MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 20108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012686	AGG	3	9	132610	132618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802544
2502	NC_012686	GAA	2	6	132687	132692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802544
2503	NC_012686	AAAAG	2	10	132713	132722	80 %	0 %	20 %	0 %	237802544
2504	NC_012686	CTT	2	6	132817	132822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802544
2505	NC_012686	GGA	2	6	132824	132829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802544
2506	NC_012686	TGA	2	6	132893	132898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802544
2507	NC_012686	GTT	2	6	132915	132920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802544
2508	NC_012686	A	6	6	132946	132951	100 %	0 %	0 %	0 %	237802544
2509	NC_012686	GGA	2	6	132986	132991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802544
2510	NC_012686	AGA	2	6	132998	133003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802544
2511	NC_012686	CAGT	2	8	133036	133043	25 %	25 %	25 %	25 %	237802544
2512	NC_012686	GATTC	2	10	133044	133053	20 %	40 %	20 %	20 %	237802544
2513	NC_012686	GCT	2	6	133056	133061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802544
2514	NC_012686	TAA	2	6	133169	133174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802544
2515	NC_012686	GAA	2	6	133176	133181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802544
2516	NC_012686	GAT	2	6	133184	133189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802544
2517	NC_012686	AT	3	6	133208	133213	50 %	50 %	0 %	0 %	237802544
2518	NC_012686	TCC	2	6	133247	133252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802544
2519	NC_012686	GAA	2	6	133269	133274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802544
2520	NC_012686	GGAG	2	8	133275	133282	25 %	0 %	75 %	0 %	237802544
2521	NC_012686	TC	3	6	133283	133288	0 %	50 %	0 %	50 %	237802544
2522	NC_012686	AAG	2	6	133298	133303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802544
2523	NC_012686	TGT	2	6	133316	133321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802544
2524	NC_012686	TGA	2	6	133328	133333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802544
2525	NC_012686	AAG	2	6	133351	133356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802544
2526	NC_012686	TGA	2	6	133382	133387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802544
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2529	NC_012686	AAG	2	6	133513	133518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802544
2530	NC_012686	TGT	2	6	133529	133534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802544
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2533	NC_012686	GAT	2	6	133698	133703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802544
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2536	NC_012686	TTAAAA	2	12	133876	133887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802544
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2539	NC_012686	GCGA	2	8	133974	133981	25 %	0 %	50 %	25 %	237802545
2540	NC_012686	CAA	2	6	134023	134028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802545
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2543	NC_012686	GGA	2	6	134211	134216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802545
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2553	NC_012686	TTC	2	6	134816	134821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802545
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2559	NC_012686	AAG	2	6	135091	135096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802545
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2568	NC_012686	CT	3	6	135341	135346	0 %	50 %	0 %	50 %	237802545
2569	NC_012686	TTG	2	6	135374	135379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802545
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2571	NC_012686	GGATA	2	10	135650	135659	40 %	20 %	40 %	0 %	237802546
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2586	NC_012686	ATTGT	2	10	136347	136356	20 %	60 %	20 %	0 %	237802547
2587	NC_012686	TGG	2	6	136396	136401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802547
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2593	NC_012686	TG	3	6	136696	136701	0 %	50 %	50 %	0 %	237802548
2594	NC_012686	TAG	2	6	136733	136738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802548
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2602	NC_012686	AAGC	2	8	137004	137011	50 %	0 %	25 %	25 %	237802549
2603	NC_012686	TTTG	2	8	137030	137037	0 %	75 %	25 %	0 %	237802549
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2608	NC_012686	AAC	2	6	137126	137131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802549
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2994	NC_012686	CTTG	2	8	158142	158149	0 %	50 %	25 %	25 %	237802569
2995	NC_012686	GA	3	6	158158	158163	50 %	0 %	50 %	0 %	237802569
2996	NC_012686	GCA	2	6	158211	158216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802569
2997	NC_012686	CTTT	2	8	158219	158226	0 %	75 %	0 %	25 %	237802569
2998	NC_012686	CTCCAT	2	12	158243	158254	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	237802569
2999	NC_012686	ATT	2	6	158321	158326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802569
3000	NC_012686	GAT	2	6	158347	158352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802569

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