MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 20108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012686	GAA	2	6	27802	27807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802455
502	NC_012686	GGGC	2	8	27868	27875	0 %	0 %	75 %	25 %	237802455
503	NC_012686	T	6	6	27884	27889	0 %	100 %	0 %	0 %	237802455
504	NC_012686	TGA	2	6	27897	27902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802455
505	NC_012686	GGAGA	2	10	27905	27914	40 %	0 %	60 %	0 %	237802455
506	NC_012686	GGATA	2	10	27931	27940	40 %	20 %	40 %	0 %	237802455
507	NC_012686	A	7	7	27955	27961	100 %	0 %	0 %	0 %	237802455
508	NC_012686	AAG	2	6	27972	27977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802455
509	NC_012686	T	6	6	27992	27997	0 %	100 %	0 %	0 %	237802455
510	NC_012686	A	8	8	28089	28096	100 %	0 %	0 %	0 %	237802456
511	NC_012686	TTC	2	6	28133	28138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802456
512	NC_012686	CAGA	2	8	28173	28180	50 %	0 %	25 %	25 %	237802456
513	NC_012686	TTC	2	6	28251	28256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802456
514	NC_012686	AAG	2	6	28266	28271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802456
515	NC_012686	TTC	2	6	28366	28371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802456
516	NC_012686	AAG	2	6	28398	28403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802456
517	NC_012686	A	6	6	28404	28409	100 %	0 %	0 %	0 %	237802456
518	NC_012686	GAA	2	6	28636	28641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802457
519	NC_012686	ATCCG	2	10	28656	28665	20 %	20 %	20 %	40 %	237802457
520	NC_012686	TTC	2	6	28769	28774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802457
521	NC_012686	TAG	2	6	28817	28822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802457
522	NC_012686	AGA	2	6	28830	28835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802457
523	NC_012686	GAT	3	9	28912	28920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802457
524	NC_012686	GAG	2	6	28955	28960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802457
525	NC_012686	TG	3	6	28987	28992	0 %	50 %	50 %	0 %	237802457
526	NC_012686	GCA	2	6	29011	29016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802457
527	NC_012686	TC	3	6	29040	29045	0 %	50 %	0 %	50 %	237802457
528	NC_012686	AGGGT	2	10	29174	29183	20 %	20 %	60 %	0 %	237802457
529	NC_012686	TTC	2	6	29210	29215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802457
530	NC_012686	CAG	2	6	29222	29227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802457
531	NC_012686	GAA	2	6	29236	29241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802457
532	NC_012686	TGA	2	6	29250	29255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802457
533	NC_012686	TTC	2	6	29283	29288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802457
534	NC_012686	CTG	2	6	29324	29329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802457
535	NC_012686	GC	4	8	29454	29461	0 %	0 %	50 %	50 %	237802457
536	NC_012686	AAG	2	6	29462	29467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802457
537	NC_012686	TA	3	6	29576	29581	50 %	50 %	0 %	0 %	237802457
538	NC_012686	GAA	2	6	29665	29670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802457
539	NC_012686	TGT	2	6	29697	29702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802458
540	NC_012686	TCT	2	6	29765	29770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802458
541	NC_012686	ACA	2	6	29993	29998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802458
542	NC_012686	ATG	2	6	30003	30008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802458
543	NC_012686	CTTT	2	8	30145	30152	0 %	75 %	0 %	25 %	237802458
544	NC_012686	TTTG	2	8	30160	30167	0 %	75 %	25 %	0 %	237802458
545	NC_012686	TTGT	2	8	30195	30202	0 %	75 %	25 %	0 %	237802458
546	NC_012686	CCTAT	2	10	30214	30223	20 %	40 %	0 %	40 %	237802458
547	NC_012686	T	6	6	30230	30235	0 %	100 %	0 %	0 %	237802458
548	NC_012686	ATC	2	6	30309	30314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802458
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550	NC_012686	T	8	8	30464	30471	0 %	100 %	0 %	0 %	237802458
551	NC_012686	ATG	2	6	30489	30494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802458
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553	NC_012686	AG	3	6	30625	30630	50 %	0 %	50 %	0 %	237802459
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555	NC_012686	GAA	2	6	30715	30720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802459
556	NC_012686	TC	3	6	30734	30739	0 %	50 %	0 %	50 %	237802459
557	NC_012686	TCT	2	6	30781	30786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802459
558	NC_012686	ACT	2	6	30871	30876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802459
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561	NC_012686	CCT	2	6	30935	30940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802459
562	NC_012686	AAAC	2	8	30988	30995	75 %	0 %	0 %	25 %	237802459
563	NC_012686	T	6	6	31005	31010	0 %	100 %	0 %	0 %	237802459
564	NC_012686	GAAGG	2	10	31013	31022	40 %	0 %	60 %	0 %	237802459
565	NC_012686	GGC	2	6	31041	31046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	237802459
566	NC_012686	GAT	2	6	31120	31125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802459
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568	NC_012686	TAG	2	6	31142	31147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802459
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570	NC_012686	TGA	2	6	31236	31241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802459
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575	NC_012686	TCG	2	6	31548	31553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802459
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598	NC_012686	CTT	2	6	32499	32504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802461
599	NC_012686	CGT	2	6	32530	32535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802461
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627	NC_012686	AG	3	6	34370	34375	50 %	0 %	50 %	0 %	237802463
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