MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 20108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_012686	GA	3	6	53938	53943	50 %	0 %	50 %	0 %	237802483
1003	NC_012686	TAG	2	6	53971	53976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802483
1004	NC_012686	GTG	2	6	53986	53991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802483
1005	NC_012686	AGA	2	6	54020	54025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802483
1006	NC_012686	TGA	2	6	54049	54054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802483
1007	NC_012686	TTTA	2	8	54088	54095	25 %	75 %	0 %	0 %	237802483
1008	NC_012686	AAG	2	6	54108	54113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802483
1009	NC_012686	CT	3	6	54255	54260	0 %	50 %	0 %	50 %	237802483
1010	NC_012686	AAAG	2	8	54312	54319	75 %	0 %	25 %	0 %	237802483
1011	NC_012686	CCGTA	2	10	54378	54387	20 %	20 %	20 %	40 %	237802483
1012	NC_012686	TTA	2	6	54408	54413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802483
1013	NC_012686	GATT	2	8	54449	54456	25 %	50 %	25 %	0 %	237802483
1014	NC_012686	AATC	2	8	54504	54511	50 %	25 %	0 %	25 %	237802483
1015	NC_012686	A	6	6	54543	54548	100 %	0 %	0 %	0 %	237802483
1016	NC_012686	TATT	2	8	54565	54572	25 %	75 %	0 %	0 %	237802483
1017	NC_012686	CTT	2	6	54574	54579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802483
1018	NC_012686	A	7	7	54681	54687	100 %	0 %	0 %	0 %	237802484
1019	NC_012686	TTC	2	6	54704	54709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802484
1020	NC_012686	CAC	2	6	54833	54838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237802484
1021	NC_012686	CAA	2	6	54867	54872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802484
1022	NC_012686	GAA	2	6	54894	54899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802484
1023	NC_012686	CT	3	6	54918	54923	0 %	50 %	0 %	50 %	237802484
1024	NC_012686	TCGA	2	8	54953	54960	25 %	25 %	25 %	25 %	237802484
1025	NC_012686	CTTC	2	8	55047	55054	0 %	50 %	0 %	50 %	237802484
1026	NC_012686	GAAT	2	8	55082	55089	50 %	25 %	25 %	0 %	237802484
1027	NC_012686	TGT	2	6	55118	55123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802484
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1029	NC_012686	TTGA	2	8	55152	55159	25 %	50 %	25 %	0 %	237802484
1030	NC_012686	GTA	2	6	55192	55197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802484
1031	NC_012686	CTT	2	6	55206	55211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802484
1032	NC_012686	A	6	6	55341	55346	100 %	0 %	0 %	0 %	237802484
1033	NC_012686	CAA	2	6	55360	55365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802484
1034	NC_012686	AAT	2	6	55494	55499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802484
1035	NC_012686	GGAA	2	8	55508	55515	50 %	0 %	50 %	0 %	237802484
1036	NC_012686	GATCTG	2	12	55543	55554	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	237802484
1037	NC_012686	GGTTCA	2	12	55680	55691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	237802484
1038	NC_012686	TTATC	2	10	55781	55790	20 %	60 %	0 %	20 %	237802484
1039	NC_012686	TGAGT	2	10	55802	55811	20 %	40 %	40 %	0 %	237802484
1040	NC_012686	TCA	3	9	55815	55823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802484
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1042	NC_012686	GGA	2	6	55881	55886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802484
1043	NC_012686	TGC	2	6	55916	55921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802484
1044	NC_012686	GTA	2	6	55959	55964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802484
1045	NC_012686	AT	3	6	56126	56131	50 %	50 %	0 %	0 %	237802484
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1049	NC_012686	TAG	2	6	56355	56360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802485
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1052	NC_012686	AGT	2	6	56443	56448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802485
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1054	NC_012686	TCC	2	6	56491	56496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802485
1055	NC_012686	TTA	2	6	56504	56509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802485
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1058	NC_012686	GTA	2	6	56630	56635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802485
1059	NC_012686	CTGGAG	2	12	56733	56744	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	237802485
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1062	NC_012686	T	6	6	56892	56897	0 %	100 %	0 %	0 %	237802485
1063	NC_012686	GAAAAG	2	12	56927	56938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802485
1064	NC_012686	TCC	2	6	56942	56947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802485
1065	NC_012686	AGT	3	9	57031	57039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802485
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1067	NC_012686	CT	3	6	57049	57054	0 %	50 %	0 %	50 %	237802485
1068	NC_012686	GAG	2	6	57062	57067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802485
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1076	NC_012686	TTTG	2	8	57349	57356	0 %	75 %	25 %	0 %	237802485
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1082	NC_012686	GGTT	2	8	57809	57816	0 %	50 %	50 %	0 %	237802485
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1093	NC_012686	GAG	2	6	58227	58232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802486
1094	NC_012686	AGTTGT	2	12	58269	58280	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	237802486
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1096	NC_012686	CAT	2	6	58441	58446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802486
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1100	NC_012686	GAAA	2	8	58677	58684	75 %	0 %	25 %	0 %	237802486
1101	NC_012686	CT	3	6	58687	58692	0 %	50 %	0 %	50 %	237802486
1102	NC_012686	AGGT	2	8	58716	58723	25 %	25 %	50 %	0 %	237802486
1103	NC_012686	ATT	2	6	58811	58816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802486
1104	NC_012686	CAC	2	6	58829	58834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237802486
1105	NC_012686	AGG	2	6	58880	58885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802486
1106	NC_012686	CTT	2	6	58894	58899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802486
1107	NC_012686	T	9	9	59005	59013	0 %	100 %	0 %	0 %	237802486
1108	NC_012686	CAA	2	6	59071	59076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802486
1109	NC_012686	GCT	2	6	59100	59105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802486
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1111	NC_012686	ATC	2	6	59138	59143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802486
1112	NC_012686	T	7	7	59146	59152	0 %	100 %	0 %	0 %	237802486
1113	NC_012686	TGT	2	6	59173	59178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802486
1114	NC_012686	TCTTGT	2	12	59190	59201	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	237802486
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1118	NC_012686	GCT	2	6	59293	59298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802486
1119	NC_012686	TAGA	2	8	59389	59396	50 %	25 %	25 %	0 %	237802486
1120	NC_012686	TGAA	2	8	59494	59501	50 %	25 %	25 %	0 %	237802486
1121	NC_012686	TGT	2	6	59508	59513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802486
1122	NC_012686	T	8	8	59571	59578	0 %	100 %	0 %	0 %	237802486
1123	NC_012686	T	6	6	59591	59596	0 %	100 %	0 %	0 %	237802486
1124	NC_012686	T	6	6	59602	59607	0 %	100 %	0 %	0 %	237802486
1125	NC_012686	TGAAAA	2	12	59662	59673	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	237802487
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1377	NC_012686	GATT	2	8	73173	73180	25 %	50 %	25 %	0 %	237802496
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