MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 20108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012686	CATT	2	8	215918	215925	25 %	50 %	0 %	25 %	237802614
4002	NC_012686	CAA	2	6	215965	215970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802614
4003	NC_012686	ATA	4	12	216008	216019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802614
4004	NC_012686	GCT	2	6	216077	216082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802614
4005	NC_012686	GAA	2	6	216162	216167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802614
4006	NC_012686	ACG	2	6	216178	216183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802614
4007	NC_012686	AGCG	2	8	216288	216295	25 %	0 %	50 %	25 %	237802614
4008	NC_012686	CT	3	6	216325	216330	0 %	50 %	0 %	50 %	237802614
4009	NC_012686	CT	3	6	216333	216338	0 %	50 %	0 %	50 %	237802614
4010	NC_012686	AGC	2	6	216340	216345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802614
4011	NC_012686	A	6	6	216412	216417	100 %	0 %	0 %	0 %	237802614
4012	NC_012686	CAC	2	6	216432	216437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237802614
4013	NC_012686	TGTTT	2	10	216482	216491	0 %	80 %	20 %	0 %	237802614
4014	NC_012686	CTA	2	6	216534	216539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802614
4015	NC_012686	TCT	2	6	216554	216559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802614
4016	NC_012686	TAGA	2	8	216585	216592	50 %	25 %	25 %	0 %	237802614
4017	NC_012686	CTTGT	2	10	216663	216672	0 %	60 %	20 %	20 %	237802614
4018	NC_012686	ATT	2	6	216679	216684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802614
4019	NC_012686	CAT	2	6	216753	216758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802614
4020	NC_012686	AGA	2	6	216855	216860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802614
4021	NC_012686	CG	3	6	216958	216963	0 %	0 %	50 %	50 %	237802614
4022	NC_012686	CTGGAT	2	12	216990	217001	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	237802614
4023	NC_012686	GTA	2	6	217215	217220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802614
4024	NC_012686	ACC	2	6	217229	217234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237802614
4025	NC_012686	CTTG	2	8	217257	217264	0 %	50 %	25 %	25 %	237802614
4026	NC_012686	GAAATA	2	12	217313	217324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	237802614
4027	NC_012686	AAC	2	6	217345	217350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802614
4028	NC_012686	CCA	2	6	217395	217400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237802614
4029	NC_012686	CGT	2	6	217506	217511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802614
4030	NC_012686	TTTCT	2	10	217513	217522	0 %	80 %	0 %	20 %	237802614
4031	NC_012686	TAA	2	6	217542	217547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802615
4032	NC_012686	CTG	2	6	217580	217585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802615
4033	NC_012686	CTT	2	6	217710	217715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802615
4034	NC_012686	ACG	2	6	217848	217853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802615
4035	NC_012686	TA	3	6	218831	218836	50 %	50 %	0 %	0 %	237802616
4036	NC_012686	ATG	2	6	218884	218889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802616
4037	NC_012686	TGT	2	6	218892	218897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802616
4038	NC_012686	GC	3	6	218957	218962	0 %	0 %	50 %	50 %	237802616
4039	NC_012686	AGA	2	6	219019	219024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802616
4040	NC_012686	ATT	2	6	219034	219039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802616
4041	NC_012686	CTG	2	6	219186	219191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802616
4042	NC_012686	CAC	2	6	219214	219219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237802616
4043	NC_012686	TCT	2	6	219284	219289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802616
4044	NC_012686	C	6	6	219328	219333	0 %	0 %	0 %	100 %	237802616
4045	NC_012686	ATGA	2	8	219334	219341	50 %	25 %	25 %	0 %	237802616
4046	NC_012686	T	6	6	219368	219373	0 %	100 %	0 %	0 %	237802616
4047	NC_012686	GCA	2	6	219456	219461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802616
4048	NC_012686	GAA	2	6	219474	219479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802616
4049	NC_012686	GAAA	2	8	219527	219534	75 %	0 %	25 %	0 %	237802616
4050	NC_012686	TCA	2	6	219575	219580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802616
4051	NC_012686	ATG	2	6	219590	219595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802616
4052	NC_012686	TCC	2	6	219601	219606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802616
4053	NC_012686	T	6	6	219607	219612	0 %	100 %	0 %	0 %	237802616
4054	NC_012686	TAA	2	6	219687	219692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802616
4055	NC_012686	AGC	2	6	219733	219738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802616
4056	NC_012686	GAT	2	6	219768	219773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802616
4057	NC_012686	T	7	7	219910	219916	0 %	100 %	0 %	0 %	237802616
4058	NC_012686	AGA	2	6	220200	220205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802617
4059	NC_012686	AGT	2	6	220225	220230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802617
4060	NC_012686	CTC	2	6	220284	220289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802617
4061	NC_012686	AAC	2	6	220298	220303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802617
4062	NC_012686	ACA	2	6	220324	220329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802617
4063	NC_012686	TC	3	6	220401	220406	0 %	50 %	0 %	50 %	237802617
4064	NC_012686	TTC	2	6	220407	220412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802617
4065	NC_012686	AAAG	2	8	220418	220425	75 %	0 %	25 %	0 %	237802617
4066	NC_012686	TAC	2	6	220440	220445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802617
4067	NC_012686	TGC	2	6	220458	220463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802617
4068	NC_012686	GAA	2	6	220507	220512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802617
4069	NC_012686	T	6	6	220542	220547	0 %	100 %	0 %	0 %	237802617
4070	NC_012686	TAA	2	6	220593	220598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802617
4071	NC_012686	TCT	2	6	220658	220663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802617
4072	NC_012686	GTC	2	6	220664	220669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802617
4073	NC_012686	TCT	2	6	220703	220708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802617
4074	NC_012686	TTC	2	6	220756	220761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802617
4075	NC_012686	CTT	2	6	220812	220817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802617
4076	NC_012686	AAT	2	6	220891	220896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802617
4077	NC_012686	ATT	2	6	220978	220983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802617
4078	NC_012686	CTT	2	6	221001	221006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802617
4079	NC_012686	GTT	2	6	221012	221017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802617
4080	NC_012686	A	6	6	221032	221037	100 %	0 %	0 %	0 %	237802617
4081	NC_012686	TTCC	2	8	221066	221073	0 %	50 %	0 %	50 %	237802617
4082	NC_012686	TTC	2	6	221130	221135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802617
4083	NC_012686	ATC	2	6	221155	221160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802617
4084	NC_012686	TAA	3	9	221265	221273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802617
4085	NC_012686	TA	4	8	221370	221377	50 %	50 %	0 %	0 %	237802617
4086	NC_012686	CTG	2	6	221412	221417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802617
4087	NC_012686	CTT	2	6	221433	221438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802617
4088	NC_012686	TCA	2	6	221456	221461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802617
4089	NC_012686	ATG	2	6	221967	221972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802618
4090	NC_012686	GAT	2	6	222025	222030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802618
4091	NC_012686	AGA	2	6	222044	222049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802618
4092	NC_012686	AAC	2	6	222069	222074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802618
4093	NC_012686	CTC	2	6	222117	222122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802618
4094	NC_012686	T	7	7	222137	222143	0 %	100 %	0 %	0 %	237802618
4095	NC_012686	A	6	6	222147	222152	100 %	0 %	0 %	0 %	237802618
4096	NC_012686	CTC	2	6	222162	222167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802618
4097	NC_012686	CGAA	2	8	222169	222176	50 %	0 %	25 %	25 %	237802618
4098	NC_012686	ATT	2	6	222184	222189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802618
4099	NC_012686	GCT	2	6	222269	222274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802618
4100	NC_012686	CAA	2	6	222301	222306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802618
4101	NC_012686	AACA	2	8	222336	222343	75 %	0 %	0 %	25 %	237802618
4102	NC_012686	TGTC	2	8	222363	222370	0 %	50 %	25 %	25 %	237802618
4103	NC_012686	ACG	2	6	222482	222487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802618
4104	NC_012686	GGA	2	6	222512	222517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802618
4105	NC_012686	TCTA	2	8	222550	222557	25 %	50 %	0 %	25 %	237802618
4106	NC_012686	CTT	2	6	222612	222617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802618
4107	NC_012686	CA	3	6	222621	222626	50 %	0 %	0 %	50 %	237802618
4108	NC_012686	GA	3	6	222648	222653	50 %	0 %	50 %	0 %	237802618
4109	NC_012686	TCT	2	6	222666	222671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802618
4110	NC_012686	TAGC	2	8	222714	222721	25 %	25 %	25 %	25 %	237802618
4111	NC_012686	C	6	6	222721	222726	0 %	0 %	0 %	100 %	237802618
4112	NC_012686	AAATA	2	10	222730	222739	80 %	20 %	0 %	0 %	237802618
4113	NC_012686	GAA	2	6	222744	222749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802618
4114	NC_012686	ACA	2	6	222811	222816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802618
4115	NC_012686	ACA	2	6	222830	222835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802618
4116	NC_012686	ACA	2	6	222845	222850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802618
4117	NC_012686	AAG	3	9	222882	222890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802618
4118	NC_012686	AGG	2	6	222988	222993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802618
4119	NC_012686	CAA	2	6	223246	223251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802619
4120	NC_012686	CT	3	6	223268	223273	0 %	50 %	0 %	50 %	237802619
4121	NC_012686	GCT	2	6	223311	223316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802619
4122	NC_012686	T	7	7	223322	223328	0 %	100 %	0 %	0 %	237802619
4123	NC_012686	CTT	2	6	223353	223358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802619
4124	NC_012686	ATT	2	6	223376	223381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802619
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4127	NC_012686	TCG	2	6	223468	223473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802619
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4242	NC_012686	AGA	2	6	228515	228520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802624
4243	NC_012686	ATTGCT	2	12	228633	228644	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	237802624
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4245	NC_012686	CTA	2	6	228762	228767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802624
4246	NC_012686	TCA	2	6	228769	228774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802624
4247	NC_012686	TG	3	6	228802	228807	0 %	50 %	50 %	0 %	237802624
4248	NC_012686	TCCTAG	2	12	228923	228934	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	237802624
4249	NC_012686	CAA	2	6	228961	228966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802624
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4253	NC_012686	TCGA	2	8	229172	229179	25 %	25 %	25 %	25 %	237802625
4254	NC_012686	TCC	2	6	229189	229194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802625
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4264	NC_012686	ATTT	2	8	229521	229528	25 %	75 %	0 %	0 %	237802625
4265	NC_012686	T	6	6	229558	229563	0 %	100 %	0 %	0 %	237802625
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4371	NC_012686	ATT	2	6	235156	235161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802630
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4490	NC_012686	AGAT	2	8	242651	242658	50 %	25 %	25 %	0 %	237802635
4491	NC_012686	CTT	2	6	242713	242718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802635
4492	NC_012686	CTG	2	6	242719	242724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802635
4493	NC_012686	T	6	6	242738	242743	0 %	100 %	0 %	0 %	237802635
4494	NC_012686	AAT	2	6	242804	242809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802635
4495	NC_012686	ATTA	2	8	242846	242853	50 %	50 %	0 %	0 %	237802635
4496	NC_012686	T	10	10	242901	242910	0 %	100 %	0 %	0 %	237802636
4497	NC_012686	AAT	2	6	242976	242981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802636
4498	NC_012686	TC	3	6	243100	243105	0 %	50 %	0 %	50 %	237802636
4499	NC_012686	AGA	2	6	243147	243152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802636
4500	NC_012686	CTA	2	6	243221	243226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802636

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