MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT chromosome

Total Repeats: 20155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_012687	CT	3	6	54171	54176	0 %	50 %	0 %	50 %	237804398
1003	NC_012687	AAAG	2	8	54228	54235	75 %	0 %	25 %	0 %	237804398
1004	NC_012687	CCGTA	2	10	54294	54303	20 %	20 %	20 %	40 %	237804398
1005	NC_012687	TTA	2	6	54324	54329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804398
1006	NC_012687	GATT	2	8	54365	54372	25 %	50 %	25 %	0 %	237804398
1007	NC_012687	AATC	2	8	54420	54427	50 %	25 %	0 %	25 %	237804398
1008	NC_012687	A	6	6	54459	54464	100 %	0 %	0 %	0 %	237804398
1009	NC_012687	TATT	2	8	54481	54488	25 %	75 %	0 %	0 %	237804398
1010	NC_012687	CTT	2	6	54490	54495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804398
1011	NC_012687	A	7	7	54597	54603	100 %	0 %	0 %	0 %	237804399
1012	NC_012687	TTC	2	6	54620	54625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804399
1013	NC_012687	CAC	2	6	54749	54754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237804399
1014	NC_012687	CAA	2	6	54783	54788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804399
1015	NC_012687	GAA	2	6	54810	54815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804399
1016	NC_012687	CT	3	6	54834	54839	0 %	50 %	0 %	50 %	237804399
1017	NC_012687	TCGA	2	8	54869	54876	25 %	25 %	25 %	25 %	237804399
1018	NC_012687	CTTC	2	8	54963	54970	0 %	50 %	0 %	50 %	237804399
1019	NC_012687	GAAT	2	8	54998	55005	50 %	25 %	25 %	0 %	237804399
1020	NC_012687	TGT	2	6	55034	55039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804399
1021	NC_012687	GAT	2	6	55062	55067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804399
1022	NC_012687	TTGA	2	8	55068	55075	25 %	50 %	25 %	0 %	237804399
1023	NC_012687	GTA	2	6	55108	55113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804399
1024	NC_012687	CTT	2	6	55122	55127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804399
1025	NC_012687	A	6	6	55257	55262	100 %	0 %	0 %	0 %	237804399
1026	NC_012687	CAA	2	6	55276	55281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804399
1027	NC_012687	AAT	2	6	55410	55415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804399
1028	NC_012687	GGAA	2	8	55424	55431	50 %	0 %	50 %	0 %	237804399
1029	NC_012687	GATCTG	2	12	55459	55470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	237804399
1030	NC_012687	GGTTCA	2	12	55596	55607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	237804399
1031	NC_012687	TTATC	2	10	55697	55706	20 %	60 %	0 %	20 %	237804399
1032	NC_012687	TGAGT	2	10	55718	55727	20 %	40 %	40 %	0 %	237804399
1033	NC_012687	TCA	3	9	55731	55739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804399
1034	NC_012687	GTT	2	6	55746	55751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804399
1035	NC_012687	GGA	2	6	55797	55802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804399
1036	NC_012687	TGC	2	6	55832	55837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804399
1037	NC_012687	GTA	2	6	55875	55880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804399
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1039	NC_012687	TTA	2	6	56057	56062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804399
1040	NC_012687	GTT	2	6	56225	56230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804400
1041	NC_012687	TGG	2	6	56233	56238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804400
1042	NC_012687	TAG	2	6	56271	56276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804400
1043	NC_012687	GTT	2	6	56280	56285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804400
1044	NC_012687	GGA	2	6	56341	56346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804400
1045	NC_012687	AGT	2	6	56359	56364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804400
1046	NC_012687	TCC	2	6	56389	56394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804400
1047	NC_012687	TCC	2	6	56407	56412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804400
1048	NC_012687	TTA	2	6	56420	56425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804400
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1050	NC_012687	AG	3	6	56503	56508	50 %	0 %	50 %	0 %	237804400
1051	NC_012687	GTA	2	6	56546	56551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804400
1052	NC_012687	CTGGAG	2	12	56649	56660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	237804400
1053	NC_012687	TGG	2	6	56674	56679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804400
1054	NC_012687	GTTGT	2	10	56753	56762	0 %	60 %	40 %	0 %	237804400
1055	NC_012687	T	6	6	56808	56813	0 %	100 %	0 %	0 %	237804400
1056	NC_012687	GAAAAG	2	12	56843	56854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804400
1057	NC_012687	TCC	2	6	56858	56863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804400
1058	NC_012687	AGT	3	9	56947	56955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804400
1059	NC_012687	AGCT	2	8	56959	56966	25 %	25 %	25 %	25 %	237804400
1060	NC_012687	CT	3	6	56965	56970	0 %	50 %	0 %	50 %	237804400
1061	NC_012687	GAG	2	6	56978	56983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804400
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1063	NC_012687	GT	3	6	57015	57020	0 %	50 %	50 %	0 %	237804400
1064	NC_012687	TGT	2	6	57024	57029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804400
1065	NC_012687	AGT	2	6	57034	57039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804400
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1070	NC_012687	TTTG	2	8	57283	57290	0 %	75 %	25 %	0 %	237804400
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1082	NC_012687	ATT	2	6	57869	57874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804400
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1101	NC_012687	T	9	9	58939	58947	0 %	100 %	0 %	0 %	237804401
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1109	NC_012687	T	6	6	59146	59151	0 %	100 %	0 %	0 %	237804401
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1122	NC_012687	T	6	6	59656	59661	0 %	100 %	0 %	0 %	237804402
1123	NC_012687	CGTT	2	8	59807	59814	0 %	50 %	25 %	25 %	237804402
1124	NC_012687	GGAG	2	8	59816	59823	25 %	0 %	75 %	0 %	237804402
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