MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 20108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012686	TCC	2	6	79673	79678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802500
1502	NC_012686	GCT	2	6	79705	79710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802500
1503	NC_012686	TCT	2	6	79716	79721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802500
1504	NC_012686	T	7	7	80411	80417	0 %	100 %	0 %	0 %	237802501
1505	NC_012686	CGA	2	6	80499	80504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802501
1506	NC_012686	TGA	2	6	80516	80521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802501
1507	NC_012686	TGTCT	2	10	80531	80540	0 %	60 %	20 %	20 %	237802501
1508	NC_012686	TGAT	2	8	80605	80612	25 %	50 %	25 %	0 %	237802501
1509	NC_012686	TCAT	2	8	80627	80634	25 %	50 %	0 %	25 %	237802501
1510	NC_012686	T	6	6	80683	80688	0 %	100 %	0 %	0 %	237802501
1511	NC_012686	GGTTTA	2	12	80694	80705	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	237802501
1512	NC_012686	TCT	2	6	80795	80800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802501
1513	NC_012686	GAA	2	6	80805	80810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802501
1514	NC_012686	TGC	2	6	80855	80860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802501
1515	NC_012686	CAA	2	6	80889	80894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802501
1516	NC_012686	GAA	2	6	80907	80912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802501
1517	NC_012686	GGA	2	6	80951	80956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802501
1518	NC_012686	TC	4	8	80979	80986	0 %	50 %	0 %	50 %	237802501
1519	NC_012686	A	7	7	80998	81004	100 %	0 %	0 %	0 %	237802501
1520	NC_012686	TTACT	2	10	81038	81047	20 %	60 %	0 %	20 %	237802501
1521	NC_012686	TATC	2	8	81054	81061	25 %	50 %	0 %	25 %	237802501
1522	NC_012686	GA	3	6	81072	81077	50 %	0 %	50 %	0 %	237802501
1523	NC_012686	TAT	2	6	81152	81157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802501
1524	NC_012686	TA	3	6	81292	81297	50 %	50 %	0 %	0 %	237802501
1525	NC_012686	AGA	2	6	81356	81361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802501
1526	NC_012686	GGGA	2	8	81365	81372	25 %	0 %	75 %	0 %	237802501
1527	NC_012686	CTGC	2	8	81469	81476	0 %	25 %	25 %	50 %	237802502
1528	NC_012686	GCT	2	6	81487	81492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802502
1529	NC_012686	ATT	2	6	81493	81498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802502
1530	NC_012686	CTT	2	6	81536	81541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802502
1531	NC_012686	CTT	2	6	81557	81562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802502
1532	NC_012686	CAT	2	6	81604	81609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802502
1533	NC_012686	TGA	2	6	81726	81731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802502
1534	NC_012686	AGG	2	6	81737	81742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802502
1535	NC_012686	GGTT	2	8	81762	81769	0 %	50 %	50 %	0 %	237802502
1536	NC_012686	CT	3	6	81802	81807	0 %	50 %	0 %	50 %	237802502
1537	NC_012686	GGA	2	6	81808	81813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802502
1538	NC_012686	CAA	2	6	81814	81819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802502
1539	NC_012686	AG	3	6	81821	81826	50 %	0 %	50 %	0 %	237802502
1540	NC_012686	T	6	6	81828	81833	0 %	100 %	0 %	0 %	237802502
1541	NC_012686	CGAT	2	8	81890	81897	25 %	25 %	25 %	25 %	237802502
1542	NC_012686	TCAT	2	8	81965	81972	25 %	50 %	0 %	25 %	237802502
1543	NC_012686	TTA	2	6	82015	82020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802502
1544	NC_012686	TG	3	6	82032	82037	0 %	50 %	50 %	0 %	237802502
1545	NC_012686	AGA	2	6	82050	82055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802502
1546	NC_012686	AAG	2	6	82067	82072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802502
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1548	NC_012686	TAC	2	6	83523	83528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802503
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1550	NC_012686	T	7	7	83559	83565	0 %	100 %	0 %	0 %	237802503
1551	NC_012686	T	6	6	83572	83577	0 %	100 %	0 %	0 %	237802503
1552	NC_012686	GTA	2	6	83658	83663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802503
1553	NC_012686	T	7	7	83668	83674	0 %	100 %	0 %	0 %	237802503
1554	NC_012686	TATG	2	8	83693	83700	25 %	50 %	25 %	0 %	237802503
1555	NC_012686	TAT	2	6	83722	83727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802503
1556	NC_012686	GTCTGT	2	12	83736	83747	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	237802503
1557	NC_012686	TCA	2	6	83756	83761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802503
1558	NC_012686	TCAT	2	8	83764	83771	25 %	50 %	0 %	25 %	237802503
1559	NC_012686	CAA	2	6	83806	83811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802503
1560	NC_012686	ACTG	2	8	83816	83823	25 %	25 %	25 %	25 %	237802503
1561	NC_012686	CATT	2	8	83831	83838	25 %	50 %	0 %	25 %	237802503
1562	NC_012686	AGA	2	6	83864	83869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802503
1563	NC_012686	AGCA	2	8	83870	83877	50 %	0 %	25 %	25 %	237802503
1564	NC_012686	TC	3	6	83892	83897	0 %	50 %	0 %	50 %	237802503
1565	NC_012686	TTA	2	6	83913	83918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802503
1566	NC_012686	ATTA	2	8	84023	84030	50 %	50 %	0 %	0 %	237802503
1567	NC_012686	TTTG	2	8	84063	84070	0 %	75 %	25 %	0 %	237802503
1568	NC_012686	TTG	2	6	84160	84165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802503
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1574	NC_012686	AGT	2	6	84541	84546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802504
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1592	NC_012686	TCC	2	6	85261	85266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802504
1593	NC_012686	ACA	2	6	85285	85290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802504
1594	NC_012686	TTTC	2	8	85340	85347	0 %	75 %	0 %	25 %	237802504
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1598	NC_012686	GAA	2	6	85571	85576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802504
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1602	NC_012686	AG	3	6	85924	85929	50 %	0 %	50 %	0 %	237802505
1603	NC_012686	GAAA	2	8	85962	85969	75 %	0 %	25 %	0 %	237802505
1604	NC_012686	T	6	6	86099	86104	0 %	100 %	0 %	0 %	237802505
1605	NC_012686	TGG	2	6	86200	86205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802505
1606	NC_012686	CTT	2	6	86256	86261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802505
1607	NC_012686	CAA	2	6	86267	86272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802505
1608	NC_012686	TCT	2	6	86345	86350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802505
1609	NC_012686	CTT	2	6	86351	86356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802505
1610	NC_012686	GAAA	2	8	86357	86364	75 %	0 %	25 %	0 %	237802505
1611	NC_012686	GCA	2	6	86380	86385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802505
1612	NC_012686	CTG	2	6	86477	86482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802505
1613	NC_012686	GATCC	2	10	86490	86499	20 %	20 %	20 %	40 %	237802505
1614	NC_012686	TAG	2	6	86520	86525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802505
1615	NC_012686	ATGG	3	12	86557	86568	25 %	25 %	50 %	0 %	237802505
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1617	NC_012686	GGT	2	6	86650	86655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802505
1618	NC_012686	AT	3	6	86782	86787	50 %	50 %	0 %	0 %	237802505
1619	NC_012686	TTG	2	6	86805	86810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802505
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1623	NC_012686	TATT	2	8	87145	87152	25 %	75 %	0 %	0 %	237802505
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1997	NC_012686	GAA	2	6	105219	105224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802522
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