT	2	6	81481	81486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804417
1526	NC_012687	CAT	2	6	81528	81533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804417
1527	NC_012687	TGA	2	6	81650	81655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804417
1528	NC_012687	AGG	2	6	81661	81666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804417
1529	NC_012687	GGTT	2	8	81686	81693	0 %	50 %	50 %	0 %	237804417
1530	NC_012687	CT	3	6	81726	81731	0 %	50 %	0 %	50 %	237804417
1531	NC_012687	GGA	2	6	81732	81737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804417
1532	NC_012687	CAA	2	6	81738	81743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804417
1533	NC_012687	AG	3	6	81745	81750	50 %	0 %	50 %	0 %	237804417
1534	NC_012687	T	6	6	81752	81757	0 %	100 %	0 %	0 %	237804417
1535	NC_012687	CGAT	2	8	81814	81821	25 %	25 %	25 %	25 %	237804417
1536	NC_012687	TCAT	2	8	81889	81896	25 %	50 %	0 %	25 %	237804417
1537	NC_012687	TTA	2	6	81939	81944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804417
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1542	NC_012687	T	6	6	82124	82129	0 %	100 %	0 %	0 %	237804418
1543	NC_012687	GAC	2	6	82151	82156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804418
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1545	NC_012687	TTA	2	6	82197	82202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804418
1546	NC_012687	CTT	2	6	82251	82256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804418
1547	NC_012687	TTA	2	6	82294	82299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804418
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1549	NC_012687	AGAAA	2	10	82352	82361	80 %	0 %	20 %	0 %	237804418
1550	NC_012687	T	6	6	82407	82412	0 %	100 %	0 %	0 %	237804418
1551	NC_012687	GTTA	2	8	82431	82438	25 %	50 %	25 %	0 %	237804418
1552	NC_012687	ACA	2	6	82465	82470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804418
1553	NC_012687	GCG	2	6	82497	82502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237804418
1554	NC_012687	T	6	6	82540	82545	0 %	100 %	0 %	0 %	237804418
1555	NC_012687	TGG	3	9	82566	82574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804418
1556	NC_012687	CAG	2	6	82642	82647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804418
1557	NC_012687	GTT	2	6	82653	82658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804418
1558	NC_012687	TATT	2	8	82663	82670	25 %	75 %	0 %	0 %	237804418
1559	NC_012687	GTG	2	6	82687	82692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804418
1560	NC_012687	CCT	2	6	82737	82742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804418
1561	NC_012687	GGAAG	2	10	82865	82874	40 %	0 %	60 %	0 %	237804418
1562	NC_012687	ATT	2	6	82884	82889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804418
1563	NC_012687	TTG	2	6	82906	82911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804418
1564	NC_012687	TTC	2	6	82914	82919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804418
1565	NC_012687	T	6	6	82948	82953	0 %	100 %	0 %	0 %	237804418
1566	NC_012687	GAA	2	6	82987	82992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804418
1567	NC_012687	GAA	2	6	83016	83021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804418
1568	NC_012687	GA	3	6	83078	83083	50 %	0 %	50 %	0 %	237804418
1569	NC_012687	GTTC	2	8	83088	83095	0 %	50 %	25 %	25 %	237804418
1570	NC_012687	GCT	2	6	83223	83228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804418
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1573	NC_012687	CAT	2	6	83301	83306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804418
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1578	NC_012687	T	7	7	83485	83491	0 %	100 %	0 %	0 %	237804419
1579	NC_012687	T	6	6	83498	83503	0 %	100 %	0 %	0 %	237804419
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1582	NC_012687	TATG	2	8	83619	83626	25 %	50 %	25 %	0 %	237804419
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1599	NC_012687	CTA	2	6	84301	84306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804419
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1612	NC_012687	GAAG	2	8	84882	84889	50 %	0 %	50 %	0 %	237804420
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1617	NC_012687	ATCC	2	8	85119	85126	25 %	25 %	0 %	50 %	237804420
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1622	NC_012687	TTTC	2	8	85266	85273	0 %	75 %	0 %	25 %	237804420
1623	NC_012687	AGAT	2	8	85307	85314	50 %	25 %	25 %	0 %	237804420
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1997	NC_012687	AGCGA	2	10	103306	103315	40 %	0 %	40 %	20 %	237804438
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1999	NC_012687	TCA	2	6	103402	103407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804438
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